GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 226 - 250 of 360 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Passive transport by Aquaporins
  • AQP1
  • AQP10
  • AQP12
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AQP5
  • AQP7
  • AQP8
  • AQP9
Sus scrofa (pig)
Pentose phosphate pathway
  • DERA
  • G6PD
  • PGD
  • PGLS
  • PGM2
  • RBKS
  • RPE
  • RPIA
  • SHPK
  • TALDO1
  • TKT
  • tkt
Sus scrofa (pig)
Peptide hormone biosynthesis
  • POMC
Sus scrofa (pig)
Peptide ligand-binding receptors
  • ACKR1
  • AGT
  • AGTR1
  • APLN
  • C3
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • CCK
  • CCKAR
  • CXCL8
  • ECE1
  • ECE2
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • GALR2
  • GALR3
  • GPER1
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GRP
  • GRPR
  • IL8
  • KEL
  • MC1R
  • MC2R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • NLN
  • NMB
  • NMBR
  • NMU
  • NMUR1
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPBWR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NPW
  • NPY
  • NPY Y4
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • NPYR5
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • OPRD1
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • PDYN
  • PMCH
  • PNOC
  • POMC
  • PPL8
  • PPYR1
  • PRLH
  • PRLHR
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR1
  • PROKR2
  • PSAP
  • PYY
  • SST
  • SSTR2
  • SSTR3
  • SSTR5
  • TRH
  • TRHR
  • UTS2
  • UTS2R
  • XK
Sus scrofa (pig)
Phase 4 - resting membrane potential
  • IRK1
  • KCNJ12
  • KCNJ14
  • KCNJ2
  • KCNJ4
  • KCNK1
  • KCNK10
  • KCNK12
  • KCNK13
  • KCNK15
  • KCNK16
  • KCNK17
  • KCNK3
  • KCNK4
  • KCNK5
  • KCNK6
  • KCNK7
  • KCNK9
Sus scrofa (pig)
Phase I - Functionalization of compounds
  • AADAC
  • ABP
  • AHR
  • AHRR
  • ALDH3A1
  • AOC1
  • AOC2
  • ARNT
  • ARNT2
  • BPHL
  • CBR3
  • CES1
  • CES3
  • CMBL
  • CYB5B
  • CYB5R3
  • CYP2B6B
  • CYP3A22
  • CYP3A227
  • CYP3A29
  • DAO
  • EPHX1
  • LOC100520329
  • LOC100736962
  • LOC110256000
  • MTARC1
  • MTARC2
  • NQO2
Sus scrofa (pig)
Phospholipase C-mediated cascade: FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • KL
  • PLCG1
Sus scrofa (pig)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR4
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • Fgf4
  • KLB
  • PLCG1
Sus scrofa (pig)
Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • DRA
  • HLA-DRA
  • LCK
  • LOC100153139
  • PAG1
  • PTPN22
  • PTPRC
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
Sus scrofa (pig)
Platelet Aggregation (Plug Formation)
  • F2
  • GP1BB
  • GP5
  • GP9
  • GPIX
  • GPIbB
  • VWF
Sus scrofa (pig)
Platelet degranulation
  • A1BG
  • A2M
  • A4
  • ABCC4
  • ACTG1
  • ACTN1
  • ACTN2
  • ACTN4
  • AD1
  • AHSG
  • ALB
  • ALDOA
  • ANXA5
  • APLP2
  • APOA1
  • APOH
  • APOOL
  • APP
  • BRPF3
  • CALM3
  • CD109
  • CD36
  • CD63
  • CD9
  • CFD
  • CHID1
  • CLEC3B
  • CLU
  • CTSW
  • CXCL7
  • CYB5R1
  • CYRIB
  • DF
  • ECM1
  • EGF
  • ENDOD1
  • F13A1
  • F5
  • FAM3C
  • FERMT3
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FLNA
  • FN1
  • GAS6
  • GTPBP2
  • HABP4
  • HGF
  • HRG
  • IGF1
