GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 126 - 150 of 252 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
MTOR signalling
  • RRAGB
  • akt3b
  • frap1
  • gbl
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • mapksp1
  • mlst8
  • mtor
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • si:dkey-176g4.2
  • slc38a9
  • tor
  • wu:fc22h08
  • wu:fc68h09
  • ywhab
  • ywhab2
  • ywhabb
  • zgc:111971
  • zgc:56499
  • zgc:73144
Danio rerio (zebrafish)
MHC class II antigen presentation
  • Ap1m1
  • CTSB
  • GILT
  • Iclp-1
  • MHCII
  • Ppgb
  • ap1g2
  • ap1m2
  • ap1s1
  • ap1s2
  • arf1
  • b2m
  • canx
  • catD
  • cb173
  • cb271
  • cb420
  • cb460
  • cb912
  • cd74a
  • clta
  • ctsa
  • ctsb
  • ctsba
  • ctsc
  • ctsd
  • ctsf
  • ctsh
  • ctsk
  • ctsl
  • ctsl.1
  • ctss2.1
  • ctssb.1
  • ctssb1
  • dnm2
  • dnm2b
  • dnm2l
  • fc07e03
  • fc38f10
  • fc44c02
  • fc47h06
  • fj40d12
  • hla-dpa1
  • hm:zewp0159
  • iclp1
  • id:ibd1201
  • ifi30
  • ik:tdsubc_1h2
  • im:6797184
  • im:6910535
  • lgmn
  • mhc2b
  • mhc2d8.45b1
  • mhc2daa
  • mhc2dgb
  • ns:zf-a41
  • sar1a
  • sar1ab
  • sb:cb146
  • sb:cb173
  • sb:cb271
  • sb:cb420
  • sec13
  • sec13l1
  • sec23a
  • sec31a
  • sec31l1
  • sec31p
  • si:busm1-160c18.10
  • si:busm1-194e12.12
  • si:busm1-194e12.8
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  • si:busm1-266f07.2
  • si:busm1-48c11.4
  • si:dkey-239j18.2
  • si:dkey-269i1.3
  • si:dz160c18.10
  • si:dz194e12.12
  • si:dz194e12.8
  • si:dz228j01.6
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  • si:zc14a17.4
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  • wu:fb33g02
  • wu:fb34e12
  • wu:fb34g12
  • wu:fb36c08
  • wu:fb61d08
  • wu:fb78h01
  • wu:fb93e11
  • wu:fb94g06
  • wu:fc07e03
  • wu:fc38f10
  • wu:fc44c02
  • wu:fc47h06
  • wu:fd13d02
  • wu:fd19a08
  • wu:fe06b12
  • wu:fi17f10
  • wu:fj17b09
  • wu:fj40d12
  • wu:fj48d06
  • wu:fj58d01
  • wu:fj91g05
  • wu:fj92g08
  • wu:fk94e07
  • zf-a41
  • zgc:101701
  • zgc:103537
  • zgc:110367
  • zgc:110650
  • zgc:112226
  • zgc:112369
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  • zgc:123061
  • zgc:123302
  • zgc:153093
  • zgc:55862
  • zgc:56704
  • zgc:63524
  • zgc:63980
  • zgc:65802
  • zgc:65809
  • zgc:73358
  • zgc:76953
  • zgc:77181
  • zgc:77233
  • zgc:77925
  • zgc:85689
  • zgc:85774
  • zgc:92089
  • zmp:0000001138
Danio rerio (zebrafish)
MDK and PTN in ALK signaling
  • alk
  • cb518
  • fb79b05
  • fj33b02
  • fj48a12
  • mdk
  • mdk2
  • mdkb
  • plei2
  • ptn
  • wu:fb79b05
  • wu:fj33b02
  • wu:fj48a12
  • zHBNF
  • zgc:111787
Danio rerio (zebrafish)
MAP2K and MAPK activation
  • ARAF
  • ERK1
  • araf
  • cb208
  • fa56c06
  • fi06b09
  • il17rd
  • lamtor2
  • lamtor3
  • map2k1
  • map2k2
  • map2k2a
  • mapk1
  • mapk3
  • mapksp1
