GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 476 - 500 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
IRS-mediated signalling
  • IRS1
  • IRS2
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
Bos taurus (cattle)
G alpha (s) signalling events
  • ADCYAP1
  • ADCYAP1R1
  • ADM
  • ADORA2A
  • ADORA2B
  • ADRB1
  • ADRB2
  • ADRB3
  • ADRBK1
  • ADRBK2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • CALC3
  • CALCA
  • CALCB
  • CALCR
  • CALCRL
  • CGA
  • CRH
  • CRHR2
  • CT
  • D1AR
  • DRD1
  • DRD5
  • FSHB
  • FSHR
  • GCG
  • GCGR
  • GHRH
  • GHRHR
  • GIP
  • GIPR
  • GLP2R
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GPA2
  • GPB5
  • GPBAR1
  • GPHA2
  • GPHB5
  • GPR15
  • GPR176
  • GPR20
  • GPR25
  • GPR39
  • GPR83
  • GPR84
  • GPRK5
  • GRK2
  • GRK3
  • GRK5
  • GRK6
  • HRH2
  • HTR4
  • HTR6
  • HTR7
  • IAPP
  • INSL3
  • LHB
  • LHCGR
  • LOC511136
  • LOC516101
  • MC1R
  • MC2R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MSHR
  • NPS
  • NPSR1
  • P2RY11
  • PDE10A
  • PDE11A
  • PDE1A
  • PDE1B
  • PDE2A
  • PDE3A
  • PDE3B
  • PDE4A
  • PDE4C
  • PDE4D
  • PDE7B
  • PDE8A
  • PDE8B
  • POMC
  • PTGDR
  • PTGER2
  • PTGER4
  • PTGIR
  • PTH
  • PTH1R
  • PTH2
  • PTH2R
  • PTHLH
  • RAMP1
  • RAMP2
  • RLF
  • RXFP1
  • RXFP2
  • SCT
  • SCTR
  • TAAR1
  • TAAR2
  • TAAR3
  • TAAR5
  • TAAR9
  • TGR5
  • TSHB
  • TSHR
  • VIP
  • VIPR1
  • VIPR2
Bos taurus (cattle)
Cilium Assembly
  • ATAT1
  • HDAC6
  • MEC17
Bos taurus (cattle)
Glutamate and glutamine metabolism
  • ALDH18A1
  • FAM80B
  • GLS
  • GLS2
  • GLUD1
  • GLUL
  • GOT2
  • OAT
  • PYCR1
  • PYCR2
  • PYCR3
  • PYCRL
  • RIMKLA
  • RIMKLB
Bos taurus (cattle)
Interleukin-2 signaling
  • IL-2
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK3
  • LCK
  • MGF
  • PTK2B
  • SHC1
  • STAT5A
  • STAT5B
  • SYK
Bos taurus (cattle)
Synthesis of glycosylphosphatidylinositol (GPI)
  • DPM2
  • GPI7
  • PIGA
  • PIGB
  • PIGC
  • PIGF
  • PIGG
  • PIGH
  • PIGL
  • PIGN
  • PIGP
  • PIGV
  • PIGW
  • PIGZ
Bos taurus (cattle)
Nuclear Receptor transcription pathway
  • AD4BP
  • AR
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESRRA
  • ESRRB
  • ESRRG
  • FTZF1
  • HNF4A
  • HNF4G
  • LXRA
  • LXRB
  • MED1
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NR0B1
  • NR0B2
  • NR1C3
  • NR1D1
  • NR1D2
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR1H4
  • NR1I2
  • NR1I3
  • NR2B3
  • NR2C1
  • NR2C2
  • NR2E1
  • NR2E3
  • NR2F1
  • NR2F6
  • NR3A1
  • NR3A2
  • NR3C1
  • NR3C2
  • NR4A1
  • NR4A2
  • NR4A3
  • NR5A1
  • NR5A2
  • NR6A1
  • NRBF2
  • PGR
  • PPARA
  • PPARD
  • PPARG
  • RARA
  • RARB
  • RARG
  • RORC
  • RXRA
  • RXRB
  • RXRG
  • TFCOUP1
  • THRA
  • THRB
  • VDR
Bos taurus (cattle)
ABO blood group biosynthesis
  • ABO
  • FUT1
  • FUT2
Bos taurus (cattle)
