GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 201 - 225 of 360 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Neutrophil degranulation
  • A1BG
  • ABCA13
  • ABP
  • ACP3
  • ACTR10
  • ACTR1B
  • ADA2
  • ADAM10
  • ADAM8
  • ADGRE3
  • ADGRE5
  • ADGRG3
  • AGA
  • AGPAT2
  • AHSG
  • ALAD
  • ALDH3B1
  • ALDOA
  • ALDOC
  • ALOX5
  • AMPD3
  • ANO6
  • ANPEP
  • ANXA2
  • AOC1
  • AP1M1
  • AP2A2
  • APAF1
  • APAF1_tv3
  • APEH
  • APRT
  • ARG1
  • ARHGAP45
  • ARHGAP9
  • ARL8A
  • ARMC8
  • ARP11
  • ARPC5
  • ARSA
  • ARSB
  • ASAH1
  • ASC
  • ATAD3A
  • ATG7
  • ATP11A
  • ATP11B
  • ATP6AP2
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0C
  • ATP8A1
  • ATP8B4
  • AZU1
  • B2M
  • B4GALT1
  • BIN2
  • BPI
  • BRI3
  • BST1
  • BST2
  • C1H6orf120
  • C1orf35
  • C2H1orf35
  • C3
  • C5AR1
  • C6orf120
  • CAB39
  • CALML5
  • CAND1
  • CANT1
  • CAP1
  • CAPN1
  • CCT2
  • CCT8
  • CD14
  • CD177
  • CD300C
  • CD36
  • CD44
  • CD47
  • CD53
  • CD55
  • CD58
  • CD59
  • CD63
  • CD68
  • CDA
  • CDK13
  • CEACAM1
  • CEACAM21
  • CEP290
  • CFD
  • CFP
  • CHI3L1
  • CHIT1
  • CK2N
  • CKAP4
  • CLEC12A
  • CLEC5A
  • CLECSF5
  • CNN2
  • COMMD9
  • COPB1
  • COTL1
  • CPNE1
  • CPNE3
  • CPPED1
  • CRACR2A
  • CREG1
  • CRISP3
  • CRISPLD2
  • CSNK2B
  • CST3
  • CST6
  • CSTB
  • CTL2
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSD
  • CTSH
  • CTSZ
  • CXCL7
  • CXCR2
  • CYB5R3
  • CYBA
  • CYFIP1
  • CYSTM1
  • DAO
  • DAP12
  • DDOST
  • DDX3X
  • DEGS1
  • DERA
  • DF
  • DGAT1
  • DIAPH1
  • DNAJC13
  • DNAJC3
  • DNAJC5
  • DNASE1L1
  • DOCK2
  • DOK3
  • DPP7
  • DSC1
  • DSG1
  • DSN1
  • DSP
  • DYNC1LI1
  • DYNLL1
  • DYNLT1
  • EEF1A1
  • ENPP4
  • EPX
  • FABP5
  • FAF2
  • FCER1G
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • FCN1
  • FCN2
  • FGL2
  • FOLR2
  • FRK
  • FRMPD3
  • FTH1
  • FTL
  • FUCA1
  • FUCA2
  • GAA
  • GALNS
  • GCA
  • GDI2
  • GGH
  • GHDC
  • GLA
  • GLB1
  • GLIPR1
  • GLUT3
  • GM2A
  • GNS
  • GOLGA7
  • GP91-PHOX
  • GPI
  • GPR84
  • GRN
  • GSDMD
  • GSN
  • GST12
  • GUSB
  • GYG1
  • HBB
  • HEBP2
  • HEXB
  • HK3
  • HP
  • HPSE
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPA1B
  • HSPA6
  • HSPA8
  • HSPCA
  • HUWE1
  • HVCN1
  • IDH1
  • IGF2R
  • ILF2
  • IMPDH
  • IMPDH1
  • IMPDH2
  • IQGAP2
  • IST1
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAV
  • ITGB2
  • JUP
  • Jup
  • KCMF1
  • KPNB1
  • KRT1
  • LAMP1
  • LAMP2
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LC8
  • LCN2
  • LOC100153783
  • LOC100154047
  • LOC100154844
  • LOC100156325
  • LOC100511639
  • LOC100512873
  • LOC100513601
  • LOC100515551
  • LOC100515837
  • LOC100517285
  • LOC100521529
  • LOC100522225
  • LOC100525227
  • LOC100525396
  • LOC100624191
  • LOC100624590
  • LOC100736623
  • LOC100739163
