GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 251 - 275 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▲ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Regulation of TP53 Activity through Phosphorylation
  • AIK
  • AIRK1
  • ARK1
  • ATM
  • ATR
  • ATRIP
  • AURA
  • AURKA
  • AURKB
  • AYK1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRIP1
  • BTAK
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CDK2
  • CDK5
  • CDK5R
  • CDK5R1
  • CDKN2
  • CDKN5
  • CHEK2
  • CK2A1
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • DNA2
  • DYRK2
  • EXO1
  • HIPK1
  • HIPK2
  • HUS1
  • IAK1
  • KAT5
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPKAPK5
  • MDM2
  • MRE11
  • NBN
  • NCK5A
  • NIR
  • NOC2L
  • NUAK1
  • PIN1
  • PLK3
  • PRKAA1
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
  • PSSALRE
  • RAD1
  • RAD17
  • RAD50
  • RAD9A
  • RAD9B
  • RBBP8
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC5
  • RHNO1
  • RMI1
  • RMI2
  • RPA1
  • RPA2
  • RPA3
  • RPS27A
  • SSRP1
  • STK11
  • STK15
  • STK6
  • SUPT16H
  • TAF1
  • TAF10
  • TAF11
  • TAF12
  • TAF15
  • TAF2
  • TAF3
  • TAF4
  • TAF4B
  • TAF5
  • TAF6
  • TAF7L
  • TAF9
  • TAF9B
  • TBP
  • TOP3A
  • TOPBP1
  • TP53
  • TP53INP1
  • TP53RK
  • TPX2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WRN
Bos taurus (cattle)
ADP signalling through P2Y purinoceptor 1
  • CPLA2
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • MAPK14
  • P2RY1
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • SRC
Bos taurus (cattle)
TCF dependent signaling in response to WNT
  • AXIN1
  • AXIN2
  • CTNNB1
  • RNF146B
  • RPS27A
  • TNKS
  • TNKS2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP34
  • WNT1
  • WNT3
  • WNT3A
  • WNT5A
Bos taurus (cattle)
Regulation of FZD by ubiquitination
  • FZD5
  • FZD6
  • FZD8
  • LGR5
  • LRP5
  • LRP6
  • RNF43
  • RPS27A
  • RSPO1
  • RSPO2
  • RSPO3
  • RSPO4
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP8
  • WNT3A
Bos taurus (cattle)
Chemokine receptors bind chemokines
  • ACKR2
  • ACKR3
  • ACKR4
  • CCL1
  • CCL11
  • CCL19
  • CCL2
  • CCL20
  • CCL21
  • CCL22
  • CCL25
  • CCL27
  • CCL28
  • CCL4
  • CCL5
  • CCR1
  • CCR10
  • CCR11
  • CCR3
  • CCR4
  • CCR5
  • CCR6
  • CCR8
  • CCR9
  • CCRL1
  • CCRL2
  • CMKBR5
  • CX3CR1
  • CXCL10
  • CXCL11
  • CXCL12
  • CXCL13
  • CXCL16
  • CXCL3
  • CXCL6
  • CXCL8
  • CXCL9
  • CXCR1
  • CXCR2
  • CXCR3
  • CXCR4
  • CXCR5
  • CXCR6
  • CXCR7
  • GCP2
  • IL8
  • LOC100297044
  • LOC525415
  • LOC616364
  • MIP3A
  • PPBP
  • SCY4A
  • SCYA2
  • SCYA20
  • SCYA5
  • SCYB6
  • XCL1
  • XCL2
  • XCR1
Bos taurus (cattle)
Assembly of active LPL and LIPC lipase complexes
  • ANGPTL3
  • ANGPTL4
  • ANGPTL8
  • FURIN
  • GPIHBP1
  • LIPC
  • LMF1
  • LMF2
  • LPL
  • PCSK5
  • PCSK6
Bos taurus (cattle)
Lewis blood group biosynthesis
  • B3GALT2
  • B3GALT4
  • B4GALNT2
  • FUT10
  • FUT11
  • FUT2
  • FUT4
  • FUT6
  • FUT7
  • FUT9
  • SIAT10
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
  • ST6GALNAC6
Bos taurus (cattle)
Glycosphingolipid biosynthesis
  • A4GALT
  • B3GALT4
  • B3GNT5
  • B4GALNT1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • CERK
  • FUT1
  • FUT2
  • GALGT
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL5
  • ST6GALNAC5
  • ST6GALNAC6
  • ST8SIA5
  • UGCG
  • UGT8
  • siat4B
Bos taurus (cattle)
FRS-mediated FGFR1 signaling
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF5
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FRS2
  • FRS3
  • Fgf4
  • GRB2
  • HBGF-1
  • KL
  • KRAS
  • NRAS
  • PTPN11
  • SOS1
Bos taurus (cattle)
