GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 76 - 100 of 268 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Reduction of cytosolic Ca++ levels
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • CALM2
  • NCX1
  • SLC8A1
  • SLC8A2
  • SLC8A3
  • SRI
Canis familiaris (dog)
Recycling of bile acids and salts
  • ABCC3
  • ALB
  • Abcb11e
  • BAAT
  • BSEP
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • RXRA
  • SLC10A1
  • SLC10A2
  • SLC27A5
  • SLC51A
  • SLC51B
  • SLCO1A2
  • SLCO1B2
  • SLCO1B3
  • STARD5
  • slc10a2
Canis familiaris (dog)
Reactions specific to the complex N-glycan synthesis pathway
  • CHST10
  • FUCA1
  • FUT5
  • FUT8
  • MAN2A1
  • MAN2A2
  • MGAT2
Canis familiaris (dog)
RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of keratinocytes
  • CTSL
  • CTSL1
  • SERPINB13
Canis familiaris (dog)
RHOQ GTPase cycle
  • ABCC7
  • ARHGAP1
  • ARHGAP17
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP33
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARHGEF7
  • ARL13B
  • CAV
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPA
  • CDC42BPB
  • CDC42EP1
  • CDC42EP2
  • CDC42EP3
  • CFTR
  • CPNE8
  • CXNK1
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DLC1
  • FNBP1
  • GFOD1
  • GIT1
  • GIT2
  • GJA1
  • GOPC
  • GRLF1
  • IQGAP3
  • JUP
  • LAMTOR1
  • LOC119867035
  • MPP7
  • OPHN1
  • P190A
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK4
  • PLEKHG3
  • PREX1
  • RAB7
  • RAB7A
  • RHOQ
  • SCRIB
  • SLC1A5
  • SLC4A7
  • SNAP23
  • SRGAP2
  • STEAP3
  • STOM
  • SYDE1
  • TFRC
  • TRIP10
  • VAMP3
  • VANGL1
  • WASL
  • WWP2
  • p190ARHOGAP
Canis familiaris (dog)
RHO GTPases regulate CFTR trafficking
  • ABCC7
  • CFTR
  • GOPC
  • RHOQ
Canis familiaris (dog)
RAF/MAP kinase cascade
  • ACTN2
  • ANGPT1
  • AREG
  • BTC
  • CALM2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2G
  • CSF2
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • DLG1
  • DLG2
  • DLG3
  • DLG4
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • FRS3
  • FYN
  • GDNF
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA4
  • GRB2
  • GRIN1
  • GRIN2B
  • GRIN2D
  • HBEGF
  • HGF
  • HRAS
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL3
  • IL5
  • IL5RA
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • KGF
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • KRAS
  • LAT
  • LRRC7
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • MGF
  • NCAM1
  • NEFL
  • NMDAR1
  • NRAPGEP
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRTN
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDZGEF1
  • PEA15
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PSPN
  • PTK2
  • PTPRA
  • RALGDS
  • RANBP9
  • RAPGEF2
  • RASGEF1A
  • RASGRF1
  • RASGRF2
  • RASGRP1
  • RASGRP3
  • RASGRP4
  • RET
  • RGL1
  • RGL2
  • RGL3
  • SHC1
  • SHC2
  • SHC3
  • SOS1
  • SPTA1
  • SPTAN1
  • SPTB
  • SPTBN1
  • SPTBN2
  • SPTBN5
  • TEK
  • TGFA
Canis familiaris (dog)
Prostanoid ligand receptors
  • PTGDR
  • PTGDR2
  • PTGER1
  • PTGER2
  • PTGER3
  • PTGER4
  • PTGFR
  • PTGIR
  • TBXA2R
Canis familiaris (dog)
Progressive trimming of alpha-1,2-linked mannose residues from Man9/8/7GlcNAc2 to produce Man5GlcNAc2