  • LOC100739707
  • LOC102161654
  • LOC102163838
  • LOC110255185
  • LOC110255221
  • LOC110258710
  • LOC110260465
  • LOC110261034
  • LOC110261633
  • LOC110261636
  • LOC110261637
  • LOX1
  • LPCAT1
  • LRRC7
  • LTA4H
  • LTF
  • MAGT1
  • MAN2B1
  • MANBA
  • MAPK1
  • MAPK14
  • MCEMP1
  • MDL1
  • MGAM
  • MGST1
  • MIF
  • MLEC
  • MME
  • MMP25
  • MMP8
  • MMP9
  • MNDA
  • MOSPD2
  • MPO
  • MVP
  • NAPRT
  • NAPRT1
  • NBEAL2
  • NCKAP1L
  • NCSTN
  • NDUFC2
  • NEU1
  • NFAM1
  • NFASC
  • NFKB1
  • NHLRC3
  • NIT2
  • NME2
  • NPC2
  • NRAS
  • OLFM4
  • OLR1
  • ORM1
  • OSCAR
  • OSTF1
  • P2RX1
  • PADI2
  • PDAP1
  • PDXK
  • PECAM1
  • PFKL
  • PGAM1
  • PGLYRP1
  • PGM2
  • PGRMC
  • PGRMC1
  • PIGE-108A11.3
  • PIGR
  • PKM
  • PKP1
  • PLAC8
  • PLAU
  • PLD1
  • PLEKHO2
  • PMAP-36
  • PNP
  • PPBP
  • PPIA
  • PRCP
  • PRDX4
  • PRDX6
  • PRKCD
  • PRSS2
  • PSAP
  • PSEN1
  • PSMA2
  • PSMA5
  • PSMB1
  • PSMB7
  • PSMC3
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PTAFR
  • PTGES2
  • PTPRB
  • PTPRC
  • PTPRN2
  • PTX3
  • PYCARD
  • PYGB
  • PYGL
  • QRICH1
  • QSOX1
  • RAB10
  • RAB18
  • RAB24
  • RAB27A
  • RAB31
  • RAB37
  • RAB3A
  • RAB3D
  • RAB44
  • RAB4B
  • RAB5B
  • RAB7A
  • RAC1
  • RAP1B
  • RAP2A
  • RAP2C
  • RETN
  • RHOA
  • RHOF
  • RHOG
  • RNASET2
  • ROCK1
  • S100A11
  • S100A12
  • S100A7
  • S100A8
  • S100A9
  • S100C
  • SCAMP1
  • SCYB7
  • SDCBP
  • SERPINA1
  • SERPINB1
  • SERPINB10
  • SERPINB12
  • SERPINB6
  • SIGLEC14
  • SIGLEC5
  • SIRPA
  • SLA-2
  • SLA-3
  • SLA-6
  • SLA-7
  • SLA-8
  • SLC11A1
  • SLC15A4
  • SLC27A2
  • SLC2A3
  • SLC2A5
  • SLC44A2
  • SLCO4C1
  • SNAP23
  • SNAP29
  • SORBS2
  • SPTAN1
  • STFB
  • STING1
  • STK11IP
  • STOM
  • SURF4
  • SVIP
  • SYNGR1
  • TBC1D10C
  • TCIRG1
  • TCN1
  • TICAM2
  • TIMP2
  • TLR2
  • TMBIM1
  • TMC6
  • TMEM179B
  • TMEM30A
  • TNFAIP6
  • TNFRSF1B
  • TOLLIP
  • TOM1
  • TRPM2
  • TSPAN14
  • TTR
  • TUBB
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TXNDC5
  • TYROBP
  • UABP-2
  • UBR4
  • UNC13D
  • VAMP8
  • VAPA
  • VAT1
  • VCL
  • VNN1
  • VPS35L
  • XRCC5
  • XRCC6
  • try
Sus scrofa (pig)
Non-integrin membrane-ECM interactions
  • DDR1
  • DDR2
Sus scrofa (pig)
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle
  • MAOA
  • OCT2
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RIMS1
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • STX1A
  • STXBP1
  • SYT1
  • TSPOAP1
  • UNC13B
  • VAMP2
Sus scrofa (pig)
Nuclear Receptor transcription pathway
  • AR
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESRRA
  • ESRRB
  • ESRRG
  • FTZF1
  • HNF4A
  • HNF4G
  • MED1
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NOR-1
  • NR0B1
  • NR0B2
  • NR1A1
  • NR1C3
  • NR1D1
  • NR1D2
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR1H4
