GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 226 - 250 of 268 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Dermatan sulfate biosynthesis
  • BCAN
  • BGN
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • DCN1C
  • DSE
  • DSEL
  • NCAN
  • UST
  • VCAN
Canis familiaris (dog)
Degradation of the extracellular matrix
  • A2M
  • ACAN
  • ADAM10
  • ADAM15
  • ADAM8
  • ADAMTS4
  • ADAMTS5
  • BCAN
  • BSG
  • CAPN1
  • CAPN10
  • CAPN11
  • CAPN12
  • CAPN13
  • CAPN14
  • CAPN15
  • CAPN2
  • CAPN3
  • CAPN5
  • CAPN6
  • CAPN7
  • CAPN8
  • CAPN9
  • CAPNS1
  • CAST
  • CD44
  • CDH1
  • CTSG
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSS
  • DCN
  • DCN1C
  • ELA2
  • ELANE
  • HTRA1
  • KLK7
  • KLND
  • MMP1
  • MMP11
  • MMP12
  • MMP13
  • MMP14
  • MMP19
  • MMP2
  • MMP20
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP8
  • MMP9
  • NID1
  • OPTC
  • SCUBE1
  • SCUBE3
  • SPP1
  • TMPRSS6
Canis familiaris (dog)
DAP12 signaling
  • B2M
  • BTK
  • CD94
  • FYN
  • GRAP2
  • GRB2
  • HRAS
  • KLRD1
  • KLRK1
  • KRAS
  • LAT
  • LCK
  • LCP2
  • LOC119863908
  • LOC119866326
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLCG1
  • PLCG2
  • RAC1
  • SHC1
  • SOS1
  • SYK
  • TYROBP
  • VAV2
  • VAV3
Canis familiaris (dog)
DAP12 interactions
  • B2M
  • CD300E
  • CD94
  • CLEC5A
  • KLRD1
  • LOC119863908
  • LOC119866326
  • LOC119873404
  • LOC476396
  • LOC484343
  • SIGLEC15
  • SIRPA
  • TREM1
  • TYROBP
Canis familiaris (dog)
Cytoprotection by HMOX1
  • ABCC1
  • ALB
  • BLVRA
  • CARM1
  • CHD9
  • COX11
  • COX16
  • COX18
  • COX4I1
  • COX5A
  • COX5B
  • COX7A2L
  • CREBBP
  • CYC
  • CYCS
  • FABP1
  • GLNA2
  • GLNA3
  • HBQ1
  • HDAC3
  • HMOX1
  • HMOX2
  • LOC100682956
  • LOC100684983
  • LOC100688724
  • LOC119868178
  • LOC477508
  • LOC606860
  • LOC609402
  • LOC612644
  • LRPPRC
  • MED1
  • MRP1
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA6
  • NCOR1
  • NCOR2
  • PPARA
  • RXRA
  • SCO1
  • SCO2
  • SIN3A
  • SIN3B
  • SMARCD3
  • SURF1
  • TACO1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TGS1
Canis familiaris (dog)
Creatine metabolism
  • CKB
  • CKM
  • CKMT2
  • GAMT
  • GATM
  • LOC478277
  • SLC6A11
  • SLC6A12
  • SLC6A7
  • SLC6A8
Canis familiaris (dog)
Costimulation by the CD28 family
  • AILIM
  • BTLA
  • GRB2
  • ICOS
  • ICOSLG
  • LOC100856339
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTPN11
  • PTPN6
  • TNFRSF14
Canis familiaris (dog)
Common Pathway of Fibrin Clot Formation
  • F10
  • F13A1
  • F13B
  • F2
  • F2R
  • F5
  • PROC
  • PROCR
  • PROS1
  • SERPINA5
  • SERPINC1
  • SERPIND1
  • SERPINE2
  • THBD
Canis familiaris (dog)
Collagen degradation
  • COL12A1
  • COL13A1
  • COL15A1
  • COL18A1
  • COL19A1
  • COL25A1
  • COL26A1
  • CTSB
  • CTSD
  • FURIN
  • MMP1
  • MMP12
  • MMP13
  • MMP14
  • MMP15
  • MMP2
  • MMP20
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP8
  • MMP9
  • PHYKPL
  • PRSS2
  • TMPRSS6
Canis familiaris (dog)
Clathrin-mediated endocytosis
  • AAK1
  • ABCC7
  • ACTR2
  • ACTR3
  • ADRB2
  • AGFG1
  • AGTR1
  • AMPH
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • AREG
  • ARF6
