GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 226 - 250 of 252 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Nicotinate metabolism
  • cb1024
  • id:ibd5068
  • im:7144541
  • mibp
  • nadka
  • nadsyn1
  • nmnat1
  • nmnat2
  • nt5e
  • urk
  • zgc:110083
  • zgc:110243
  • zgc:63784
Danio rerio (zebrafish)
Energy dependent regulation of mTOR by LKB1-AMPK
  • RRAGB
  • cb116
  • frap1
  • gbl
  • im:7154392
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • mapksp1
  • mlst8
  • mtor
  • prkaa1
  • prkab1a
  • prkag1
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
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  • si:dkey-176g4.2
  • slc38a9
  • tor
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  • wu:fd12h04
  • zgc:111971
  • zgc:56499
  • zgc:63896
  • zgc:73144
  • zgc:92228
Danio rerio (zebrafish)
Macroautophagy
  • Atg12
  • GABARAPL2
  • KM0005
  • MAP1-LC3A
  • MAP1-LC3B
  • MAP1-LC3C
  • Map1lc3
  • RRAGB
  • ambra1b
  • apg4b
  • apg4c
  • apg5l
  • atg10
  • atg101
  • atg12
  • atg13
  • atg4a
  • atg4b
  • atg4c
  • atg4cl
  • atg4da
  • atg5
  • bc2
  • cb116
  • cb741
  • chmp2a
  • chmp2ba
  • chmp3
  • chmp4b
  • chmp4c
  • chmp6
  • chmp6l
  • chmp7
  • dlc-1
  • dnl2
  • dnl2l
  • dynll2a
  • dynll2b
  • frap1
  • gabarap
  • gabarapa
  • gabarapl2
  • gbl
  • im:7153729
  • im:7154392
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • map1lc3a
  • map1lc3b
  • map1lc3c
  • mapksp1
  • mg:bb02b03
  • mlst8
  • mtor
  • prkaa1
  • prkab1a
  • prkag1
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • sb:cb130
  • si:ch211-212h16.5
  • si:ch211-224m9.5
  • si:dkey-176g4.2
  • slc38a9
  • tor
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  • wdr45b
  • wdr45l
  • wipi1
  • wipi3
  • wipi4
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  • wu:fd12h04
  • wu:fj43a09
  • zgc:100934
  • zgc:110812
  • zgc:111958
  • zgc:111971
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  • zgc:56499
  • zgc:56565
  • zgc:63896
  • zgc:64205
  • zgc:66081
  • zgc:73144
  • zgc:77094
  • zgc:86888
  • zgc:92228
  • zgc:92319
Danio rerio (zebrafish)
G beta:gamma signalling through PI3Kgamma
  • akt2
  • akt3b
  • cb945
  • pdpk1b
  • rhoac
  • zgc:77318
Danio rerio (zebrafish)
RHO GTPases activate PKNs
  • CPI-17
  • Pp1alpha-96A
  • im:7147597
  • mbs
  • mypt1
  • pdpk1b
  • pkn1b
  • pkn2
  • pkn3
  • ppp1cbl
  • ppp1r12a
  • ppp1r14a
  • ppp1r14aa
  • prk2
  • prkcl2
  • rac1
  • rac1a
  • rhoac
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  • wu:fd16e02
  • zgc:110700
  • zgc:55823
  • zgc:55917
  • zgc:64169
  • zgc:77318
  • zgc:86934
Danio rerio (zebrafish)
PI3K/AKT Signaling
  • ARHG
  • EGFR12
  • EGFR15
  • ER[b]2
  • ER[b]a
  • NRG2b
  • akt2
  • akt3b
  • btc
  • cb945
  • dob
  • egfr
  • egfra
  • epgn
  • erbb2
  • erbb3
  • erbb3b
  • erbb4
  • erbb4a
  • erbeta2
  • esr
  • esr1
  • esr2a
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hbegfa
  • id:ibd5158
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • kl
  • nr3a1
  • nrg2b
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • pdgfra
  • pdpk1b
  • pik3ap1
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3cd
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pik3r3a
  • rac1
  • rac1a
  • rac2
  • rhog
  • rhogb
  • sgk
  • sgk1
  • si:ch211-227n20.1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sparse
  • src
  • strn
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  • wu:fk56b03
  • wu:fv70f10
  • zfER-beta2
  • zfER[b]2
