GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 252 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
Synthesis of PA
  • Gpd1
  • acp6
  • agpat2
  • agpat3
  • agpat4
  • agpat6
  • agpat8
  • agpat9
  • alp3
  • alpi
  • alpi.1
  • alpi.2
  • aytl2
  • cpla2
  • fam73a
  • fam73b
  • fb68b10
  • fc21c07
  • fd13g09
  • fj78c06
  • gpat2
  • gpat3
  • gpat4
  • gpd1b
  • gpd1h
  • gpd1l
  • im:7147584
  • im:7149526
  • im:7149588
  • lclat1
  • liph
  • lpcat1
  • lycat
  • miga1
  • miga2
  • pla2g10
  • pla2g12a
  • pla2g4
  • pla2g4a
  • pld6
  • si:ch211-262h13.1
  • si:ch211-262h13.2
  • wu:fa16h03
  • wu:fa95f04
  • wu:fb68b10
  • wu:fc21c07
  • wu:fc25a07
  • wu:fc58b05
  • wu:fd13g09
  • wu:fi89e03
  • wu:fj78c06
  • wu:fq33b10
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  • zgc:63605
  • zgc:66051
  • zgc:85742
Danio rerio (zebrafish)
Release of Hh-Np from the secreting cell
  • Gpc5a
  • disp2
  • gpc5
  • gpc5a
  • hha
  • ihh
  • ihha
  • notum1a
  • scube2
  • shh
  • shha
  • shhb
  • twhh
  • vhh1
  • you
Danio rerio (zebrafish)
HS-GAG degradation
  • Gpc2
  • Gpc5a
  • Gpc6a
  • SDC4
  • cb440
  • chunp6920
  • fc47a08
  • fe05f10
  • gal3st4
  • gpc1
  • gpc2
  • gpc3
  • gpc4
  • gpc4/6
  • gpc5
  • gpc5a
  • gpc6
  • gpc6a
  • gpc6l
  • hpse
  • ids
  • im:6970974
  • im:7144134
  • kny
  • knypek
  • sdc2
  • sdc4
  • sdc4l
  • si:ch1073-86a3.1
  • wu:fc47a08
  • wu:fc47g09
  • wu:fe05f10
  • zgc:103676
  • zgc:158245
  • zgc:194854
Danio rerio (zebrafish)
Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade
  • GRK1A
  • GUCA1D
  • METAP2
  • fk56b01
  • fk56e06
  • fnta
  • fntb
  • gcap1
  • gcap2
  • gcap3
  • gcap4
  • gcap5
  • gnat1
  • gng1
  • gngt1
  • grk1
  • grk1a
  • grk7-2
  • grk7b
  • guca1a
  • guca1aa
  • guca1ab.1
  • guca1b
  • guca1c
  • guca1d
  • guca1e
  • im:2601337
  • im:6909421
  • metap1
  • metap2
  • metap2b
  • nmt-1
  • nmt1
  • nmt1a
  • nmt2
  • rcv1a
  • rcvrna
  • rho
  • saga
  • si:rp71-1p14.1
  • wu:fb51d12
  • wu:fb98h06
  • wu:fb99h09
  • wu:fc15d01
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  • wu:fk53d06
  • wu:fk56b01
  • wu:fk56e06
  • wu:fz92f09
  • zfo2
  • zgc:110714
  • zgc:114180
  • zgc:158397
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  • zgc:66250
  • zgc:73318
  • zgc:85885
  • zgc:86774
Danio rerio (zebrafish)
Activation of the phototransduction cascade
  • GNB1x
  • fb39f01
  • fk56e06
  • gnat1
  • gnb1b
  • gnb1l
  • gng1
  • gngt1
  • rho
  • wu:fb39f01
  • wu:fb98e06
  • wu:fj09d12
  • wu:fk53d06
  • wu:fk56e06
  • zfo2
  • zgc:55774
  • zgc:73318
Danio rerio (zebrafish)
Sensory perception of sweet, bitter, and umami (glutamate) taste
  • GNB1x
  • T2R2
  • TAS1R1
  • TAS1R2a
  • TAS1R3
  • TAS2R1a
  • TAS2R1b
  • Tas1R2b
  • fb39f01
