GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 151 - 175 of 268 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Post-translational protein phosphorylation
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMELX
  • AMTN
  • ANO8
  • APLP2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APP
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • CALU
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • COA5
  • CP
  • CSF1
  • DMP1
  • DNAJC3
  • ENAM
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FBN1
  • FGA
  • FGF23
  • FGF8B
  • FN1
  • FSTL1
  • FSTL3
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • GRP94
  • HRC
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP7
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC102156332
  • LOC481722
  • LOC607874
  • LTBP1
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MFGE8
  • MIA3
  • MXRA8
  • NOTUM
  • NUCB1
  • P4HB
  • PDIA6
  • PENK
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • QSOX1
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SERPINA1
  • SERPINC1
  • SERPIND1
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • STC2
  • TGOLN2
  • TIMP1
  • TMEM132A
  • TNC
  • TRA1
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
Canis familiaris (dog)
SHC-mediated cascade:FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • GRB2
  • HRAS
  • KL
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
Canis familiaris (dog)
MHC class II antigen presentation
  • ACTR10
  • ACTR1A
  • ACTR1B
  • AP1B1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARF1
  • CANX
  • CAPZA2
  • CAPZA3
  • CAPZB
  • CD74
  • CENPE
  • CLTA
  • CLTC
  • CTRN1
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSC
  • CTSD
  • CTSE
  • CTSF
  • CTSH
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSO
  • CTSS
  • DCTN1
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN6
  • DLA-DMA
  • DLA-DMB
  • DLA-DOA
  • DLA-DQA1
  • DLA-DRA
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • HLA-DQB2
  • IFI30
  • KIF11
  • KIF18A
  • KIF20A
  • KIF22
  • KIF23
  • KIF26A
  • KIF2B
  • KIF2C
  • KIF3A
  • KIF3C
  • KIF4A
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KIFAP3
  • KLC1
  • KLC3
  • KLC4
  • LAG3
  • LGMN
  • LOC100856399
  • LOC119868747
  • LOC119876190
  • LOC612266
  • OSBPL1A
  • PHLPP2
  • QTRT1
  • RAB7
  • RAB7A
  • RACGAP1
  • RILP
  • SEC13
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SH3GL2
  • SPTBN2
Canis familiaris (dog)
Glycosphingolipid catabolism
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSF
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSJ
  • ARSK
  • ARSL
  • ASAH1
  • ASAH2
  • CTSA
  • ENPP7
  • GALC
  • GBA1
  • GBA2
  • GBA3
  • GLA
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GM2A
  • HEXA
  • HEXB
  • M6PR
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • PSAP
  • SMPD1
  • SMPD2
  • SMPD3
  • SMPD4
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
  • arsb
Canis familiaris (dog)
Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins
  • AQP1
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AVP
  • AVPR2
  • GNAS
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG11
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT2
  • LOC119863873
  • MYO5B
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11FIP2
Canis familiaris (dog)
Negative regulation of FGFR1 signaling
  • ANOS1
  • CBL
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • FRS2
  • GRB2
  • KL
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PTPN11
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
Canis familiaris (dog)
Ub-specific processing proteases
  • ABCC7
  • ADRB2
  • ADRM1
  • AR
  • ARRB1
  • ARRB2
  • ATXN7