  • IGF2
  • ISLR
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • ITIH3
  • ITIH4
  • KNG1
  • LAMP2
  • LEFTY2
  • LGALS3BP
  • LHFPL2
  • LOC100156325
  • LOC100524517
  • LY6G6F
  • MMRN1
  • NHLRC2
  • OLA1
  • ORM1
  • PAI1
  • PALLD
  • PCDH7
  • PCYOX1L
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PECAM1
  • PHACTR2
  • PLANH1
  • PLEK
  • PLG
  • PPBP
  • PROS1
  • PSAP
  • QSOX1
  • RAB27B
  • RARRES2
  • SCCPDH
  • SCG3
  • SCYB7
  • SELP
  • SERPINA1
  • SERPINA4
  • SERPINE1
  • SERPINF2
  • SERPING1
  • SOD1
  • SPARC
  • SPP2
  • SRGN
  • STXBP2
  • SYTL4
  • TAGLN2
  • TF
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • THBS1
  • TIMP1
  • TIMP3
  • TLN1
  • TMSB4
  • TOR4A
  • TUBA4A
  • UABP-2
  • VCL
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VWF
  • WDR1
  • ly6g6f
Sus scrofa (pig)
Platelet homeostasis
  • P2RX1
  • P2RX2
  • P2RX3
  • P2RX4
  • P2RX5
  • P2RX6
  • P2RX7
  • PAFAH2
Sus scrofa (pig)
Platelet sensitization by LDL
  • APOB
  • ApoER2
  • LRP8
  • MAPK14
  • PECAM1
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PTPN11
Sus scrofa (pig)
Post-translational modification: synthesis of GPI-anchored proteins
  • ALPL
  • ART3
  • ART4
  • BST1
  • CD109
  • CD52
  • CEACAM1
  • CEACAM21
  • CNTN4
  • CNTN5
  • CPM
  • DDAH2
  • FCGR3A
  • FOLR2
  • GP2
  • GPLD1
  • LOC100157453
  • LOC100521229
  • LOC100522404
  • LSAMP
  • LY6E
  • LY6G6C
  • LY6G6D
  • LY6K
  • LYPD1
  • LYPD3
  • LYPD4
  • LYPD5
  • LYPD8
  • MDGA1
  • MELTF
  • NEGR1
  • NRN1
  • NRN1L
  • NTM
  • OPCML
  • OTOA
  • PLET1
  • PRND
  • PSCA
  • RECK
  • RTN4RL1
  • SPACA4
  • SPRN
  • TECTB
  • TEX101
  • THY1
  • ULBP1
  • VNN1
  • XPNPEP2
  • ly6g6d
Sus scrofa (pig)
Post-translational protein phosphorylation
  • A4
  • AD1
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMEL
  • ANO8
  • APLP2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APP
  • ATGL
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • C4A
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • CSF1
  • CST3
  • DMP1
  • DNAJC3
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FGA
  • FGF23
  • FGG
  • FN1
  • FSTL1
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • HRC
  • HSP90B1
  • IGFBP1
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP7
  • IL-6
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC100156062
  • LOC100738836
  • LOC106510284
  • LTBP1
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MGAT4A
  • MIA3
  • MXRA8
  • NOTUM
  • NUCB1
  • OPN
  • P4HB
  • PCSK9
  • PDIA6
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • QSOX1
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SDC2
  • SERPINA1
  • SERPINC1
  • SERPIND1
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • STC2
  • TF
  • TIMP1
  • TMEM132A
  • TNC
  • TNN
  • UABP-2
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
  • bmp4
Sus scrofa (pig)
Progressive trimming of alpha-1,2-linked mannose residues from Man9/8/7GlcNAc2 to produce Man5GlcNAc2
  • MAN1A1
  • MAN1A2
  • MAN1C1
Sus scrofa (pig)
Prolactin receptor signaling
  • CUL1
  • GH1
  • JAK2
  • PRL
  • PRLR
  • RBX1
  • SH2B1
  • SKP1
Sus scrofa (pig)
Prostanoid ligand receptors
