GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 201 - 225 of 252 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
RND3 GTPase cycle
  • CAV1
  • LOC100004299
  • arhe
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • bck
  • cav1
  • cb594
  • ckap4
  • ckb
  • ckbb
  • cpda
  • ddx4
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • epha2
  • epha2a
  • fam83b
  • fc39h07
  • flot2a
  • heg
  • id:ibd2712
  • id:ibd2919
  • id:ibd5152
  • kctd13
  • llk
  • pik3r1
  • pik3r2
  • rbm39a
  • rbm39b
  • rho8
  • rnd3
  • rnd3a
  • rnpc2
  • rnpc2l
  • rtk6
  • scrb1
  • scrib
  • stb2
  • stbm
  • tmod2
  • tnfaip1
  • tri
  • vangl1
  • vangl2
  • vas
  • vasa
  • vlg
  • wu:fa97g07
  • wu:fb09c08
  • wu:fb65b05
  • wu:fc07c04
  • wu:fc39h07
  • wu:fi06b02
  • wu:fi24g05
  • wu:fj36f10
  • wu:fj37d11
  • zgc:109812
  • zgc:112139
  • zgc:113117
  • zgc:158535
  • zgc:55302
  • zgc:55780
  • zgc:73080
  • zgc:86648
Danio rerio (zebrafish)
RND1 GTPase cycle
  • Aldh-III
  • CAV1
  • LOC100004299
  • aldh3a2
  • aldh3a2a
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • arms
  • cav1
  • cpda
  • dspa
  • epha2
  • epha2a
  • fam83b
  • fb36h09
  • fi33b05
  • flot2a
  • frs3
  • heg
  • id:ibd5152
  • im:6911394
  • kidins220
  • kidins220b
  • pik3r1
  • pik3r2
  • plxna1
  • plxna1b
  • rbm39a
  • rbm39b
  • rnd1a
  • rnd1b
  • rnd1l
  • rnpc2
  • rnpc2l
  • rras2
  • rtk6
  • scg10
  • scgn10
  • si:dkey-181m9.10
  • stb2
  • stbm
  • stip1
  • stmn2
  • stmn2b
  • tfr1a
  • tmem59
  • tri
  • vangl1
  • vangl2
  • wu:fa97g07
  • wu:fb09c08
  • wu:fb36h09
  • wu:fb65b05
  • wu:fc06b11
  • wu:fc07c04
  • wu:fc47b08
  • wu:fi33b05
  • wu:fk50c04
  • zgc:110132
  • zgc:110215
  • zgc:112139
  • zgc:113117
  • zgc:153089
  • zgc:194621
  • zgc:55780
  • zgc:92064
  • zgc:92133
Danio rerio (zebrafish)
Keratinization
  • cb112
  • cb80
  • ckii
  • dsc
  • dsc2
  • dsc2l
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • jup
  • jupa
  • krt18b
  • krt2-8
  • krt5
  • krt8
  • krt93
  • krt94
  • krt95
  • krt97
  • krtt1c6
  • pkp2
  • pkp3
  • pkp3a
  • sb:cb112
  • sb:cb481
  • wu:fa91c11
  • wu:fa91g11
  • wu:fa96h10
  • wu:fa97f09
  • wu:fb02h09
  • wu:fb58f07
  • wu:fj02d02
  • wu:fk69a12
  • wu:fk78b12
  • zfCKII
  • zgc:136656
  • zgc:66015
Danio rerio (zebrafish)
The NLRP3 inflammasome
  • TXN
  • asc
  • asc1
  • fb15h09
  • hsp90ab1
  • hsp90b
  • hspc3
  • nlrp1
  • p2rx7
  • p2xr7
  • panx1
  • panx1a
  • pstpip1b
  • pycard
  • sb:cb368
  • sgut1
  • sugt1
  • txn
  • txnip
  • txnipa
  • wu:fb15h09
  • wu:fd45a02
  • zgc:123255
  • zgc:194990
  • zgc:55631
  • zgc:92903
Danio rerio (zebrafish)
Sema3A PAK dependent Axon repulsion
  • cb422
  • cb820
  • fynb
  • hsp90a.2
  • hsp90a2
  • hsp90aa1.2
  • hsp90ab1
  • hsp90b
  • hspc3
  • kinase
  • limk1
  • limk1a
  • np-1
  • nrp1
  • nrp1a
  • pak2
  • pak2a
  • plxna1
  • plxna1b
  • plxna2
  • plxna3
  • plxna4
  • rac1
  • rac1a
  • sema3ab
  • semaz1b
  • si:dz198m22.1
  • wu:fb71h01
  • wu:fd16e02
  • zgc:55823