  • AXIN1
  • AXIN2
  • BECN1
  • BIRC2
  • BIRC3
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCP110
  • CDC20
  • CDC25A
  • CDK16
  • CFTR
  • CLSPN
  • CYLD
  • FKBP8
  • FOXO4
  • GATA3
  • H2AC1
  • H2AC13
  • H2AC14
  • H2AC16
  • H2AC19
  • H2AC21
  • H2AC25
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2BC10
  • H2BC15
  • H2BC2
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • HGS
  • HIF1A
  • IDE
  • IFIH1
  • IKBKG
  • IL33
  • KAT2A
  • KEAP1
  • LOC100686569
  • LOC100687259
  • LOC100688437
  • LOC119867694
  • LOC119867696
  • LOC119867718
  • LOC119868881
  • LOC119869165
  • LOC119869175
  • LOC119869178
  • LOC119869187
  • LOC119869258
  • LOC119874734
  • LOC482940
  • LOC610717
  • MAP3K7
  • MAT2B
  • MDM2
  • MDM4
  • MMAC1
  • MUL1
  • MYC
  • Madh3
  • NFKBIA
  • OTUB1
  • POLB
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • PTEN
  • PTRH2
  • RCE1
  • RHOT1
  • RIPK1
  • RNF123
  • RNF128
  • RNF146
  • RPS27A
  • RUVBL1
  • SIAH2
  • SMAD1
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD7
  • SMURF2
  • STAM2
  • SUDS3
  • TAB1
  • TADA2B
  • TADA3
  • TAF10
  • TAF9B
  • TGFBR1
  • TNKS
  • TNKS2
  • TOMM20
  • TOMM70
  • TP53
  • TRAF2
  • TRAF6
  • TRRAP
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • USP10
  • USP12
  • USP13
  • USP14
  • USP15
  • USP16
  • USP18
  • USP19
  • USP2
  • USP20
  • USP21
  • USP22
  • USP26
  • USP28
  • USP3
  • USP30
  • USP33
  • USP34
  • USP37
  • USP4
  • USP42
  • USP44
  • USP47
  • USP48
  • USP49
  • USP5
  • USP7
  • USP8
  • VDAC1
  • VDAC2
  • VDAC3
  • WDR20
  • WDR48
  • p53
Canis familiaris (dog)
Interleukin receptor SHC signaling
  • CSF2
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • GAB2
  • GRB2
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL3
  • IL5
  • IL5RA
  • INPP5D
  • INPPL1
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • LOC100856339
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTPN6
  • SHC1
  • SHIP2
  • SOS1
Canis familiaris (dog)
Initial triggering of complement
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • COLEC10
  • FCN2
  • LOC481722
  • MASP1
  • MASP2
Canis familiaris (dog)
EPH-Ephrin signaling
  • EFNA1
  • EFNA2
  • EFNA3
  • EFNA4
  • EFNA5
  • EFNB1
  • EFNB2
  • EFNB3
  • EPHA1
  • EPHA10
  • EPHA2
  • EPHA3
  • EPHA4
  • EPHA5
  • EPHA7
  • EPHA8
  • EPHB2
  • EPHB3
  • EPHB4
  • EPHB6
  • efnB2
Canis familiaris (dog)
ABC-family proteins mediated transport
  • ABCA4
  • ABCA8
  • ABCB1
  • ABCB4
  • ABCB5
  • ABCB9
  • ABCC1
  • ABCC10
  • ABCC11
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ABCC4
  • ABCC5
  • ABCC6
  • ABCC7
  • ABCC9
  • ABCF1
  • Abcc4
  • CFTR
  • DERL1
  • DERL2
  • DERL3
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • ERLEC1
  • ERLIN1
  • ERLIN2
  • KCNJ11
  • LOC100686569
  • LOC100687259
  • LOC610717
  • MRP1
  • OS9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RNF5
  • RPS27A
  • SEL1L
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • VCP
Canis familiaris (dog)
Drug-mediated inhibition of MET activation
  • HGF
  • MET
Canis familiaris (dog)
Macroautophagy
  • AMBRA1
  • ATG10
  • ATG101
  • ATG12
  • ATG13
  • ATG14
  • ATG16L1
  • ATG3
  • ATG4A
  • ATG4B
  • ATG4C
  • ATG4D
  • ATG5
  • ATG7
  • ATG9A
  • ATG9B
  • BECN1
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP7
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • GABARAP
  • GABARAPL2
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • MAP1LC3C
  • MLST8
  • MTMR14
  • MTMR3
  • MTOR
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
  • RB1CC1
  • RHEB
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SLC38A9
  • TSC1
  • TSC2
  • ULK1
  • UVRAG
  • WDR45
