GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 126 - 150 of 252 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Estrogen-dependent gene expression
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • carm1
  • cited1
  • erbb4
  • erbb4a
  • esr
  • esr1
  • fc15h02
  • fi05d05
  • fj36b10
  • fkd7
  • forkhead-7
  • foxa1
  • gata3
  • gb:dq017620
  • gro1
  • groucho1
  • gta3
  • gtf2a1
  • gtf2a2
  • h2af1al
  • h2afvb
  • h2afvl
  • h2afx1
  • h2afza
  • h2av
  • h2ax1
  • h2az2a
  • h2az2b
  • h3-5
  • h3f3a
  • h3f3b.1
  • h3f3c
  • h3f3d
  • hist2h2l
  • im:6896397
  • jmjd2b
  • kat2b
  • kat5a
  • kdm4b
  • nr3a1
  • nrip1a
  • pg
  • pgr
  • pr
  • si:ch211-113a14.17
  • si:ch211-113a14.29
  • si:ch211-113a14.6
  • si:ch211-124a3.4
  • si:ch211-227n20.1
  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
  • si:dkey-108k21.18
  • si:dkey-108k21.28
  • si:dkey-23a13.7
  • tbp
  • tf2a
  • tle3b
  • wu:fc15h02
  • wu:fi05d05
  • wu:fj36b10
  • zgc:112234
  • zgc:113984
  • zgc:173585
  • zgc:173587
  • zgc:194998
  • zgc:55847
  • zgc:56685
Danio rerio (zebrafish)
TCF dependent signaling in response to WNT
  • ctnnb1
Danio rerio (zebrafish)
Enzymatic degradation of Dopamine by monoamine oxidase
  • comta
Danio rerio (zebrafish)
Enzymatic degradation of dopamine by COMT
  • comta
  • mrc
  • tomt
Danio rerio (zebrafish)
Apoptotic execution phase
  • bcap31
  • casp10
  • casp8l2
  • dnm1l
  • si:bz30i22.4
  • si:rp71-30i22.4
  • stk24a
  • zgc:163071
  • zgc:56389
Danio rerio (zebrafish)
Neurotransmitter clearance
  • cbe
  • ces2
  • ces2a
  • im:6908784
  • oct1
  • si:dkey-38l12.2
  • slc22a2
  • wu:fc01b11
  • zgc:153863
  • zgc:64076
Danio rerio (zebrafish)
LDL clearance
  • LOC565099
  • cbe
  • ces2
  • ces2a
  • im:6908784
  • ldlr
  • ldlra
  • nceh1a
  • npc2
  • npc2.2
  • si:dkey-21p1.4
  • si:dkey-38l12.2
  • soat1
  • zgc:153863
  • zgc:193713
  • zgc:193725
  • zgc:92416
Danio rerio (zebrafish)
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors)
  • CB1R
  • cb1
  • cb2a
  • cb2b
  • cnr1
  • cnr2
  • gpr183
  • gpr183a
  • gpr35.1
  • gpr39
  • hcar1-4
  • mel1ar
  • mel1br
  • mtnr1aa
  • mtnr1ar
  • mtnr1bb
  • mtnr1br
  • mtnr1br-2
  • oxgr1a.1
  • ptafr
  • zgc:136854
  • zgc:64187
Danio rerio (zebrafish)
Apoptotic cleavage of cell adhesion proteins
  • E-cad
  • casp3
  • casp3a
  • cdh1
  • ctnnb1
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • ocln
  • oclna
  • wu:fd23h10
  • wu:fi13c01
  • zgc:100890
  • zgc:113992
  • zgc:56359
Danio rerio (zebrafish)
Adherens junctions interactions
  • E-cad
  • R-cadherin
  • cadm1b
  • cb903
  • cdh1
  • cdh10
  • cdh10a
  • cdh11
  • cdh17
  • cdh2
  • cdh4
  • cdh5
  • cdh6
  • cdhvn
  • fb65d02
  • nectin1b
  • nectin3
  • pac
  • pvrl1b
  • pvrl3l
  • rcad
  • rnasel2