  • gnat2
  • gnb1b
  • gnb1l
  • gnb3a
  • gnb3l
  • gng13b
  • t1rc1
  • tas1r1
  • tas1r2.1
  • tas1r2.2
  • tas1r2a
  • tas1r2b
  • tas1r3
  • tas2r1a
  • tas2r200.1
  • tas2r200.2
  • tas2r2l
  • wu:fb39f01
  • wu:fb98e06
  • wu:fj09d12
  • zgc:55774
  • zgc:92641
  • zgc:92704
Danio rerio (zebrafish)
Adrenaline,noradrenaline inhibits insulin secretion
  • GNB1x
  • GNG5
  • [g]3
  • adcy5
  • adra2a
  • adra2c
  • fb39f01
  • fi21e06
  • gnai1
  • gnai2
  • gnai2b
  • gnb1b
  • gnb1l
  • gnb3a
  • gnb3l
  • gnb5a
  • gng1
  • gng12b
  • gng13b
  • gng3
  • gng5
  • gng7
  • gng8
  • gngt1
  • gngt2
  • gngt2a
  • id:ibd1139
  • ik:tdsubc_2c12
  • si:dkey-178j17.2
  • si:dkey-44g17.6
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  • wu:fb98e06
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  • wu:fj09d12
  • wu:fj56b02
  • wu:fk53d05
  • wu:fk53d06
  • xx:tdsubc_2c12
  • zgc:100880
  • zgc:110316
  • zgc:55774
  • zgc:56690
  • zgc:63957
  • zgc:73318
  • zgc:92641
  • zgc:92704
  • zgc:92709
  • zgc:92852
Danio rerio (zebrafish)
FGFR1b ligand binding and activation
  • GIPC
  • TIP-2
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf2
  • fgf22
  • fgf3
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • gipc1
  • rgs19ip1
  • si:ch73-18k18.1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • tgfbr3
  • wu:fd11d03
  • zgc:109774
Danio rerio (zebrafish)
FGFR1c ligand binding and activation
  • GIPC
  • TIP-2
  • anos1a
  • anos1b
  • anosmin-1a
  • anosmin-1b
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • gipc1
  • id:ibd5158
  • kal1.1
  • kal1.2
  • kal1a
  • kal1b
  • rgs19ip1
  • si:ch73-18k18.1
  • tgfbr3
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fl91z45
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
  • F-spondin1
  • b3galtla
  • b3glcta
  • etID309958.14
  • fc46a11
  • mindin2
  • pofut2
  • sema5a
  • sema5ba
  • si:dkey-1o1.2
  • spon1a
  • spon2b
  • thsd7a
  • thsd7aa
  • wu:fa95e03
  • wu:fc46a11
  • wu:fi41a04
  • zgc:100756
  • zgc:194822
Danio rerio (zebrafish)
Cell surface interactions at the vascular wall
  • ESAM
  • Iclp-1
  • JAM
  • MIF
  • SCN2B
  • cb810
  • cd74a
  • ceacam1
  • cxadr
  • epcam
  • esam
  • esama
  • f11r
  • f11r.1
  • hm:zeh0068
  • iclp1
  • itga4
  • itgb1
  • itgb1b
  • itgb1b.1
  • itgb1b.2
  • jam2a
  • jam3b
  • jamb
  • jamc
  • mif
  • sb:cb6
  • sc:d0175
  • sc:d0254
  • scn2b
  • selp
  • selplg
  • si:ch211-260g14.4
  • si:ch211-264f5.6
  • tacstd
  • wu:fb11f09
  • wu:fb12a01
  • wu:fb13d06
  • wu:fc07c05
  • wu:fj17g02
  • wu:fk94e07
  • zeh0068
  • zgc:103642
  • zgc:110304
  • zgc:77119
  • zgc:85632
Danio rerio (zebrafish)
ESR-mediated signaling
  • ER[b]2
  • ER[b]a
  • Tebp
  • cPGES-1
  • cb820
  • erbeta2
  • esr
  • esr1
  • esr2a
  • hsp90a.2
