GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 268 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Glycosphingolipid catabolism
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSF
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSJ
  • ARSK
  • ARSL
  • ASAH1
  • ASAH2
  • CTSA
  • ENPP7
  • GALC
  • GBA1
  • GBA2
  • GBA3
  • GLA
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GM2A
  • HEXA
  • HEXB
  • M6PR
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • PSAP
  • SMPD1
  • SMPD2
  • SMPD3
  • SMPD4
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
  • arsb
Canis familiaris (dog)
Glycosphingolipid biosynthesis
  • A4GALT
  • B3GALNT1
  • B3GALT4
  • B4GALNT1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • CERK
  • FUT2
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL5
  • ST6GALNAC5
  • ST6GALNAC6
  • ST8SIA5
  • UGCG
  • UGT8
Canis familiaris (dog)
Glycolysis
  • ADPGK
  • ALDOA
  • ALDOB
  • ALDOC
  • BPGM
  • ENO2
  • ENO3
  • ENO4
  • GAPDH
  • GAPDHS
  • GCK
  • GNPDA1
  • GNPDA2
  • GPI
  • HK1
  • HK2
  • HK3
  • HKDC1
  • LOC106558132
  • PFKL
  • PFKM
  • PFKP
  • PGAM1
  • PGAM2
  • PGK1
  • PGK2
  • PGM2L1
  • PKLR
  • TPI1
Canis familiaris (dog)
Glycogen breakdown (glycogenolysis)
  • AGL
  • CALM2
  • GAA
  • GYG1
  • GYG2
  • PHKA1
  • PHKA2
  • PHKB
  • PHKG2
  • PYGL
  • PYGM
Canis familiaris (dog)
Glycerophospholipid biosynthesis
  • AGK
  • CPNE3
  • CPNE7
Canis familiaris (dog)
Gluconeogenesis
  • ALDOA
  • ALDOB
  • ALDOC
  • ENO2
  • ENO3
  • ENO4
  • FBP1
  • FBP2
  • G6PC1
  • G6PC2
  • G6PC3
  • GAPDH
  • GAPDHS
  • GPI
  • LOC106558132
  • PC
  • PCK1
  • PCK2
  • PGAM1
  • PGAM2
  • PGK1
  • PGK2
  • SLC37A1
  • SLC37A2
  • SLC37A4
  • TPI1
Canis familiaris (dog)
Generation of second messenger molecules
  • CD101
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • DLA-DQA1
  • DLA-DRA
  • FYB1
  • GRAP2
  • HLA-DQB2
  • ITK
  • LAT
  • LCK
  • LCP2
  • NCK1
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PLCG1
  • PLCG2
  • TRAV29DV5
  • ZAP70
Canis familiaris (dog)
Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK
  • CCKBR
  • CREB1
  • GAS
  • GAST
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPK7
  • RPS6KA1
  • RPS6KA2
  • RPS6KA3
Canis familiaris (dog)
Gamma-carboxylation of protein precursors
  • BGLAP
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • GGCX
  • PROC
  • PROS1
Canis familiaris (dog)
Gamma carboxylation, hypusinylation, hydroxylation, and arylsulfatase activation
  • FN3K
  • FN3KRP
Canis familiaris (dog)
Galactose catabolism
  • GALE
  • GALK1
  • GALT
  • H3-3B
Canis familiaris (dog)
GRB2:SOS provides linkage to MAPK signaling for Integrins
  • APBB1IP
  • F8VWF
  • FN1
  • GRB2
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • PTK2
  • RAP1A
  • RAP1B
  • SOS1
  • SRC
  • TLN1
  • VWF
Canis familiaris (dog)
GPVI-mediated activation cascade
  • CDC42
  • CLEC1B
  • FCER1G
  • FYN
  • GP40
  • GP6
  • LAT
  • LCK
  • LCP2
  • LOC100856339
  • LYN
  • MPIG6B
  • PDPK1