  • zgc:55917
  • zgc:86934
  • zgc:91798
Danio rerio (zebrafish)
CRMPs in Sema3A signaling
  • CRMP-5a
  • DPYSL5
  • LOC568402
  • cdk5
  • cdk5r1a
  • crmp5.1
  • dpysl3
  • dpysl5a
  • fc28b06
  • fynb
  • im:7146614
  • np-1
  • nrp1
  • nrp1a
  • plxna1
  • plxna1b
  • plxna2
  • plxna3
  • plxna4
  • sema3ab
  • semaz1b
  • wu:fc28b06
  • zgc:101604
  • zgc:194104
  • zgc:194109
Danio rerio (zebrafish)
Amino acid transport across the plasma membrane
  • fa11f11
  • fc26e12
  • fc51c07
  • id:ibd1327
  • sb:cb519
  • si:ch211-132b12.1
  • si:ch211-154h20.4
  • si:zc101n13.5
  • slc16a10
  • slc1a4
  • slc1a5
  • slc25a29
  • slc36a4
  • slc38a2
  • slc38a3
  • slc38a5b
  • slc3a2b
  • slc43a1b
  • slc6a11
  • slc6a11a
  • slc6a15
  • slc6a18
  • slc6a19
  • slc6a19b
  • slc6a6
  • slc6a6b
  • slc7a1
  • slc7a1a
  • slc7a2
  • slc7a6
  • slc7a7
  • snat2
  • tau
  • taut
  • wu:fa01a01
  • wu:fa11f11
  • wu:fc26e12
  • wu:fc31c02
  • wu:fc48a10
  • wu:fc51c07
  • wu:fd58f10
  • wu:fe14a07
  • wu:fq18d12
  • zgc:114094
  • zgc:123300
  • zgc:158383
  • zgc:158423
  • zgc:172267
  • zgc:55813
  • zgc:66050
  • zgc:92015
  • zgc:92817
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by PDGF
  • furin
  • furina
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • pdgfra
  • ptpn12
  • si:dkey-281a24.5
  • wu:fc32c12
  • zgc:153249
  • zgc:65856
  • zgc:77437
Danio rerio (zebrafish)
Downstream signal transduction
  • Stat5
  • crk
  • crkl
  • fb18e12
  • fb34h10
  • fc05a01
  • fd20h08
  • fi19g05
  • fj46f04
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • im:7147817
  • nck1b
  • nck2b
  • nras
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • pdgfra
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3r1
  • pik3r2
  • plcg1
  • sb:eu508
  • sb:eu615
  • si:ch211-147g19.3
  • sos1
  • src
  • stat1
  • stat1a
  • stat5
  • stat5.1
  • stat5.2
  • stat5a
  • stat5b
  • stat6
  • stat7
  • wu:fa55g05
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb34h10
  • wu:fb65b05
  • wu:fc05a01
  • wu:fc32c12
  • wu:fc54a04
  • wu:fd20h08
  • wu:fi19g05
  • wu:fj46f04
  • wu:fj57a05
  • wu:fj59e07
  • wu:fj60e01
  • wu:fj66g07
  • zgc:100936
  • zgc:103549
  • zgc:110734
  • zgc:153249
  • zgc:158274
  • zgc:63469
  • zgc:73077
  • zgc:92024
Danio rerio (zebrafish)
Enzymatic degradation of dopamine by COMT
  • comta
  • mrc
  • tomt
Danio rerio (zebrafish)
Platelet degranulation
  • ANX V
  • CYB5R1
  • IGF-1
  • IGF-1L
  • IGF-1a
  • IGF-I
  • LOC792613
  • MRP
  • PAI
  • PAI-1
  • PAI1
  • PLANH1
  • TAGLN
  • Tbeta11
  • VWF
  • abcc4
  • actbb
  • actn2
  • actn2b
  • ahsg
  • ahsg1
  • ai39657
  • aldoa
  • aldoaa
  • antivin
  • anx
  • anx5
  • anxa5
  • anxa5b
  • apoa
  • apoa1
  • apoa1a
  • apool
  • app
  • appa
  • atv
  • atv2
  • bactin2
  • cb1019
  • cb223
  • cb420
  • cb720
  • cb73
  • cb79
  • cb989
  • cd163
  • cd36
  • cd63
  • cdc37l1
  • cfd
  • cfdl
  • chid1
  • clu
  • ctsf
  • cuzn
  • cxcl-c13d
  • cxcl8b.1
  • cxcl8b.3
  • cyb5r1
  • dZ52I16.4
  • dia1