  • PTGDR
  • PTGER1
  • PTGER2
  • PTGER3
  • PTGER4
  • PTGFR
  • PTGIR
  • TBXA2R
  • fp
Sus scrofa (pig)
Pyroptosis
  • BAX
  • CASP1
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • CYC
  • CYCS
  • GSDMD
  • GSDME
  • GZMB
  • IGIF
  • IL18
  • IL1A
  • IL1B
  • IL1B2
  • LOC100519295
  • LOC100522842
  • LOC100522887
  • LOC100621347
  • LOC100739590
  • LOC110255300
  • LOC110258125
  • LOC110258578
  • LOC110259156
Sus scrofa (pig)
RAC1 GTPase cycle
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL2
  • ABR
  • ALS2
  • AMIGO2
  • ARAP1
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP12
  • ARHGAP15
  • ARHGAP17
  • ARHGAP20
  • ARHGAP21
  • ARHGAP22
  • ARHGAP23
  • ARHGAP24
  • ARHGAP25
  • ARHGAP26
  • ARHGAP27
  • ARHGAP29
  • ARHGAP30
  • ARHGAP31
  • ARHGAP33
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP4
  • ARHGAP44
  • ARHGAP45
  • ARHGAP5
  • ARHGAP9
  • ARHGDIA
  • ARHGEF10
  • ARHGEF11
  • ARHGEF15
  • ARHGEF18
  • ARHGEF19
  • ARHGEF25
  • ARHGEF39
  • ARHGEF5
  • ARHGEF6
  • ARHGEF7
  • BAIAP2
  • BAIAP2L1
  • BCR
  • BRK1
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPA
  • CDC42EP1
  • CDC42EP4
  • CHN1
  • CHN2
  • CIT
  • CYBA
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DEF6
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DOCK1
  • DOCK10
  • DOCK11
  • DOCK2
  • DOCK3
  • DOCK4
  • DOCK5
  • DOCK6
  • DOCK7
  • DOCK8
  • DOCK9
  • ECT2
  • EMD
  • EPHA2
  • ESYT1
  • FAM13A
  • FAM13B
  • FARP1
  • FARP2
  • FERMT2
  • FGD5
  • FMNL1
  • GARRE1
  • GIT1
  • GIT2
  • GMIP
  • GNA13
  • GP91-PHOX
  • IQGAP2
  • IQGAP3
  • ITGB1
  • JAG1
  • KIAA0355
  • KTN1
  • LAMTOR1
  • LBR
  • MCAM
  • MCF2
  • MCF2L
  • MPP7
  • MYO9B
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NGEF
  • NHS
  • NISCH
  • NOX1
  • NOX3
  • NOXA1
  • NOXO1
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK5
  • PAK6
  • PARD6A
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKN1
  • PKN2
  • PLD1
  • PLD2
  • PLEKHG1
  • PLEKHG2
  • PLEKHG3
  • PLEKHG6
  • PREX1
  • PREX2
  • RAB7A
  • RAC1
  • RACGAP1
  • RASGRF2
  • RBM39
  • SH3BP1
  • SLC1A5
  • SNAP23
  • SOS1
  • SOS2
  • SRGAP1
  • SRGAP2
  • SRGAP3
  • SWAP70
  • SYDE2
  • TAGAP
  • TFRC
  • TIAM1
  • TIAM2
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAV1
  • VAV2
  • WASF2
  • WASF3
  • WASL
  • WIPF1
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
RAC2 GTPase cycle
  • ABI1
  • ABI2
  • ABR
  • ANKLE2
  • ARHGAP1
  • ARHGAP17
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGDIA
  • ARMCX3
  • BAIAP2L1
  • BCR
  • BRK1
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42EP1
  • CDC42EP4
  • CYBA
  • CYFIP1
  • DEF6
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DOCK1
  • DOCK10
  • DOCK2
  • DOCK3
  • DOCK4
  • DSG2
  • EMD
  • EPHA2
  • ESYT1
  • GARRE1
  • GIT1
  • GIT2
  • GP91-PHOX
  • ITGB1
  • KIAA0355
  • LAMTOR1
  • LBR
  • LMAN1
  • MCAM
  • MCF2
  • MPP7
  • MTX1
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NHS
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PGRMC2
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLD2
  • PREX1
  • RAB7A
  • RAC2
  • RACGAP1
  • RBM39
