GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Signaling by Activin
  • ACVR1B
  • ACVR1C
  • ACVR2A
  • ACVR2B
  • INHA
  • INHBA
  • INHBB
  • MADH3
  • MADH4
  • MAPK1
  • MAPK3
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • TGFBR3
Sus scrofa (pig)
PI Metabolism
  • TNFAIP8L2
Sus scrofa (pig)
GAB1 signalosome
  • AREG
  • BTC
  • CSK
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GAB1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • PAG1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
  • PXN
  • SRC
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
APAP ADME
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ABCC4
  • ABCC5
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ACY1
  • BMDP
  • CNDP2
  • CYP2E1
  • GGT1
  • GGT6
  • GGT7
  • GSTT1
  • LOC100153094
  • LOC100511540
  • LOC100515741
  • LOC100516628
  • LOC100623255
  • LOC100623504
  • LOC100739163
  • LOC110262115
  • SULT1A3
  • SULT1C4
  • SULT1E1
  • SULT2A1
  • UGT2B31
Sus scrofa (pig)
Heme biosynthesis
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ALAD
  • ALAS1
  • ALAS2
  • ALB
  • BMDP
  • COX10
  • COX15
  • CPOX
  • FECH
  • FLVCR1
  • HMBS
  • PPOX
  • UROD
  • UROS
Sus scrofa (pig)
VEGFR2 mediated vascular permeability
  • CALM3
  • CAV1
  • CDH5
  • CTNNA1
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • JUP
  • Jup
  • NOS3
  • PAK1
  • PAK2
  • PDPK1
  • RAC1
  • VAV1
  • VAV2
Sus scrofa (pig)
FRS-mediated FGFR4 signaling
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • FRS3
  • Fgf4
  • GRB2
  • HRAS
  • KLB
  • KRAS
  • NRAS
  • PTPN11
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
Passive transport by Aquaporins
  • AQP1
  • AQP10
  • AQP12
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AQP5
  • AQP7
  • AQP8
  • AQP9
Sus scrofa (pig)
Nuclear Receptor transcription pathway
  • AR
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESRRA
  • ESRRB
  • ESRRG
  • FTZF1
  • HNF4A
  • HNF4G
  • MED1
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NOR-1
  • NR0B1
  • NR0B2
  • NR1A1
  • NR1C3
  • NR1D1
  • NR1D2
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR1H4
  • NR1I1
  • NR1I2
  • NR1I3
  • NR2B3
  • NR2C1
  • NR2E1
  • NR2E3
  • NR2F1
  • NR2F6
  • NR3A1
  • NR3C1
  • NR3C2
  • NR4A1
  • NR4A2
  • NR4A3
  • NR5A1
  • NR5A2
  • NR6A1
  • PGR
  • PPARA
  • PPARD
  • PPARG
  • RARA
  • RORA
  • RORB
  • RXRA
  • RXRB
  • RXRG
  • THRA
  • THRB
  • VDR
Sus scrofa (pig)
Melanin biosynthesis
  • DCT
  • OCA2
  • SLC45A2
  • TYR
  • TYRP1
  • TYRP2
Sus scrofa (pig)
Interleukin-3, Interleukin-5 and GM-CSF signaling
  • CSF2
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • IL5
  • IL5RA
  • JAK2
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTPN11
  • SHC1
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TEC
  • VAV1
  • YWHAZ
  • stat5B
Sus scrofa (pig)
Regulation of insulin secretion
  • ABCC8
  • CACNA1D
  • CACNA1E
  • CACNA2D2
  • CACNB2
  • CACNB3
  • GLUT1
  • GLUT2
  • RAPGEF3
  • RAPGEF4
  • SLC2A1
