GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 360 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Molecules associated with elastic fibres
  • BMP10
  • BMP2
  • BMP4
  • BMP7
  • EFEMP2
  • FBLN5
  • GDF5
  • ITGA8
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB8
  • LTBP1
  • LTBP3
  • LTBP4
  • MFAP2
  • MFAP4
  • MFAP5
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • VTN
  • bmp4
Sus scrofa (pig)
Mitochondrial protein degradation
  • A4
  • ACAD8
  • ACADSB
  • ACAT1
  • ACO2
  • AD1
  • AFG3L2
  • ALAS1
  • ALDH18A1
  • ALDH1B1
  • ALDH2
  • APP
  • ARG2
  • ATP5A1
  • ATP5A2
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5O
  • ATP5PO
  • ATP6
  • ATPASE6
  • BDH1
  • CLPP
  • CLPX
  • COI
  • COX5A
  • COX5B
  • COXI
  • CS
  • DBT
  • DLD
  • ECH1
  • ECI1
  • FECH
  • FH
  • GLUD
  • GLUD1
  • HAD
  • HADH
  • HADHSC
  • HMGCS2
  • HSD17B10
  • HSPA9
  • HSPD1
  • HTRA2
  • IARS2
  • IDH2
  • IDH3A
  • LDHD
  • LOC100524613
  • LOC106507363
  • LOC110255331
  • LONP1
  • MDH2
  • ME2
  • MRPL32
  • MRPS10
  • MRPS2
  • MT-ATP6
  • MT-CO1
  • MTATP6
  • MTCO1
  • NADK2
  • NDUFS1
  • NDUFS3
  • OGDH
  • OXCT
  • OXCT1
  • OXSM
  • PCCB
  • PDHA1
  • PDHB
  • PDK1
  • PMPCA
  • SCHAD
  • SCOT
  • SHMT2
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • SMDT1
  • SPG7
  • SSBP1
  • STAR
  • SUCLG2
  • TFAM
  • TWNK
  • UQCRC2
Sus scrofa (pig)
Mineralocorticoid biosynthesis
  • 3b-HSD
  • CGA
  • CYP11B
  • CYP11B2
  • CYP21
  • CYP21A1
  • CYP21A3
  • HSD3B
  • LHB
Sus scrofa (pig)
Metabolism of steroid hormones
  • STS
Sus scrofa (pig)
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • ACE
  • ACE2
  • AGT
  • ATP6AP2
  • CES1
  • CTSD
  • CTSZ
  • ENPEP
  • LOC100154047
  • LOC100736962
  • MME
  • REN
Sus scrofa (pig)
Melanin biosynthesis
  • DCT
  • OCA2
  • SLC45A2
  • TYR
  • TYRP1
  • TYRP2
Sus scrofa (pig)
MTOR signalling
  • AKT1S1
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • MLST8
  • MTOR
  • RHEB
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SLC38A9
  • YWHAB
Sus scrofa (pig)
MHC class II antigen presentation
  • ACTR10
  • ACTR1A
  • ACTR1B
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S3
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARF1
  • ARP11
  • CANX
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • CAPZB
  • CD74
  • CENPE
  • CLTA
  • CLTC
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSD
  • CTSF
  • CTSH
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSO
  • DCTN1
  • DCTN2
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN6
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DRA
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • GILT
  • HLA-DOB
  • HLA-DRA
  • IFI30
  • KIF11
  • KIF15
  • KIF18A
  • KIF22
  • KIF23
  • KIF26A
  • KIF2A
  • KIF2B
  • KIF2C
  • KIF3A
  • KIF3C
  • KIF4A
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KIFAP3
  • KLC1
  • KLC2
  • KLC3
  • KLC4
  • LAG3
  • LC8
  • LGMN
  • LOC100153139
  • OSBPL1A
  • RAB7A
  • RACGAP1
  • RILP
  • SAR1B
  • SEC13
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SLA
  • SLA-DMB
  • SLA-DOA
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
  • SPTBN2
Sus scrofa (pig)
MET receptor recycling
  • ARF6
  • CRK
  • GAB1
  • GGA3
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • RAB4A
  • RAB4B
Sus scrofa (pig)
MET interacts with TNS proteins
  • HGF
  • ITGB1
  • MET
  • TNS3
  • TNS4
Sus scrofa (pig)
MET activates STAT3
  • HGF
  • MET
  • STAT3
Sus scrofa (pig)
MET activates RAS signaling
  • GRB2
  • HGF
  • HRAS
  • KRAS
  • MET
  • MUC20
  • NRAS
  • RANBP10
  • RANBP9
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
MET activates RAP1 and RAC1
  • CRK
  • DOCK7
  • GAB1
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • RAC1
  • RAP1B
  • RAPGEF1
Sus scrofa (pig)
MET activates PTPN11
  • GAB1
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • PTPN11
Sus scrofa (pig)
MET activates PTK2 signaling
  • HGF
  • MET
  • SRC
Sus scrofa (pig)
MET activates PI3K/AKT signaling
  • GAB1
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • PIK3CA
  • PIK3R1
Sus scrofa (pig)
MET Receptor Activation
  • HGF
  • HGFAC
  • HPN
  • MET
  • SPINT1
  • SPINT2
Sus scrofa (pig)
Lysosphingolipid and LPA receptors
  • EDG7
  • EDG8
  • LPA3
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR5
  • PLPPR1
  • PLPPR2
  • PLPPR3
  • PLPPR4
  • PLPPR5
  • S1PR1
  • S1PR2
  • S1PR3
  • S1PR4
  • S1PR5
Sus scrofa (pig)
Lysosome Vesicle Biogenesis
  • A4
  • AD1
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1G2
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S3
  • AP4B1
  • AP4E1
  • AP4M1
  • APP
  • ARF1
  • ARRB1
  • CHMP2A
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLVS1
  • CTSZ
  • DNASE2
  • DNASE2A
  • DNL2
  • DNM2
  • GNS
  • HGS
  • M6PR
  • TXNDC5
  • VAMP2
  • VAMP8
Sus scrofa (pig)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • MAN2B1
  • MAN2B2
  • MAN2C1
  • MANBA
Sus scrofa (pig)
Ligand-dependent caspase activation
  • CASP8
  • CD14
  • FADD
  • LY96
  • RIPK1
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TLR4
  • TNFRSF6
Sus scrofa (pig)
Lewis blood group biosynthesis
  • B3GALT1
  • B3GALT2
  • B3GALT4
  • FUT10
  • FUT11
  • FUT2
  • FUT4
  • FUT7
  • LOC100513844
  • LOC110255214
  • ST3GAL-III
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
  • ST6GALNAC6
Sus scrofa (pig)
Lectin pathway of complement activation
  • COLEC10
  • COLEC11
  • FCN1
  • FCN2
  • MASP1
  • MASP2
  • MBL2
Sus scrofa (pig)
Lactose synthesis
  • B4GALT1
  • GLUT1
  • LALBA
  • SLC2A1
Sus scrofa (pig)
LDL clearance
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • CES3
  • CLTA
  • CLTC
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LIPA
  • NCEH1
  • NPC1
  • NPC2
  • PCSK9
  • SOAT1
  • SOAT2
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024