  • hsp90a2
  • hsp90aa1.2
  • hsp90ab1
  • hsp90b
  • hspc3
  • nr3a1
  • ptges3
  • ptges3a
  • wu:fb98d06
  • zfER-beta2
  • zfER[b]2
  • zgc:65804
  • zgc:77131
Danio rerio (zebrafish)
Negative regulation of FGFR1 signaling
  • ERK1
  • anos1a
  • anos1b
  • anosmin-1a
  • anosmin-1b
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fi06b09
  • id:ibd5158
  • kal1.1
  • kal1.2
  • kal1a
  • kal1b
  • kl
  • mapk1
  • mapk3
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fi06b09
  • wu:fl91z45
  • zERK1
  • zERK2
  • zgc:109774
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
Oxidative Stress Induced Senescence
  • ERK1
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • MKK4
  • MKK4A-l
  • MKK7
  • bmi1
  • bmi1a
  • c-Jun
  • cb1065
  • cbx2
  • cbx7a
  • cbx8b
  • drp53
  • edr2
  • eed
  • ezh2
  • fi06b09
  • fj36h07
  • fos
  • fosab
  • h2af1al
  • h2afvb
  • h2afvl
  • h2afx1
  • h2afza
  • h2av
  • h2ax1
  • h2az2a
  • h2az2b
  • h3-5
  • h3f3a
  • h3f3b.1
  • h3f3c
  • h3f3d
  • hist2h2l
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  • jnk1
  • jun
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  • map2k4
  • map2k4A
  • map2k4a
  • map2k6
  • map2k7
  • mapk1
  • mapk11
  • mapk14
  • mapk14b
  • mapk3
  • mapk8
  • mapkapk2
  • mapkapk2a
  • mapkapk3
  • mapkapk5
  • mdm2
  • mdm4
  • mdmx
  • pc1
  • pcgf4a
  • ph2
  • phc2
  • psc1
  • rbb4
  • rbb4l
  • rbbp4
  • rbbp7
  • ring1b
  • rnf2
  • rps27a
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  • si:ch211-113a14.29
  • si:ch211-113a14.6
  • si:ch211-254d18.2
  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
  • si:dkey-108k21.18
  • si:dkey-108k21.28
  • si:dkey-23a13.7
  • suz12
  • suz12b
  • tdsubc_1f2
  • tp53
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  • wu:fb30e10
  • wu:fc56c10
  • wu:fd20e09
  • wu:fi03a01
  • wu:fi06b09
  • wu:fj36h07
  • xx:tdsubc_1f2
  • zERK1
  • zERK2
  • zgc:103563
  • zgc:110152
  • zgc:111978
  • zgc:112234
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  • zgc:123344
  • zgc:136500
  • zgc:152758
  • zgc:158342
  • zgc:173585
  • zgc:173587
  • zgc:194998
  • zgc:56685
  • zgc:65863
  • zgc:66168
  • zgc:77885
  • zgc:86905
  • zgc:92197
Danio rerio (zebrafish)
RNA Polymerase I Promoter Opening
  • ERK1
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • MBD3
  • fi06b09
  • h2af1al
  • h2afvb
  • h2afvl
  • h2afx1
  • h2afza
  • h2av
  • h2ax1
  • h2az2a
  • h2az2b
  • h3-5
  • h3f3a
  • h3f3b.1
  • h3f3c
  • h3f3d
  • hist2h2l
  • im:6896397
  • mapk3
  • mbd1
  • mbd1b
  • mbd2
  • mbd3a
  • si:ch211-113a14.17
  • si:ch211-113a14.29
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  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
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  • si:dkey-23a13.7