  • MAN1A1
  • MAN1A2
  • MAN1C1
Canis familiaris (dog)
Presynaptic depolarization and calcium channel opening
  • CACNA1A
  • CACNA1E
  • CACNA2D2
  • CACNA2D3
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNB3
  • CACNB4
  • CACNG2
  • CACNG4
Canis familiaris (dog)
Post-translational protein phosphorylation
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMELX
  • AMTN
  • ANO8
  • APLP2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APP
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • CALU
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • COA5
  • CP
  • CSF1
  • DMP1
  • DNAJC3
  • ENAM
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FBN1
  • FGA
  • FGF23
  • FGF8B
  • FN1
  • FSTL1
  • FSTL3
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • GRP94
  • HRC
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP7
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC102156332
  • LOC481722
  • LOC607874
  • LTBP1
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MFGE8
  • MIA3
  • MXRA8
  • NOTUM
  • NUCB1
  • P4HB
  • PDIA6
  • PENK
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • QSOX1
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SERPINA1
  • SERPINC1
  • SERPIND1
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • STC2
  • TGOLN2
  • TIMP1
  • TMEM132A
  • TNC
  • TRA1
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
Canis familiaris (dog)
Post-translational modification: synthesis of GPI-anchored proteins
  • ALPI
  • ALPL
  • ART3
  • ART4
  • BST1
  • CD109
  • CD52
  • CDW52
  • CE5
  • CEACAM1
  • CEACAM20
  • CNTN5
  • CPM
  • FCGR3A
  • GLIPR2
  • GP2
  • GPIHBP1
  • GPLD1
  • HMCN2
  • IZUMO1R
  • LOC100683099
  • LOC119875695
  • LOC476816
  • LOC478984
  • LSAMP
  • LY6D
  • LY6E
  • LY6G6C
  • LY6G6D
  • LY6H
  • LYPD1
  • LYPD3
  • LYPD4
  • LYPD5
  • LYPD6B
  • LYPD8
  • MELTF
  • NEGR1
  • NRN1
  • NRN1L
  • NTM
  • OPCML
  • OTOA
  • PLET1
  • PRND
  • PSCA
  • RTN4RL1
  • RTN4RL2
  • SPACA4
  • SPRN
  • TECTA
  • TECTB
  • TEX101
  • THY1
  • VNN1
  • XPNPEP2
Canis familiaris (dog)
Platelet homeostasis
  • P2RX1
  • P2RX2
  • P2RX3
  • P2RX4
  • P2RX5
  • P2RX6
  • P2RX7
  • PAFAH2
Canis familiaris (dog)
Platelet degranulation
  • A1BG
  • A2M
  • ABCC4
  • ACTG1
  • ACTN1
  • ACTN2
  • AHSG
  • ALB
  • ALDOA
  • ANXA5
  • APLP2
  • APOA1
  • APOH
  • APOOL
  • APP
  • Abcc4
  • B9D2
  • BRPF3
  • CALM2
  • CANT1
  • CD109
  • CD36
  • CD63
  • CD9
  • CDC37L1
  • CFD
  • CHID1
  • CLU
  • CTSW
  • CYB5R1
  • CYRIB
  • ECM1
  • EGF
  • ENDOD1
  • F13A1
  • F5
  • F8VWF
  • FAM3C
  • FERMT3
  • FLNA
  • FN1
  • GAS6
  • GTPBP2
  • HABP4
  • HGF
  • HRG
  • IGF1
  • IGF2
  • IGFIA
  • ISLR
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • ITIH3
  • ITIH4
  • KNG1
  • LAMP2
  • LEFTY1
  • LGALS7B
  • LHFPL2
  • LOC100685620
  • LOC102152706
  • LOC119866770
  • LOC490387
  • LY6G6F
  • MAGED2
  • MANF
  • NHLRC2
  • OLA1
  • PCDH7
  • PCYOX1L
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PECAM1
  • PHACTR2
  • PLEK
  • PLG
  • PPBP
  • PROS1
  • PSAP
  • QSOX1
  • RARRES2
  • SCCPDH
  • SCG3
  • SELENOP
  • SELP
  • SERPINA1
  • SERPINA3
  • SERPINA4
  • SERPINE1
  • SERPINF2