SHC-mediated cascade:FGFR1
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF5
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • Fgf4
  • GRB2
  • HBGF-1
  • KL
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
Bos taurus (cattle)
PI-3K cascade:FGFR1
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF5
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FRS2
  • Fgf4
  • GAB1
  • GRB2
  • HBGF-1
  • KL
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
Bos taurus (cattle)
Downstream signaling of activated FGFR1
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF5
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FLRT1
  • FLRT2
  • FLRT3
  • Fgf4
  • HBGF-1
  • KL
Bos taurus (cattle)
Phospholipase C-mediated cascade: FGFR1
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF5
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • Fgf4
  • HBGF-1
  • KL
  • PLCG1
Bos taurus (cattle)
FGFR1b ligand binding and activation
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF3
  • FGF5C
  • FGFA
  • FGFR1
  • HBGF-1
Bos taurus (cattle)
FGFR1c ligand binding and activation
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF17
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • Fgf4
  • HBGF-1
Bos taurus (cattle)
FGFR1c and Klotho ligand binding and activation
  • FGF23
  • FGFR1
  • KL
Bos taurus (cattle)
Bicarbonate transporters
  • AHCYL2
  • SLC4A1
  • SLC4A10
  • SLC4A2
  • SLC4A3
  • SLC4A4
  • SLC4A5
  • SLC4A7
  • SLC4A8
  • SLC4A9
Bos taurus (cattle)
TRAF6 mediated NF-kB activation
  • AGER
  • APP
  • CAAF1
  • CHUK
  • HMG1
  • HMGB1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKBIA
  • NFKBIB
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • RELA
  • S100A12
  • S100B
  • bIkBa
Bos taurus (cattle)
TAK1-dependent IKK and NF-kappa-B activation
  • AGER
  • APP
  • CAAF1
  • CHUK
  • HMG1
  • HMGB1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKBIA
  • NFKBIB
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • RELA
  • S100A12
  • S100B
  • bIkBa
Bos taurus (cattle)
SUMOylation of immune response proteins
  • IKBKE
  • IKBKG
  • NEMO
  • NFKB2
  • NFKBIA
  • PIAS3
  • PIAS4
  • RELA
  • SUMO3
  • TOPORS
  • bIkBa
Bos taurus (cattle)
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha
  • AJUBA
  • CUL2
  • EGLN1
  • EGLN2
  • EGLN3
  • ELOC
  • EPAS1
  • HIF1A
  • HIF3A
  • JUB
  • LIMD1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SUG1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5B
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • WTIP
Bos taurus (cattle)
Phase 1 - inactivation of fast Na+ channels
  • KCND1
  • KCND2
  • KCND3
  • KCNIP1
  • KCNIP2
  • KCNIP3
  • KCNIP4
Bos taurus (cattle)
Formation of the cornified envelope
  • CASP14
  • CDSN
  • CELA2A
  • DSC1
  • DSC2
  • DSC3
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • EVPL
  • JUP
  • KLK12
  • KLK13
  • KLK14
  • KLK5
  • KLK8
  • KLNC
  • LIPJ
  • LIPK
  • LIPM
  • LIPN
  • PI3
  • PKP1
  • PKP4
  • PPL
  • RPTN
  • SPINK5
  • SPINK6
  • SPINK9
  • TCHH
  • TGM1
Bos taurus (cattle)
Ion homeostasis
  • ABCC9
  • ASPH
  • ATP1A1
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1A4
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • CALM
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CLIC2
  • FKBP12.6
  • FKBP1B
  • FXYD1
  • FXYD2
  • FXYD4
  • FXYD6
  • FXYD7
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KCNJ11
  • NOS1
  • PLM
  • PLN
  • PRKACA
  • RYR2
  • SLC8A1
  • SLC8A2
  • SRI
  • STIM1
  • TRPC1
Bos taurus (cattle)
PI Metabolism
  • TNFAIP8
  • TNFAIP8L1
  • TNFAIP8L2
  • TNFAIP8L3
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024