GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 51 - 75 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
Keratan sulfate biosynthesis
  • ACAN
  • B3GNT1
  • B3GNT2
  • B3GNT4
  • B3GNT6
  • B4GALT1
  • B4GALT2
  • B4GALT4
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • B4GAT1
  • CHST1
  • CHST2
  • FMOD
  • GALT
  • GGTB2
  • KERA
  • LDC
  • LUM
  • OMD
  • PRELP
  • SIAT10
  • SLC35D2
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
  • siat4B
Bos taurus (cattle)
Keratan sulfate degradation
  • ACAN
  • FMOD
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GNS
  • HEXA
  • HEXB
  • KERA
  • LDC
  • LUM
  • OMD
  • PRELP
Bos taurus (cattle)
Maturation of TCA enzymes and regulation of TCA cycle
  • ACAT1
  • ACN9
  • ACO2
  • CS
  • CSKMT
  • CYB560
  • FRDA
  • FXN
  • HBLD1
  • HBLD2
  • IDH2
  • ISCA1
  • ISCA2
  • ISCU
  • ISD11
  • LYRM4
  • LYRM8
  • NFS1
  • PGL2
  • SDH5
  • SDHA
  • SDHAF1
  • SDHAF2
  • SDHAF3
  • SDHB
  • SDHC
  • SDHD
  • SIRT3
Bos taurus (cattle)
Ketone body catabolism
  • ACAT1
  • BDH
  • BDH1
  • OXCT1
Bos taurus (cattle)
Cholesterol biosynthesis
  • ACAT2
  • ARV1
  • CYP51A1
  • DHCR24
  • FDFT1
  • GGPS1
  • HMGCR
  • HMGCS1
  • HSD17B7
  • IDI1
  • LBR
  • LSS
  • MSMO1
  • MVD
  • MVK
  • NSDHL
  • PLPP6
  • PMVK
  • SC4MOL
  • SQLE
  • SREBF1
  • SREBF2
  • TM7SF2
  • fdft1
Bos taurus (cattle)
Stimuli-sensing channels
  • ACCN1
  • ANO10
  • ANO2
  • ANO3
  • ANO4
  • ANO5
  • ANO6
  • ANO8
  • ANO9
  • ASIC1
  • ASIC2
  • ASIC4
  • ASIC5
  • ASPH
  • BEST1
  • BEST2
  • BEST3
  • BEST4
  • CALM
  • CLCA1
  • CLCA4
  • CLCN1
  • CLCN2
  • CLCN3
  • CLCN5
  • CLCN6
  • CLCN7
  • CLCNKA
  • CLIC2
  • FKBP12.6
  • FKBP1B
  • NALCN
  • NHEDC1
  • OSTM1
  • RYR2
  • SCNN1A
  • SCNN1B
  • SCNN1D
  • SCNN1G
  • SLC17A3
  • SLC9B2
  • SRI
  • STOM
  • STOML3
  • TMEM16D
  • TPCN1
  • TPCN2
  • TTYH1
  • TTYH2
  • TTYH3
  • UNC79
  • UNC80
Bos taurus (cattle)
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • ACE2
  • AGT
  • ATP6AP2
  • ATP6IP2
  • CES1
  • CPA3
  • CPB
  • CPB1
  • CPB2
  • CTSD
  • CTSZ
  • ENPEP
  • LOC100139881
  • LOC509956
  • LOC540321
  • LOC617313
  • MME
  • REN
  • SERPINA8
Bos taurus (cattle)
Sphingolipid catabolism
  • ACER1
  • ACER2
  • ACER3
  • ALDH3A2
  • ALDH3B1
  • PLPP1
  • PLPP2
  • PLPP3
  • PPAP2B
  • PPAP2C
  • SGPL1
  • SGPP1
Bos taurus (cattle)
Peptide ligand-binding receptors
  • ACKR1
  • AGT
  • AGTR1
  • AGTR2
  • APLN
  • APLNR
  • BDKRB2
  • BRS3
  • C3
  • C3AR1
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C5L2
  • CCK
  • CCKBR
  • CORT
  • CXCL8
  • ECE1
  • ECE2
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • GAL
