GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1 - 25 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Insulin receptor signalling cascade
  • GRB10
  • GRB2
  • INS
  • INSR
  • SHC1
  • SOS1
Bos taurus (cattle)
Highly calcium permeable nicotinic acetylcholine receptors
  • CHRNA1
  • CHRNA2
  • CHRNA3
  • CHRNA4
  • CHRNA5
  • CHRNA6
  • CHRNB2
  • CHRNB3
  • CHRNB4
Bos taurus (cattle)
Respiratory electron transport
  • CI-B14-5A
  • COA1
  • COB
  • COII
  • COQ10A
  • COQ10B
  • COX1
  • COX11
  • COX14
  • COX16
  • COX18
  • COX19
  • COX2
  • COX20
  • COX3
  • COX4
  • COX4I1
  • COX5A
  • COX6A1
  • COX6C
  • COX7A2L
  • COX7B
  • COX7C
  • COX7CP1
  • COXII
  • CYC
  • CYC1
  • CYCS
  • CYTB
  • GRIM19
  • LOC100296227
  • LOC101906178
  • LOC783202
  • LRPPRC
  • MT-CO2
  • MT-CYB
  • MT-ND3
  • MT-ND4
  • MT-ND6
  • MTCO2
  • MTCYB
  • MTND3
  • MTND4
  • MTND6
  • NADH3
  • NADH4
  • NADH6
  • ND1
  • ND2
  • ND3
  • ND4
  • ND5
  • ND6
  • NDUFA1
  • NDUFA10
  • NDUFA11
  • NDUFA13
  • NDUFA2
  • NDUFA3
  • NDUFA4
  • NDUFA5
  • NDUFA6
  • NDUFA7
  • NDUFA8
  • NDUFA9
  • NDUFAB1
  • NDUFB1
  • NDUFB10
  • NDUFB11
  • NDUFB2
  • NDUFB3
  • NDUFB5
  • NDUFB6
  • NDUFB7
  • NDUFB8
  • NDUFB9
  • NDUFC1
  • NDUFC2
  • NDUFS1
  • NDUFS2
  • NDUFS3
  • NDUFS4
  • NDUFS5
  • NDUFS6
  • NDUFS7
  • NDUFS8
  • NDUFV1
  • NDUFV2
  • SCO1
  • SCO2
  • SCOD1
  • SURF1
  • TACO1
  • TMEM186
  • UQCR10
  • UQCRB
  • UQCRC1
  • UQCRC2
  • UQCRFS1
  • UQCRH
  • UQCRQ
  • UQOR22
Bos taurus (cattle)
Regulation of TP53 Activity through Phosphorylation
  • AIK
  • AIRK1
  • ARK1
  • ATM
  • ATR
  • ATRIP
  • AURA
  • AURKA
  • AURKB
  • AYK1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRIP1
  • BTAK
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CDK2
  • CDK5
  • CDK5R
  • CDK5R1
  • CDKN2
  • CDKN5
  • CHEK2
  • CK2A1
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • DNA2
  • DYRK2
  • EXO1
  • HIPK1
  • HIPK2
  • HUS1
  • IAK1
  • KAT5
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPKAPK5
  • MDM2
  • MRE11
  • NBN
  • NCK5A
  • NIR
  • NOC2L
  • NUAK1
  • PIN1
  • PLK3
  • PRKAA1
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
  • PSSALRE
  • RAD1
  • RAD17
  • RAD50
  • RAD9A
  • RAD9B
  • RBBP8
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC5
  • RHNO1
  • RMI1
  • RMI2
  • RPA1
  • RPA2
  • RPA3
  • RPS27A
  • SSRP1
  • STK11
  • STK15
  • STK6
  • SUPT16H
  • TAF1
  • TAF10
  • TAF11
  • TAF12
  • TAF15
  • TAF2
  • TAF3
  • TAF4
  • TAF4B
  • TAF5
  • TAF6
  • TAF7L
  • TAF9
  • TAF9B
  • TBP
  • TOP3A
  • TOPBP1
  • TP53
  • TP53INP1
  • TP53RK
  • TPX2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WRN
Bos taurus (cattle)
Transport of gamma-carboxylated protein precursors from the endoplasmic reticulum to the Golgi apparatus
  • BGLAP
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • GAS6
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
Bos taurus (cattle)
Collagen chain trimerization
  • COL10A1
  • COL11A1
  • COL11A2
  • COL12A1
  • COL13A1
  • COL14A1
  • COL16A1
  • COL17A1
  • COL18A1
  • COL1A1
  • COL1A2
  • COL20A1
  • COL23A1
  • COL26A1
  • COL27A1
  • COL28A1
  • COL2A1
  • COL3A1
  • COL5A1
  • COL5A3
  • COL6A1
  • COL6A2
  • COL6A3
  • COL6A5
  • COL6A6
  • COL8A1
  • COL8A2
Bos taurus (cattle)
Myogenesis
  • ABL1
  • BNIP2
  • BOC
  • CDC42
  • CDH15
  • CDH2