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:153249
  • zgc:194535
  • zgc:55823
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  • zgc:55917
  • zgc:63473
  • zgc:63601
  • zgc:73077
  • zgc:73230
  • zgc:77318
  • zgc:86686
  • zgc:86934
Danio rerio (zebrafish)
Hedgehog ligand biogenesis
  • CH211-265P12.8
  • LMP7
  • PA28-gamma
  • PSMA5
  • PSMB9A
  • PSMD10
  • Psma2
  • Psmb11b
  • Y
  • beta1
  • beta1ia
  • beta2i
  • beta5
  • beta5ia
  • beta5tb
  • cdc48
  • derl2
  • erlec1
  • etID309919.2
  • fa93g07
  • fb17c09
  • fb20g04
  • fb49a10
  • fc34f08
  • fj42d12
  • fk89d05
  • gankyrin
  • hha
  • hm:zeh0386
  • hrd1
  • ihh
  • ihha
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  • im:6909944
  • lmp2
  • lmp7
  • macropain
  • os9
  • p4hb
  • prosome
  • psma1
  • psma2
  • psma2a
  • psma2b
  • psma3
  • psma4
  • psma5
  • psma6b
  • psma7
  • psma8
  • psmb1
  • psmb10
  • psmb11b
  • psmb12
  • psmb13a
  • psmb2
  • psmb3
  • psmb5
  • psmb6
  • psmb8
  • psmb8a
  • psmb9
  • psmb9a
  • psmc1
  • psmc1a
  • psmc1b
  • psmc2
  • psmc4
  • psmc5
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  • psmd1
  • psmd10
  • psmd11b
  • psmd12
  • psmd13
  • psmd14
  • psmd3
  • psmd4
  • psmd4a
  • psmd6
  • psmd7
  • psmd8
  • psme1
  • psme2
  • psme3
  • psme4b
  • rps27a
  • sb:cb309
  • shh
  • shha
  • shhb
  • si:rp71-45k5.4
  • si:zc14a17.13
  • syvn1
  • tdsubc_1f2
  • twhh
  • uba52
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  • unp310
  • vcp
  • vhh1
  • wu:fa14g03
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  • wu:fa91f08
  • wu:fa93g07
  • wu:faa49c06
  • wu:fb05d04
  • wu:fb11d10
  • wu:fb17c09
  • wu:fb19c08
  • wu:fb20g04
  • wu:fb23a11
  • wu:fb38a06
  • wu:fb49a10
  • wu:fb59c07
  • wu:fb98h03
  • wu:fc34f08
  • wu:fc49f02
  • wu:fc85c10
  • wu:fe05d10
  • wu:fe38b10
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  • wu:fj14c10
  • wu:fj22d05
  • wu:fj42d12
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  • wu:fk89d05
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  • x
  • xx:tdsubc_1f2
  • y
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  • zgc:56516
  • zgc:63709
  • zgc:63995
  • zgc:65867
  • zgc:66168
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  • zgc:77369
  • zgc:77482
  • zgc:86762
  • zgc:86820
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  • zgc:86851
  • zgc:86923
  • zgc:91842
  • zgc:92282
  • zgc:92464
  • zgc:92596
  • zgc:92716
  • zgc:92726
  • zgc:92791
Danio rerio (zebrafish)
Hedgehog 'on' state
  • CH211-265P12.8
  • LMP7
  • PA28-gamma
  • PSMA5
  • PSMB9A
  • PSMD10
  • Psma2
  • Su(fu)
  • Y
  • beta1
  • beta1ia
  • beta2i
  • beta5
  • beta5ia
  • cos2
  • cul3
  • cul3b
  • dre
  • dzip1
  • etID309919.2
  • fa93g07
  • fb17c09
  • fb20g04
  • fb49a10
  • fc34f08
  • fc85b05
  • fi39e05
  • fj42d12
  • fk89d05
  • gankyrin
  • gli2
  • gli2a
  • gli3
  • gpr161
  • hm:zeh0386
  • igu
  • ik:tdsubc_1f2
  • im:6909944
  • im:7137515
  • im:7142603
  • itch
  • itcha
  • itchb
  • kif7
  • lmp2
  • lmp7
  • macropain
  • numb
  • prosome
  • psma1
  • psma2
  • psma2a
  • psma2b
  • psma3
  • psma4
  • psma5
  • psma6b
  • psmb1
  • psmb10
  • psmb12
  • psmb13a
  • psmb2
  • psmb3
  • psmb5
  • psmb6
  • psmb8
  • psmb8a
  • psmb9
  • psmb9a
  • psmc1
  • psmc1a
  • psmc1b
  • psmc2
  • psmc4
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  • psmc6
  • psmd1
  • psmd10
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  • psmd13
  • psmd14
