GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 268 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
COPII-mediated vesicle transport
  • ANKRD28
  • AREG
  • BET1
  • CD59
  • CNIH1
  • CNIH2
  • CNIH3
  • CSNK1D
  • CTSC
  • CTSZ
  • F5
  • GOLGA2
  • GORASP1
  • GOSR2
  • GRIA1
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • LOC119876190
  • LOC609612
  • MCFD2
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NSF
  • PPP6C
  • PPP6R1
  • PPP6R3
  • PREB
  • RAB1
  • RAB1A
  • SCFD1
  • SEC13
  • SEC16A
  • SEC16B
  • SEC22A
  • SEC22C
  • SEC23A
  • SEC23IP
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SERPINA1
  • STX17
  • STX5
  • TBC1D20
  • TFG
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
  • TRAPPC1
  • TRAPPC10
  • TRAPPC2
  • TRAPPC2L
  • TRAPPC3
  • TRAPPC4
  • TRAPPC6A
  • TRAPPC6B
  • TRAPPC9
  • USO1
  • YKT6
Canis familiaris (dog)
Digestion
  • ALPI
  • GUCA2A
  • GUCA2B
  • GUCY2C
  • PIR
Canis familiaris (dog)
Fructose biosynthesis
  • AKR1B1
  • SORD
Canis familiaris (dog)
Phase I - Functionalization of compounds
  • AADAC
  • AHR
  • AHRR
  • ALDH3
  • ALDH3A1
  • AOC2
  • AOC3
  • ARNT
  • ARNT2
  • BPHL
  • C5BR
  • CBR3
  • CES2
  • CES5A
  • CMBL
  • CYB5B
  • CYB5R3
  • CYP2B6
  • CYP3A12
  • DIA1
  • EPHX1
  • LOC119868939
  • LOC119875773
  • LOC119876349
  • MTARC1
  • NQO2
Canis familiaris (dog)
Cytoprotection by HMOX1
  • ABCC1
  • ALB
  • BLVRA
  • CARM1
  • CHD9
  • COX11
  • COX16
  • COX18
  • COX4I1
  • COX5A
  • COX5B
  • COX7A2L
  • CREBBP
  • CYC
  • CYCS
  • FABP1
  • GLNA2
  • GLNA3
  • HBQ1
  • HDAC3
  • HMOX1
  • HMOX2
  • LOC100682956
  • LOC100684983
  • LOC100688724
  • LOC119868178
  • LOC477508
  • LOC606860
  • LOC609402
  • LOC612644
  • LRPPRC
  • MED1
  • MRP1
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA6
  • NCOR1
  • NCOR2
  • PPARA
  • RXRA
  • SCO1
  • SCO2
  • SIN3A
  • SIN3B
  • SMARCD3
  • SURF1
  • TACO1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TGS1
Canis familiaris (dog)
Post-translational protein phosphorylation
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMELX
  • AMTN
  • ANO8
  • APLP2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APP
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • CALU
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • COA5
  • CP
  • CSF1
  • DMP1
  • DNAJC3
  • ENAM
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FBN1
  • FGA
  • FGF23
  • FGF8B
  • FN1
  • FSTL1
  • FSTL3
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • GRP94
  • HRC
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP7
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC102156332
  • LOC481722
  • LOC607874
  • LTBP1
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MFGE8
  • MIA3
  • MXRA8
  • NOTUM
  • NUCB1
  • P4HB
  • PDIA6
  • PENK
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • QSOX1
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SERPINA1
  • SERPINC1
  • SERPIND1
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • STC2
  • TGOLN2
  • TIMP1
  • TMEM132A
  • TNC
  • TRA1
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
Canis familiaris (dog)
Regulation of IGF Activity by IGFBP
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMELX
  • AMTN
  • ANO8
  • APLP2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APP
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • CALU
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • COA5
  • CP
  • CSF1
  • DMP1
  • DNAJC3
  • ENAM
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FBN1