  • CDH4
  • CDON
  • CTNNA1
  • CTNNB1
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MEF2B
  • MEF2C
  • MRF4
  • MYF5
  • MYF6
  • MYOD1
  • MYOG
  • SPAG9
  • TCF12
  • TCF3
  • TCF4
Bos taurus (cattle)
Glyoxylate metabolism and glycine degradation
  • AGXT
  • AGXT2
  • ALDH4A1
  • DAO
  • DHDPSL
  • GNMT
  • GOT2
  • GRHPR
  • HAO1
  • HOGA1
Bos taurus (cattle)
Toll Like Receptor 7/8 (TLR7/8) Cascade
  • TLR7
Bos taurus (cattle)
Cytoprotection by HMOX1
  • ABCC1
  • ALB
  • BLVRA
  • BLVRB
  • CHD9
  • COII
  • COX1
  • COX11
  • COX14
  • COX16
  • COX18
  • COX19
  • COX2
  • COX20
  • COX3
  • COX4
  • COX4I1
  • COX5A
  • COX6A1
  • COX6C
  • COX7A2L
  • COX7B
  • COX7C
  • COX7CP1
  • COXII
  • CREBBP
  • CYC
  • CYCS
  • FABP1
  • HBA
  • HBB
  • HDAC3
  • HMOX1
  • HMOX2
  • LOC100296227
  • LOC783202
  • LRPPRC
  • MED1
  • MRP1
  • MT-CO2
  • MTCO2
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA6
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NDUFA4
  • PPARA
  • RXRA
  • SCAN
  • SCO1
  • SCO2
  • SCOD1
  • SIN3A
  • SIN3B
  • SMARCD3
  • SURF1
  • TACO1
  • TBL1X
  • TGS1
Bos taurus (cattle)
Recycling of bile acids and salts
  • ABCB11
  • ABCC3
  • ALB
  • FABP6
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • OSTA
  • OSTB
  • RXRA
  • SLC10A1
  • SLC10A2
  • SLC27A5
  • SLC51A
  • SLC51B
  • SLCO1A2
  • SLCO1B3
  • STARD5
Bos taurus (cattle)
TRP channels
  • MCOLN1
  • MCOLN2
  • MCOLN3
  • TRP6
  • TRPA1
  • TRPC1
  • TRPC3
  • TRPC4
  • TRPC4AP
  • TRPC5
  • TRPC6
  • TRPC7
  • TRPM4
  • TRPM5
  • TRPM7
  • TRPM8
  • TRPV1
  • TRPV2
  • TRPV3
  • TRPV4
  • TRPV5
  • TRPV6
Bos taurus (cattle)
Disassembly of the destruction complex and recruitment of AXIN to the membrane
  • AMER1
  • APC
  • AXIN1
  • CAV1
  • CSNK1A1
  • CTNNB1
  • DVL1
  • DVL2
  • DVL3
  • FRAT2
  • FZD1
  • FZD2
  • FZD5
  • GSK3B
  • LRP5
  • LRP6
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WNT1
  • WNT3A
  • WNT8A
  • WNT8B
Bos taurus (cattle)
TCF dependent signaling in response to WNT
  • AXIN1
  • AXIN2
  • CTNNB1
  • RNF146B
  • RPS27A
  • TNKS
  • TNKS2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP34
  • WNT1
  • WNT3
  • WNT3A
  • WNT5A
Bos taurus (cattle)
The role of GTSE1 in G2/M progression after G2 checkpoint
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC2
  • CDK1
  • CDKN1
  • GTSE1
  • MAPRE1
  • PLK1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SUG1
  • TP53
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Aflatoxin activation and detoxification
  • ACY1
  • AKR7A2
  • CYP1A2
  • CYP2A13
  • CYP3A28
  • CYP3A4
  • CYP3A5
  • CYP3A74
  • CYP3A76
  • DPEP1
  • DPEP2
  • DPEP3
  • GGT1
  • GGT5
  • GGT7
  • GGTL3
  • MGST1
  • MGST2
  • MGST3
Bos taurus (cattle)
Ca2+ pathway
  • CALM
  • CAMK2A
  • CNA2
  • CNB
  • CTNNB1
  • FZD2
  • FZD3
  • FZD5
  • FZD6
  • GNAO1
  • GNAT2
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • KRAS
  • LEF1
  • MAP3K7
  • NFATC1
  • NLK
  • PDE6A
  • PDE6B
  • PDE6G
  • PDEG
  • PLCB1
  • PPP3CA
  • PPP3CB
  • PPP3R1
  • TCF7L2
  • WNT11
  • WNT5A
Bos taurus (cattle)
Common Pathway of Fibrin Clot Formation
  • CD177
  • EPCR
  • F10
  • F13A1
  • F13B
  • F2
  • F2R
  • F5
  • F7
  • F8
  • PPBP
  • PROC
  • PROCR
  • PROS
  • PROS1
  • PRTN3
  • SERPINA5
  • SERPIND1
  • SERPINE2
  • THBD
Bos taurus (cattle)
CTLA4 inhibitory signaling
  • CD152