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  • psmd4
  • psmd4a
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  • psmd7
  • psmd8
  • psme1
  • psme2
  • psme3
  • rbx1
  • rps27a
  • sb:eu762
  • si:rp71-45k5.4
  • si:zc14a17.13
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  • spopl
  • spopla
  • sufu
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  • uba52
  • ulk3
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  • unp310
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  • wu:fa66f04
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  • wu:fa93g07
  • wu:faa49c06
  • wu:fb05d04
  • wu:fb11d10
  • wu:fb17c09
  • wu:fb19c08
  • wu:fb20g04
  • wu:fb23a11
  • wu:fb38a06
  • wu:fb49a10
  • wu:fb59c07
  • wu:fb98h03
  • wu:fc34f08
  • wu:fc49f02
  • wu:fc85b05
  • wu:fc85c10
  • wu:fe05d10
  • wu:fe38b10
  • wu:fi03c01
  • wu:fi39e05
  • wu:fj14c10
  • wu:fj22d05
  • wu:fj42d12
  • wu:fk89d05
  • wu:fu88b08
  • x
  • xx:tdsubc_1f2
  • y
  • yot
  • you-too
  • zgc:109707
  • zgc:109823
  • zgc:110363
  • zgc:110710
  • zgc:114044
  • zgc:123344
  • zgc:136444
  • zgc:162272
  • zgc:55284
  • zgc:55818
  • zgc:56176
  • zgc:56374
  • zgc:56377
  • zgc:56471
  • zgc:56516
  • zgc:63709
  • zgc:63995
  • zgc:65867
  • zgc:66168
  • zgc:77369
  • zgc:77482
  • zgc:86762
  • zgc:86820
  • zgc:86833
  • zgc:86851
  • zgc:86923
  • zgc:91842
  • zgc:92282
  • zgc:92464
  • zgc:92596
  • zgc:92716
  • zgc:92726
  • zgc:92791
Danio rerio (zebrafish)
Ub-specific processing proteases
  • CH211-129M12.3
  • CH211-265P12.8
  • CycA2
  • LMP7
  • LOC100332229
  • LOC559473
  • LOC570661
  • MDA5a
  • MDA5b
  • NR3C4
  • PA28-gamma
  • PSMA5
  • PSMB9A
  • PSMD10
  • Psma2
  • Psmb11b
  • TOM70
  • VDAC1
  • Y
  • ada3
  • adrb2b
  • adrm1b
  • ar
  • atxn7
  • becn1
  • beta1
  • beta1ia
  • beta2i
  • beta5
  • beta5ia
  • beta5tb
  • cb671
  • ccna1
  • ccna2
  • cdc20
  • chunp6924
  • cylda
  • drp53
  • etID309919.2
  • fa13f11
  • fa93g07
  • fb17c09
  • fb20g04
  • fb49a10
  • fc34f08
  • fd14f08
  • fj33c07
  • fj42d12
  • fj60c10
  • fk89d05
  • fkbp8
  • gankyrin
  • h2af1al
  • h2afx1
  • h2ax1
  • hist2h2l
  • hm:zeh0386
  • ide
  • ifih1
  • ik:tdsubc_1f2
  • ikbkg
  • im:6899389
  • im:6909944
  • im:7146383
  • kat2a
  • keap1b
  • lmp2
  • lmp7
  • macropain
  • madh1
  • madh2
  • madh3
  • madh3a
  • madh7
  • mat2b
  • mul1b
  • nemo
  • prosome
  • psma1
  • psma2
  • psma2a
  • psma2b
  • psma3
  • psma4
  • psma5
  • psma6b
  • psma7
  • psma8
  • psmb1
  • psmb10
  • psmb11b
  • psmb12
  • psmb13a
  • psmb2
  • psmb3
  • psmb5
  • psmb6
  • psmb8
  • psmb8a
  • psmb9
  • psmb9a
  • psmc1
  • psmc1a
  • psmc1b
  • psmc2
  • psmc4
  • psmc5
  • psmc6
  • psmd1
  • psmd10
  • psmd11b
  • psmd12
  • psmd13
  • psmd14
  • psmd3
  • psmd4
  • psmd4a
  • psmd6
  • psmd7
  • psmd8
  • psme1
  • psme2
  • psme3
  • psme4b
  • ptrh2
  • rhot1a
  • rps27a
  • ruvbl1
  • si:ch211-113a14.29
  • si:dkey-72l14.8
  • si:dkey-81j5.2
  • si:rp71-11b17.7
  • si:rp71-45k5.4
  • si:zc14a17.13
  • siah2
  • siah2l
  • siaz
  • smad1
  • smad2
  • smad3
  • smad3a
  • smad7
  • smurf2
  • suds3
  • tada2b
  • tada3
  • tada3l
  • taf10
  • tdsubc_1f2
  • tgfbr1b
  • tomm20b
  • tomm70a
  • tp53
  • traf2b
  • traf6
  • trrap
  • uba52
  • unp309
  • unp310
  • usp13
  • usp14
  • usp16
  • usp20
  • usp22
  • usp30
  • usp33
  • usp37
  • usp42
  • usp44
  • usp49
  • usp5
  • vdac1
  • vdac2
  • wu:fa01a08
  • wu:fa06b05
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  • wu:fa14g03
