GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
SHC-related events triggered by IGF1R
  • GRB2
  • IGF1
  • IGF1R
  • IGF2
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
SHC-mediated cascade:FGFR4
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • Fgf4
  • GRB2
  • HRAS
  • KLB
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
FRS-mediated FGFR4 signaling
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • FRS3
  • Fgf4
  • GRB2
  • HRAS
  • KLB
  • KRAS
  • NRAS
  • PTPN11
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
RET signaling
  • ARTN
  • CDC25C
  • DOK1
  • DOK2
  • DOK4
  • DOK5
  • DOK6
  • GAB1
  • GAB2
  • GDNF
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA3
  • GFRA4
  • GRB2
  • GRB7
  • Grb10
  • IRS2
  • MAPK7
  • NRTN
  • PDLIM7
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLCG1
  • PRKCA
  • PSPN
  • PTPN11
  • RAP1GAP
  • RET
  • SHC1
  • SHC3
  • SOS1
  • SRC
Sus scrofa (pig)
SHC-mediated cascade:FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • GRB2
  • HRAS
  • KL
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
FRS-mediated FGFR1 signaling
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FRS3
  • Fgf4
  • GRB2
  • HRAS
  • KL
  • KRAS
  • NRAS
  • PTPN11
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
GRB2 events in EGFR signaling
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • SOS1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
SHC1 events in EGFR signaling
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
Glycogen breakdown (glycogenolysis)
  • CALM3
  • GAA
  • GYG1
  • GYG2
  • PHKA1
  • PHKA2
  • PHKB
  • PHKG2
  • PYGL
  • PYGM
Sus scrofa (pig)
LDL clearance
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • CES3
  • CLTA
  • CLTC
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LIPA
  • NCEH1
  • NPC1
  • NPC2
  • PCSK9
  • SOAT1
  • SOAT2
Sus scrofa (pig)
VxPx cargo-targeting to cilium
  • ARF4
  • ASAP1
  • CNGA4
  • CNGB1
  • EXOC1
  • EXOC2
  • EXOC3
  • EXOC5
  • EXOC6
  • EXOC7
  • EXOC8
  • GBF1
  • PKD1
  • PKD2
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11FIP3
  • RAB3IP
  • RAB8A
  • RHO
  • RHO1
Sus scrofa (pig)
Degradation of cysteine and homocysteine
  • ADO
  • CDO1
  • FMO-1
  • FMO1
  • GADL1
  • MPST
  • TST
  • TXN2
Sus scrofa (pig)
Vasopressin-like receptors
  • AVP
  • AVPR1A
  • AVPR1B
  • AVPR2
  • OXT
  • OXTR
Sus scrofa (pig)
Advanced glycosylation endproduct receptor signaling
  • A4
  • AD1
  • AGER
  • APP
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • S100A12
  • S100B
Sus scrofa (pig)
TRAF6 mediated NF-kB activation
  • A4
  • AD1
  • AGER
  • APP
  • CHUK
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB2_tv2
  • NFKBIA
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • RELA
  • S100A12
  • S100B
Sus scrofa (pig)
TAK1-dependent IKK and NF-kappa-B activation
  • A4
  • AD1
  • AGER
  • ALPK1
  • APP
  • CHUK
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IRAK1
  • IRAK2
  • MAP3K7
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB2_tv2
  • NFKBIA
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • RELA
  • RPS27A
  • S100A12
  • S100B
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1b
  • TIFA
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBE2NL
  • USP18
Sus scrofa (pig)
Cargo concentration in the ER
  • AREG
  • CD59
  • CNIH1
  • CNIH3
  • COL7A1
  • CTSZ
  • F5
  • FOLR1
  • FOLR3
  • GOSR2
  • GRIA1
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • MCFD2
  • MIA2
  • MIA3
  • PREB
  • SAR1B
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SERPINA1
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
  • UABP-2
Sus scrofa (pig)
Transport of organic anions
  • AVP
  • SLC16A2
  • SLCO1A2
  • SLCO1B2
  • SLCO1B3
  • SLCO1C1
  • SLCO2A1
  • SLCO2B1
  • SLCO3A1
  • SLCO4A1
  • SLCO4C1
Sus scrofa (pig)
HS-GAG degradation
  • AGRN
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • GUSB
  • HPSE
  • HPSE2
  • IDS
  • IDUA
  • NAGLU
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SGSH
Sus scrofa (pig)
ECM proteoglycans
  • ACAN
  • AGRN
  • BCAN
  • BGN
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COMP
  • DCN
  • DMP1
  • HAPLN1
  • ITGA2
  • ITGA2B
  • ITGA7
  • ITGA8
  • ITGA9
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • MATN1
  • MATN3
  • MATN4
  • NCAN
  • PAI1
  • PLANH1
  • SERPINE1
  • SPARC
  • TNC
  • TNN
  • TNXB
  • VCAN
  • VTN
Sus scrofa (pig)
HS-GAG biosynthesis
  • AGRN
  • EXT1
  • EXT2
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HS2ST1
  • HS3ST1
  • HS3ST2
  • HS3ST3A1
  • HS3ST3B1
  • HS3ST4
  • HS3ST5
  • HS3ST6
  • HS6ST1
  • HS6ST2
  • HS6ST3
  • NDST1
  • NDST2
  • NDST3
  • NDST4
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SLC35D2
Sus scrofa (pig)
Formation of the cornified envelope
  • CDSN
  • CELA2A
  • DSC1
  • DSC2
  • DSC3
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • ELA2
  • ELA2A
  • EVPL
  • JUP
  • Jup
  • KAZN
  • KLK12
  • KLK14
  • KLK5
  • LOC396866
  • PERP
  • PKP1
  • PKP2
  • PKP3
  • PKP4
  • PPL
  • RPTN
  • SPINK5
  • SPINK9
  • TCHH
  • TGM1
Sus scrofa (pig)
Cytosolic sulfonation of small molecules
  • ABHD14B
  • BPNT1
  • BPNT2
  • IMPA3
  • IMPAD1
  • PODXL2
  • SULT1A3
  • SULT1B1
  • SULT1C4
  • SULT1E1
  • SULT2A1
  • SULT2B1
  • SULT4A1
  • SULT6B1
  • TPST2
Sus scrofa (pig)
CS/DS degradation
  • ARSB
  • BCAN
  • BGN
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • HEXA
  • HEXB
  • HYAL1
  • IDS
  • IDUA
  • NCAN
  • VCAN
Sus scrofa (pig)
APAP ADME
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ABCC4
  • ABCC5
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ACY1
  • BMDP
  • CNDP2
  • CYP2E1
  • GGT1
  • GGT6
  • GGT7
  • GSTT1
  • LOC100153094
  • LOC100511540
  • LOC100515741
  • LOC100516628
  • LOC100623255
  • LOC100623504
  • LOC100739163
  • LOC110262115
  • SULT1A3
  • SULT1C4
  • SULT1E1
  • SULT2A1
  • UGT2B31
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024