GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 451 - 475 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
TWIK-related alkaline pH activated K+ channel (TALK)
  • KCNK16
  • KCNK17
Bos taurus (cattle)
Class B/2 (Secretin family receptors)
  • ADGRE3
  • ADGRE5
  • CD55
  • CRH
  • CRHBP
  • CRHR2
  • LOC112447333
  • LOC508459
  • PTH
  • PTH1R
  • PTH2
  • PTH2R
  • PTHLH
  • SPC
  • UCN2
  • UCN3
Bos taurus (cattle)
Glucagon-type ligand receptors
  • ADCYAP1
  • ADCYAP1R1
  • GCG
  • GCGR
  • GHRH
  • GHRHR
  • GIP
  • GIPR
  • GLP2R
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • SCT
  • SCTR
  • VIP
  • VIPR1
  • VIPR2
Bos taurus (cattle)
Antigen activates B Cell Receptor (BCR) leading to generation of second messengers
  • BLNK
  • BTK
  • CD19
  • CD22
  • CD79A
  • CD79B
  • DAPP1
  • GRB2
  • IGA
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • MB-1
  • NCK1
  • PIK3AP1
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PLCG2
  • PTPN6
  • SH3KBP1
  • SOS1
  • STIM1
  • SYK
  • TRPC1
  • VAV1
Bos taurus (cattle)
Activated NTRK3 signals through PI3K
  • NTF3
  • NTRK3
  • SRC
Bos taurus (cattle)
O-linked glycosylation
  • AGO61
  • B3GALNT2
  • B3GNT1
  • B3GNT6
  • B4GAT1
  • DAG1
  • GTDC2
  • LARGE1
  • LARGE2
  • POMGNT1
  • POMGNT2
  • POMK
  • POMT1
  • POMT2
Bos taurus (cattle)
Cooperation of PDCL (PhLP1) and TRiC/CCT in G-protein beta folding
  • CCT2
  • CCT3
  • CCT4
  • CCT5
  • CCT6A
  • CCT6B
  • CCT7
  • CCT8
  • CK2A1
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • PDCL
  • RGS11
  • RGS6
  • RGS7
  • RGS9
  • TCP1
Bos taurus (cattle)
Multifunctional anion exchangers
  • SLC26A1
  • SLC26A11
  • SLC26A2
  • SLC26A3
  • SLC26A4
  • SLC26A6
  • SLC26A7
  • SLC26A9
  • SLC5A12
  • SMCT2
Bos taurus (cattle)
Ub-specific processing proteases
  • ADA3
  • ADRB2
  • ADRM1
  • AR
  • ARHT1
  • ARRB1
  • ARRB2
  • ATXN7
  • AXIN1
  • AXIN2
  • BECN1
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BIT1
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCP110
  • CDC20
  • CDC25A
  • CLSPN
  • CYLD
  • CYLD1
  • DDB2
  • FKBP8
  • FOXO4
  • GATA3
  • H2AC10
  • H2AC12
  • H2AC18
  • H2AC21
  • H2AC25
  • H2AC6
  • H2AW
  • H2B
  • H2BC26
  • H2BC5
  • HGS
  • HIF1A
  • HIST1H2BI
  • HIST3H2A
  • IDE
  • IFIH1
  • IKBKG
  • IL33
  • KAT2A
  • KEAP1
  • LOC112446467
  • LOC614881
  • LOC790134
  • MAP3K7
  • MAT2B
  • MDM2
  • MUL1
  • MYC
  • NEMO
  • NFKBIA
  • OTUB1
  • POLB
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • PTEN
  • PTRH2
  • RCE1
  • RHOT1
  • RIGI
  • RIPK1
  • RNF123
  • RNF128
  • RNF146B
  • RPS27A
  • RUVBL1
  • SIAH2
  • SKP2
  • SMAD1