  • rnasel3
  • rnasel4
  • sc:d0664
  • si:ch211-139g14.6
  • vnc
  • wu:fb65d02
  • zgc:103673
  • zgc:136316
Danio rerio (zebrafish)
Cell surface interactions at the vascular wall
  • ESAM
  • Iclp-1
  • JAM
  • MIF
  • SCN2B
  • cb810
  • cd74a
  • ceacam1
  • cxadr
  • epcam
  • esam
  • esama
  • f11r
  • f11r.1
  • hm:zeh0068
  • iclp1
  • itga4
  • itgb1
  • itgb1b
  • itgb1b.1
  • itgb1b.2
  • jam2a
  • jam3b
  • jamb
  • jamc
  • mif
  • sb:cb6
  • sc:d0175
  • sc:d0254
  • scn2b
  • selp
  • selplg
  • si:ch211-260g14.4
  • si:ch211-264f5.6
  • tacstd
  • wu:fb11f09
  • wu:fb12a01
  • wu:fb13d06
  • wu:fc07c05
  • wu:fj17g02
  • wu:fk94e07
  • zeh0068
  • zgc:103642
  • zgc:110304
  • zgc:77119
  • zgc:85632
Danio rerio (zebrafish)
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell
  • SCN2B
  • cb810
  • cd226
  • cd40
  • cd40lg
  • cxadr
  • dl3
  • itga4
  • itgb1
  • itgb1b
  • itgb1b.1
  • itgb1b.2
  • mag
  • nectin1b
  • pvrl1b
  • sb:cb1043
  • sc:d147
  • scn2b
  • si:ch211-231h20.3
  • si:ch211-264f5.2
  • si:ch73-208g10.1
  • siglec-4
  • tnfsf10
  • tnfsf10l2
  • tnfsf10l4
  • zgc:113297
  • zgc:158817
  • zgc:85632
  • zgc:92320
Danio rerio (zebrafish)
VEGF ligand-receptor interactions
  • figf
  • vegf
  • vegf-d
  • vegfa
  • vegfaa
  • vegfc
  • vegfd
Danio rerio (zebrafish)
VEGF binds to VEGFR leading to receptor dimerization
  • figf
  • flk1b
  • flt-4
  • flt4
  • kdr
  • kdrb
  • vegf
  • vegf-d
  • vegfa
  • vegfaa
  • vegfc
  • vegfd
  • vegfr3
Danio rerio (zebrafish)
Myogenesis
  • Ctnna2
  • MEF2B
  • R-cadherin
  • boc
  • cb507
  • cb553
  • cb641
  • cdh2
  • cdh4
  • cdon
  • ctnna1
  • ctnnb1
  • etID309781.16
  • fa16d03
  • fk53b11
  • mapk11
  • mapk12b
  • mapk14
  • mapk14b
  • mef2D
  • mef2b
  • mef2d
  • mrf4
  • myf-5
  • myf5
  • myf6
  • myod
  • myod1
  • myog
  • pac
  • rcad
  • si:ch211-125m10.1
  • si:dkey-14d8.5
  • tcf12
  • tcf3a
  • tcf3b
  • wu:fa10c03
  • wu:fa16d03
  • wu:fb94b11
  • wu:fc50h03
  • wu:fk53b11
  • zgc:100763
  • zgc:109833
  • zgc:110509
  • zgc:136316
  • zgc:158240
  • zgc:86905
Danio rerio (zebrafish)
Detoxification of Reactive Oxygen Species
  • TXN
  • cat
  • cb356
  • cb463
  • cb58
  • cb718
  • cb893
  • cuzn
  • cyba
  • cybb
  • cyc
  • ero1a
  • ero1l
  • fa02f07
  • fb15h09
  • gpx7
  • gpx8
  • gpx9
  • gstp1
  • gstp1.2
  • hm:zehl0637
  • im:6902827
  • im:7151832
  • ncf1
  • ncf2
  • nudt2
  • p4hb
  • prdx1
  • prdx2
  • prdx3
  • prdx5
  • prdx6
  • psmb3
  • si:ch73-111m19.2
  • sod1
  • sod2
  • sod3a
  • txn
  • txn2
  • wu:fa02f07
  • wu:fb15h09
  • wu:fj23a02
  • wu:fj33b01
  • wu:fk49e09
  • wu:fq19b09
  • zgc:103706
  • zgc:110282
  • zgc:110343
  • zgc:112293
  • zgc:112318
  • zgc:112512
  • zgc:158405
  • zgc:64144
  • zgc:66077
  • zgc:73051
  • zgc:73360