  • NR1I1
  • NR1I2
  • NR1I3
  • NR2B3
  • NR2C1
  • NR2E1
  • NR2E3
  • NR2F1
  • NR2F6
  • NR3A1
  • NR3C1
  • NR3C2
  • NR4A1
  • NR4A2
  • NR4A3
  • NR5A1
  • NR5A2
  • NR6A1
  • PGR
  • PPARA
  • PPARD
  • PPARG
  • RARA
  • RORA
  • RORB
  • RXRA
  • RXRB
  • RXRG
  • THRA
  • THRB
  • VDR
Sus scrofa (pig)
Nuclear signaling by ERBB4
  • APH1A
  • APH1B
  • ERBB4
  • ESR
  • ESR1
  • NCSTN
  • NR3A1
  • PSEN1
  • PSEN2
  • SRC
  • STAT5A
  • WWOX
  • YAP1
Sus scrofa (pig)
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
  • ADAMTS1
  • ADAMTS10
  • ADAMTS12
  • ADAMTS13
  • ADAMTS14
  • ADAMTS15
  • ADAMTS16
  • ADAMTS17
  • ADAMTS18
  • ADAMTS19
  • ADAMTS2
  • ADAMTS20
  • ADAMTS3
  • ADAMTS4
  • ADAMTS5
  • ADAMTS6
  • ADAMTS7
  • ADAMTS8
  • ADAMTS9
  • ADAMTSL1
  • ADAMTSL2
  • ADAMTSL3
  • ADAMTSL4
  • ADAMTSL5
  • B3GLCT
  • CFP
  • POFUT2
  • SBSPON
  • SEMA5A
  • SEMA5B
  • SPON2
  • SSPOP
  • THBS1
  • THBS2
  • THSD1
  • THSD4
  • THSD7A
  • THSD7B
Sus scrofa (pig)
O-linked glycosylation
  • B3GALNT2
  • B4GAT1
  • DAG1
  • LARGE1
  • LARGE2
  • POMGNT1
  • POMGNT2
  • POMK
  • POMT1
  • POMT2
Sus scrofa (pig)
O-linked glycosylation of mucins
  • A4GNT
  • B3GNT2
  • B3GNT4
  • B3GNT5
  • B3GNT6
  • B3GNT7
  • B3GNT8
  • B3GNT9
  • B3GNTL1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • C1GALT1
  • C1GALT1C1
  • CHST4
  • GALNT1
  • GALNT10
  • GALNT11
  • GALNT12
  • GALNT14
  • GALNT15
  • GALNT16
  • GALNT17
  • GALNT18
  • GALNT2
  • GALNT4
  • GALNT5
  • GALNT6
  • GALNT7
  • GALNT8
  • GALNT9
  • GALNTL5
  • GCNT1
  • GCNT3
  • GCNT4
  • GCNT7
  • MUC1
  • MUC13
  • MUC15
  • MUC2
  • MUC20
  • MUC4
  • MUC5AC
  • MUC5B
  • MUC6
Sus scrofa (pig)
Opsins
  • LOC494564
  • OPN4
  • OPN5
  • RGR
  • RHO
  • RHO1
  • RRH
Sus scrofa (pig)
Orexin and neuropeptides FF and QRFP bind to their respective receptors
  • HCRT
  • HCRTR1
  • HCRTR2
  • NPFFR1
  • NPFFR2
  • ORX
  • OX
  • PPOX
  • QRFPR
Sus scrofa (pig)
Organic anion transport
  • OAT2
  • OAT3
  • SLC22A11
  • SLC22A12
  • SLC22A6
  • SLC22A7
  • SLC22A8
Sus scrofa (pig)
Organic cation transport
  • OCT2
  • RUNX1
  • SLC22A1
  • SLC22A15
  • SLC22A16
  • SLC22A18
  • SLC22A2
  • SLC22A3
  • SLC22A4
  • SLC22A5
Sus scrofa (pig)
Other interleukin signaling
  • CD4
  • CSF1
  • CSF1R
  • CSF3
  • CSF3R
  • IFNLR1
  • IL10RB
  • IL16
  • IL29
  • IL34
  • JAK1
  • PTPRZ1
  • SDC1
  • STX1A
  • STX3
  • STX4
  • STXBP2
  • TXLNA
  • TYK2
  • VAMP2
Sus scrofa (pig)
Ovarian tumor domain proteases
  • APC
  • CDK1
  • ESR
  • ESR1
  • NR3A1
  • OTUB1
  • OTUB2
  • OTUD3
  • OTUD7A
  • OTUD7B
  • P53
  • PTEN
  • RHOA
  • RIPK1
  • RNF128
  • RPS27A
  • TNFAIP3
  • TNIP1
  • TNIP2
  • TNIP3
  • TP53
  • TRAF3
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBE2D1
  • VCPIP1
  • YOD1
  • ZRANB1
Sus scrofa (pig)