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • SMAD7
  • SMURF2
  • STAM2
  • SUG1
  • TAB1
  • TADA2B
  • TADA3
  • TADA3L
  • TAF10
  • TAF9B
  • TGFBR1
  • TNKS
  • TNKS2
  • TOMM20
  • TOMM70
  • TOMM70A
  • TP53
  • TRAF2
  • TRAF6
  • TRAP2
  • TRRAP
  • Tom70
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UFC1
  • UFD1
  • USP11
  • USP12
  • USP13
  • USP14
  • USP15
  • USP19
  • USP20
  • USP21
  • USP22
  • USP24
  • USP25
  • USP26
  • USP28
  • USP3
  • USP30
  • USP33
  • USP34
  • USP37
  • USP4
  • USP42
  • USP44
  • USP47
  • USP48
  • USP49
  • USP5
  • USP7
  • USP8
  • USP9X
  • VDAC1
  • VDAC2
  • VDAC3
  • VDAC5P
  • WDR20
  • WDR48
  • bIkBa
Bos taurus (cattle)
RHOH GTPase cycle
  • ARHGDIA
  • ARHGDIG
  • ASCT2
  • BRWD2
  • CAV1
  • CSK
  • DBT
  • ERP27
  • FAM91A1
  • GBAS
  • JUP
  • LAMTOR1
  • LCK
  • MTR
  • NIPSNAP2
  • NSFL1C
  • OSBPL11
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK4
  • PAK5
  • PAK6
  • RALGAPA1
  • RHOH
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SLC1A5
  • SLC4A7
  • STOM
  • TFRC
  • TMEM59
  • VANGL1
  • VCP
  • WDR11
  • ZAP70
Bos taurus (cattle)
Chylomicron assembly
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA4
  • APOB
  • APOC2
  • APOC3
  • APOE
  • MTTP
  • P4HB
  • SAR1B
Bos taurus (cattle)
RUNX3 regulates WNT signaling
  • CTNNB1
  • LEF1
  • RUNX3
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
Bos taurus (cattle)
Interleukin-35 Signalling
  • CANX
  • EBI3
  • IL12A
  • IL12RB2
  • IL27RA
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK2
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT4
  • TYK2
  • canx
Bos taurus (cattle)
Formation of ATP by chemiosmotic coupling
  • ATP5C
  • ATP5C1
  • ATP5D
  • ATP5E
  • ATP5F
  • ATP5F1
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5F1D
  • ATP5F1E
  • ATP5G1
  • ATP5G3
  • ATP5H
  • ATP5I
  • ATP5J
  • ATP5J2
  • ATP5MC1
  • ATP5MC2
  • ATP5MC3
  • ATP5ME
  • ATP5MF
  • ATP5MG
  • ATP5O
  • ATP5PB
  • ATP5PD
  • ATP5PF
  • ATP5PO
  • ATP5S
  • ATP6
  • ATP8
  • ATPASE6
  • ATPASE8
  • ATPW
  • DMAC2L
  • MT-ATP6
  • MT-ATP8
  • MTATP6
  • MTATP8
Bos taurus (cattle)
Scavenging by Class B Receptors
  • APOA1
  • APOB
  • CD36
  • PAS4
  • SCARB1
Bos taurus (cattle)
CREB3 factors activate genes
  • CREB3
  • CREB3L3
  • CREBRF
  • MBTPS1
  • MBTPS2
Bos taurus (cattle)
FGFR1b ligand binding and activation
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF3
  • FGF5C
  • FGFA
  • FGFR1
  • HBGF-1
Bos taurus (cattle)
IRS-mediated signalling
  • IRS1
  • IRS2
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
Bos taurus (cattle)