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  • ubtf
  • wu:fa97f06
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  • wu:fj38c10
  • zERK1
  • zK13A21.11
  • zK13A21.17
  • zgc:111862
  • zgc:112234
  • zgc:113984
  • zgc:173585
  • zgc:173587
  • zgc:194998
  • zgc:56685
Danio rerio (zebrafish)
Glycolysis
  • ENO1
  • PGI
  • adpgk
  • aldoa
  • aldoaa
  • aldob
  • aldoc
  • aldocb
  • bpgm
  • cb1029
  • cb79
  • cb883
  • eno1
  • eno1a
  • eno2
  • eno3
  • eno4
  • fc09h05
  • fi09d05
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  • fj24f12
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  • gapdh
  • gapdh-2
  • gnpda1
  • gpi
  • gpib
  • hk1
  • hk2
  • im:7140576
  • im:7148527
  • pfkm
  • pfkma
  • pgam1
  • pgam1a
  • pgam2
  • pgi-2
  • pgk1
  • pgm2l1
  • pklr
  • pkm2
  • pkm2a
  • pkma
  • sb:cb79
  • tpi1b
  • wu:fa28b10
  • wu:fb10b11
  • wu:fb81h05
  • wu:fc09d08
  • wu:fc09h05
  • wu:fc16e02
  • wu:fc21e02
  • wu:fd15e01
  • wu:fd59b07
  • wu:fi09d05
  • wu:fi17h06
  • wu:fi31b04
  • wu:fi32b03
  • wu:fi37e08
  • wu:fj24f12
  • wu:fj33f03
  • wu:fj36g06
  • wu:fk58e02
  • wu:fq14b11
  • zgc:110691
  • zgc:153956
  • zgc:198285
  • zgc:55790
  • zgc:55926
  • zgc:56252
  • zgc:63876
  • zgc:73152
  • zgc:77618
  • zgc:77899
  • zgc:92230
  • zgc:92344
  • zgc:92418
Danio rerio (zebrafish)
Gluconeogenesis
  • ENO1
  • PGI
  • PYCa
  • aldoa
  • aldoaa
  • aldob
  • aldoc
  • aldocb
  • cb598
  • cb79
  • cb856
  • cb883
  • cb924
  • eno1
  • eno1a
  • eno2
  • eno3
  • eno4
  • fb17g10
  • fb57b01
  • fbp1
  • fbp1b
  • fc09h05
  • fc25d06
  • fj24f12
  • fj93h11
  • g6pc3
  • gapdh
  • gapdh-2
  • gpi
  • gpib
  • id:ibd1091
  • id:ibd5157
  • pck
  • pck1
  • pck2
  • pcl
  • pcxa
  • pgam1
  • pgam1a
  • pgam2
  • pgi-2
  • pgk1
  • sb:cb79
  • slc37a1
  • slc37a2
  • slc37a4
  • slc37a4a
  • tpi1b
  • wu:fa28b10
  • wu:fb10b11
  • wu:fb17g10
  • wu:fb57b01
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  • wu:fc09h05
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  • wu:fi32b03
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  • wu:fj36g06
  • wu:fj93h11
  • wu:fk58e02
  • zgc:101659
  • zgc:123047
  • zgc:56252
  • zgc:63869
  • zgc:63876
  • zgc:64127
  • zgc:73152
  • zgc:77098
  • zgc:77867
  • zgc:77899
  • zgc:92418
Danio rerio (zebrafish)
RAF/MAP kinase cascade
  • EGFR12
  • EGFR15
  • ERK1
  • NRG2b
  • ang1
  • angpt1
  • btc
  • c-met
  • cmet
  • dob
  • egfr
  • egfra
  • epgn
  • erbb2
  • erbb3
  • erbb3b
  • erbb4
  • erbb4a
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
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  • hrasl
  • id:ibd5158
  • kit
  • kita
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  • met