  • GALN
  • GALR1
  • GALR2
  • GALR3
  • GPR10
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GPR73L1
  • GPR77
  • GPR8
  • GRP
  • GRPR
  • IL8
  • KISS1
  • KISS1R
  • KNG1
  • LOC112445811
  • MC1R
  • MC2R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MCHR1
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • MSHR
  • NLN
  • NMBR
  • NMS
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPBWR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NPY
  • NPY1R
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • OPRD1
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • PDYN
  • PENK
  • PKR2
  • PMCH
  • PNOC
  • POMC
  • PPY
  • PPYR1
  • PRLHR
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR2
  • PSAP
  • PYY
  • SERPINA8
  • SST
  • SSTR1
  • SSTR2
  • SSTR5
  • TRH
  • TRHR
  • mln
Bos taurus (cattle)
Chemokine receptors bind chemokines
  • ACKR2
  • ACKR3
  • ACKR4
  • CCL1
  • CCL11
  • CCL19
  • CCL2
  • CCL20
  • CCL21
  • CCL22
  • CCL25
  • CCL27
  • CCL28
  • CCL4
  • CCL5
  • CCR1
  • CCR10
  • CCR11
  • CCR3
  • CCR4
  • CCR5
  • CCR6
  • CCR8
  • CCR9
  • CCRL1
  • CCRL2
  • CMKBR5
  • CX3CR1
  • CXCL10
  • CXCL11
  • CXCL12
  • CXCL13
  • CXCL16
  • CXCL3
  • CXCL6
  • CXCL8
  • CXCL9
  • CXCR1
  • CXCR2
  • CXCR3
  • CXCR4
  • CXCR5
  • CXCR6
  • CXCR7
  • GCP2
  • IL8
  • LOC100297044
  • LOC525415
  • LOC616364
  • MIP3A
  • PPBP
  • SCY4A
  • SCYA2
  • SCYA20
  • SCYA5
  • SCYB6
  • XCL1
  • XCL2
  • XCR1
Bos taurus (cattle)
G alpha (i) signalling events
  • ACKR3
  • ADORA1
  • ADORA3
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
  • AGT
  • AGTR2
  • APLN
  • APLNR
  • BCP
  • BDKRB2
  • C3
  • C3AR1
  • C5
  • C5AR1
  • CASR
  • CCL1
  • CCL19
  • CCL20
  • CCL21
  • CCL25
  • CCL27
  • CCL28
  • CCL4
  • CCL5
  • CCR1
  • CCR10
  • CCR3
  • CCR4
  • CCR5
  • CCR6
  • CCR8
  • CCR9
  • CHRM2
  • CMKBR5
  • CNR1
  • CNR2
  • CORT
  • CX3CR1
  • CXCL10
  • CXCL11
  • CXCL12
  • CXCL13
  • CXCL16
  • CXCL3
  • CXCL6
  • CXCL8
  • CXCL9
  • CXCR1
  • CXCR2
  • CXCR3
  • CXCR4
  • CXCR5
  • CXCR6
  • CXCR7
  • DRD3
  • GABBR1
  • GABBR2
  • GAL
  • GALN
  • GALR1
  • GALR2
  • GALR3
  • GCP2
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI3
  • GNAT1
  • GNAT2
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GPR17
  • GPR18
  • GPR183
  • GPR31
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GPR8
  • GPR92
  • GPRC2A
  • GPSM1
  • GPSM2
  • GRM2
  • GRM3
  • GRM4
  • GRM6
  • GRM7
  • GRM8
  • HCAR1
  • HRH4
  • HTR1B
  • HTR1D
  • HTR1E
  • HTR1F
  • HTR5A
  • IL8
  • KNG1
  • LOC782957
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR5
  • MCHR1
  • MCHR2
  • MIP3A
