GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 276 - 300 of 360 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
FGFR1b ligand binding and activation
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF22
  • FGF3
  • FGFR1
  • TGFBR3
Sus scrofa (pig)
FCGR activation
  • CD247
  • CD3G
  • FCGR1A
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • FYN
  • HCK
  • IGKV5-2
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • LYN
  • SRC
  • YES1
Sus scrofa (pig)
Extracellular matrix organization
  • FN1
Sus scrofa (pig)
Extra-nuclear estrogen signaling
  • CALM3
  • CAV1
  • CAV2
  • DTR
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI3
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • IGF1R
  • LOC100621431
  • LOC110255211
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP9
  • NOS3
  • NR3A1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRMT1
  • S1PR3
  • SHC1
  • SPHK1
  • SRC
  • STRN
Sus scrofa (pig)
Estrogen-dependent gene expression
  • CARM1
  • CBFB
  • CCNT1
  • CDK9
  • CITED1
  • CREBBP
  • DDX5
  • EP300
  • ERBB4
  • ESR
  • ESR1
  • FKBP4
  • FOS
  • FOXA1
  • GATA3
  • GREB1
  • GTF2A1
  • GTF2A2
  • GTF2F1
  • H1-2
  • H2AB1
  • H2AB2
  • H2AB3
  • H2AC10
  • H2AC11
  • H2AC17
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC19
  • H2BC20
  • H2BC21
  • H2BC5
  • H3-3A
  • H3C12
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C4
  • H3C6
  • H3F3A
  • HDAC1
  • HIST1H2BD
  • HIST1H3E
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPCA
  • JUN
  • KAT2B
  • KAT5
  • KDM1A
  • KDM4B
  • LOC110261482
  • MED1
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA3
  • NR3A1
  • NR5A2
  • NRIP1
  • PGR
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2L
  • POU2F1
  • PRMT1
  • PTGES3
  • RUNX1
  • SP1
  • TLE3
  • USF1
  • USF2
  • YY1
  • ZNF217
Sus scrofa (pig)
Erythropoietin activates RAS
  • EPO
  • EPOR
  • GRB2
  • IRS2
  • JAK2
  • LYN
  • RAPGEF1
  • SHC1
  • VAV1
Sus scrofa (pig)
Erythropoietin activates Phosphoinositide-3-kinase (PI3K)
  • EPO
  • EPOR
  • GAB1
  • IRS2
  • JAK2
  • LYN
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3CG
  • PIK3R1
  • PIK3R5
Sus scrofa (pig)
Elevation of cytosolic Ca2+ levels
  • ITPR1
  • ITPR3
  • P2RX1
  • P2RX2
  • P2RX3
  • P2RX4
  • P2RX5
  • P2RX6
  • P2RX7
  • TRPC3
  • TRPC6
  • TRPC7
Sus scrofa (pig)
Electric Transmission Across Gap Junctions
  • GJA10
  • GJA7
  • GJC1
  • GJD2
  • PANX
  • PANX1
  • PANX2
Sus scrofa (pig)
Elastic fibre formation
  • ELN
  • FBLN5
  • FBN2
  • FBN3
  • FURIN
  • LOX
  • LOXL1
  • LOXL2
  • LOXL3
  • LOXL4
  • MFAP2
  • MFAP5
Sus scrofa (pig)
ESR-mediated signaling
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FKBP4
  • FKBP5
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPCA
  • NR3A1
  • PPP5C
  • PTGES3
Sus scrofa (pig)
ERBB2 Regulates Cell Motility
  • BTC
  • DIAPH1
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • MEMO1
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • RHOA
Sus scrofa (pig)
ERBB2 Activates PTK6 Signaling
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PTK6
Sus scrofa (pig)
ER-Phagosome pathway
  • B2M
  • CALR
  • LOC100513601
  • PDIA3
  • SLA-2
  • SLA-3
  • SLA-6
  • SLA-7
  • SLA-8
  • SNAP23
  • STX4
  • TAP1
  • TAP2
  • VAMP3
  • VAMP8
Sus scrofa (pig)
EGFR interacts with phospholipase C-gamma
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • PLCG1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
EGFR downregulation
  • AREG
  • ARHGEF7
  • BTC
  • CBL
  • CDC42
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EPN1
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGS
  • PTPN12
  • PTPN3
  • PTPRK
  • RPS27A
  • SH3GL1
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • SPRY1
  • STAM
  • STAM2
  • TGFA
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
EGFR Transactivation by Gastrin
  • DTR
  • EGFR
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • MMP3
  • NRAS
  • PRKCA
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
ECM proteoglycans
  • ACAN
  • AGRN
  • BCAN
  • BGN
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COMP
  • DCN
  • DMP1
  • HAPLN1
  • ITGA2
  • ITGA2B
  • ITGA7
  • ITGA8
  • ITGA9
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • MATN1
  • MATN3
  • MATN4
  • NCAN
  • PAI1
  • PLANH1
  • SERPINE1
  • SPARC
  • TNC
  • TNN
  • TNXB
  • VCAN
  • VTN
Sus scrofa (pig)
Drug-mediated inhibition of MET activation
  • HGF
  • MET
Sus scrofa (pig)
Downstream signaling of activated FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FLRT1
  • FLRT2
  • FLRT3
  • Fgf4
  • KL
Sus scrofa (pig)
Downstream TCR signaling
  • BCL10
  • CARD11
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CHUK
  • DRA
  • HLA-DRA
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • INPP5D
  • LCK
  • LMP2
  • LOC100153139
  • MALT1
  • MAP3K7
  • NFKB1
  • NFKBIA
  • PDPK1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRORP
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB3
  • PSMB7
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC3
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • PTEN
  • RELA
  • RIPK2
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
  • TAB2
  • TAK1b
  • TRAF6
  • UBE2NL
Sus scrofa (pig)
Downregulation of TGF-beta receptor signaling
  • BAMBI
  • MADH3
  • MTMR4
  • PMEPA1
  • RPS27A
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD7
  • SMURF2
  • STUB1
  • Smad7
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • bambi
Sus scrofa (pig)
Downregulation of ERBB2 signaling
  • BTC
  • CDC37
  • CUL5
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • MATK
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PTPN12
  • PTPN18
  • RPS27A
  • STUB1
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
Dissolution of Fibrin Clot
  • ANXA2
  • HRG
  • PAI1
  • PLANH1
  • PLAT
  • PLAU
  • PLG
  • S100A10
  • SERPINB2
  • SERPINB6
  • SERPINB8
  • SERPINE1
  • SERPINE2
  • SERPINF2
Sus scrofa (pig)
Dimerization of procaspase-8
  • APT1
  • CASP8
  • CASP9
  • FADD
  • FAS
  • LOC100624226
  • LOC100737977
  • RIPK1
  • TNFRSF6
  • TRADD
  • TRAF2
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


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Last updated: August 19, 2024