GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 226 - 250 of 557 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Neutrophil degranulation
  • A1BG
  • ABCA13
  • ABP1
  • ACAA1
  • ACLY
  • ACP3
  • ACPP
  • ACTR10
  • ACTR1B
  • ACTR2
  • ADA2
  • ADAM10
  • ADGRE3
  • ADGRE5
  • ADGRG3
  • AGA
  • AGL
  • AGP
  • AGPAT2
  • AHSG
  • ALAD
  • ALDH3B1
  • ALDOA
  • ALDOC
  • ALOX5
  • AMPD3
  • ANO6
  • ANX2
  • ANXA2
  • AOC1
  • AOP2
  • AP1M1
  • AP2A2
  • APAF1
  • APEH
  • APRT
  • ARG1
  • ARHA
  • ARHGAP45
  • ARHGAP9
  • ARL8A
  • ARMC8
  • ARP10
  • ARP2
  • ARPC5
  • ARSA
  • ARSB
  • ASAH1
  • ATAD3
  • ATG7
  • ATP11A
  • ATP11B
  • ATP6AP2
  • ATP6IP2
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0C
  • ATP8A1
  • ATP8B4
  • AZU1
  • B2M
  • B4GALT1
  • BIN2
  • BOLA
  • BOLA-NC1
  • BPI
  • BRI3
  • BST1
  • C3
  • C3AR1
  • C5AR1
  • C7H1orf35
  • CAAF1
  • CAAF2
  • CAB39
  • CALML5
  • CAND1
  • CANT1
  • CAP1
  • CAPN1
  • CAT
  • CATHL4
  • CCT2
  • CCT8
  • CD14
  • CD177
  • CD18
  • CD36
  • CD44
  • CD47
  • CD53
  • CD55
  • CD58
  • CD59
  • CD63
  • CD68
  • CD93
  • CDC2L
  • CDC2L5
  • CDK13
  • CEACAM1
  • CEP290
  • CFD
  • CFP
  • CHI3L1
  • CHRNB4
  • CK2N
  • CKAP4
  • CLEC4D
  • CLEC5A
  • CLEC6A
  • CMTM6
  • CNN2
  • COMMD3
  • COMMD9
  • COPB1
  • COTL1
  • CPNE1
  • CPNE3
  • CPPED1
  • CRACR2A
  • CREG1
  • CRISP2
  • CRISP3
  • CRISPLD2
  • CSNK2B
  • CST3
  • CSTB
  • CTL2
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSC
  • CTSD
  • CTSH
  • CTSS
  • CTSZ
  • CXCR1
  • CXCR2
  • CYB5R3
  • CYBA
  • CYBB
  • CYFIP1
  • CYSTM1
  • DDOST
  • DDX3X
  • DECTIN2
  • DEGS1
  • DERA
  • DES1
  • DGAT1
  • DIA1
  • DIAPH1
  • DNAJC13
  • DNAJC3
  • DNAJC5
  • DNASE1L1
  • DNCL1
  • DOCK2
  • DOK3
  • DPP7
  • DSC1
  • DSG1
  • DSN1
  • DSP
  • DYNC1H1
  • DYNC1LI1
  • DYNLL1
  • EEF1A
  • EEF1A1
  • EEF2
  • EF1A
  • ELANE
  • ENPP4
  • ERK2
  • ERP44
  • FABP5
  • FAF2
  • FCAR
  • FCER1G
  • FCGR2B
  • FCGR3
  • FCGR3A
  • FCGRIII
  • FCN2
  • FETUA
  • FGL2
  • FGR
  • FOLR2
  • FRK
  • FRMPD3
  • FTH
  • FTH1
  • FTL
  • FUCA1
  • FUCA2
  • GAA
  • GALNS
  • GALT
  • GCA
  • GDI2
  • GGH
  • GGTB2
  • GHDC
  • GLA
  • GLB1
  • GLIPR1
  • GLUT5
  • GM2A
  • GMFG
  • GNS
  • GOLGA7
  • GPI
  • GPR84
  • GPX
  • GRN
  • GSDMD
  • GSN
  • GSTP1
  • GUSB
  • GYG1
  • HBB
  • HEBP2
  • HEXB
  • HGSNAT
  • HK3
  • HMG1
  • HMGB1
  • HMOX2
  • HPSE
  • HSC70
  • HSP70-1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPA1A
  • HSPA6
  • HSPA8