  • zgc:77127
  • zgc:91915
  • zgc:92596
  • zgc:92891
  • zgc:92903
Danio rerio (zebrafish)
CS/DS degradation
  • DC
  • bcan
  • bgn
  • bgna
  • cspg2b
  • dcan
  • dcn
  • decorin
  • fb99b07
  • fi32a12
  • hyal1
  • ids
  • ncanb
  • vcanb
  • wu:fb99b07
  • wu:fi32a12
  • zgc:158245
  • zgc:91989
Danio rerio (zebrafish)
A tetrasaccharide linker sequence is required for GAG synthesis
  • DC
  • Gpc2
  • Gpc5a
  • Gpc6a
  • SDC4
  • b3galt6
  • b3gat2
  • bcan
  • bgn
  • bgna
  • cb440
  • chunp6920
  • cspg2b
  • dcan
  • dcn
  • decorin
  • fb99b07
  • fc47a08
  • fe05f10
  • fi32a12
  • gal3st4
  • gpc1
  • gpc2
  • gpc3
  • gpc4
  • gpc4/6
  • gpc5
  • gpc5a
  • gpc6
  • gpc6a
  • gpc6l
  • im:6970974
  • kny
  • knypek
  • ncanb
  • sdc2
  • sdc4
  • sdc4l
  • si:ch1073-86a3.1
  • vcanb
  • wu:fb99b07
  • wu:fc47a08
  • wu:fc47g09
  • wu:fe05f10
  • wu:fi32a12
  • xylt1
  • zgc:103676
  • zgc:194854
  • zgc:91925
  • zgc:91989
Danio rerio (zebrafish)
Dermatan sulfate biosynthesis
  • DC
  • bcan
  • bgn
  • bgna
  • chst14
  • cspg2b
  • d4st1
  • dcan
  • dcn
  • decorin
  • dse
  • fb99b07
  • fi32a12
  • ncanb
  • si:dkey-121j17.2
  • vcanb
  • wu:fb99b07
  • wu:fi32a12
  • zgc:91989
Danio rerio (zebrafish)
Chondroitin sulfate biosynthesis
  • DC
  • bcan
  • bgn
  • bgna
  • chst11
  • chst12b.2
  • chst15
  • chst3b
  • chsy1
  • chys1
  • cspg2b
  • dcan
  • dcn
  • decorin
  • fb99b07
  • fi32a12
  • ncanb
  • si:dkey-26i13.3
  • vcanb
  • wu:fb99b07
  • wu:fc27h05
  • wu:fc27h06
  • wu:fi32a12
  • zgc:64191
  • zgc:91989
Danio rerio (zebrafish)
HS-GAG biosynthesis
  • 2-OST
  • 2OST
  • 3-OST-6
  • 3OST6
  • Gpc2
  • Gpc5a
  • Gpc6a
  • HS2st
  • HS2st1
  • HS3st2
  • HS3st3X
  • HS3st3Z
  • HS3st6
  • SDC4
  • cb440
  • chunp6920
  • ext1b
  • ext2
  • fc14g07
  • fc47a08
  • fe05f10
  • fj47c03
  • gal3st4
  • gpc1
  • gpc2
  • gpc3
  • gpc4
  • gpc4/6
  • gpc5
  • gpc5a
  • gpc6
  • gpc6a
  • gpc6l
  • hs2st1
  • hs2st1a
  • hs3st2
  • hs3st3b1a
  • hs3st3b1b
  • hs3st3l
  • hs6st
  • hs6st1
  • hs6st1a
  • hs6st2
  • hs6st3b
  • im:6970974
  • im:7147474
  • kny
  • knypek
  • ndst1
  • ndst1b
  • ndst2b
  • sdc2
  • sdc4
  • sdc4l
  • si:ch1073-86a3.1
  • wu:fc14g07
  • wu:fc47a08
  • wu:fc47g09
  • wu:fe05f10
  • wu:fj47c03
  • zgc:103676
  • zgc:152967
  • zgc:158230
  • zgc:194854
Danio rerio (zebrafish)
PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
  • ARHG
  • EGFR12
  • EGFR15
  • ERK1
  • ER[b]2
  • ER[b]a
  • LOC560360
  • NRG2b
  • akt3b
  • btc
  • dob
  • egfr
  • egfra
  • epgn
  • erbb2
  • erbb3
  • erbb3b
  • erbb4
  • erbb4a
  • erbeta2
  • esr
  • esr1
  • esr2a
  • fb17h07
  • fb18e12
  • fc05c02
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fi06b09
  • fk24a01
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hbegfa