  • mek1
  • mek2
  • morg1
  • sb:eu994
  • sef
  • si:ch211-242m18.2
  • wdr83
  • wu:fa56c06
  • wu:fi06b09
  • wu:fj56a12
  • wu:fj61b01
  • wu:fk45h07
  • zERK1
  • zERK2
  • zgc:123171
  • zgc:56557
  • zgc:92074
Danio rerio (zebrafish)
Lysosphingolipid and LPA receptors
  • Lpar3
  • edg1
  • edg2
  • edg5
  • lpar1
  • lpar2a
  • lpar3
  • lpar5a
  • lpar6
  • lpar6l
  • p2ry5
  • s1pr1
  • s1pr2
  • s1pr5b
  • si:dz22b13.1
  • si:dz46m7.1
  • wu:fb62d01
  • zgc:101053
  • zgc:158362
  • zgc:66034
  • zgc:92157
Danio rerio (zebrafish)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • manba
  • zgc:55493
  • zgc:76896
Danio rerio (zebrafish)
Lewis blood group biosynthesis
  • LOC565422
  • LOC796410
  • LOC798349
  • b3galt10.1
  • b3galt11
  • b3galt2
  • fe05b03
  • fut10
  • fut11
  • fut7
  • fut9a
  • im:7151092
  • siat4c
  • st3gal4
  • wu:fe05b03
  • zgc:152705
  • zgc:158162
  • zgc:194168
  • zgc:194170
  • zgc:194313
  • zgc:194330
  • zgc:76904
Danio rerio (zebrafish)
Lactose synthesis
  • b4galt1l
  • fc29a02
  • glut1
  • glut1a
  • glut1b
  • lys-C
  • lyz
  • slc2a1
  • slc2a1a
  • wu:fc29a02
  • zgc:136734
  • zgc:154116
Danio rerio (zebrafish)
LDL remodeling
  • mtp
  • mttp
  • p4hb
  • psmb3
  • zgc:92596
Danio rerio (zebrafish)
LDL clearance
  • LOC565099
  • cbe
  • ces2
  • ces2a
  • im:6908784
  • ldlr
  • ldlra
  • nceh1a
  • npc2
  • npc2.2
  • si:dkey-21p1.4
  • si:dkey-38l12.2
  • soat1
  • zgc:153863
  • zgc:193713
  • zgc:193725
  • zgc:92416
Danio rerio (zebrafish)
Keratinization
  • cb112
  • cb80
  • ckii
  • dsc
  • dsc2
  • dsc2l
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • jup
  • jupa
  • krt18b
  • krt2-8
  • krt5
  • krt8
  • krt93
  • krt94
  • krt95
  • krt97
  • krtt1c6
  • pkp2
  • pkp3
  • pkp3a
  • sb:cb112
  • sb:cb481
  • wu:fa91c11
  • wu:fa91g11
  • wu:fa96h10
  • wu:fa97f09
  • wu:fb02h09
  • wu:fb58f07
  • wu:fj02d02
  • wu:fk69a12
  • wu:fk78b12
  • zfCKII
  • zgc:136656
  • zgc:66015
Danio rerio (zebrafish)
Keratan sulfate degradation
  • Lum
  • fmoda
  • gnsa
  • im:6910494
  • kera
  • lum
  • ogn
  • ogna
  • si:ch211-103f16.4
  • zgc:113456
  • zgc:113545
  • zgc:114066
  • zgc:86661
Danio rerio (zebrafish)
Keratan sulfate biosynthesis
  • B3GNT1
  • CH1073-177A15.1
  • Lum
  • b3gnt1
  • b3gnt2b
  • b3gnt3
  • b3gnt3.4
  • b3gnt7
  • b4galt1l
  • b4galt2
  • b4galt4
  • b4galt5
  • b4galt6
  • b4gat1
  • cb543
  • chst1
  • fk70b01
  • fmoda
  • im:6910494
  • im:7151092
  • kera
  • lum
  • ogn
  • ogna
  • si:ch211-103f16.4
  • si:ch211-261p7.4
  • siat4
  • siat4c
  • ssp1
  • ssp5
  • st3gal1l
  • st3gal2l
  • st3gal4
  • st3gal8
  • wu:fa55h04
  • wu:fc39c01
  • wu:fk30b12
  • wu:fk70b01
  • zgc:101780
  • zgc:111788
  • zgc:113456
  • zgc:113545
  • zgc:113947
  • zgc:154116
  • zgc:158162
  • zgc:55730