  • PDPN
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CG
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R5
  • PIK3R6
  • PLCG2
  • PTPN11
  • PTPN6
  • RAC1
  • RAC2
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOG
  • SYK
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
Canis familiaris (dog)
GP1b-IX-V activation signalling
  • F8VWF
  • RAF1
  • SRC
  • VWF
  • YWHAZ
Canis familiaris (dog)
GDP-fucose biosynthesis
  • FCSK
  • FPGT
  • FUOM
  • GFUS
  • GMDS
  • SLC35C1
Canis familiaris (dog)
GABA synthesis, release, reuptake and degradation
  • CPLX1
  • DNAJC5
  • GAD1
  • GAD2
  • GAD65
  • GAD67
  • LOC607182
  • RAB3A
  • RIMS1
  • SLC32A1
  • SNAP25
  • STX1A
  • STXBP1
  • SYT1
  • VAMP2
Canis familiaris (dog)
G alpha (q) signalling events
  • 5-HTR2A
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1D
  • AGT
  • AGTR1
  • ANXA1
  • APP
  • ARHGEF25
  • AVP
  • AVPR1A
  • AVPR1B
  • BDKRB1
  • BDKRB2
  • BRS3
  • BTK
  • Bdkrb2
  • CASR
  • CCK
  • CCKBR
  • CCL23
  • CHRM1
  • CHRM3
  • CHRM5
  • CYSLTR1
  • CYSLTR2
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • FFAR1
  • FFAR2
  • FFAR4
  • FPR2
  • GAS
  • GAST
  • GCG
  • GCGR
  • GHRL
  • GHSR
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG11
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT2
  • GNRH1
  • GNRHR
  • GPR132
  • GPR143
  • GPR17
  • GPR39
  • GPR68
  • GPRC6A
  • GRK2
  • GRM1
  • GRM5
  • GRP
  • GRPR
  • HCRT
  • HCRTR1
  • HCRTR2
  • HRH1
  • HTR2A
  • HTR2B
  • HTR2C
  • KALRN
  • KISS1R
  • KNG1
  • Kiss1
  • LOC100856339
  • LOC116183080
  • LOC119863873
  • LOC119865171
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR4
  • LPAR5
  • LPAR6
  • LTB4R2
  • MCH
  • MCHR1
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • MTLR
  • MTLRP
  • NMB
  • NMBR
  • NMS
  • NMU
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPFFR1
  • NPFFR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • OPN4
  • OX
  • OXT
  • OXTR
  • P2RY1
  • P2RY10
  • P2RY11
  • P2RY2
  • P2RY6
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
  • PLCB4
  • PMCH
  • PPOX
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR1
  • PTAFR
  • PTGER1
  • PTGFR
  • QRFP
  • QRFPR
  • RGS1
  • RGS13
  • RGS16
  • RGS17
  • RGS18
  • RGS19
  • RGS2
  • RGS21
  • RGS3
  • RGS4
  • RGS5
  • RGSL1
  • TAC1
  • TACR1
  • TACR2
  • TACR3
  • TBXA2R
  • TRH
  • TRHR
  • UTS2B
  • UTS2R
  • XCR1
Canis familiaris (dog)
G alpha (i) signalling events
  • ADORA1
  • ADORA3
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
  • AGT
  • AGTR2
  • ANXA1
  • APP
  • BDKRB1
  • BDKRB2
  • Bdkrb2
  • C3
  • C3AR1
  • C5
  • C5AR1
  • CAFA-T2R43
  • CASR
  • CB2
  • CCL19
  • CCL23
  • CCL25
  • CCL28
  • CCL4
  • CCR1
  • CCR10
  • CCR5
  • CCR7
  • CCR9
  • CHRM2
  • CHRM4
  • CMKBR5
  • CNR2
  • CX3CL1
  • CX3CR1
  • CXCL10
  • CXCL11
  • CXCL13
  • CXCL16
  • CXCL6
  • CXCL8
  • CXCR2
  • CXCR3
  • CXCR5
  • CXCR6
  • DRD3
  • FPR2
  • GABBR1
  • GABBR2
  • GAL
  • GALR1
  • GALR2
  • GALR3
