GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 251 - 275 of 557 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Interconversion of nucleotide di- and triphosphates
  • AK1
  • AK2
  • AK3L1
  • AK4
  • AK5
  • AK6
  • AK7
  • AK8
  • AK9
  • CINAP
  • CMPK
  • CMPK1
  • CTPS
  • CTPS1
  • CTPS2
  • DCTD
  • DUT
  • GSR
  • GUK
  • GUK1
  • NME1-2
  • NME2
  • NME3
  • NME4
  • NUDT13
  • RRM1
  • RRM2
  • RRM2B
  • TXN
  • TXNRD1
  • TYMS
Bos taurus (cattle)
Interferon alpha/beta signaling
  • ABCE1
  • IF1AG1
  • IF1AG8
  • IFNAC
  • IFNAR
  • IFNAR1
  • IFNAR2
  • IRF9
  • ISGF3G
  • JAK1
  • KPNA1
  • KPNB1
  • LOC100335490
  • LOC523244
  • LOC618947
  • LOC783912
  • RNASEL
  • RPS27A
  • SOCS1
  • SOCS3
  • STAT1
  • STAT2
  • TYK2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Interferon gamma signaling
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • ERK2
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • JAK1
  • JAK2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKCD
  • PRKM1
  • PTPN6
  • SOCS1
  • SOCS3
  • STAT1
  • YB1
  • YBX1
Bos taurus (cattle)
Interleukin receptor SHC signaling
  • CSF2
  • CSF2RB
  • GAB2
  • GRB2
  • IL-2
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RG
  • IL3
  • IL3RA
  • IL5
  • IL5RA
  • INPP5D
  • INPPL1
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PTPN6
  • SHC1
  • SOS1
Bos taurus (cattle)
Interleukin-1 processing
  • CASP1
  • GSDMD
  • IGIF
  • IL18
  • IL1A
  • IL1B
  • LOC509956
  • NFKB1
  • NFKB2
  • RELA
Bos taurus (cattle)
Interleukin-1 signaling
  • CHUK
  • CUL1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IL1A
  • IL1B
  • IL1R1
  • IL1R2
  • IL1RN
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK3
  • IRAK4
  • MAP2K6
  • MAP3K3
  • MAP3K7
  • MYD88
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKBIA
  • PELI1
  • PELI2
  • PELI3
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RELA
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SQSTM1
  • SUG1
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TOLLIP
  • TRAF6
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBE2N
  • bIkBa
Bos taurus (cattle)
Interleukin-12 signaling
  • IL12A
  • IL12B
  • IL12RB1
  • IL12RB2
  • JAK1
  • JAK2
  • P4HB
  • STAT4
  • TYK2
Bos taurus (cattle)
Interleukin-15 signaling
  • GRB2
  • IL15
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK3
  • L2HGDH
  • MGF
  • SHC1
  • SOS1
  • SOS2
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
Bos taurus (cattle)
Interleukin-2 signaling
  • IL-2
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK3
  • LCK
  • MGF
  • PTK2B
  • SHC1
  • STAT5A
  • STAT5B
  • SYK
Bos taurus (cattle)
Interleukin-21 signaling
  • IL21
  • IL21R
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK3
  • MGF
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT4
  • STAT5A
  • STAT5B
Bos taurus (cattle)
Interleukin-3, Interleukin-5 and GM-CSF signaling
  • CSF2
  • CSF2RB
  • IL3
  • IL3RA
  • IL5
  • IL5RA
  • JAK2
  • MGF
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PRKACA
  • PTPN11
  • PTPN6
  • SHC1
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TEC
  • VAV1
  • YWHAZ
Bos taurus (cattle)
Interleukin-35 Signalling
  • CANX
  • EBI3
  • IL12A
  • IL12RB2
  • IL27RA
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK2
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT4
  • TYK2
  • canx
Bos taurus (cattle)
Interleukin-4 and Interleukin-13 signaling
  • GRP94
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • IL13
  • IL13RA1
  • IL13RA2
  • IL2RG
  • IL4
  • IL4R
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • SOCS1
  • SOCS5
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT6
  • TRA1
  • TYK2
Bos taurus (cattle)
Interleukin-6 signaling