  • SERPING1
  • SOD1
  • SPARC
  • SPP2
  • SRGN
  • STXBP2
  • SYTL4
  • TAGLN2
  • TEX264
  • TGFB2
  • TGFB3
  • THBS1
  • TIMP1
  • TIMP3
  • TLN1
  • TMX3
  • TUBA4A
  • VCL
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VWF
  • WDR1
Canis familiaris (dog)
Platelet Adhesion to exposed collagen
  • ADAMTS13
  • F8VWF
  • FCER1G
  • FYN
  • GP6
  • LYN
  • VWF
Canis familiaris (dog)
Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • DLA-DQA1
  • DLA-DRA
  • HLA-DQB2
  • LCK
  • PAG1
  • PTPN22
  • PTPRC
  • PTPRJ
  • TRAV29DV5
Canis familiaris (dog)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR3
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF7A
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR3
  • PLCG1
Canis familiaris (dog)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR2
  • KGF
  • PLCG1
Canis familiaris (dog)
Phospholipase C-mediated cascade: FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • KL
  • PLCG1
Canis familiaris (dog)
Phase I - Functionalization of compounds
  • AADAC
  • AHR
  • AHRR
  • ALDH3
  • ALDH3A1
  • AOC2
  • AOC3
  • ARNT
  • ARNT2
  • BPHL
  • C5BR
  • CBR3
  • CES2
  • CES5A
  • CMBL
  • CYB5B
  • CYB5R3
  • CYP2B6
  • CYP3A12
  • DIA1
  • EPHX1
  • LOC119868939
  • LOC119875773
  • LOC119876349
  • MTARC1
  • NQO2
Canis familiaris (dog)
Phase 4 - resting membrane potential
  • IRK1
  • KCNJ12
  • KCNJ14
  • KCNJ2
  • KCNK1
  • KCNK10
  • KCNK12
  • KCNK13
  • KCNK15
  • KCNK16
  • KCNK17
  • KCNK18
  • KCNK3
  • KCNK4
  • KCNK5
  • KCNK6
  • KCNK7
  • KCNK9
Canis familiaris (dog)
Phase 3 - rapid repolarisation
  • CERG
  • ERG
  • KCNA5
  • KCNE2
  • KCNE3
  • KCNE4
  • KCNE5
  • KCNH2
Canis familiaris (dog)
Phase 2 - plateau phase
  • CACNA1C
  • CACNA2D2
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG7
  • CACNG8
Canis familiaris (dog)
Phase 0 - rapid depolarisation
  • CACNA1C
  • CACNA2D2
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG7
  • CACNG8
Canis familiaris (dog)
Peptide ligand-binding receptors
  • ACKR1
  • AGT
  • AGTR1
  • AGTR2
  • BDKRB1
  • BDKRB2
  • BRS3
  • Bdkrb2
  • C3
  • C3AR1
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • CCK
  • CCKBR
  • CXCL8
  • ECE1
  • ECE2
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • GAL
  • GALR1
  • GALR2
  • GALR3
  • GPER1
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GRP
  • GRPR
  • IL8
  • KEL
  • KISS1R
  • KNG1
  • Kiss1
  • MC2R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MCH
  • MCHR1
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • MTLR
  • NLN
  • NMB
  • NMBR
  • NMS
  • NMU
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPS
  • NPSR1
  • NPY
  • NPY1R
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5
  • NPY5R
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • OPRD1
  • OPRK1
  • OPRM1
  • PDYN
  • PENK
  • PMCH
  • POMC
  • PPY
  • PRLH
  • PRLHR
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR1
  • PSAP
  • PYY
  • SST
  • SSTR1
  • SSTR2
  • SSTR3
  • SSTR5
  • TRH
  • TRHR
  • UTS2B
  • UTS2R
  • XK
Canis familiaris (dog)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


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Last updated: August 19, 2024