  • id:ibd5158
  • ik:tdsubc_2h3
  • im:7139868
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • kl
  • mapk1
  • mapk3
  • nr3a1
  • nrg2b
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • pdgfra
  • pik3ap1
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3cd
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pik3r3a
  • pip4k2a
  • pip4k2aa
  • pip4k2c
  • pip5k1a
  • pip5k1aa
  • pip5k2
  • pip5k2c
  • ppp2ca
  • ppp2caa
  • ppp2cb
  • ppp2r1b
  • ppp2r1bb
  • ppp2r5c
  • ppp2r5cb
  • rac1
  • rac1a
  • rac2
  • rhog
  • rhogb
  • si:ch211-227n20.1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkey-241l7.9
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sparse
  • src
  • strn
  • tdsubc_2h3
  • wu:fa11a11
  • wu:fb05c08
  • wu:fb16a12
  • wu:fb17h07
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb38a08
  • wu:fb65b05
  • wu:fc05c02
  • wu:fc32c12
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fd16e02
  • wu:fi06b09
  • wu:fk24a01
  • wu:fk30f01
  • wu:fk56b03
  • wu:fv70f10
  • xx:tdsubc_2h3
  • zERK1
  • zERK2
  • zfER-beta2
  • zfER[b]2
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110576
  • zgc:110641
  • zgc:153249
  • zgc:194535
  • zgc:194746
  • zgc:194777
  • zgc:55808
  • zgc:55823
  • zgc:55848
  • zgc:55917
  • zgc:63473
  • zgc:63601
  • zgc:73077
  • zgc:73230
  • zgc:77172
  • zgc:86686
  • zgc:86934
  • zgc:92493
Danio rerio (zebrafish)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • manba
  • zgc:55493
  • zgc:76896
Danio rerio (zebrafish)
Gluconeogenesis
  • ENO1
  • PGI
  • PYCa
  • aldoa
  • aldoaa
  • aldob
  • aldoc
  • aldocb
  • cb598
  • cb79
  • cb856
  • cb883
  • cb924
  • eno1
  • eno1a
  • eno2
  • eno3
  • eno4
  • fb17g10
  • fb57b01
  • fbp1
  • fbp1b
  • fc09h05
  • fc25d06
  • fj24f12
  • fj93h11
  • g6pc3
  • gapdh
  • gapdh-2
  • gpi
  • gpib
  • id:ibd1091
  • id:ibd5157
  • pck
  • pck1
  • pck2
  • pcl
  • pcxa
  • pgam1
  • pgam1a
  • pgam2
  • pgi-2
  • pgk1
  • sb:cb79
  • slc37a1
  • slc37a2
  • slc37a4
  • slc37a4a
  • tpi1b
  • wu:fa28b10
  • wu:fb10b11
  • wu:fb17g10
  • wu:fb57b01
  • wu:fb81h05
  • wu:fc09h05
  • wu:fc25d06
  • wu:fc51c05
  • wu:fd59b07
  • wu:fi32b03
  • wu:fj24f12
  • wu:fj36g06
  • wu:fj93h11
  • wu:fk58e02
  • zgc:101659
  • zgc:123047
  • zgc:56252
  • zgc:63869
  • zgc:63876
  • zgc:64127
  • zgc:73152
  • zgc:77098
  • zgc:77867
  • zgc:77899
  • zgc:92418
Danio rerio (zebrafish)
O-linked glycosylation
  • ago61
  • b3galnt2
  • b3gnt1
  • b4gat1
  • dag
  • dag1
  • gtdc2
  • gyltl1b
  • im:7151461
  • large
  • large1
  • large2
  • pomgnt1
  • pomgnt2
  • pomk
  • pomt1
  • pomt2
  • sgk196
  • wu:fb83d06
  • wu:fi25f06
  • wu:fi37b08
  • zPOMGnT1
  • zgc:109786
  • zgc:158130
Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024