G alpha (s) signalling events
  • ADCYAP1
  • ADCYAP1R1
  • ADM
  • ADORA2A
  • ADORA2B
  • ADRB1
  • ADRB2
  • ADRB3
  • ADRBK1
  • ADRBK2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • CALC3
  • CALCA
  • CALCB
  • CALCR
  • CALCRL
  • CGA
  • CRH
  • CRHR2
  • CT
  • D1AR
  • DRD1
  • DRD5
  • FSHB
  • FSHR
  • GCG
  • GCGR
  • GHRH
  • GHRHR
  • GIP
  • GIPR
  • GLP2R
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GPA2
  • GPB5
  • GPBAR1
  • GPHA2
  • GPHB5
  • GPR15
  • GPR176
  • GPR20
  • GPR25
  • GPR39
  • GPR83
  • GPR84
  • GPRK5
  • GRK2
  • GRK3
  • GRK5
  • GRK6
  • HRH2
  • HTR4
  • HTR6
  • HTR7
  • IAPP
  • INSL3
  • LHB
  • LHCGR
  • LOC511136
  • LOC516101
  • MC1R
  • MC2R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MSHR
  • NPS
  • NPSR1
  • P2RY11
  • PDE10A
  • PDE11A
  • PDE1A
  • PDE1B
  • PDE2A
  • PDE3A
  • PDE3B
  • PDE4A
  • PDE4C
  • PDE4D
  • PDE7B
  • PDE8A
  • PDE8B
  • POMC
  • PTGDR
  • PTGER2
  • PTGER4
  • PTGIR
  • PTH
  • PTH1R
  • PTH2
  • PTH2R
  • PTHLH
  • RAMP1
  • RAMP2
  • RLF
  • RXFP1
  • RXFP2
  • SCT
  • SCTR
  • TAAR1
  • TAAR2
  • TAAR3
  • TAAR5
  • TAAR9
  • TGR5
  • TSHB
  • TSHR
  • VIP
  • VIPR1
  • VIPR2
Bos taurus (cattle)
Cilium Assembly
  • ATAT1
  • HDAC6
  • MEC17
Bos taurus (cattle)
Glutamate and glutamine metabolism
  • ALDH18A1
  • FAM80B
  • GLS
  • GLS2
  • GLUD1
  • GLUL
  • GOT2
  • OAT
  • PYCR1
  • PYCR2
  • PYCR3
  • PYCRL
  • RIMKLA
  • RIMKLB
Bos taurus (cattle)
Interleukin-2 signaling
  • IL-2
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK3
  • LCK
  • MGF
  • PTK2B
  • SHC1
  • STAT5A
  • STAT5B
  • SYK
Bos taurus (cattle)
Synthesis of glycosylphosphatidylinositol (GPI)
  • DPM2
  • GPI7
  • PIGA
  • PIGB
  • PIGC
  • PIGF
  • PIGG
  • PIGH
  • PIGL
  • PIGN
  • PIGP
  • PIGV
  • PIGW
  • PIGZ
Bos taurus (cattle)
Nuclear Receptor transcription pathway
  • AD4BP
  • AR
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESRRA
  • ESRRB
  • ESRRG
  • FTZF1
  • HNF4A
  • HNF4G
  • LXRA
  • LXRB
  • MED1
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NR0B1
  • NR0B2
  • NR1C3
  • NR1D1
  • NR1D2
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR1H4
  • NR1I2
  • NR1I3
  • NR2B3
  • NR2C1
  • NR2C2
  • NR2E1
  • NR2E3
  • NR2F1
  • NR2F6
  • NR3A1
  • NR3A2
  • NR3C1
  • NR3C2
  • NR4A1
  • NR4A2
  • NR4A3
  • NR5A1
  • NR5A2
  • NR6A1
  • NRBF2
  • PGR
  • PPARA
  • PPARD
  • PPARG
  • RARA
  • RARB
  • RARG
  • RORC
  • RXRA
  • RXRB
  • RXRG
  • TFCOUP1
  • THRA
  • THRB
  • VDR
Bos taurus (cattle)
ABO blood group biosynthesis
  • ABO
  • FUT1
  • FUT2
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024