  • SAMM50
  • SLITRK5
  • SWAP70
  • SYDE1
  • TFRC
  • TIAM1
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAPB
  • VAV1
  • VAV2
  • WASF2
Sus scrofa (pig)
RAC3 GTPase cycle
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL2
  • ABR
  • AMIGO2
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP15
  • ARHGAP17
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • ARHGAP6
  • BAIAP2
  • BAIAP2L1
  • BCR
  • BRK1
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42EP1
  • CYBA
  • CYFIP1
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DOCK10
  • DSG2
  • EMD
  • EPHA2
  • ESYT1
  • FERMT2
  • GARRE1
  • GIT1
  • GIT2
  • GP91-PHOX
  • ITGB1
  • JAG1
  • KIAA0355
  • LAMTOR1
  • LBR
  • LMAN1
  • MCAM
  • MCF2
  • MPP7
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NHS
  • NOX1
  • NOX3
  • NOXA1
  • NOXO1
  • OCRL
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PGRMC2
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PREX1
  • RAB7A
  • RAC3
  • RACGAP1
  • RAPGEF1
  • RBM39
  • SLC1A5
  • SLITRK3
  • SLITRK5
  • SNAP23
  • SRGAP2
  • SWAP70
  • SYDE1
  • TFRC
  • TIAM1
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAV2
  • WASF2
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
RAF/MAP kinase cascade
  • ACTN2
  • ANGPT1
  • AREG
  • ARTN
  • BTC
  • CALM3
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CDC25C
  • CSF2
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • DLG1
  • DLG3
  • DLG4
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS3
  • FYN
  • Fgf4
  • GDNF
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA3
  • GFRA4
  • GRB2
  • GRIN1
  • GRIN2B
  • GRIN2D
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGF
  • HRAS
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL2RG
  • IL5
  • IL5RA
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • KRAS
  • LAT
  • LRRC7
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • NEFL
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRTN
  • ODAD3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PEA15
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PSPN
  • PTPRA
  • RALGDS
  • RANBP9
  • RASGEF1A
  • RASGRF1
  • RASGRF2
  • RASGRP1
  • RASGRP4
  • RET
  • RGL1
  • RGL2
  • RGL3
  • SHC1
  • SHC2
  • SHC3
  • SOS1
  • SPTA1
  • SPTAN1
  • SPTBN1
  • SPTBN2
  • SPTBN4
  • SPTBN5
  • TEK
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
RET signaling
  • ARTN
  • CDC25C
  • DOK1
  • DOK2
  • DOK4
  • DOK5
  • DOK6
  • GAB1
  • GAB2
  • GDNF
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA3
  • GFRA4
  • GRB2
  • GRB7
  • Grb10
  • IRS2
  • MAPK7
  • NRTN
  • PDLIM7
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLCG1
  • PRKCA
  • PSPN
  • PTPN11
  • RAP1GAP
  • RET
  • SHC1
  • SHC3
  • SOS1
  • SRC
Sus scrofa (pig)
RHOA GTPase cycle
  • ABCD3
  • ABR
  • ACBD5
  • ACTC1
  • AKAP13
  • ANLN
  • ARAP1
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP18
  • ARHGAP19
  • ARHGAP20
  • ARHGAP21
  • ARHGAP22
  • ARHGAP23
  • ARHGAP24
  • ARHGAP26
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Sus scrofa (pig)

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Last updated: August 19, 2024