GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 226 - 250 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
Ion transport by P-type ATPases
  • ATP10A
  • ATP10B
  • ATP10D
  • ATP11A
  • ATP11B
  • ATP11C
  • ATP12A
  • ATP13A1
  • ATP13A2
  • ATP13A4
  • ATP13A5
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • ATP2C1
  • ATP2C2
  • ATP4A
  • ATP4B
  • ATP7A
  • ATP8A1
  • ATP8A2
  • ATP8B1
  • ATP8B2
  • ATP8B3
  • ATP8B4
  • ATP9A
  • ATP9B
  • CALM3
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • FXYD1
  • FXYD6
  • PDZD11
  • PDZK11
  • PLM
  • PLN
  • SRI
Sus scrofa (pig)
G alpha (z) signalling events
  • A2AR
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY7
  • ADCY8
  • ADCY9
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
  • GNAZ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • LOC100621431
  • LOC110255211
  • RGS16
  • RGS17
  • RGS20
Sus scrofa (pig)
Iron uptake and transport
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ACO1
  • BMDP
  • CAND1
  • CUL1
  • CYBRD1
  • FBXL5
  • FLVCR1
  • FTH1
  • FTL
  • HEPH
  • HMOX1
  • IREB2
  • LCN2
  • NEDD8
  • RPS27A
  • SKP1
  • SLC11A2
  • SLC22A17
  • SLC46A1
  • TF
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
GRB2 events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • ERBB2
  • ERBB4
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
Nuclear signaling by ERBB4
  • APH1A
  • APH1B
  • ERBB4
  • ESR
  • ESR1
  • NCSTN
  • NR3A1
  • PSEN1
  • PSEN2
  • SRC
  • STAT5A
  • WWOX
  • YAP1
Sus scrofa (pig)
MyD88 cascade initiated on plasma membrane
  • ECSIT
  • MAP3K1
  • TRAF6
Sus scrofa (pig)
MET interacts with TNS proteins
  • HGF
  • ITGB1
  • MET
  • TNS3
  • TNS4
Sus scrofa (pig)
RHOB GTPase cycle
  • ABR
  • ACTC1
  • AKAP13
  • ANLN
  • ARHGAP1
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • ARHGDIG
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF17
  • ARHGEF2
  • ARHGEF25
  • ARHGEF28
  • ARHGEF3
  • ARHGEF5
  • BCR
  • CAV1
  • CAVIN1
  • CIT
  • DAAM1
  • DEPDC1B
  • DIAPH1
  • DIAPH3
  • DLC1
  • ECT2
  • FLOT1
  • FLOT2
  • IQGAP3
  • JUP
  • Jup
  • MCAM
  • MCF2
  • MCF2L
  • MYO9A
  • MYO9B
  • NET1
  • OPHN1
  • PCDH7
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKN1
  • PKN2
  • PKN3
  • PREX1
  • RACGAP1
  • RHOB
  • RHPN2
  • ROCK1
  • ROCK2
  • RTKN
  • SLK
  • SNAP23
  • STARD8
  • STOM
  • TFRC
  • TJP2
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAV2
Sus scrofa (pig)
MTOR signalling
  • AKT1S1
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • MLST8
  • MTOR
  • RHEB
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SLC38A9
  • YWHAB
Sus scrofa (pig)
UCH proteinases
  • ACTB
  • ACTL6A
  • ACTR5
  • ACTR8
  • ADRM1
  • ASXL1
  • ASXL2
  • BAP1
  • BARD1
  • FOXK1
  • FOXK2
  • H2AC10
  • H2AC11
  • H2AC12
  • H2AC14
  • H2AC17
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC25
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • HCFC1
  • INO80
  • INO80B
  • INO80C
  • INO80D
  • INO80E
  • KDM1B
  • LMP2
  • LOC110261482
  • MBD5
  • MBD6
  • MCRS1
  • NEDD8
  • NFRKB
  • PRORP
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB3
  • PSMB7
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC3
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • RUVBL1
  • SENP8
  • TFPT
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UCHL1
  • UCHL3
  • UCHL5
  • YY1
Sus scrofa (pig)
Regulation by c-FLIP
  • APT1
  • CASP8
  • CASP9
  • FADD
  • FAS
  • LOC100624226
  • LOC100737977