  • CD80
  • CD86
  • CTLA-4
  • CTLA4
  • FYN
  • LCK
  • LYN
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PTPN11
  • SRC
  • YES1
Bos taurus (cattle)
Neddylation
  • ANKRD9
  • ASB1
  • ASB10
  • ASB11
  • ASB12
  • ASB13
  • ASB14
  • ASB15
  • ASB17
  • ASB4
  • ASB5
  • ASB6
  • ASB7
  • ASB8
  • ASB9
  • BIRC5
  • BTBD1
  • BTBD6
  • CAND1
  • CCDC22
  • CCDC8
  • CISH
  • COMMD1
  • COMMD10
  • COMMD2
  • COMMD3
  • COMMD4
  • COMMD5
  • COMMD7
  • COMMD8
  • COMMD9
  • COP1
  • COPS2
  • COPS3
  • COPS4
  • COPS5
  • COPS6
  • COPS7A
  • COPS7B
  • COPS8
  • CSN3
  • CUL1
  • CUL2
  • CUL3
  • CUL4A
  • CUL4B
  • CUL5
  • CUL7
  • CUL9
  • DCAF10
  • DCAF11
  • DCAF13
  • DCAF17
  • DCAF5
  • DCAF6
  • DCAF7
  • DCAF8
  • DCUN1D2
  • DCUN1D3
  • DCUN1D4
  • DCUN1D5
  • DDA1
  • DDB1
  • DDB2
  • DTL
  • ELOC
  • EPAS1
  • ERCC8
  • FBS2
  • FBW7
  • FBX6
  • FBXL12
  • FBXL13
  • FBXL14
  • FBXL15
  • FBXL16
  • FBXL18
  • FBXL19
  • FBXL20
  • FBXL21
  • FBXL4
  • FBXL5
  • FBXL7
  • FBXO10
  • FBXO11
  • FBXO15
  • FBXO2
  • FBXO21
  • FBXO22
  • FBXO30
  • FBXO31
  • FBXO32
  • FBXO4
  • FBXO40
  • FBXO41
  • FBXO44
  • FBXO6
  • FBXO7
  • FBXO9
  • FBXW11
  • FBXW2
  • FBXW4
  • FBXW5
  • FBXW7
  • FBXW8
  • FBXW9
  • FEM1A
  • FEM1B
  • FEM1C
  • GAN
  • GPS1
  • HIF1A
  • HIF3A
  • KBTBD10
  • KBTBD13
  • KBTBD6
  • KBTBD7
  • KBTBD8
  • KCTD6
  • KCTD7
  • KEAP1
  • KLHL11
  • KLHL13
  • KLHL2
  • KLHL20
  • KLHL21
  • KLHL22
  • KLHL3
  • KLHL41
  • KLHL42
  • KLHL5
  • KLHL9
  • LMO7
  • LOC101903064
  • LOC528919
  • LOC782101
  • LOC789309
  • LRR1
  • LRRC41
  • MUL1
  • NAE1
  • NEDD8
  • NEURL2
  • NFE2L2
  • NPLOC4
  • NUB1
  • OBSL1
  • PPIL5
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RBBP5
  • RBBP7
  • RNF7
  • RPS27A
  • SENP8
  • SKP1
  • SKP1A
  • SKP2
  • SOCS2
  • SOCS3
  • SOCS5
  • SPSB1
  • SPSB2
  • SPSB3
  • SPSB4
  • SSB3
  • SUG1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TRAP2
  • TULP4
  • UBA3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC12
  • UBC4
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5B
  • UBD
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • UBE2F
  • UBE2M
  • UBXN7
  • UCHL3
  • UFD1
  • VCP
  • WDR21A
  • WDR5
  • WDR68
  • WDTC1
  • WSB1
Bos taurus (cattle)
Downstream signaling of activated FGFR1
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF5
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FLRT1
  • FLRT2
  • FLRT3
  • Fgf4
  • HBGF-1
  • KL
Bos taurus (cattle)
Ubiquitin-dependent degradation of Cyclin D
  • CCND1
  • CDK4
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Highly sodium permeable postsynaptic acetylcholine nicotinic receptors
  • CHRNA3
  • CHRNA4
  • CHRNB2
  • CHRNB4
  • CHRND
  • CHRNE
  • CHRNG
Bos taurus (cattle)
Degradation of beta-catenin by the destruction complex
  • AMER1
  • APC
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • CTNNB1
  • CUL1
  • GSK3B
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • ZRANB1
Bos taurus (cattle)
RAF-independent MAPK1/3 activation
  • DUSP1
  • DUSP10
  • DUSP16
  • DUSP4
  • DUSP5
  • DUSP6
  • DUSP7
  • DUSP8
  • DUSP9
  • ERK2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PEA15
  • PRKM1
Bos taurus (cattle)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

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Last updated: August 19, 2024