GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 276 - 300 of 557 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Lactose synthesis
  • B4GALT1
  • GALT
  • GGTB2
  • GLUT1
  • SLC2A1
Bos taurus (cattle)
LRR FLII-interacting protein 1 (LRRFIP1) activates type I IFN production
  • CREBBP
  • CTNNB1
  • EP300
  • IRF3
Bos taurus (cattle)
LGI-ADAM interactions
  • ADAM22
  • ADAM23
  • CACNG2
  • CACNG3
  • CACNG4
  • CACNG8
  • DLG4
  • LGI1
  • LGI2
  • LGI3
  • LGI4
  • STX1A
  • STX1B
  • STX1B2
Bos taurus (cattle)
LDL clearance
  • AADACL1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • CES3
  • CLTA
  • CLTC
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • NCEH1
  • NPC2
  • SOAT1
  • SOAT2
Bos taurus (cattle)
Ketone body catabolism
  • ACAT1
  • BDH
  • BDH1
  • OXCT1
Bos taurus (cattle)
Keratinization
  • DSC1
  • DSC2
  • DSC3
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • JUP
  • KRT1
  • KRT10
  • KRT13
  • KRT14
  • KRT15
  • KRT16
  • KRT17
  • KRT18
  • KRT19
  • KRT2
  • KRT20
  • KRT23
  • KRT24
  • KRT25
  • KRT26
  • KRT27
  • KRT28
  • KRT3
  • KRT31
  • KRT32
  • KRT33A
  • KRT33B
  • KRT35
  • KRT36
  • KRT37
  • KRT39
  • KRT4
  • KRT40
  • KRT5
  • KRT6B
  • KRT7
  • KRT72
  • KRT73
  • KRT74
  • KRT75
  • KRT77
  • KRT78
  • KRT79
  • KRT8
  • KRT80
  • KRT81
  • KRT82
  • KRT83
  • KRT84
  • KRT85
  • KRT86
  • KRT9
  • KRTAP1-1
  • KRTAP10-8
  • KRTAP11-1
  • KRTAP12-2
  • KRTAP19-5
  • KRTAP24-1
  • KRTAP27-1
  • KRTAP3-1
  • KRTAP3-3
  • KRTAP4-7
  • KRTAP8-1
  • LOC100294937
  • LOC100300014
  • LOC101902114
  • LOC112442669
  • LOC112446672
  • LOC112446673
  • LOC112446984
  • LOC112448008
  • LOC507184
  • LOC616413
  • LOC618359
  • LOC618938
  • LOC787051
  • LOC787225
  • LOC787600
  • PKP1
  • PKP4
Bos taurus (cattle)
Keratan sulfate degradation
  • ACAN
  • FMOD
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GNS
  • HEXA
  • HEXB
  • KERA
  • LDC
  • LUM
  • OMD
  • PRELP
Bos taurus (cattle)
Keratan sulfate biosynthesis
  • ACAN
  • B3GNT1
  • B3GNT2
  • B3GNT4
  • B3GNT6
  • B4GALT1
  • B4GALT2
  • B4GALT4
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • B4GAT1
  • CHST1
  • CHST2
  • FMOD
  • GALT
  • GGTB2
  • KERA
  • LDC
  • LUM
  • OMD
  • PRELP
  • SIAT10
  • SLC35D2
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
  • siat4B
Bos taurus (cattle)
KEAP1-NFE2L2 pathway
  • CUL3
  • KEAP1
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3
  • MAP1LC3B
  • MUL1
  • NFE2L2
  • NPLOC4
  • PRKCI
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SESN1
  • SESN2
  • SQSTM1
  • SUG1
  • TRAP2
  • TRIM21
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBXN7
  • UFD1
  • VCP
Bos taurus (cattle)
Iron uptake and transport
  • ABCG2
  • ACO1
  • CAND1
  • CP
  • CUL1
  • CYBRD1
  • FBXL5
  • FLVCR1
  • FTH
  • FTH1
  • FTL
  • FTMT
  • HCP1
  • HEPH
  • HMOX1
  • HMOX2
  • IREB2
  • LCN2
  • NEDD8
  • PCFT
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SLC11A2
  • SLC22A17
  • SLC40A1
  • SLC46A1
  • TF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Ion transport by P-type ATPases
  • ATP10A
  • ATP10B
  • ATP10D
  • ATP11A
  • ATP11B
  • ATP11C
  • ATP12A
  • ATP13A1
  • ATP13A2
  • ATP13A4
  • ATP13A5
  • ATP1A1
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1A4
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • ATP2C1
  • ATP2C2
  • ATP4A
  • ATP4B
  • ATP8A1
  • ATP8A2
  • ATP8B1
  • ATP8B2
  • ATP8B3
  • ATP8B4
  • ATP9A
  • ATP9B
  • CALM
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • FXYD1
  • FXYD2
  • FXYD4
  • FXYD6
  • FXYD7