Keratan sulfate biosynthesis
  • ACAN
  • B3GNT1
  • B3GNT2
  • B3GNT4
  • B3GNT6
  • B4GALT1
  • B4GALT2
  • B4GALT4
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • B4GAT1
  • CHST1
  • CHST2
  • FMOD
  • GALT
  • GGTB2
  • KERA
  • LDC
  • LUM
  • OMD
  • PRELP
  • SIAT10
  • SLC35D2
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
  • siat4B
Bos taurus (cattle)
Mitochondrial protein degradation
  • AAC3
  • ACAD8
  • ACADSB
  • ACAT1
  • ACO2
  • ACOT2
  • AFG3L2
  • ALAS1
  • ALDH18A1
  • ALDH1B1
  • ALDH2
  • ANT2
  • ANT3
  • APP
  • ARG2
  • ATP5C
  • ATP5C1
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5H
  • ATP5J
  • ATP5MG
  • ATP5O
  • ATP5PD
  • ATP5PF
  • ATP5PO
  • ATP6
  • ATPASE6
  • BDH
  • BDH1
  • C26H10ORF2
  • CLPP
  • COX1
  • COX5A
  • CS
  • DBT
  • DLD
  • ECH1
  • ECI1
  • EMRE
  • FECH
  • FH
  • GLUD1
  • GRIM19
  • HADH2
  • HMGCS2
  • HSD17B10
  • HSPA9
  • HSPD1
  • HTRA2
  • IARS2
  • IDH2
  • IDH3A
  • LDHD
  • LONP1
  • MDH2
  • ME2
  • MRPL12
  • MRPL32
  • MRPS10
  • MRPS2
  • MT-ATP6
  • MTATP6
  • NADK2
  • NDUFA13
  • NDUFA2
  • NDUFS1
  • NDUFS3
  • NDUFV1
  • OGDH
  • OXCT1
  • OXSM
  • PCCB
  • PDHA1
  • PDHB
  • PDK1
  • PMPCA
  • PRKACA
  • SHMT2
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • SMDT1
  • SPG7
  • SSBP1
  • STAR
  • SUCLG2
  • TFAM
  • TWNK
  • UQCRC2
  • UQCRQ
Bos taurus (cattle)
Regulation of IGF Activity by IGFBP
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMELX
  • AMTN
  • ANO8
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APOL3
  • APP
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • C4A
  • CALU
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHGC
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • CP
  • CSF1
  • CSPG2
  • CST3
  • DMP1
  • DNAJC3
  • ENAM
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FBN1
  • FETUA
  • FGA
  • FGF23
  • FN1
  • FSTL1
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • GRP94
  • HRC
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • IGF1
  • IGF2
  • IGFBP1
  • IGFBP2
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP7
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC107131209
  • LOC112442231
  • LOC112446726
  • LOC510193
  • LOC515697
  • LOC518495
  • LOC521214
  • LOC524576
  • LOC531557
  • LOC786352
  • LOC788334
  • LTBP1
  • MADM
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MFGE8
  • MGAT4A
  • MIA3
  • MXRA8
  • NUCB1
  • P4HB
  • PAPPA2
  • PDIA6
  • PENK
  • PI
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SCOTIN
  • SDC2
  • SERPINA1
  • SERPINA10
  • SERPIND1
  • SHISA5
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • SPP24
  • STC2
  • TF
  • TMEM132A
  • TNC
  • TRA1
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
Bos taurus (cattle)
Retrograde transport at the Trans-Golgi-Network