  • ARFGAP1
  • ARPC1A
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC4
  • ARPC5
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • BIN1
  • BTC
  • CBL
  • CD3D
  • CD3G
  • CD4
  • CFTR
  • CHRM2
  • CI-MPR/IGF2R
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL1
  • DAB2
  • DNAJC6
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DVL2
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • EPN1
  • EPN2
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • FCHO1
  • FCHO2
  • FNBP1
  • FNBP1L
  • FZD4
  • GAK
  • GAPVD1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HGS
  • HIP1
  • HIP1R
  • IGF2R
  • IL7R
  • ITSN2
  • KIAA0319
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LOC102156511
  • LOC119867035
  • LOC607182
  • LRP2
  • M6PR
  • NECAP1
  • NECAP2
  • OCRL
  • PACSIN1
  • PACSIN2
  • PACSIN3
  • PICALM
  • PIK3C2A
  • PIP5K1C
  • QTRT1
  • RAB5A
  • RAB5B
  • RAB5C
  • REPS2
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3KBP1
  • SLC18A3
  • SLC2A8
  • SNAP91
  • SNX18
  • SNX9
  • STAM
  • STAM2
  • STON1
  • STON2
  • SYNJ1
  • SYNJ2
  • SYT1
  • SYT11
  • SYT2
  • SYT8
  • TACR1
  • TGFA
  • TGOLN2
  • TRIP10
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • VAMP2
  • VAMP3
  • VAMP4
  • VAMP7
  • VAMP8
  • WASL
  • WNT5A
Canis familiaris (dog)
Class B/2 (Secretin family receptors)
  • ADGRE1
  • ADGRE3
  • ADGRE5
  • CD55
  • CRH
  • CRHBP
  • CRHR1
  • CRHR2
  • LOC484897
  • PTH
  • PTH1
  • PTH1R
  • PTH2
  • PTH2R
  • PTHLH
  • PTHR1
  • UCN
  • UCN3
Canis familiaris (dog)
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors)
  • CB2
  • CMKLR1
  • CNR2
  • GPBAR1
  • GPR132
  • GPR18
  • GPR183
  • GPR35
  • GPR39
  • GPR55
  • GPR68
  • HCAR2
  • MTNR1A
  • MTNR1B
  • OXGR1
  • PTAFR
  • SUCNR1
Canis familiaris (dog)
Cilium Assembly
  • ATAT1
  • HDAC6
  • MEC17
Canis familiaris (dog)
Chondroitin sulfate biosynthesis
  • BCAN
  • BGN
  • CHPF
  • CHPF2
  • CHST11
  • CHST12
  • CHST13
  • CHST3
  • CHST7
  • CHST9
  • CHSY1
  • CHSY3
  • CSGALNACT1
  • CSGALNACT2
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • DCN1C
  • NCAN
  • VCAN
Canis familiaris (dog)
Cellular hexose transport
  • FGF21
  • FGF8C
  • MFSD4B
  • SLC2A1
  • SLC2A10
  • SLC2A11
  • SLC2A12
  • SLC2A2
  • SLC2A3
  • SLC2A4
  • SLC2A6
  • SLC2A8
  • SLC2A9
  • SLC45A3
  • SLC50A1
  • SLC5A1
  • SLC5A10
  • SLC5A2
  • SLC5A4
  • SLC5A9
Canis familiaris (dog)
Cell surface interactions at the vascular wall
  • APOB
  • B9D2
  • CD177
  • CD2
  • CD244
  • CD44
  • CD47
  • CD48
  • CD58
  • CD74
  • CD84
  • CEACAM1
  • CEACAM20
  • CXADR
  • EPCAM
  • ESAM
  • F11R
  • F2
  • FCAMR
  • FCER1G
  • FN1
  • FYN
  • GAS6
  • GLG1
  • GP6
  • GPC1
  • ITGA4
  • ITGA5
  • ITGAD
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGB1
  • ITGB2
  • JAM3
  • JAML
  • JCHAIN
  • LOC119867047
  • LOC119868972
  • LYN
  • MERTK
  • MIF
  • OLR1
  • PECAM1
  • PROC
  • PROCR
  • PROS1
  • SDC1
  • SDC3
  • SDC4
  • SELE
  • SELL
  • SELP
  • SELPLG
  • SIRPA
  • SPN
  • THBD
  • TREM1
Canis familiaris (dog)
Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis
  • AAK1
  • ABCC7
  • ADRB2
  • AGFG1