PD-1 signaling
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • DRA
  • HLA-DRA
  • LCK
  • LOC100153139
  • PDCD1
  • PDCD1LG2
  • PTPN11
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
Sus scrofa (pig)
PECAM1 interactions
  • FYN
  • INPP5D
  • ITGAV
  • ITGB3
  • LCK
  • LYN
  • PECAM1
  • PLCG1
  • PTPN11
  • SRC
  • YES1
Sus scrofa (pig)
PI Metabolism
  • TNFAIP8L2
Sus scrofa (pig)
PI-3K cascade:FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • GAB1
  • GRB2
  • KL
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
Sus scrofa (pig)
PI-3K cascade:FGFR4
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • Fgf4
  • GAB1
  • GRB2
  • KLB
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
Sus scrofa (pig)
PI3K Cascade
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • IRS1
  • IRS2
  • KL
  • KLB
  • PIK3C3
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R4
  • PTPN11
  • TLR9
Sus scrofa (pig)
PI3K events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • GAB1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PIK3CA
  • PIK3R1
Sus scrofa (pig)
PI3K events in ERBB4 signaling
  • BTC
  • DTR
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PIK3CA
  • PIK3R1
Sus scrofa (pig)
PI3K/AKT Signaling
  • AREG
  • BTC
  • CD28
  • CD80
  • CD80/B7-1
  • CD86
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FYN
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGF
  • IL1RL1
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • LCK
  • MET
  • MLST8
  • MTOR
  • MYD88
  • NR3A1
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDPK1
  • PIK3AP1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRR5
  • PTPN11
  • RAC1
  • RAC2
  • RHOG
  • RICTOR
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • TRAF6
  • VAV1
Sus scrofa (pig)
PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
  • AREG
  • BTC
  • CD28
  • CD80
  • CD80/B7-1
  • CD86
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FYN
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGF
  • IER3
  • IL1RL1
  • INS
  • INSR
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • LCK
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • MYD88
  • NR3A1
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PIK3AP1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIP4K2A
  • PIP4K2B
  • PIP5K1A
  • PIP5K1B
  • PIP5K1C
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PTPN11
  • RAC1
  • RAC2
  • RHOG
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • TRAF6
  • VAV1
Sus scrofa (pig)
PTK6 promotes HIF1A stabilization
  • DTR
  • EGFR
  • GPNMB
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HIF1A
  • LRRK2
  • PTK6
Sus scrofa (pig)

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International Collaboration

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Last updated: August 19, 2024