  • ARFIP2
  • ARFRP1
  • ARL1
  • COG1
  • COG2
  • COG3
  • COG4
  • COG5
  • COG6
  • COG7
  • COG8
  • GCC1
  • GCC2
  • GOLGA1
  • GOLGA4
  • IGF2R
  • M6PR
  • M6PRBP1
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NSF
  • PLIN3
  • RAB6A
  • RAB6B
  • RAB9A
  • RAB9B
  • RABEPK
  • RGP1
  • RHOBTB3
  • RIC1
  • SCOC
  • SNAPB
  • STX10
  • STX16
  • STX6
  • SYS1
  • TMF1
  • VAMP4
  • VPS51
  • VPS52
  • VPS53
  • VPS54
  • VTI1A
Bos taurus (cattle)
Ovarian tumor domain proteases
  • APC
  • ARHA
  • CARD15
  • CDC2
  • CDK1
  • CDKN1
  • ESR
  • ESR1
  • IKBKG
  • NEMO
  • NOD2
  • NR3A1
  • OTUB1
  • OTUB2
  • OTUD3
  • OTUD7A
  • OTUD7B
  • PTEN
  • RHO12
  • RHOA
  • RIPK1
  • RIPK2
  • RNF128
  • RPS27A
  • TNIP1
  • TNIP2
  • TNIP3
  • TP53
  • TRAF3
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBE2D1
  • VCP
  • VCPIP1
  • YOD1
  • ZRANB1
Bos taurus (cattle)
Phase 4 - resting membrane potential
  • IRK1
  • KCNJ12
  • KCNJ14
  • KCNJ2
  • KCNJ4
  • KCNK1
  • KCNK10
  • KCNK12
  • KCNK13
  • KCNK15
  • KCNK16
  • KCNK17
  • KCNK18
  • KCNK2
  • KCNK3
  • KCNK4
  • KCNK5
  • KCNK7
  • KCNK9
Bos taurus (cattle)
TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of growth factors and their receptors
  • ATAD2
  • CGA
  • ESR
  • ESR1
  • LHB
  • NR3A1
Bos taurus (cattle)
Reversible hydration of carbon dioxide
  • CA1
  • CA12
  • CA13
  • CA14
  • CA2
  • CA3
  • CA4
  • CA5A
  • CA5B
  • CA6
  • CA9
Bos taurus (cattle)
Organic anion transporters
  • GC1
  • SLC17A1
  • SLC17A5
  • SLC17A6
  • SLC17A7
  • SLC17A8
  • SLC20A4
  • SLC25A1
  • SLC25A10
  • SLC25A11
  • SLC25A22
  • SLC5A5
  • SLC5A8
  • SMCT1
  • VGLUT1
  • VGLUT2
Bos taurus (cattle)
Prostanoid ligand receptors
  • PTGDR
  • PTGDR2
  • PTGER1
  • PTGER2
  • PTGER3
  • PTGER4
  • PTGFR
  • PTGIR
  • TBXA2R
Bos taurus (cattle)
Synthesis of 12-eicosatetraenoic acid derivatives
  • ALOX12
  • ALOX12B
  • ALOX15
  • ALOXE3
  • GPX1
  • GPX4
Bos taurus (cattle)
VEGF ligand-receptor interactions
  • FIGF
  • PGF
  • PLGF
  • VEGF
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VRF
Bos taurus (cattle)
Laminin interactions
  • ITGA3
  • ITGA6
  • ITGA7
  • ITGB1
  • ITGB4
  • LAMA4
  • MEGF6
  • NID1
Bos taurus (cattle)
Other interleukin signaling
  • CSF1
  • CSF1R
  • CSF3
  • CSF3R
  • GCSF
  • IFNLR1
  • IL10RB
  • IL34
  • JAK1
  • PRTN3
  • PTPRZ1
  • SDC1
  • SNAP25
  • STX1A
  • STX3
  • STX4
  • STXBP2
  • SYB2
  • TXLNA
  • TYK2
  • VAMP2
Bos taurus (cattle)
RHO GTPases activate IQGAPs
  • CALM
  • CDC42
  • CDH1
  • CLIP1
  • CTNNA1
  • CTNNB1
  • IQGAP1
  • IQGAP2
  • IQGAP3
  • MEN1
Bos taurus (cattle)
Arachidonate production from DAG
  • ABHD12
  • ABHD6
  • DAGLA
  • DAGLB
Bos taurus (cattle)
Ketone body catabolism
  • ACAT1
  • BDH
  • BDH1
  • OXCT1
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024