  • RIPK1
  • TNFRSF6
  • TRADD
  • TRAF2
Sus scrofa (pig)
Platelet sensitization by LDL
  • APOB
  • ApoER2
  • LRP8
  • MAPK14
  • PECAM1
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PTPN11
Sus scrofa (pig)
RIPK1-mediated regulated necrosis
  • FLOT1
  • FLOT2
  • MLKL
  • PDCD6IP
  • RIPK1
  • RIPK3
  • SDCBP
Sus scrofa (pig)
Orexin and neuropeptides FF and QRFP bind to their respective receptors
  • HCRT
  • HCRTR1
  • HCRTR2
  • NPFFR1
  • NPFFR2
  • ORX
  • OX
  • PPOX
  • QRFPR
Sus scrofa (pig)
RAC3 GTPase cycle
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL2
  • ABR
  • AMIGO2
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP15
  • ARHGAP17
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • ARHGAP6
  • BAIAP2
  • BAIAP2L1
  • BCR
  • BRK1
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42EP1
  • CYBA
  • CYFIP1
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DOCK10
  • DSG2
  • EMD
  • EPHA2
  • ESYT1
  • FERMT2
  • GARRE1
  • GIT1
  • GIT2
  • GP91-PHOX
  • ITGB1
  • JAG1
  • KIAA0355
  • LAMTOR1
  • LBR
  • LMAN1
  • MCAM
  • MCF2
  • MPP7
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NHS
  • NOX1
  • NOX3
  • NOXA1
  • NOXO1
  • OCRL
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PGRMC2
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PREX1
  • RAB7A
  • RAC3
  • RACGAP1
  • RAPGEF1
  • RBM39
  • SLC1A5
  • SLITRK3
  • SLITRK5
  • SNAP23
  • SRGAP2
  • SWAP70
  • SYDE1
  • TFRC
  • TIAM1
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAV2
  • WASF2
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade
  • EEA1
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • RBSN
  • TLR9
Sus scrofa (pig)
Signaling by ERBB4
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
Sus scrofa (pig)
RUNX3 regulates p14-ARF
  • CBFB
  • CCND1
  • EP300
  • HDAC4
  • RUNX3
  • TGFB1
Sus scrofa (pig)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR4
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • Fgf4
  • KLB
  • PLCG1
Sus scrofa (pig)
Elevation of cytosolic Ca2+ levels
  • ITPR1
  • ITPR3
  • P2RX1
  • P2RX2
  • P2RX3
  • P2RX4
  • P2RX5
  • P2RX6
  • P2RX7
  • TRPC3
  • TRPC6
  • TRPC7
Sus scrofa (pig)
Regulation of necroptotic cell death
  • BIRC2
  • CASP8
  • CDC37
  • FADD
  • FLOT1
  • FLOT2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • MLKL
  • PDCD6IP
  • PIAP
  • RIPK1
  • RIPK3
  • RPS27A
  • SDCBP
  • STUB1
  • TNFRSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBE2L3
Sus scrofa (pig)
Non-integrin membrane-ECM interactions
  • DDR1
  • DDR2
Sus scrofa (pig)
The NLRP3 inflammasome
  • HSP90AB1
  • NLRP3
  • P2RX7
  • PANX
  • PANX1
  • TXN
  • TXNIP
Sus scrofa (pig)
Cristae formation
  • ATP5A1
  • ATP5A2
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5F1E
  • ATP5I
  • ATP5J2
  • ATP5MC2
  • ATP5MC3
  • ATP5ME
  • ATP5MF
  • ATP5O
  • ATP5PO
  • ATP6
  • ATP8
  • ATPASE6
  • ATPASE8
  • DMAC2L
  • LOC100519871
  • MT-ATP6
  • MT-ATP8
  • MTATP6
  • MTATP8
Sus scrofa (pig)
Sialic acid metabolism
  • CMAS
  • CTSA
  • GLB1
  • GNE
  • NANP
  • NANS
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • NPL
  • SLC17A5
  • SLC35A1
  • ST3GAL-III
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL5
  • ST3GAL6
  • ST6GAL1
  • ST6GAL2
  • ST6GALNAC1
  • ST6GALNAC2
  • ST6GALNAC3
  • ST6GALNAC4
  • ST6GALNAC5
  • ST6GALNAC6
  • ST8SIA1
  • ST8SIA2
  • ST8SIA3
  • ST8SIA4
  • ST8SIA5
  • ST8SIA6
  • ST8Sia 2
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024