  • CBL
  • IL6
  • IL6R
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK2
  • PTPN11
  • SOCS3
  • STAT1
  • STAT3
  • TYK2
Bos taurus (cattle)
Interleukin-7 signaling
  • BAF190A
  • BRG1
  • BRWD1
  • IL2RG
  • IL7
  • IL7R
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK3
  • MGF
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • SMARCA4
  • SNF2B
  • SNF2L4
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
Bos taurus (cattle)
Interleukin-9 signaling
  • IL2RG
  • IL9
  • JAK1
  • JAK3
  • MGF
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
Bos taurus (cattle)
Intestinal hexose absorption
  • GLUT2
  • GLUT5
  • SLC2A2
  • SLC2A5
  • SLC5A1
Bos taurus (cattle)
Intracellular metabolism of fatty acids regulates insulin secretion
  • ACSL3
  • ACSL4
  • CD36
  • PAS4
Bos taurus (cattle)
Intrinsic Pathway of Fibrin Clot Formation
  • C1QBP
  • F10
  • F11
  • F12
  • F2
  • F7
  • F8
  • F9
  • GP1BB
  • GP5
  • GP9
  • KLKB1
  • KNG1
  • PRCP
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
  • SERPINA5
  • SERPIND1
  • SERPINE2
  • SERPING1
  • VWF
Bos taurus (cattle)
Ion channel transport
  • ATP6A1
  • ATP6AP1
  • ATP6B1
  • ATP6B2
  • ATP6C
  • ATP6D
  • ATP6E
  • ATP6G
  • ATP6G1
  • ATP6H
  • ATP6IP1
  • ATP6N1B
  • ATP6S1
  • ATP6S14
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A2
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E
  • ATP6V0E1
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1A
  • ATP6V1A1
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • LOC101904667
  • TCIRG1
  • VATC
  • VATF
  • VPATPD
Bos taurus (cattle)
Ion homeostasis
  • ABCC9
  • ASPH
  • ATP1A1
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1A4
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • CALM
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CLIC2
  • FKBP12.6
  • FKBP1B
  • FXYD1
  • FXYD2
  • FXYD4
  • FXYD6
  • FXYD7
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KCNJ11
  • NOS1
  • PLM
  • PLN
  • PRKACA
  • RYR2
  • SLC8A1
  • SLC8A2
  • SRI
  • STIM1
  • TRPC1
Bos taurus (cattle)
Ion transport by P-type ATPases
  • ATP10A
  • ATP10B
  • ATP10D
  • ATP11A
  • ATP11B
  • ATP11C
  • ATP12A
  • ATP13A1
  • ATP13A2
  • ATP13A4
  • ATP13A5
  • ATP1A1
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1A4
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • ATP2C1
  • ATP2C2
  • ATP4A
  • ATP4B
  • ATP8A1
  • ATP8A2
  • ATP8B1
  • ATP8B2
  • ATP8B3
  • ATP8B4
  • ATP9A
  • ATP9B
  • CALM
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • FXYD1
  • FXYD2
  • FXYD4
  • FXYD6
  • FXYD7
  • PLM
  • PLN
  • SPCA
  • SRI
Bos taurus (cattle)
Iron uptake and transport
  • ABCG2
  • ACO1
  • CAND1
  • CP
  • CUL1
  • CYBRD1
  • FBXL5
  • FLVCR1
  • FTH
  • FTH1
  • FTL
  • FTMT
  • HCP1
  • HEPH
  • HMOX1
  • HMOX2
  • IREB2
  • LCN2
  • NEDD8
  • PCFT
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SLC11A2
  • SLC22A17
  • SLC40A1
  • SLC46A1
  • TF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
KEAP1-NFE2L2 pathway
  • CUL3
  • KEAP1
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3
  • MAP1LC3B
  • MUL1
  • NFE2L2
  • NPLOC4
  • PRKCI
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SESN1
  • SESN2
  • SQSTM1
  • SUG1
  • TRAP2
  • TRIM21
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBXN7
  • UFD1
  • VCP
Bos taurus (cattle)
Keratan sulfate biosynthesis
  • ACAN
  • B3GNT1
  • B3GNT2
  • B3GNT4
  • B3GNT6
  • B4GALT1
  • B4GALT2
  • B4GALT4
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • B4GAT1
  • CHST1
  • CHST2
  • FMOD
  • GALT
  • GGTB2
  • KERA
  • LDC
  • LUM
  • OMD
  • PRELP
  • SIAT10
  • SLC35D2
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
  • siat4B
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024