GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 351 - 360 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Post-translational modification: synthesis of GPI-anchored proteins
  • ALPL
  • ART3
  • ART4
  • BST1
  • CD109
  • CD52
  • CEACAM1
  • CEACAM21
  • CNTN4
  • CNTN5
  • CPM
  • DDAH2
  • FCGR3A
  • FOLR2
  • GP2
  • GPLD1
  • LOC100157453
  • LOC100521229
  • LOC100522404
  • LSAMP
  • LY6E
  • LY6G6C
  • LY6G6D
  • LY6K
  • LYPD1
  • LYPD3
  • LYPD4
  • LYPD5
  • LYPD8
  • MDGA1
  • MELTF
  • NEGR1
  • NRN1
  • NRN1L
  • NTM
  • OPCML
  • OTOA
  • PLET1
  • PRND
  • PSCA
  • RECK
  • RTN4RL1
  • SPACA4
  • SPRN
  • TECTB
  • TEX101
  • THY1
  • ULBP1
  • VNN1
  • XPNPEP2
  • ly6g6d
Sus scrofa (pig)
Neutrophil degranulation
  • A1BG
  • ABCA13
  • ABP
  • ACP3
  • ACTR10
  • ACTR1B
  • ADA2
  • ADAM10
  • ADAM8
  • ADGRE3
  • ADGRE5
  • ADGRG3
  • AGA
  • AGPAT2
  • AHSG
  • ALAD
  • ALDH3B1
  • ALDOA
  • ALDOC
  • ALOX5
  • AMPD3
  • ANO6
  • ANPEP
  • ANXA2
  • AOC1
  • AP1M1
  • AP2A2
  • APAF1
  • APAF1_tv3
  • APEH
  • APRT
  • ARG1
  • ARHGAP45
  • ARHGAP9
  • ARL8A
  • ARMC8
  • ARP11
  • ARPC5
  • ARSA
  • ARSB
  • ASAH1
  • ASC
  • ATAD3A
  • ATG7
  • ATP11A
  • ATP11B
  • ATP6AP2
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0C
  • ATP8A1
  • ATP8B4
  • AZU1
  • B2M
  • B4GALT1
  • BIN2
  • BPI
  • BRI3
  • BST1
  • BST2
  • C1H6orf120
  • C1orf35
  • C2H1orf35
  • C3
  • C5AR1
  • C6orf120
  • CAB39
  • CALML5
  • CAND1
  • CANT1
  • CAP1
  • CAPN1
  • CCT2
  • CCT8
  • CD14
  • CD177
  • CD300C
  • CD36
  • CD44
  • CD47
  • CD53
  • CD55
  • CD58
  • CD59
  • CD63
  • CD68
  • CDA
  • CDK13
  • CEACAM1
  • CEACAM21
  • CEP290
  • CFD
  • CFP
  • CHI3L1
  • CHIT1
  • CK2N
  • CKAP4
  • CLEC12A
  • CLEC5A
  • CLECSF5
  • CNN2
  • COMMD9
  • COPB1
  • COTL1
  • CPNE1
  • CPNE3
  • CPPED1
  • CRACR2A
  • CREG1
  • CRISP3
  • CRISPLD2
  • CSNK2B
  • CST3
  • CST6
  • CSTB
  • CTL2
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSD
  • CTSH
  • CTSZ
  • CXCL7
  • CXCR2
  • CYB5R3
  • CYBA
  • CYFIP1
  • CYSTM1
  • DAO
  • DAP12
  • DDOST
  • DDX3X
  • DEGS1
  • DERA
  • DF
  • DGAT1
  • DIAPH1
  • DNAJC13
  • DNAJC3
  • DNAJC5
  • DNASE1L1
  • DOCK2
  • DOK3
  • DPP7
  • DSC1
  • DSG1
  • DSN1
  • DSP
  • DYNC1LI1
  • DYNLL1
  • DYNLT1
  • EEF1A1
  • ENPP4
  • EPX
  • FABP5
  • FAF2
  • FCER1G
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • FCN1
  • FCN2
  • FGL2
  • FOLR2
  • FRK
  • FRMPD3
  • FTH1
  • FTL
  • FUCA1
  • FUCA2
  • GAA
  • GALNS
  • GCA
  • GDI2
  • GGH
  • GHDC
  • GLA
  • GLB1
  • GLIPR1
  • GLUT3
  • GM2A
  • GNS
  • GOLGA7
  • GP91-PHOX
  • GPI
  • GPR84
  • GRN
  • GSDMD
  • GSN
  • GST12
  • GUSB
  • GYG1
  • HBB
  • HEBP2
  • HEXB
  • HK3
  • HP
  • HPSE
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPA1B
  • HSPA6
  • HSPA8
  • HSPCA
  • HUWE1
  • HVCN1
  • IDH1
  • IGF2R
  • ILF2
  • IMPDH
  • IMPDH1
  • IMPDH2
  • IQGAP2
  • IST1
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAV
  • ITGB2
  • JUP
  • Jup
  • KCMF1
  • KPNB1
  • KRT1
  • LAMP1
  • LAMP2
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LC8
  • LCN2
  • LOC100153783
  • LOC100154047
  • LOC100154844
  • LOC100156325
  • LOC100511639
  • LOC100512873