  • MTNR1A
  • MTNR1B
  • NMS
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPBWR2
  • NPY
  • NPY1R
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • OPN1LW
  • OPN1SW
  • OPN5
  • OPRD1
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • OXER1
  • OXGR1
  • P2RY12
  • P2RY14
  • P2RY4
  • PBX2
  • PCAR1
  • PCP2
  • PDYN
  • PENK
  • PMCH
  • PNOC
  • POMC
  • PPBP
  • PPY
  • PPYR1
  • PSAP
  • PTGDR2
  • PTGER3
  • PYY
  • RCP
  • RGR
  • RGS1
  • RGS11
  • RGS13
  • RGS14
  • RGS16
  • RGS17
  • RGS18
  • RGS19
  • RGS20
  • RGS21
  • RGS3
  • RGS4
  • RGS5
  • RGS6
  • RGS7
  • RGS8
  • RGS9
  • RHO
  • RRH
  • S1PR2
  • S1PR3
  • S1PR5
  • SCY4A
  • SCYA20
  • SCYA5
  • SCYB6
  • SERPINA8
  • SRC
  • SST
  • SSTR1
  • SSTR2
  • SSTR5
  • SUCNR1
  • T2R10C
  • T2R65A
  • TAS1R1
  • TAS1R2
  • TAS1R3
  • TAS2R1
  • TAS2R16
  • TAS2R3
  • TAS2R39
  • TAS2R4
  • TAS2R40
  • TAS2R42
  • TAS2R46
  • TAS2R60
  • TAS2R7
  • TAS2R8
  • gpr81
Bos taurus (cattle)
Citric acid cycle (TCA cycle)
  • ACO2
  • CS
  • CYB560
  • FH
  • HSP75
  • HSPC5
  • IDH2
  • IDH3A
  • IDH3B
  • IDH3G
  • MDH2
  • NNT
  • SDHA
  • SDHB
  • SDHC
  • SDHD
  • SUCLA2
  • SUCLG1
  • SUCLG2
  • TRAP1
Bos taurus (cattle)
Vitamin B2 (riboflavin) metabolism
  • ACP5
  • ENPP1
  • FLAD1
  • RFK
  • RFT2
  • SLC52A2
  • SLC52A3
Bos taurus (cattle)
Synthesis of PA
  • ACP6
  • AGPAT1
  • AGPAT2
  • AGPAT3
  • AGPAT4
  • AGPAT5
  • AGPAT6
  • CPLA2
  • DDHD1
  • DDHD2
  • FAM73B
  • GNPAT
  • GPAM
  • GPAT2
  • GPAT3
  • GPAT4
  • GPD1
  • GPD1L
  • GPD2
  • LIPH
  • LOC516378
  • LOC613966
  • LPCAT1
  • LPCAT4
  • MIGA1
  • MIGA2
  • PLA2G12A
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D1
  • PLA2G2E
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4D
  • PLA2R1
  • PLD1
  • PLD2
  • PLD6
Bos taurus (cattle)
Acrosome Reaction and Sperm:Oocyte Membrane Binding
  • ACR
  • CD9
  • IZUMO1
  • IZUMO2
  • IZUMO3
  • IZUMO4
Bos taurus (cattle)
Synthesis of very long-chain fatty acyl-CoAs
  • ACSF3
  • ACSL1
  • ACSL3
  • ACSL4
  • ACSL5
  • ACSL6
  • ELOVL2
  • ELOVL3
  • ELOVL5
  • ELOVL6
  • ELOVL7
  • GPSN2
  • HACD1
  • HACD2
  • HACD3
  • HACD4
  • HSD17B12
  • HSD17B3
  • LOC789567
  • MGC139109
  • PTPLAD1
  • SRD5A2L2
  • TECR
  • TECRL
Bos taurus (cattle)
Intracellular metabolism of fatty acids regulates insulin secretion
  • ACSL3
  • ACSL4
  • CD36
  • PAS4
Bos taurus (cattle)
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis
  • ACSS2
  • CYC
  • CYCS
  • GABPA
  • GABPB1
  • GABPB2
  • GLUD1
  • IDH2
  • SIRT3
  • SIRT4
  • SIRT5
  • SOD2
Bos taurus (cattle)
RHOF GTPase cycle
  • ACTB
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTN1