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • HUWE1
  • HVCN1
  • IDH1
  • IGF2R
  • ILF2
  • IMPDH1
  • IMPDH2
  • IQGAP1
  • IQGAP2
  • IST1
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAV
  • ITGAX
  • ITGB2
  • JUP
  • KCMF1
  • KCNAB2
  • KPNB1
  • KRT1
  • KVB2
  • LAMP1
  • LAMP2
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LCN2
  • LGALS3
  • LILRA4
  • LOC100138951
  • LOC100336589
  • LOC100336941
  • LOC101904667
  • LOC107131803
  • LOC112441494
  • LOC112448555
  • LOC509956
  • LOC511695
  • LOC519132
  • LOC522479
  • LOC526163
  • LOC614923
  • LOC617406
  • LOC618268
  • LOC618463
  • LOC618737
  • LOC781990
  • LOC786350
  • LOC786410
  • LOC789748
  • LPCAT1
  • LRG1
  • LTA4H
  • LTF
  • LYZ1
  • LYZ2
  • LYZ3
  • MADM
  • MAGT1
  • MAN2B1
  • MANB
  • MANBA
  • MAPK1
  • MAPK14
  • MCEMP1
  • MGAM2
  • MGC140461
  • MGST1
  • MIF
  • MLEC
  • MME
  • MMP25
  • MMP8
  • MMP9
  • MOSPD2
  • MPO
  • MS4A3
  • MVP
  • NCKAP1L
  • NCSTN
  • NDUFC2
  • NEU1
  • NFAM1
  • NFASC
  • NFKB1
  • NHLRC3
  • NIT2
  • NME2
  • NPC2
  • NRAS
  • OLFM4
  • OLR1
  • ORM1
  • ORMDL3
  • OSCAR
  • OSTF1
  • P2RX1
  • PA2G4
  • PADI2
  • PAFAH1B2P68402
  • PAFAHB
  • PAFR
  • PAS4
  • PDAP1
  • PDXK
  • PECAM1
  • PFKL
  • PGAM1
  • PGLYRP
  • PGLYRP1
  • PGM2
  • PGRMC1
  • PGRP
  • PHGPX
  • PHT1
  • PI
  • PIGR
  • PKM
  • PKM2
  • PKP1
  • PLAC8
  • PLAU
  • PLAUR
  • PLD1
  • PLEKHO2
  • PNP
  • PPIA
  • PRCP
  • PRDX4
  • PRDX6
  • PRKCD
  • PRKM1
  • PRSS2
  • PRTN3
  • PSAP
  • PSEN1
  • PSMA2
  • PSMA5
  • PSMB1
  • PSMB7
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PTAFR
  • PTGES2
  • PTPN6
  • PTPRB
  • PTPRC
  • PTPRJ
  • PTPRN2
  • PTX3
  • PYCARD
  • PYGB
  • PYGL
  • QPCT
  • RAB10
  • RAB14
  • RAB18
  • RAB27A
  • RAB31
  • RAB37
  • RAB3A
  • RAB44
  • RAB4B
  • RAB5B
  • RAB6A
  • RAB9B
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RAP2B
  • RAP2C
  • RECS1
  • RETN
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOF
  • RHOG
  • RNASE2
  • RNASET2
  • ROCK1
  • RSTN
  • S100A12
  • S100A7
  • S100A8
  • S100A9
  • SCAMP1
  • SDCBP
  • SERPINA1
  • SERPINB1
  • SERPINB10
  • SERPINB12
  • SIRPA
  • SIRPB1
  • SLC11A1
  • SLC15A4
  • SLC27A2
  • SLC2A3
  • SLC2A5
  • SLC44A2
  • SLCO4C1
  • SLPI
  • SNAP23
  • SNAP25
  • SNAP29
  • SORBS2
  • SPTAN1
  • SRP14
  • STBD1
  • STING
  • STING1
  • STK11IP
  • STOM
  • SURF4
  • SVIP
  • SYNGR1
  • TCIRG1
  • TCN1
  • TICAM2
  • TIMP2
  • TLR2
  • TMBIM1
  • TMEM173
  • TMEM179B
  • TMEM30A
  • TNFAIP6
  • TNFRSF1B
  • TOLLIP
  • TOM1
  • TRAM