  • FGA
  • FGF23
  • FGF8B
  • FN1
  • FSTL1
  • FSTL3
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • GRP94
  • HRC
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • IGF1
  • IGF2
  • IGFBP2
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP6
  • IGFBP7
  • IGFIA
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC102156332
  • LOC481722
  • LOC607874
  • LTBP1
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MFGE8
  • MIA3
  • MXRA8
  • NOTUM
  • NUCB1
  • P4HB
  • PAPPA
  • PAPPA2
  • PDIA6
  • PENK
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • QSOX1
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SERPINA1
  • SERPINC1
  • SERPIND1
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • STC2
  • TGOLN2
  • TIMP1
  • TMEM132A
  • TNC
  • TRA1
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
Canis familiaris (dog)
Regulation of Glucokinase by Glucokinase Regulatory Protein
  • AAAS
  • GCK
  • GCKR
  • NDC1
  • NUP107
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP54
  • NUP58
  • NUP62
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUP98
  • POM121C
  • RANBP2
  • SEC13
  • TPR
Canis familiaris (dog)
A tetrasaccharide linker sequence is required for GAG synthesis
  • AGRN
  • B3GALT6
  • B3GAT1
  • B3GAT2
  • B3GAT3
  • B4GALT7
  • BCAN
  • BGN
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • DCN1C
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • NCAN
  • SDC1
  • SDC3
  • SDC4
  • VCAN
  • XYLT1
  • XYLT2
Canis familiaris (dog)
HS-GAG degradation
  • AGRN
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • GUSB
  • HPSE
  • HPSE2
  • IDS
  • IDUA
  • NAGLU
  • SDC1
  • SDC3
  • SDC4
  • SGSH
  • ids
Canis familiaris (dog)
Keratan sulfate degradation
  • ACAN
  • FMOD
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GNS
  • HEXA
  • HEXB
  • KERA
  • LUM
  • OGN
  • OMD
  • PRELP
Canis familiaris (dog)
ECM proteoglycans
  • ACAN
  • AGRN
  • BCAN
  • BGN
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COMP
  • DCN
  • DCN1C
  • DMP1
  • DSPP
  • HAPLN1
  • ITGA2
  • ITGA2B
  • ITGA7
  • ITGA8
  • ITGA9
  • ITGAD
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • MATN1
  • MATN3
  • MATN4
  • NCAN
  • SEBOX
  • SERPINE1
  • SPARC
  • TNC
  • TNR
  • VCAN
Canis familiaris (dog)
Adherens junctions interactions
  • AFDN
  • CADM1
  • CADM2
  • CADM3
  • CDH1
  • CDH10
  • CDH11
  • CDH12
  • CDH13
  • CDH15
  • CDH17
  • CDH18
  • CDH2
  • CDH24
  • CDH3
  • CDH4
  • CDH5
  • CDH6
  • CDH7
  • CDH8
  • CDH9
  • CTNNA1
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • JUP
  • NECTIN1
  • NECTIN2
  • NECTIN3
  • NECTIN4
Canis familiaris (dog)
Peptide ligand-binding receptors
  • ACKR1
  • AGT
  • AGTR1
  • AGTR2
  • BDKRB1
  • BDKRB2
  • BRS3
  • Bdkrb2
  • C3
  • C3AR1
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • CCK
  • CCKBR
  • CXCL8
  • ECE1
  • ECE2
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • GAL
  • GALR1
  • GALR2
  • GALR3
  • GPER1
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GRP
  • GRPR
  • IL8
  • KEL
  • KISS1R
  • KNG1
  • Kiss1
  • MC2R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MCH
  • MCHR1
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • MTLR
  • NLN
  • NMB
  • NMBR
  • NMS
  • NMU
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPS
  • NPSR1
  • NPY
  • NPY1R
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5
  • NPY5R
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • OPRD1
  • OPRK1
  • OPRM1
  • PDYN
  • PENK
  • PMCH
  • POMC
  • PPY
  • PRLH