  • SLC2A2
Sus scrofa (pig)
TNFR1-induced proapoptotic signaling
  • BIRC2
  • CYLD
  • FADD
  • IKBKE
  • MIB2
  • OTUD1
  • OTUD7B
  • PIAP
  • RBCK1
  • RIPK1
  • RNF31
  • SPATA2
  • TBK1
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAIP3
  • TNFRSF1A
  • TNFRSF6
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF2
  • USP2
  • USP21
  • USP4
Sus scrofa (pig)
Interleukin-12 signaling
  • IL12A
  • IL12B
  • IL12RB1
  • IL12RB2
  • JAK1
  • JAK2
  • LOC100736717
  • P4HB
  • STAT4
  • TYK2
  • stat4
Sus scrofa (pig)
PI-3K cascade:FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • GAB1
  • GRB2
  • KL
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
Sus scrofa (pig)
Regulation of IFNG signaling
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • JAK1
  • JAK2
  • PIAS1
  • PTPN2
  • SOCS1
  • SOCS3
  • STAT1
  • SUMO1
  • socs1
Sus scrofa (pig)
ESR-mediated signaling
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FKBP4
  • FKBP5
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPCA
  • NR3A1
  • PPP5C
  • PTGES3
Sus scrofa (pig)
RND2 GTPase cycle
  • ALDH3A2
  • ARHGAP1
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • BLTP3B
  • CAV1
  • CKAP4
  • DEPDC1B
  • DLG5
  • DSG1
  • DST
  • EPHA2
  • FAM83B
  • FNBP1
  • FRS3
  • GOLGA3
  • KCTD13
  • KIDINS220
  • KTN1
  • LOC100516390
  • LRRC1
  • MUC13
  • NISCH
  • NUDC
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKP4
  • PLXND1
  • PTPN13
  • RBM39
  • RND2
  • SCRIB
  • TFRC
  • TNFAIP1
  • TXNL1
  • UBXN11
  • VANGL1
  • VANGL2
  • WDR6
Sus scrofa (pig)
Formation of the cornified envelope
  • CDSN
  • CELA2A
  • DSC1
  • DSC2
  • DSC3
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • ELA2
  • ELA2A
  • EVPL
  • JUP
  • Jup
  • KAZN
  • KLK12
  • KLK14
  • KLK5
  • LOC396866
  • PERP
  • PKP1
  • PKP2
  • PKP3
  • PKP4
  • PPL
  • RPTN
  • SPINK5
  • SPINK9
  • TCHH
  • TGM1
Sus scrofa (pig)
HDL clearance
  • APOA1
  • HDLBP
  • SCARB1
Sus scrofa (pig)
Activation of PKB
  • AKT2
  • PDPK1
  • TRIB3
Sus scrofa (pig)
Hyaluronan biosynthesis and export
  • ABCC5
  • CEMIP
  • HAS1
  • HAS3
  • SHAS2
  • shas3
Sus scrofa (pig)
Scavenging by Class B Receptors
  • APOA1
  • APOB
  • CD36
  • SCARB1
Sus scrofa (pig)
Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • DRA
  • HLA-DRA
  • LCK
  • LOC100153139
  • PAG1
  • PTPN22
  • PTPRC
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
Sus scrofa (pig)
Chemokine receptors bind chemokines
  • ACKR2
  • ACKR3
  • ACKR4
  • CCL1
  • CCL17
  • CCL2
  • CCL20
  • CCL21
  • CCL22
  • CCL25
  • CCL27
  • CCL3L1
  • CCL4
  • CCL5
  • CCR1
  • CCR10
  • CCR2
  • CCR3
  • CCR4
  • CCR5
  • CCR6
  • CCR7
  • CCR9
  • CCRL1
  • CCRL2
  • CCXCR1
  • CXCL10
  • CXCL12
  • CXCL13
  • CXCL16
  • CXCL2
  • CXCL7
  • CXCL8
  • CXCL9
  • CXCR2
  • CXCR3
  • CXCR4
  • CXCR5
  • CXCR6
  • IL8
  • LOC100525396
  • MIP1B
  • PPBP
  • SCY4A
  • SCYA2
  • SCYB7
  • XCL1
  • XCR1
Sus scrofa (pig)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024