  • TRAP2
  • TRAPPC1
  • TTR
  • TUBB2C
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TXNDC4
  • TXNDC5
  • UBR4
  • UBXD8
  • UNC13D
  • VAMP8
  • VAPA
  • VAT1
  • VCL
  • VCP
  • VNN1
  • XRCC5
  • XRCC6
  • YPEL5
  • agp
  • tsg-6
Bos taurus (cattle)
Neurotransmitter release cycle
  • NAAA
Bos taurus (cattle)
Neurotransmitter receptors and postsynaptic signal transmission
  • GLRA1
  • GLRA2
  • GLRA3
  • GLRB
  • HTR3A
  • HTR3B
  • LOC616094
Bos taurus (cattle)
Neurotransmitter clearance
  • OCT1
  • SLC22A1
  • SLC22A2
Bos taurus (cattle)
Neurexins and neuroligins
  • CASK
  • DLG3
  • DLG4
  • DLGAP1
  • DLGAP3
  • DLGAP4
  • E41P
  • EPB41
  • EPB41L1
  • EPB41L2
  • EPB41L3
  • EPB41L5
  • GRM1
  • GRM5
  • HOMER1
  • HOMER2
  • HOMER3
  • LRRTM1
  • LRRTM2
  • LRRTM3
  • LRRTM4
  • NLGN1
  • NLGN2
  • NLGN3
  • NLGN4X
  • NRXN3
  • SHANK1
  • SHANK3
  • SORBS2
Bos taurus (cattle)
Negative regulation of the PI3K/AKT network
  • PTEN
Bos taurus (cattle)
Negative regulation of FGFR3 signaling
  • AFGF
  • CBL
  • ERK2
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6A
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR3
  • FRS2
  • Fgf4
  • GRB2
  • HBGF-1
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PTPN11
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Negative regulation of FGFR2 signaling
  • AFGF
  • CBL
  • ERK2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR2
  • FRS2
  • Fgf4
  • GRB2
  • HBGF-1
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PTPN11
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Negative regulation of FGFR1 signaling
  • AFGF
  • CBL
  • ERK2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF5
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FRS2
  • Fgf4
  • GRB2
  • HBGF-1
  • KL
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PTPN11
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Neddylation
  • ANKRD9
  • ASB1
  • ASB10
  • ASB11
  • ASB12
  • ASB13
  • ASB14
  • ASB15
  • ASB17
  • ASB4
  • ASB5
  • ASB6
  • ASB7
  • ASB8
  • ASB9
  • BIRC5
  • BTBD1
  • BTBD6
  • CAND1
  • CCDC22
  • CCDC8
  • CISH
  • COMMD1
  • COMMD10
  • COMMD2
  • COMMD3
  • COMMD4
  • COMMD5
  • COMMD7
  • COMMD8
  • COMMD9
  • COP1
  • COPS2
  • COPS3
  • COPS4
  • COPS5
  • COPS6
  • COPS7A
  • COPS7B
  • COPS8
  • CSN3
  • CUL1
  • CUL2
  • CUL3
  • CUL4A
  • CUL4B
  • CUL5
  • CUL7
  • CUL9
  • DCAF10
  • DCAF11
  • DCAF13
  • DCAF17
  • DCAF5
  • DCAF6
  • DCAF7
  • DCAF8
  • DCUN1D2
  • DCUN1D3
  • DCUN1D4
  • DCUN1D5
  • DDA1
  • DDB1
  • DDB2