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  • wu:fb05d04
  • wu:fb11d10
  • wu:fb17c09
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  • wu:fb23a11
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  • wu:fb38a06
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  • wu:fb59c07
  • wu:fb98h03
  • wu:fc21h02
  • wu:fc34f08
  • wu:fc49f02
  • wu:fc61g08
  • wu:fc85c10
  • wu:fd14f08
  • wu:fe05d10
  • wu:fe38b10
  • wu:fe49f10
  • wu:fi03c01
  • wu:fi20d12
  • wu:fi36f03
  • wu:fi41g10
  • wu:fj09f02
  • wu:fj14c10
  • wu:fj22d05
  • wu:fj33c07
  • wu:fj42d12
  • wu:fj58b04
  • wu:fj60c10
  • wu:fk28c01
  • wu:fk63d09
  • wu:fk89d05
  • wu:fu88b08
  • x
  • xx:tdsubc_1f2
  • y
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Danio rerio (zebrafish)
ABC-family proteins mediated transport
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Danio rerio (zebrafish)
Glycosphingolipid biosynthesis
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Danio rerio (zebrafish)
MTOR signalling
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Danio rerio (zebrafish)
mTORC1-mediated signalling
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Danio rerio (zebrafish)
TP53 Regulates Metabolic Genes
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  • mtco3
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Danio rerio (zebrafish)
The canonical retinoid cycle in rods (twilight vision)
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Danio rerio (zebrafish)
Metabolism of folate and pterines
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Danio rerio (zebrafish)
RHOG GTPase cycle
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Danio rerio (zebrafish)
Phospholipase C-mediated cascade: FGFR1
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Danio rerio (zebrafish)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR4
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Danio rerio (zebrafish)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR3
  • dob
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Danio rerio (zebrafish)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR2
  • dob
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  • zgc:109774
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Danio rerio (zebrafish)
Downstream signal transduction
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  • zgc:73077
  • zgc:92024
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by ALK
  • alk
  • alkal1
  • alkal2b
  • cb518
  • fb79b05
  • fj33b02
  • fj46f04
  • fj48a12
  • mdk
  • mdk2
  • mdkb
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3r1
  • pik3r2
  • plcg1
  • plei2
  • ptn
  • wu:fb65b05
  • wu:fb79b05
  • wu:fj33b02
  • wu:fj46f04
  • wu:fj48a12
  • wu:fj57a05
  • zHBNF
  • zgc:111787
Danio rerio (zebrafish)
VEGFR2 mediated cell proliferation
  • fb09d10
  • fj46f04
  • flk1b
  • fv43b11
  • kdr
  • kdrb
  • pdpk1b
  • plcg1
  • prkcb1
  • prkcbb
  • prkcd
  • prkcda
  • src
  • vegf
  • vegfa
  • vegfaa
  • wu:fb09d10
  • wu:fj46f04
  • wu:fj57a05
  • wu:fv43b11
  • zgc:56558
  • zgc:77318
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol
  • fa11a08
  • fb73f10
  • fc83f12
  • fd16b10
  • fj46f04
  • fk90e11
  • inppl1a
  • itpk1b
  • plcd1a
  • plcd3a
  • plcg1
  • pten
  • ptenb
  • ship2a
  • si:bz1g13.4
  • wu:fa11a08
  • wu:fb73f10
  • wu:fc83f12
  • wu:fd16b10
  • wu:fj46f04
  • wu:fj57a05
  • wu:fk90e11
  • zgc:165641
Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024