  • WDR45B
  • WIPI1
  • WIPI2
Canis familiaris (dog)
Recycling of bile acids and salts
  • ABCC3
  • ALB
  • Abcb11e
  • BAAT
  • BSEP
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • RXRA
  • SLC10A1
  • SLC10A2
  • SLC27A5
  • SLC51A
  • SLC51B
  • SLCO1A2
  • SLCO1B2
  • SLCO1B3
  • STARD5
  • slc10a2
Canis familiaris (dog)
Trafficking and processing of endosomal TLR
  • CNPY3
  • CTSB
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSS
  • GRP94
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • LGMN
  • TLR3
  • TLR7
  • TLR8
  • TLR9
  • TRA1
  • UNC93B1
Canis familiaris (dog)
Interferon gamma signaling
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2G
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • JAK1
  • JAK2
  • LOC479011
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKCD
  • PTPN6
  • SOCS3
  • STAT1
  • YBX1
Canis familiaris (dog)
Hyaluronan biosynthesis and export
  • ABCC5
  • CEMIP
  • HAS1
  • HAS2
  • HAS3
Canis familiaris (dog)
GP1b-IX-V activation signalling
  • F8VWF
  • RAF1
  • SRC
  • VWF
  • YWHAZ
Canis familiaris (dog)
Reactions specific to the complex N-glycan synthesis pathway
  • CHST10
  • FUCA1
  • FUT5
  • FUT8
  • MAN2A1
  • MAN2A2
  • MGAT2
Canis familiaris (dog)
Integrin cell surface interactions
  • BSG
  • CD44
  • CD47
  • CDH1
  • COL13A1
  • COL16A1
  • COL18A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COMP
  • F11R
  • FBN1
  • FN1
  • IBSP
  • ICAM1
  • ICAM2
  • ICAM3
  • ICAM4
  • ICAM5
  • ITGA1
  • ITGA10
  • ITGA11
  • ITGA2
  • ITGA2B
  • ITGA3
  • ITGA4
  • ITGA5
  • ITGA6
  • ITGA8
  • ITGA9
  • ITGAD
  • ITGAE
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB2
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB7
  • ITGB8
  • JAM3
  • LOC119867047
  • LUM
  • MADCAM1
  • PECAM1
  • SEBOX
  • SPP1
  • THBS1
  • TNC
  • VCAM1
Canis familiaris (dog)
Sialic acid metabolism
  • CMAS
  • CTSA
  • GLB1
  • GNE
  • NANP
  • NANS
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • NPL
  • SLC17A5
  • SLC35A1
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL5
  • ST3GAL6
  • ST6GAL1
  • ST6GAL2
  • ST6GALNAC1
  • ST6GALNAC2
  • ST6GALNAC3
  • ST6GALNAC4
  • ST6GALNAC5
  • ST6GALNAC6
  • ST8SIA1
  • ST8SIA2
  • ST8SIA3
  • ST8SIA4
  • ST8SIA5
  • ST8SIA6
Canis familiaris (dog)
Glycosphingolipid biosynthesis
  • A4GALT
  • B3GALNT1
  • B3GALT4
  • B4GALNT1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • CERK
  • FUT2
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL5
  • ST6GALNAC5
  • ST6GALNAC6
  • ST8SIA5
  • UGCG
  • UGT8
Canis familiaris (dog)
Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein
  • ALG1
  • ALG12
  • ALG14
  • ALG2
  • ALG3
  • ALG6
  • ALG8
  • ALG9
  • DPAGT1
  • MPDU1
Canis familiaris (dog)
Regulation of IFNG signaling
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • JAK1
  • JAK2
  • PIAS1
  • PTPN2
  • SOCS3
  • STAT1
  • SUMO1
Canis familiaris (dog)
Extra-nuclear estrogen signaling
  • AREG
  • BTC
  • CAV
  • CAV-2
  • CAV1
  • CAV2
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • EREG
  • ESR1
  • ESR2
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI3
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG11
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT2
  • HBEGF
  • IGF1R
  • LOC100856339
  • LOC119863873
  • MMP2
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP9
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRMT1
  • PTK2
  • S1PR3
  • SHC1
  • SPHK1
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • ZDHHC21
  • ZDHHC7
Canis familiaris (dog)

About Release Notes Help Feedback

Click here to visit the beta site.


International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024