  • DTL
  • ELOC
  • EPAS1
  • ERCC8
  • FBS2
  • FBW7
  • FBX6
  • FBXL12
  • FBXL13
  • FBXL14
  • FBXL15
  • FBXL16
  • FBXL18
  • FBXL19
  • FBXL20
  • FBXL21
  • FBXL4
  • FBXL5
  • FBXL7
  • FBXO10
  • FBXO11
  • FBXO15
  • FBXO2
  • FBXO21
  • FBXO22
  • FBXO30
  • FBXO31
  • FBXO32
  • FBXO4
  • FBXO40
  • FBXO41
  • FBXO44
  • FBXO6
  • FBXO7
  • FBXO9
  • FBXW11
  • FBXW2
  • FBXW4
  • FBXW5
  • FBXW7
  • FBXW8
  • FBXW9
  • FEM1A
  • FEM1B
  • FEM1C
  • GAN
  • GPS1
  • HIF1A
  • HIF3A
  • KBTBD10
  • KBTBD13
  • KBTBD6
  • KBTBD7
  • KBTBD8
  • KCTD6
  • KCTD7
  • KEAP1
  • KLHL11
  • KLHL13
  • KLHL2
  • KLHL20
  • KLHL21
  • KLHL22
  • KLHL3
  • KLHL41
  • KLHL42
  • KLHL5
  • KLHL9
  • LMO7
  • LOC101903064
  • LOC528919
  • LOC782101
  • LOC789309
  • LRR1
  • LRRC41
  • MUL1
  • NAE1
  • NEDD8
  • NEURL2
  • NFE2L2
  • NPLOC4
  • NUB1
  • OBSL1
  • PPIL5
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RBBP5
  • RBBP7
  • RNF7
  • RPS27A
  • SENP8
  • SKP1
  • SKP1A
  • SKP2
  • SOCS2
  • SOCS3
  • SOCS5
  • SPSB1
  • SPSB2
  • SPSB3
  • SPSB4
  • SSB3
  • SUG1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TRAP2
  • TULP4
  • UBA3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC12
  • UBC4
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5B
  • UBD
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • UBE2F
  • UBE2M
  • UBXN7
  • UCHL3
  • UFD1
  • VCP
  • WDR21A
  • WDR5
  • WDR68
  • WDTC1
  • WSB1
Bos taurus (cattle)
Na+/Cl- dependent neurotransmitter transporters
  • B0AT2
  • NTT73
  • OCT1
  • SLC18A1
  • SLC18A2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SLC6A1
  • SLC6A11
  • SLC6A13
  • SLC6A15
  • SLC6A18
  • SLC6A19
  • SLC6A2
  • SLC6A20
  • SLC6A3
  • SLC6A5
  • SLC6A6
  • SLC6A7
  • SLC6A9
Bos taurus (cattle)
NTF3 activates NTRK3 signaling
  • NTF3
  • NTRK3
Bos taurus (cattle)
NIK-->noncanonical NF-kB signaling
  • CHUK
  • CUL1
  • FBXW11
  • IKKA
  • MAP3K14
  • NFKB2
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RELB
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC12
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBE2M
Bos taurus (cattle)
NF-kB is activated and signals survival
  • IKBKB
  • IRAK1
  • NFKB1
  • NFKBIA
  • NGF
  • NGFR
  • RELA
  • RPS27A
  • SQSTM1
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • bIkBa
Bos taurus (cattle)
N-glycan trimming in the ER and Calnexin/Calreticulin cycle
  • AMFR
  • DERL1
  • ENGASE
  • NGLY1
  • RAD23B
  • RPS27A
  • SAKS1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBXN1
  • VCP