  • zgc:86661
Danio rerio (zebrafish)
Iron uptake and transport
  • Cul1
  • DMT1
  • LOC555483
  • aco1
  • cand1
  • cb141
  • cb193
  • cb426
  • cp
  • cul1a
  • cybrd1
  • fa07b10
  • fb06g09
  • fb78a05
  • fbxl5
  • fc27c04
  • fj01a11
  • fj24b11
  • fpn1
  • fth
  • fth1
  • fth1a
  • fth1b
  • fthl
  • fthl27
  • fthl28
  • fthl29
  • fthl31
  • hm:zeh0800
  • hm:zeh1145
  • hmox1
  • hmox1a
  • hmox2b
  • id:ibd5130
  • id:ibd5159
  • im:7160217
  • irp1
  • lcn15
  • nedd8l
  • pcft
  • ptgds
  • ptgdsa
  • ptgdsb
  • ptgdsb.1
  • ptgdsb.2
  • ptgdsl
  • sb:cb141
  • si:ch211-14a17.5
  • si:zc14a17.5
  • skp1
  • skp1a
  • slc11a2
  • slc39a1
  • slc40a1
  • slc46a1
  • wu:fa07b10
  • wu:fb06g09
  • wu:fb10b10
  • wu:fb11h03
  • wu:fb15e12
  • wu:fb78a05
  • wu:fc13a10
  • wu:fc27c04
  • wu:fi23f10
  • wu:fj01a11
  • wu:fj24b11
  • wu:fj24c01
  • wu:fo75b03
  • wu:fq18c10
  • zeh1145
  • zgc:136699
  • zgc:153704
  • zgc:153919
  • zgc:158768
  • zgc:194505
  • zgc:194526
  • zgc:198419
  • zgc:55729
  • zgc:55747
  • zgc:65984
  • zgc:73186
  • zgc:77500
  • zgc:92245
  • zgc:92768
Danio rerio (zebrafish)
Intestinal hexose absorption
  • glut2
  • slc2a2
  • slc5a1
  • wu:fb62h10
  • zgc:66074
  • zgc:85782
Danio rerio (zebrafish)
Interleukin-38 signaling
  • il-1FMA
  • il1fma
  • il1rapl1b
  • jnk1
  • mapk8
  • zmp:0000001271
Danio rerio (zebrafish)
Interaction With Cumulus Cells And The Zona Pellucida
  • CHIA
  • ZP3
  • ZPC
  • b4galt1l
  • chia.1
  • chia.2
  • chia.3
  • chia.4
  • chia.5
  • chia.6
  • chioIIa
  • chioIa
  • chioIb
  • chit1
  • fa55e05
  • fe16c11
  • fi20d05
  • fj87h02
  • im:6902904
  • si:dkey-202n12.1
  • si:dkey-51e6none
  • spam1
  • wu:fa55e05
  • wu:fa55g10
  • wu:fb57c11
  • wu:fb61c11
  • wu:fb66f12
  • wu:fd61a02
  • wu:fe16c11
  • wu:fi13f01
  • wu:fi20d05
  • wu:fj87h02
  • zfZPC
  • zgc:114017
  • zgc:153827
  • zgc:154116
  • zgc:158668
  • zgc:162961
  • zgc:173556
  • zgc:55406
  • zgc:55941
  • zgc:56053
  • zgc:63792
  • zgc:77889
  • zgc:77912
  • zp2
  • zp2.2
  • zp2a
  • zp2l1
  • zp2l2
  • zp2v2
  • zp3
  • zp3.2
  • zp3.3
  • zp3a.2
  • zp3al
  • zp3b
  • zp3d.1
  • zp3e
  • zpb2b
  • zpb2c
  • zpc1-2
  • zpc2
  • zpc3
  • zpc4a-1
  • zpc6
Danio rerio (zebrafish)
Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade
  • GRK1A
  • GUCA1D
  • METAP2
  • fk56b01
  • fk56e06
  • fnta
  • fntb
  • gcap1
  • gcap2
  • gcap3
  • gcap4
  • gcap5
  • gnat1
  • gng1
  • gngt1
  • grk1
  • grk1a
  • grk7-2
  • grk7b
  • guca1a
  • guca1aa
  • guca1ab.1
  • guca1b
  • guca1c
  • guca1d
  • guca1e
  • im:2601337
  • im:6909421
  • metap1
  • metap2
  • metap2b
  • nmt-1
  • nmt1
  • nmt1a
  • nmt2
  • rcv1a
  • rcvrna
  • rho
  • saga
  • si:rp71-1p14.1
  • wu:fb51d12
  • wu:fb98h06
  • wu:fb99h09
  • wu:fc15d01
  • wu:fc18a04
  • wu:fk53d06