  • LOC100513601
  • LOC100515551
  • LOC100515837
  • LOC100517285
  • LOC100521529
  • LOC100522225
  • LOC100525227
  • LOC100525396
  • LOC100624191
  • LOC100624590
  • LOC100736623
  • LOC100739163
  • LOC100739707
  • LOC102161654
  • LOC102163838
  • LOC110255185
  • LOC110255221
  • LOC110258710
  • LOC110260465
  • LOC110261034
  • LOC110261633
  • LOC110261636
  • LOC110261637
  • LOX1
  • LPCAT1
  • LRRC7
  • LTA4H
  • LTF
  • MAGT1
  • MAN2B1
  • MANBA
  • MAPK1
  • MAPK14
  • MCEMP1
  • MDL1
  • MGAM
  • MGST1
  • MIF
  • MLEC
  • MME
  • MMP25
  • MMP8
  • MMP9
  • MNDA
  • MOSPD2
  • MPO
  • MVP
  • NAPRT
  • NAPRT1
  • NBEAL2
  • NCKAP1L
  • NCSTN
  • NDUFC2
  • NEU1
  • NFAM1
  • NFASC
  • NFKB1
  • NHLRC3
  • NIT2
  • NME2
  • NPC2
  • NRAS
  • OLFM4
  • OLR1
  • ORM1
  • OSCAR
  • OSTF1
  • P2RX1
  • PADI2
  • PDAP1
  • PDXK
  • PECAM1
  • PFKL
  • PGAM1
  • PGLYRP1
  • PGM2
  • PGRMC
  • PGRMC1
  • PIGE-108A11.3
  • PIGR
  • PKM
  • PKP1
  • PLAC8
  • PLAU
  • PLD1
  • PLEKHO2
  • PMAP-36
  • PNP
  • PPBP
  • PPIA
  • PRCP
  • PRDX4
  • PRDX6
  • PRKCD
  • PRSS2
  • PSAP
  • PSEN1
  • PSMA2
  • PSMA5
  • PSMB1
  • PSMB7
  • PSMC3
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PTAFR
  • PTGES2
  • PTPRB
  • PTPRC
  • PTPRN2
  • PTX3
  • PYCARD
  • PYGB
  • PYGL
  • QRICH1
  • QSOX1
  • RAB10
  • RAB18
  • RAB24
  • RAB27A
  • RAB31
  • RAB37
  • RAB3A
  • RAB3D
  • RAB44
  • RAB4B
  • RAB5B
  • RAB7A
  • RAC1
  • RAP1B
  • RAP2A
  • RAP2C
  • RETN
  • RHOA
  • RHOF
  • RHOG
  • RNASET2
  • ROCK1
  • S100A11
  • S100A12
  • S100A7
  • S100A8
  • S100A9
  • S100C
  • SCAMP1
  • SCYB7
  • SDCBP
  • SERPINA1
  • SERPINB1
  • SERPINB10
  • SERPINB12
  • SERPINB6
  • SIGLEC14
  • SIGLEC5
  • SIRPA
  • SLA-2
  • SLA-3
  • SLA-6
  • SLA-7
  • SLA-8
  • SLC11A1
  • SLC15A4
  • SLC27A2
  • SLC2A3
  • SLC2A5
  • SLC44A2
  • SLCO4C1
  • SNAP23
  • SNAP29
  • SORBS2
  • SPTAN1
  • STFB
  • STING1
  • STK11IP
  • STOM
  • SURF4
  • SVIP
  • SYNGR1
  • TBC1D10C
  • TCIRG1
  • TCN1
  • TICAM2
  • TIMP2
  • TLR2
  • TMBIM1
  • TMC6
  • TMEM179B
  • TMEM30A
  • TNFAIP6
  • TNFRSF1B
  • TOLLIP
  • TOM1
  • TRPM2
  • TSPAN14
  • TTR
  • TUBB
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TXNDC5
  • TYROBP
  • UABP-2
  • UBR4
  • UNC13D
  • VAMP8
  • VAPA
  • VAT1
  • VCL
  • VNN1
  • VPS35L
  • XRCC5
  • XRCC6
  • try
Sus scrofa (pig)
Cell surface interactions at the vascular wall
  • APOB
  • CD177
  • CD2
  • CD244
  • CD44
  • CD47
  • CD48
  • CD58
  • CD74
  • CD84
  • CEACAM1
  • CEACAM21
  • CXADR
  • EPCAM
  • F11R
  • F2
  • FCAMR
  • FCER1G
  • FN1
  • FYN
  • GAS6
  • GLG1
  • GP6
  • GPC1
  • IGHM
  • IGKV5-2
  • ITGA4
  • ITGA5
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGB1
  • ITGB2
  • JAM2
  • JAM3
  • JAML
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • LOC100624226
  • LOC100736623
  • LOC100737977
  • LOC100739707
  • LOC102161654
  • LOX1
  • LYN
  • MERTK
  • MIF
  • OLR1
  • PECAM1
  • PROC
  • PROS1
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SELE
  • SIRPA
  • SPN
  • TACSTD1
  • TGFB1
  • THBD
  • TREM1
Sus scrofa (pig)
Scavenging of heme from plasma
  • ALB
  • AMBP
  • APOA1
  • CD163
  • HBB
  • HP
  • HPX
  • IGKV5-2
  • LOC100125542