  • PLM
  • PLN
  • SPCA
  • SRI
Bos taurus (cattle)
Ion homeostasis
  • ABCC9
  • ASPH
  • ATP1A1
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1A4
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • CALM
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CLIC2
  • FKBP12.6
  • FKBP1B
  • FXYD1
  • FXYD2
  • FXYD4
  • FXYD6
  • FXYD7
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KCNJ11
  • NOS1
  • PLM
  • PLN
  • PRKACA
  • RYR2
  • SLC8A1
  • SLC8A2
  • SRI
  • STIM1
  • TRPC1
Bos taurus (cattle)
Ion channel transport
  • ATP6A1
  • ATP6AP1
  • ATP6B1
  • ATP6B2
  • ATP6C
  • ATP6D
  • ATP6E
  • ATP6G
  • ATP6G1
  • ATP6H
  • ATP6IP1
  • ATP6N1B
  • ATP6S1
  • ATP6S14
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A2
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E
  • ATP6V0E1
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1A
  • ATP6V1A1
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • LOC101904667
  • TCIRG1
  • VATC
  • VATF
  • VPATPD
Bos taurus (cattle)
Intrinsic Pathway of Fibrin Clot Formation
  • C1QBP
  • F10
  • F11
  • F12
  • F2
  • F7
  • F8
  • F9
  • GP1BB
  • GP5
  • GP9
  • KLKB1
  • KNG1
  • PRCP
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
  • SERPINA5
  • SERPIND1
  • SERPINE2
  • SERPING1
  • VWF
Bos taurus (cattle)
Intracellular metabolism of fatty acids regulates insulin secretion
  • ACSL3
  • ACSL4
  • CD36
  • PAS4
Bos taurus (cattle)
Intestinal hexose absorption
  • GLUT2
  • GLUT5
  • SLC2A2
  • SLC2A5
  • SLC5A1
Bos taurus (cattle)
Interleukin-9 signaling
  • IL2RG
  • IL9
  • JAK1
  • JAK3
  • MGF
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
Bos taurus (cattle)
Interleukin-7 signaling
  • BAF190A
  • BRG1
  • BRWD1
  • IL2RG
  • IL7
  • IL7R
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK3
  • MGF
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • SMARCA4
  • SNF2B
  • SNF2L4
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
Bos taurus (cattle)
Interleukin-6 signaling
  • CBL
  • IL6
  • IL6R
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK2
  • PTPN11
  • SOCS3
  • STAT1
  • STAT3
  • TYK2
Bos taurus (cattle)
Interleukin-4 and Interleukin-13 signaling
  • GRP94
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • IL13
  • IL13RA1
  • IL13RA2
  • IL2RG
  • IL4
  • IL4R
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • SOCS1
  • SOCS5
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT6
  • TRA1
  • TYK2
Bos taurus (cattle)
Interleukin-35 Signalling
  • CANX
  • EBI3
  • IL12A
  • IL12RB2
  • IL27RA
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK2
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT4
  • TYK2
  • canx
Bos taurus (cattle)
Interleukin-3, Interleukin-5 and GM-CSF signaling
  • CSF2
  • CSF2RB
  • IL3
  • IL3RA
  • IL5
  • IL5RA
  • JAK2
  • MGF
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PRKACA
  • PTPN11
  • PTPN6
  • SHC1
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TEC
  • VAV1
  • YWHAZ
Bos taurus (cattle)
Interleukin-21 signaling
  • IL21
  • IL21R
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK3
  • MGF
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT4
  • STAT5A
  • STAT5B
Bos taurus (cattle)
Interleukin-2 signaling
  • IL-2
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK3
  • LCK
  • MGF
  • PTK2B
  • SHC1
  • STAT5A
  • STAT5B
  • SYK
Bos taurus (cattle)
Interleukin-15 signaling
  • GRB2
  • IL15
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK3
  • L2HGDH
  • MGF
  • SHC1
  • SOS1
  • SOS2
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024