  • wu:fk56b01
  • wu:fk56e06
  • wu:fz92f09
  • zfo2
  • zgc:110714
  • zgc:114180
  • zgc:158397
  • zgc:66109
  • zgc:66243
  • zgc:66250
  • zgc:73318
  • zgc:85885
  • zgc:86774
Danio rerio (zebrafish)
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell
  • SCN2B
  • cb810
  • cd226
  • cd40
  • cd40lg
  • cxadr
  • dl3
  • itga4
  • itgb1
  • itgb1b
  • itgb1b.1
  • itgb1b.2
  • mag
  • nectin1b
  • pvrl1b
  • sb:cb1043
  • sc:d147
  • scn2b
  • si:ch211-231h20.3
  • si:ch211-264f5.2
  • si:ch73-208g10.1
  • siglec-4
  • tnfsf10
  • tnfsf10l2
  • tnfsf10l4
  • zgc:113297
  • zgc:158817
  • zgc:85632
  • zgc:92320
Danio rerio (zebrafish)
Hyaluronan uptake and degradation
  • hyal1
Danio rerio (zebrafish)
Hyaluronan biosynthesis and export
  • abcc5
  • fj51h02
  • si:ch1073-183g13.2
  • wu:fj51h02
Danio rerio (zebrafish)
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors
  • LOC555747
  • LOC556619
  • chrna1
  • chrna2
  • chrna2a
  • chrna4
  • chrna4b
  • chrna5
  • chrna6
  • chrna7
  • chrna7a
  • chrnb3a
  • dZ70B1.1
  • nic1
  • si:dkey-234d14.1
  • zgc:110642
  • zgc:136717
Danio rerio (zebrafish)
Highly calcium permeable nicotinic acetylcholine receptors
  • LOC555747
  • LOC556619
  • chrna1
  • chrna2
  • chrna2a
  • chrna4
  • chrna4b
  • chrna6
  • chrnb3a
  • nic1
  • si:dkey-234d14.1
  • zgc:136717
Danio rerio (zebrafish)
Heme signaling
  • HBA2r
  • HBAA1
  • LOC100334599
  • MGC173646
  • OTTDARP00000001843
  • OTTDARP00000001844
  • OTTDARP00000001846
  • OTTDARP00000002003
  • SI:dZ118J2.10
  • SI:dZ118J2.7
  • SI:dZ118J2.8
  • SI:dZ118J2.9
  • bE1
  • ba1
  • ba1l
  • be1c
  • dZ118J2.6
  • hba2
  • hbae1
  • hbae1.1
  • hbae1.2
  • hbae1.3
  • hbba2
  • hbbe1
  • hbbe1.1
  • hbbe1.2
  • hbbe1.3
  • hbbe1c
  • hbbe2
  • hbbe3
  • pcft
  • pgrmc2
  • si:busm1-118j2.5
  • si:by119c3.1
  • si:by119c3.2
  • si:by119c3.3
  • si:ch211-5k11.12
  • si:xx-119c3.3
  • slc46a1
  • wu:fa12a11
  • wu:fb25g12
  • wu:fb74f06
  • wu:fd12f11
  • zgc:110736
  • zgc:56692
  • zgc:86936
Danio rerio (zebrafish)
Hedgehog ligand biogenesis
  • CH211-265P12.8
  • LMP7
  • PA28-gamma
  • PSMA5
  • PSMB9A
  • PSMD10
  • Psma2
  • Psmb11b
  • Y
  • beta1
  • beta1ia
  • beta2i
  • beta5
  • beta5ia
  • beta5tb
  • cdc48
  • derl2
  • erlec1
  • etID309919.2
  • fa93g07
  • fb17c09
  • fb20g04
  • fb49a10
  • fc34f08
  • fj42d12
  • fk89d05
  • gankyrin
  • hha
  • hm:zeh0386
  • hrd1
  • ihh
  • ihha
  • ik:tdsubc_1f2
  • im:6909944
  • lmp2
  • lmp7
  • macropain
  • os9
  • p4hb
  • prosome
  • psma1
  • psma2
  • psma2a
  • psma2b
  • psma3
  • psma4
  • psma5
  • psma6b
  • psma7
  • psma8
  • psmb1
  • psmb10
  • psmb11b
  • psmb12
  • psmb13a
  • psmb2
  • psmb3
  • psmb5
  • psmb6
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Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024