  • LOC100156062
  • LOC100523213
  • LOC106510284
  • LOC110259958
Sus scrofa (pig)
FCGR activation
  • CD247
  • CD3G
  • FCGR1A
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • FYN
  • HCK
  • IGKV5-2
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • LYN
  • SRC
  • YES1
Sus scrofa (pig)
Role of phospholipids in phagocytosis
  • CD247
  • CD3G
  • FCGR1A
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • IGKV5-2
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLA2G6
  • PLCG1
  • PLCG2
  • PLD1
  • PLD2
  • PLD3
  • PLD4
  • PLPP4
  • PLPP5
  • PRKCD
  • PRKCE
Sus scrofa (pig)
Initial triggering of complement
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C4A
  • COLEC10
  • COLEC11
  • FCN1
  • FCN2
  • IGKV5-2
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • MASP1
  • MASP2
  • MBL2
Sus scrofa (pig)
Regulation of Complement cascade
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C3
  • C4A
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C6
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C8G
  • C9
  • CD55
  • CD59
  • CD81
  • CFB
  • CFH
  • CFI
  • CLU
  • CPB2
  • CPN1
  • CPN2
  • F2
  • IGKV5-2
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • SERPING1
  • VTN
Sus scrofa (pig)
Regulation of actin dynamics for phagocytic cup formation
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL1
  • ACTB
  • ACTG1
  • ACTR3
  • ARPC1A
  • ARPC1B
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC5
  • BAIAP2
  • BRK1
  • CD247
  • CD3G
  • CDC42
  • CRK
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DOCK1
  • ELMO2
  • FCGR1A
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • GRB2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPCA
  • IGKV5-2
  • LIMK1
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MYH9
  • MYO10
  • MYO1C
  • MYO9B
  • NCK1
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NCKIPSD
  • NF2
  • PAK1
  • RAC1
  • VAV1
  • VAV2
  • WASF2
  • WASF3
  • WASL
  • WIPF1
Sus scrofa (pig)
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell
  • B2M
  • C3
  • CD1.1
  • CD1B
  • CD1D
  • CD200
  • CD200R1
  • CD22
  • CD226
  • CD247
  • CD300A
  • CD300C
  • CD300LF
  • CD300LG
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD40
  • CD40LG
  • CD81
  • CD8A
  • CD8B
  • CD96
  • CLEC2B
  • CLEC4G
  • CRTAM
  • CXADR
  • DAP10
  • DAP12
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • HCST
  • ICAM1
  • ICAM2
  • ICAM4
  • ICAM5
  • IFITM1
  • IFITM3
  • IGKV5-2
  • ITGA4
  • ITGAL
  • ITGB1
  • ITGB2
  • ITGB7
  • JAML
  • KIR2DL1
  • KLRB1
  • KLRF1
  • KLRK1
  • LOC100125542
  • LOC100513601
  • LOC100513863
  • LOC100515551
  • LOC100515837
  • LOC100515852
  • LOC100519082
  • LOC100521998
  • LOC100523213
  • LOC100626247
  • LOC102161418
  • LOC110260307
  • LOC110261034
  • MADCAM1
  • NCR2
  • NECTIN2
  • NPDC1
  • OSCAR
  • PIANP
  • PILRA
  • PVR
  • SIGLEC1
  • SIGLEC5
  • SLA-2
  • SLA-3
  • SLA-6
  • SLA-7
  • SLA-8
  • SLAMF7
  • TNFRSF5
  • TREM1
  • TREM2
  • TREML2
  • TYROBP
  • ULBP1
  • VCAM1
  • cd1d
  • pCD1A
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

Click here to visit the beta site.


International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024