  • AGTR1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • AREG
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • BTC
  • CBL
  • CD3D
  • CD3G
  • CD4
  • CFTR
  • CHRM2
  • CI-MPR/IGF2R
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL1
  • COPS2
  • COPS3
  • COPS5
  • COPS6
  • COPS7A
  • COPS7B
  • COPS8
  • DAB2
  • DVL2
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • EPN1
  • EPN2
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • FCHO1
  • FCHO2
  • FZD4
  • GPS1
  • GRB2
  • GRK2
  • GRK3
  • HBEGF
  • HGS
  • IGF2R
  • IL7R
  • ITSN2
  • KIAA0319
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LOC102156511
  • LOC119867035
  • LRP2
  • M6PR
  • NECAP1
  • NECAP2
  • NEDD8
  • PICALM
  • REPS2
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3KBP1
  • SLC18A3
  • SLC2A8
  • SNAP91
  • STAM
  • STAM2
  • STON1
  • STON2
  • SYT1
  • SYT11
  • SYT2
  • SYT8
  • TACR1
  • TGFA
  • TGOLN2
  • TOR1A
  • TOR1B
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • VAMP2
  • VAMP3
  • VAMP4
  • VAMP7
  • VAMP8
  • WNT5A
Canis familiaris (dog)
Cargo concentration in the ER
  • AREG
  • CD59
  • CNIH1
  • CNIH2
  • CNIH3
  • CTSC
  • CTSZ
  • F5
  • GOSR2
  • GRIA1
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • LOC119876190
  • LOC609612
  • MCFD2
  • MIA2
  • PREB
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SERPINA1
  • STX5
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
Canis familiaris (dog)
CS/DS degradation
  • ARSB
  • BCAN
  • BGN
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • DCN1C
  • HEXA
  • HEXB
  • HYAL1
  • IDS
  • IDUA
  • NCAN
  • VCAN
  • arsb
  • ids
Canis familiaris (dog)
COX reactions
  • COX1
  • PTGS1
Canis familiaris (dog)
COPII-mediated vesicle transport
  • ANKRD28
  • AREG
  • BET1
  • CD59
  • CNIH1
  • CNIH2
  • CNIH3
  • CSNK1D
  • CTSC
  • CTSZ
  • F5
  • GOLGA2
  • GORASP1
  • GOSR2
  • GRIA1
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • LOC119876190
  • LOC609612
  • MCFD2
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NSF
  • PPP6C
  • PPP6R1
  • PPP6R3
  • PREB
  • RAB1
  • RAB1A
  • SCFD1
  • SEC13
  • SEC16A
  • SEC16B
  • SEC22A
  • SEC22C
  • SEC23A
  • SEC23IP
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SERPINA1
  • STX17
  • STX5
  • TBC1D20
  • TFG
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
  • TRAPPC1
  • TRAPPC10
  • TRAPPC2
  • TRAPPC2L
  • TRAPPC3
  • TRAPPC4
  • TRAPPC6A
  • TRAPPC6B
  • TRAPPC9
  • USO1
  • YKT6
Canis familiaris (dog)
CD22 mediated BCR regulation
  • CD79A
  • CD79B
  • IGHM
  • LYN
  • MAG
  • PTPN6
Canis familiaris (dog)
Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein
  • ALG1
  • ALG12
  • ALG14
  • ALG2
  • ALG3
  • ALG6
  • ALG8
  • ALG9
  • DPAGT1
  • MPDU1
Canis familiaris (dog)
Atorvastatin ADME
  • ABCB1
  • ABCC2
  • CYP3A12
  • LOC119868939
  • LOC119875773
  • LOC119876349
  • PON1
  • PON3
  • SLCO1B2
  • SLCO1B3
  • SLCO2B1
Canis familiaris (dog)
Assembly and cell surface presentation of NMDA receptors
  • GRIN1
  • GRIN2A
  • GRIN2B
  • GRIN2C
  • GRIN2D
  • GRIN3A
  • NMDAR1
Canis familiaris (dog)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024