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  • rgl1
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  • sos1
  • sparse
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  • tie2
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  • wu:fd11d03
  • wu:fi06b09
  • wu:fj59e07
  • wu:fv70f10
  • zERK1
  • zERK2
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:153249
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:63601
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides
  • EAAT3
  • EAAT5A
  • SLC1A2a
  • SLC1A7
  • ctns
  • samc
  • si:ch211-284b7.1
  • si:ch73-116b16.2
  • si:dkey-21n12.2
  • slc1a1
  • slc1a2a
  • slc1a3b
  • slc1a7
  • slc1a7a
  • slc1a7b
  • slc25a26
  • slc32a1
  • zgc:110194
  • zgc:158324
  • zgc:91959
Danio rerio (zebrafish)
Glutamate Neurotransmitter Release Cycle
  • EAAT3
  • EAAT5A
  • MGC163045
  • SLC1A2a
  • SLC1A7
  • addicsin
  • arl6ip5b
  • fj55a04
  • glsl
  • rab3a
  • rab3ab
  • si:ch211-255d18.4
  • si:ch211-284b7.1
  • si:ch73-116b16.2
  • si:dkey-21n12.2
  • slc17a7
  • slc17a7a
  • slc1a1
  • slc1a2a
  • slc1a3b
  • slc1a7
  • slc1a7a
  • slc1a7b
  • slc38a2
  • snat2
  • syt1
  • syt1a
  • vamp2
  • vglut1
  • wu:fj41c01
  • wu:fj55a04
  • wu:fj61c06
  • wu:fk56d05
  • zgc:112516
  • zgc:73302
  • zgc:91959
  • zgc:92811
  • zgc:92899
  • zp22
Danio rerio (zebrafish)
Apoptotic cleavage of cell adhesion proteins
  • E-cad
  • casp3
  • casp3a
  • cdh1
  • ctnnb1
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • ocln
  • oclna
  • wu:fd23h10
  • wu:fi13c01
  • zgc:100890
  • zgc:113992
  • zgc:56359
Danio rerio (zebrafish)
Adherens junctions interactions
  • E-cad
  • R-cadherin
  • cadm1b
  • cb903
  • cdh1
  • cdh10
  • cdh10a
  • cdh11
  • cdh17
  • cdh2
  • cdh4
  • cdh5
  • cdh6
  • cdhvn
  • fb65d02
  • nectin1b
  • nectin3
  • pac
  • pvrl1b
  • pvrl3l
  • rcad
  • rnasel2
  • rnasel3
  • rnasel4
  • sc:d0664
  • si:ch211-139g14.6
  • vnc
  • wu:fb65d02
  • zgc:103673
  • zgc:136316
Danio rerio (zebrafish)
Metal ion SLC transporters
  • DMT1
  • cb426
  • cp
  • ctr-1
  • ctr1
  • fa07b10
  • fpn1
  • slc11a2
  • slc30a10
  • slc31a1
  • slc39a1
  • slc40a1
  • slc41a1
  • slc41a2b
  • wu:fa07b10
  • wu:fi23f10
  • zgc:136699
  • zgc:76839
Danio rerio (zebrafish)
CS/DS degradation
  • DC
  • bcan
  • bgn
  • bgna
  • cspg2b
  • dcan
  • dcn
  • decorin
  • fb99b07
  • fi32a12
  • hyal1
  • ids
  • ncanb
  • vcanb
  • wu:fb99b07
  • wu:fi32a12
  • zgc:158245
  • zgc:91989
Danio rerio (zebrafish)
Dermatan sulfate biosynthesis
  • DC
  • bcan
  • bgn
  • bgna
  • chst14
  • cspg2b
  • d4st1
  • dcan
  • dcn
  • decorin
  • dse
  • fb99b07
  • fi32a12
  • ncanb
  • si:dkey-121j17.2
  • vcanb
  • wu:fb99b07
  • wu:fi32a12
  • zgc:91989
Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024