GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 76 - 100 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Vitamin C (ascorbate) metabolism
  • CYB5
  • CYB5A
  • CYB5R3
  • DIA1
  • GLUT1
  • GSTO2
  • SLC23A1
  • SLC23A2
  • SLC2A1
  • SLC2A3
Bos taurus (cattle)
PKA activation
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY8
  • ADCY9
  • CALM
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2A
Bos taurus (cattle)
Degradation of GLI1 by the proteasome
  • CUL1
  • GLI1
  • ITCH
  • NUMB
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUFU
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Regulation of RUNX2 expression and activity
  • CUL1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSMF1
  • RPS27A
  • RUNX2
  • SKP1
  • SKP1A
  • SKP2
  • STUB1
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins
  • AQP1
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AVP
  • AVPR2
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • MYO5B
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2A
  • RAB11A
  • RAB11FIP2
Bos taurus (cattle)
HSF1-dependent transactivation
  • AKT1S1
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CRYA2
  • CRYAB
  • DNAJB1
  • GBL
  • HSBP1
  • HSC70
  • HSF1
  • HSP70-1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPA1A
  • HSPA1L
  • HSPA8
  • HSPB8
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • LST8
  • MLST8
  • MTOR
  • RPTOR
Bos taurus (cattle)
DEx/H-box helicases activate type I IFN and inflammatory cytokines production
  • DDX9
  • DHX36
  • DHX9
  • MYD88
  • NDH2
  • NFKB1
  • NFKB2
  • RELA
Bos taurus (cattle)
Peptide hormone biosynthesis
  • PCSK1
  • POMC
Bos taurus (cattle)
Interleukin-1 signaling
  • CHUK
  • CUL1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IL1A
  • IL1B
  • IL1R1
  • IL1R2
  • IL1RN
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK3
  • IRAK4
  • MAP2K6
  • MAP3K3
  • MAP3K7
  • MYD88
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKBIA
  • PELI1
  • PELI2
  • PELI3
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RELA
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SQSTM1
  • SUG1
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TOLLIP
  • TRAF6
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBE2N
  • bIkBa
Bos taurus (cattle)
Signaling by ROBO receptors
  • CXCL12
  • CXCR4
  • GPC1
  • ROBO1
  • SLIT2
  • SLIT3
Bos taurus (cattle)
Thromboxane signalling through TP receptor
  • AAMP
  • GNA11
  • GNA13
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • TBXA2R
Bos taurus (cattle)
Autodegradation of Cdh1 by Cdh1:APC/C
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • CDC16
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • FZR1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Bos taurus (cattle)
RAF/MAP kinase cascade
  • ACTN2
  • AFGF
  • ANG1
  • ANGPT1
  • AREG
  • ARTN
  • BTC
  • CALM
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CSF2
  • CSF2RB
  • DLG1
  • DLG3
  • DLG4
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ERK2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8A
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • FRS3
  • FYN
  • Fgf4
  • GDNF
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA3
  • GFRA4
  • GRB2
  • HBEGF
  • HBGF-1
  • HGF
  • IL-2
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RG
  • IL3
  • IL3RA
  • IL5
  • IL5RA
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • KRAS
  • LAT
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • NEFL
  • NRAPGEP
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRTN
  • ODAD3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDZGEF1
  • PEA15
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRKM1
  • PTK2
  • PTPRA
  • RALGDS
  • RANBP9
  • RAPGEF2
  • RASGEF1A
  • RASGRF1
  • RASGRF2
  • RASGRP1
  • RASGRP3
  • RASGRP4
  • RET
  • RGL1
  • RGL2
  • RGL3
  • SCF
  • SHC1
  • SHC2
  • SHC3
  • SOS1
  • SPTA1
  • SPTAN1
  • SPTB
  • SPTBN2
  • SPTBN4
  • TEK
  • TGFA
  • TIE-2
  • TIE2
Bos taurus (cattle)
Creatine metabolism
  • CKB
  • CKM
  • CKMT1
  • CKMT2
  • GAMT
  • GATM
  • SLC6A11
  • SLC6A7
  • SLC6A8
Bos taurus (cattle)
Asymmetric localization of PCP proteins
  • DVL2
  • FZD1
  • FZD2
  • FZD3
  • FZD5
  • FZD7
  • FZD8
  • PARD6A
  • PRICKLE1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SMURF1
  • SMURF2
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WNT5A
Bos taurus (cattle)
TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of cell cycle factors
  • KDM5B
  • MYC
  • TFAP2C
Bos taurus (cattle)
Leukotriene receptors
  • CYSLTR1
  • CYSLTR2
  • GPR17
  • LTB4R
  • LTB4R2
Bos taurus (cattle)
Synthesis, secretion, and deacylation of Ghrelin
  • BCHE
  • GCG
  • GH1
  • GHRL
  • IGF1
  • INS
  • LEP
  • MBOAT4
  • PCSK1
  • PLA2G7
  • SEC11A
  • SEC11C
  • SEC11L1
  • SPC18
  • SPCS1
  • SPCS2
  • SPCS3
  • ob
Bos taurus (cattle)
N-glycan trimming in the ER and Calnexin/Calreticulin cycle
  • AMFR
  • DERL1
  • ENGASE
  • NGLY1
  • RAD23B
  • RPS27A
  • SAKS1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBXN1
  • VCP
Bos taurus (cattle)
Neurotransmitter release cycle
  • NAAA
Bos taurus (cattle)
Chylomicron clearance
  • APOB
  • APOE
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LIPC
Bos taurus (cattle)
Serotonin Neurotransmitter Release Cycle
  • CPLX1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RIMS1
  • SLC18A2
  • SNAP25
  • STX1A
  • STXBP1
  • SYB2
  • SYN1
  • SYT1
  • UNC13B
  • UNC18A
  • VAMP2
Bos taurus (cattle)
Interleukin-3, Interleukin-5 and GM-CSF signaling
  • CSF2
  • CSF2RB
  • IL3
  • IL3RA
  • IL5
  • IL5RA
  • JAK2
  • MGF
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PRKACA
  • PTPN11
  • PTPN6
  • SHC1
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TEC
  • VAV1
  • YWHAZ
Bos taurus (cattle)
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA
  • MRE11
Bos taurus (cattle)
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
  • ADAMTS1
  • ADAMTS10
  • ADAMTS12
  • ADAMTS13
  • ADAMTS14
  • ADAMTS15
  • ADAMTS16
  • ADAMTS17
  • ADAMTS18
  • ADAMTS19
  • ADAMTS2
  • ADAMTS20
  • ADAMTS3
  • ADAMTS4
  • ADAMTS5
  • ADAMTS6
  • ADAMTS8
  • ADAMTS9
  • ADAMTSL1
  • ADAMTSL3
  • ADAMTSL4
  • ADAMTSL5
  • B3GLCT
  • CFP
  • NPI
  • POFUT2
  • RPESP
  • SBSPON
  • SEMA5A
  • SEMA5B
  • SPON1
  • SSPO
  • THBS1
  • THBS2
  • THSD1
  • THSD7A
  • THSD7B
  • VSGP
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024