  • PRLHR
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR1
  • PSAP
  • PYY
  • SST
  • SSTR1
  • SSTR2
  • SSTR3
  • SSTR5
  • TRH
  • TRHR
  • UTS2B
  • UTS2R
  • XK
Canis familiaris (dog)
Class B/2 (Secretin family receptors)
  • ADGRE1
  • ADGRE3
  • ADGRE5
  • CD55
  • CRH
  • CRHBP
  • CRHR1
  • CRHR2
  • LOC484897
  • PTH
  • PTH1
  • PTH1R
  • PTH2
  • PTH2R
  • PTHLH
  • PTHR1
  • UCN
  • UCN3
Canis familiaris (dog)
Adenosine P1 receptors
  • ADORA1
  • ADORA2A
  • ADORA3
  • RDC7
  • RDC8
Canis familiaris (dog)
Transcriptional and post-translational regulation of MITF-M expression and activity
  • AIMP1
  • AIMP2
  • CREBBP
  • DARS1
  • EEF1E1
  • EPRS1
  • GSK3B
  • IARS1
  • KARS1
  • KIT
  • KITLG
  • LARS1
  • LOC100684571
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MARS1
  • MGF
  • MITF
  • QARS1
  • RARS1
  • RPS6KA1
  • WNT3A
  • XPO1
Canis familiaris (dog)
MET activates RAP1 and RAC1
  • CRK
  • CRKL
  • DOCK7
  • GAB1
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • RAC1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RAPGEF1
Canis familiaris (dog)
p130Cas linkage to MAPK signaling for integrins
  • APBB1IP
  • BCAR1
  • CRK
  • F8VWF
  • FN1
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • PTK2
  • RAP1A
  • RAP1B
  • SRC
  • TLN1
  • VWF
Canis familiaris (dog)
The retinoid cycle in cones (daylight vision)
  • AWAT2
  • DHRS3
  • OPN1LW
  • OPN1SW
  • RBP3
  • RCP
  • RLBP1
Canis familiaris (dog)
Arachidonic acid metabolism
  • DGAT2L6
  • FAAH
  • PLA2G4A
Canis familiaris (dog)
Glycerophospholipid biosynthesis
  • AGK
  • CPNE3
  • CPNE7
Canis familiaris (dog)
Synthesis of bile acids and bile salts via 7alpha-hydroxycholesterol
  • ACOT8
  • ACOX2
  • Abcb11e
  • BAAT
  • BSEP
  • CYP27A1
  • CYP7A1
  • CYP7B1
  • CYP8B1
  • HSD17B4
  • HSD3B7
  • LOC119874618
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • PTGIS
  • RXRA
  • SCP2
  • SLC27A2
  • SLC27A5
Canis familiaris (dog)
Unblocking of NMDA receptors, glutamate binding and activation
  • ACTN2
  • CALM2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2G
  • DLG1
  • DLG2
  • DLG3
  • DLG4
  • GRIA1
  • GRIA2
  • GRIA3
  • GRIA4
  • GRIN1
  • GRIN2A
  • GRIN2B
  • GRIN2C
  • GRIN2D
  • LRRC7
  • NEFL
  • NMDAR1
Canis familiaris (dog)
RAF/MAP kinase cascade
  • ACTN2
  • ANGPT1
  • AREG
  • BTC
  • CALM2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2G
  • CSF2
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • DLG1
  • DLG2
  • DLG3
  • DLG4
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • FRS3
  • FYN
  • GDNF
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA4
  • GRB2
  • GRIN1
  • GRIN2B
  • GRIN2D
  • HBEGF
  • HGF
  • HRAS
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL3
  • IL5
  • IL5RA
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • KGF
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • KRAS
  • LAT
  • LRRC7
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • MGF
  • NCAM1
  • NEFL
  • NMDAR1
  • NRAPGEP
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRTN
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDZGEF1
  • PEA15
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PSPN
  • PTK2
  • PTPRA
  • RALGDS
  • RANBP9
  • RAPGEF2
  • RASGEF1A
  • RASGRF1
  • RASGRF2
  • RASGRP1
  • RASGRP3
  • RASGRP4
  • RET
  • RGL1
  • RGL2
  • RGL3
  • SHC1
  • SHC2
  • SHC3
  • SOS1
  • SPTA1
  • SPTAN1
  • SPTB
  • SPTBN1
  • SPTBN2
  • SPTBN5
  • TEK
  • TGFA
Canis familiaris (dog)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024