Bos taurus (cattle)
N-glycan trimming and elongation in the cis-Golgi
  • MANEA
  • MGAT1
Bos taurus (cattle)
N-Glycan antennae elongation
  • B4GALT1
  • B4GALT2
  • B4GALT4
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • GALT
  • GGTB2
  • MGAT4A
  • MGAT4B
  • MGAT4C
  • MGAT5
  • ST3GAL4
  • ST8SIA2
  • ST8SIA3
Bos taurus (cattle)
Myogenesis
  • ABL1
  • BNIP2
  • BOC
  • CDC42
  • CDH15
  • CDH2
  • CDH4
  • CDON
  • CTNNA1
  • CTNNB1
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MEF2B
  • MEF2C
  • MRF4
  • MYF5
  • MYF6
  • MYOD1
  • MYOG
  • SPAG9
  • TCF12
  • TCF3
  • TCF4
Bos taurus (cattle)
MyD88:MAL(TIRAP) cascade initiated on plasma membrane
  • ECSIT
  • MAP3K1
  • TIRAP
  • TRAF6
Bos taurus (cattle)
MyD88-independent TLR4 cascade
  • CD14
  • LY96
  • MD-2
  • SARM1
  • TICAM2
  • TLR4
  • TRAM
Bos taurus (cattle)
MyD88 cascade initiated on plasma membrane
  • ECSIT
  • MAP3K1
  • TRAF6
Bos taurus (cattle)
Muscarinic acetylcholine receptors
  • CHRM1
  • CHRM2
  • CHRM3
  • CHRM5
Bos taurus (cattle)
Multifunctional anion exchangers
  • SLC26A1
  • SLC26A11
  • SLC26A2
  • SLC26A3
  • SLC26A4
  • SLC26A6
  • SLC26A7
  • SLC26A9
  • SLC5A12
  • SMCT2
Bos taurus (cattle)
Molecules associated with elastic fibres
  • BMP10
  • BMP2
  • BMP4
  • BMP7
  • EFEMP2
  • FBLN5
  • GDF5
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB8
  • LTBP1
  • LTBP2
  • LTBP3
  • LTBP4
  • MFAP3
  • MFAP4
  • MFAP5
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • VTN
Bos taurus (cattle)
Mitotic Prometaphase
  • AHCTF1
  • APITD1
  • AURKB
  • B9D2
  • BIRC5
  • BUB1
  • BUB1B
  • BUB3
  • CCDC99
  • CDC20
  • CDCA8
  • CENPC
  • CENPE
  • CENPF
  • CENPH
  • CENPI
  • CENPK
  • CENPL
  • CENPM
  • CENPO
  • CENPP
  • CENPQ
  • CENPS
  • CENPT
  • CKAP5
  • CLASP1
  • CLASP2
  • CLIP1
  • DNCL1
  • DSN1
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • ERCC6L
  • FAAP16
  • INCENP
  • ITGB3BP
  • KIF2B
  • KNL1
  • KNTC1
  • LIS1
  • MAD1L1
  • MAD2L1
  • MAPRE1
  • MCM21R
  • MHF1
  • MIS12
  • NDC80
  • NDE1
  • NDEL1
  • NSL1
  • NUDC
  • NUF2
  • NUP107
  • NUP133
  • NUP160
  • NUP37
  • NUP43
  • NUP85
  • NUP98
  • PAFAH1B1
  • PLK1
  • PMF1
  • PPP1CC
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • RANBP2
  • RANGAP1
  • RCC2
  • RPS27
  • SEC13
  • SEC13L1
  • SEH1L
  • SGO1
  • SGO2
  • SKA1
  • SKA2
  • SPBC25
  • SPC24
  • SPC25
  • SPDL1
  • TAOK1
  • XPO1
  • ZW10
  • ZWILCH
  • ZWINT
Bos taurus (cattle)

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Last updated: August 19, 2024