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI3
  • GNAT1
  • GNAT2
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG11
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT2
  • GPER1
  • GPR17
  • GPR18
  • GPR183
  • GPR31
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GPR55
  • GPSM1
  • GPSM2
  • GPSM3
  • GRM2
  • GRM3
  • GRM4
  • GRM6
  • GRM7
  • GRM8
  • HCAR1
  • HCAR2
  • HRH4
  • HTR1B
  • HTR1D
  • HTR1E
  • HTR1F
  • HTR5A
  • IL8
  • KNG1
  • LOC100682759
  • LOC119863873
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR5
  • MCH
  • MCHR1
  • MCHR2
  • MTNR1A
  • MTNR1B
  • NMS
  • NMU
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPY
  • NPY1R
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5
  • NPY5R
  • OPN1LW
  • OPN1SW
  • OPN3
  • OPN5
  • OPRD1
  • OPRK1
  • OPRM1
  • OXER1
  • OXGR1
  • P2RY12
  • P2RY14
  • PCP2
  • PDYN
  • PENK
  • PMCH
  • POMC
  • PPBP
  • PPY
  • PSAP
  • PTGDR2
  • PTGER3
  • PYY
  • RCP
  • RDC7
  • RGR
  • RGS1
  • RGS11
  • RGS12
  • RGS13
  • RGS14
  • RGS16
  • RGS17
  • RGS18
  • RGS19
  • RGS20
  • RGS21
  • RGS3
  • RGS4
  • RGS5
  • RGS6
  • RGS7
  • RGS8
  • RGS9
  • RHO
  • RLN3
  • RRH
  • RXFP3
  • S1PR2
  • S1PR3
  • S1PR4
  • S1PR5
  • SCYA4
  • SRC
  • SST
  • SSTR1
  • SSTR2
  • SSTR3
  • SSTR5
  • SUCNR1
  • TAS1R1
  • TAS1R3
  • TAS2R1
  • TAS2R10
  • TAS2R3
  • TAS2R38
  • TAS2R39
  • TAS2R4
  • TAS2R40
  • TAS2R41
  • TAS2R42
  • TAS2R5
  • TAS2R7
  • ccr9
  • cx3cl1
  • gpr81
Canis familiaris (dog)
Fructose biosynthesis
  • AKR1B1
  • SORD
Canis familiaris (dog)
Formation of the cornified envelope
  • CAPN1
  • CAPNS1
  • CASP14
  • CSTA
  • DSC1
  • DSC3
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • EVPL
  • FLG
  • FURIN
  • JUP
  • KAZN
  • KLK12
  • KLK13
  • KLK14
  • LIPJ
  • LIPK
  • LIPM
  • LIPN
  • LOC119876865
  • PCSK6
  • PERP
  • PI3
  • PKP1
  • PKP2
  • PKP3
  • PKP4
  • PPL
  • PRSS8
  • RPTN
  • SPINK6
  • TCHH
  • TGM1
  • cystatin A
Canis familiaris (dog)
Ficolins bind to repetitive carbohydrate structures on the target cell surface
  • FCN2
  • MASP1
  • MASP2
Canis familiaris (dog)
FRS-mediated FGFR3 signaling
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF7A
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR3
  • FRS2
  • FRS3
  • GRB2
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • PTPN11
  • SOS1
Canis familiaris (dog)
FRS-mediated FGFR2 signaling
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR2
  • FRS2
  • FRS3
  • GRB2
  • HRAS
  • KGF
  • KRAS
  • NRAS
  • PTPN11
  • SOS1
Canis familiaris (dog)
FRS-mediated FGFR1 signaling
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • FRS2
  • FRS3
  • GRB2
  • HRAS
  • KL
  • KRAS
  • NRAS
  • PTPN11
  • SOS1
Canis familiaris (dog)
FGFRL1 modulation of FGFR1 signaling
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF7A
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGFRL1
  • SPRED1
  • SPRED2
Canis familiaris (dog)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024