  • etID32613.12
  • f13a1
  • f13a1b
  • f5
  • fa92e03
  • fa96h09
  • fam3c
  • fam49bb
  • fb08c07
  • fb11g09
  • fb52d02
  • fb61f12
  • fb63c02
  • fc21c08
  • fc21h08
  • fe38b03
  • fi27b02
  • figf
  • fj34a12
  • fj40h03
  • fo83d04
  • gas6
  • hm:zeh0062
  • hm:zehn2160
  • igf1
  • igf2
  • igf2a
  • igf2b
  • ik:tdsubc_2b12
  • il8l1
  • im:6902790
  • im:6909481
  • im:7044540
  • im:7144020
  • ino80e
  • itga2b
  • itgb3.1
  • itgb3b
  • itih3a
  • itih3a.1
  • lft1
  • lft2
  • lgals3bp
  • lgals3bpa
  • lhfpl2a
  • mage
  • manf
  • ndnl2
  • ola1
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • plek
  • pros1
  • sb:cb420
  • sb:cb79
  • sccpdha
  • sccpdha.1
  • scg3
  • selp
  • sepp1a
  • serpine1
  • serpinf2b
  • si:busm1-52i16.4
  • si:bz20i5.3
  • si:ch1073-474e24.1
  • si:ch211-133n4.4
  • si:ch211-138a11.1
  • si:ch211-165i18.2
  • si:ch211-186e20.7
  • si:ch211-229i10.3
  • si:ch211-260g14.4
  • si:ch211-284e20.8
  • si:ch73-54f23.2
  • si:dkey-243k1.3
  • si:dkey-27b3.6
  • si:dkey-46g23.4
  • si:dkeyp-105g12.2
  • si:dz202l16.5
  • si:dz52i16.4
  • sm22[a]
  • sod1
  • sparc
  • stxbp2
  • sytl4
  • tagln2
  • tagln3
  • tex264a
  • tgfb1
  • tgfb1a
  • tgfb2
  • tgfb3
  • timp2
  • timp2a
  • timp2b
  • timp2l
  • tmsb4x
  • tmx3b
  • tor4a
  • vcl
  • vcla
  • vegf
  • vegf-d
  • vegfa
  • vegfaa
  • vegfc
  • vegfd
  • vti1b
  • vwf
  • wu:fa28b10
  • wu:fa92e03
  • wu:fa96h09
  • wu:fa98f06
  • wu:fb08c07
  • wu:fb10b11
  • wu:fb11g09
  • wu:fb13a07
  • wu:fb13e02
  • wu:fb15h03
  • wu:fb16b08
  • wu:fb52d02
  • wu:fb61f12
  • wu:fb63c02
  • wu:fb63g02
  • wu:fc21c08
  • wu:fc21h08
  • wu:fc32c12
  • wu:fc34h12
  • wu:fc78g09
  • wu:fd21h06
  • wu:fd44c03
  • wu:fe38b03
  • wu:fi27b02
  • wu:fj08a12
  • wu:fj10f10
  • wu:fj34a12
  • wu:fj34d10
  • wu:fj40h03
  • wu:fk65e12
  • wu:fo83d04
  • xx:ai39657
  • xx:tdsubc_2b12
  • zgc:101850
  • zgc:103687
  • zgc:109940
  • zgc:123223
  • zgc:136726
  • zgc:153093
  • zgc:153249
  • zgc:153327
  • zgc:153334
  • zgc:153988
  • zgc:154001
  • zgc:158410
  • zgc:171446
  • zgc:172339
  • zgc:195198
  • zgc:56042
  • zgc:63525
  • zgc:63860
  • zgc:65825
  • zgc:65967
  • zgc:66013
  • zgc:73352
  • zgc:77709
  • zgc:85740
  • zgc:85799
  • zgc:85807
  • zgc:92058
  • zgc:92376
  • zgc:92513
  • zgc:92525
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by SCF-KIT
  • JAK2bCA
  • Stat5
  • ZFMMP-9
  • fb18e12
  • fj05a08
  • fj21h04
  • fj59e07
  • fynb
  • grap
  • grap2a
  • grapa
  • grb10
  • grb10a
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • jak2
  • jak2b
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • lck
  • mmp9
  • nras
  • pik3ca
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pik3r3a
  • ptpru
  • rptppsi
  • sb:eu508
  • sb:eu615
  • sos1
  • sparse
  • src
  • stat1
  • stat1a
  • stat5
  • stat5.1
  • stat5.2
  • stat5a
  • stat5b
  • stat6
  • stat7
  • tec
  • wu:fb02g06
  • wu:fb07b05
  • wu:fb16a12
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb65b05
  • wu:fi98c09
  • wu:fj05a08
  • wu:fj21h04
  • wu:fj59e07
  • wu:fj66g07
  • wu:fk56b03
  • yes
  • yes1
  • zgc:103549
  • zgc:110202
  • zgc:110734
  • zgc:112091
  • zgc:136695
  • zgc:158274
  • zgc:64165
  • zgc:73077
  • zgc:73230
  • zgc:91987
Danio rerio (zebrafish)
Class C/3 (Metabotropic glutamate/pheromone receptors)
  • T2R2
  • TAS1R1
  • TAS1R2a
  • TAS1R3
  • TAS2R1a
  • TAS2R1b
  • Tas1R2b
  • gb:kf234084
  • gprc6a
  • grm1
  • grm1b
  • grm2b
  • grm3
  • grm5a
  • grm5b
  • grm6a
  • grm7
  • grm8a
  • si:ch211-233h19.1
  • si:ch211-278p9.5
  • si:dkey-52h10.3
  • t1rc1
  • tas1r1
  • tas1r2.1
  • tas1r2.2
  • tas1r2a
  • tas1r2b
  • tas1r3
  • tas2r1a
  • tas2r200.1
  • tas2r200.2
  • tas2r2l
Danio rerio (zebrafish)
HS-GAG biosynthesis
  • 2-OST
  • 2OST
  • 3-OST-6
  • 3OST6
  • Gpc2
  • Gpc5a
  • Gpc6a
  • HS2st
  • HS2st1
  • HS3st2
  • HS3st3X
  • HS3st3Z
  • HS3st6
  • SDC4
  • cb440
  • chunp6920
  • ext1b
  • ext2
  • fc14g07
  • fc47a08
  • fe05f10
  • fj47c03
  • gal3st4
  • gpc1
  • gpc2
  • gpc3
  • gpc4
  • gpc4/6
  • gpc5
  • gpc5a
  • gpc6
  • gpc6a
  • gpc6l
  • hs2st1
  • hs2st1a
  • hs3st2
  • hs3st3b1a
  • hs3st3b1b
  • hs3st3l
  • hs6st
  • hs6st1
  • hs6st1a
  • hs6st2
  • hs6st3b
  • im:6970974
  • im:7147474
  • kny
  • knypek
  • ndst1
  • ndst1b
  • ndst2b
  • sdc2
  • sdc4
  • sdc4l
  • si:ch1073-86a3.1
  • wu:fc14g07
  • wu:fc47a08
  • wu:fc47g09
  • wu:fe05f10
  • wu:fj47c03
  • zgc:103676
  • zgc:152967
  • zgc:158230
  • zgc:194854
Danio rerio (zebrafish)
Hedgehog ligand biogenesis
  • CH211-265P12.8
  • LMP7
  • PA28-gamma
  • PSMA5
  • PSMB9A
  • PSMD10
  • Psma2
  • Psmb11b
  • Y
  • beta1
  • beta1ia
  • beta2i
  • beta5
  • beta5ia
  • beta5tb
  • cdc48
  • derl2
  • erlec1
  • etID309919.2
  • fa93g07
  • fb17c09
  • fb20g04
  • fb49a10
  • fc34f08
  • fj42d12
  • fk89d05
  • gankyrin
  • hha
  • hm:zeh0386
  • hrd1
  • ihh
  • ihha
  • ik:tdsubc_1f2
  • im:6909944
  • lmp2
  • lmp7
  • macropain
  • os9
  • p4hb
  • prosome
  • psma1
  • psma2
  • psma2a
  • psma2b
  • psma3
  • psma4
  • psma5
  • psma6b
  • psma7
  • psma8
  • psmb1
  • psmb10
  • psmb11b
  • psmb12
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  • psmb2
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Danio rerio (zebrafish)
LDL remodeling
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Danio rerio (zebrafish)
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Danio rerio (zebrafish)
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Danio rerio (zebrafish)
PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
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Danio rerio (zebrafish)
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Danio rerio (zebrafish)
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Danio rerio (zebrafish)
Gluconeogenesis
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Danio rerio (zebrafish)
mTORC1-mediated signalling
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Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024