  • ADD3
  • AKAP12
  • ARHGAP1
  • ARHGAP12
  • ARHGAP32
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • BAIAP2L1
  • BAIAP2L2
  • BASP1
  • CAV1
  • DEPDC1B
  • DIAPH1
  • DIAPH2
  • DIAPH3
  • ESYT1
  • FAM169A
  • FAM62A
  • FARP1
  • LMNB1
  • MCAM
  • MTMR1
  • MYO9B
  • NAP22
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • RHOF
  • SENP1
  • SLC4A7
  • SNAP23
  • SRGAP2
  • STEAP3
  • SYDE1
  • TOR1AIP1
  • VANGL1
Bos taurus (cattle)
EPHB-mediated forward signaling
  • ACTB
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTR2
  • ACTR3
  • ARHA
  • ARHGEF28
  • ARP2
  • ARP3
  • ARPC1A
  • ARPC1B
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC4
  • ARPC5
  • CDC42
  • ITSN1
  • PAK1
  • PTK2
  • RASA1
  • RHO12
  • RHOA
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SDC2
  • WASL
Bos taurus (cattle)
UCH proteinases
  • ACTB
  • ACTL6A
  • ACTR5
  • ACTR8
  • ADRM1
  • ARP8
  • ASXL1
  • ASXL2
  • BAP1
  • BARD1
  • CCDC95
  • FOXK1
  • FOXK2
  • H2AC10
  • H2AC18
  • H2AC21
  • H2AC25
  • H2AC6
  • H2AW
  • HCFC1
  • HIST3H2A
  • INO80
  • INO80B
  • INO80C
  • INO80D
  • INO80E
  • KDM1B
  • LOC614881
  • MBD5
  • MBD6
  • MCRS1
  • NEDD8
  • NFRKB
  • OGT
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • RUVBL1
  • SENP8
  • SUG1
  • TFPT
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UCH37
  • UCHL1
  • UCHL3
  • UCHL5
  • YY1
Bos taurus (cattle)
RHOBTB2 GTPase cycle
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTN1
  • BAT1
  • CCT2
  • CCT6A
  • CCT7
  • CDC37
  • CUL3
  • DDX39B
  • HNRPC
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • MYO6
  • PHIP
  • RBMX
  • RHOBTB2
  • SFRS10
  • SRRM1
  • STK38
  • TMOD3
  • TRA2B
  • TWF1
  • TXNL1
  • UAP56
Bos taurus (cattle)
RUNX1 interacts with co-factors whose precise effect on RUNX1 targets is not known
  • ACTL6
  • ACTL6A
  • ACTL6B
  • ARID1A
  • ARID1B
  • AUTS2
  • BAF190A
  • BAF47
  • BAF53B
  • BMI1
  • BRG1
  • CBFB
  • CBX2
  • CBX4
  • CBX6
  • CBX8
  • CK2A1
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • EP300
  • HIPK2
  • PBRM1
  • PCGF4
  • PCGF5
  • PHC1
  • PHC2
  • PHC3
  • RNF2
  • RUNX1
  • RYBP
  • SCMH1
  • SMARCA2
  • SMARCA4
  • SMARCB1
  • SMARCC1
  • SMARCD1
  • SMARCD2
  • SMARCD3
  • SMARCE1
  • SNF2B
  • SNF2L4
  • YAF2
Bos taurus (cattle)
RHOD GTPase cycle
  • ACTN1
  • ADD3
  • AKAP12
  • ANKFY1
  • ARHGAP1
  • ARHGAP12
  • ARHGAP17
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • CAV1
  • CPNE8
  • DEPDC1B
  • DIAPH1
  • DIAPH2
  • DIAPH3
  • EFHD2
  • EMD
  • ESYT1
  • FAM62A
  • FILIP1
  • GOLGA2
  • HINT2
  • LBR
  • LMAN1
  • LMNB1
  • MCAM
  • MOSPD2
  • PAK5
  • PAK6
  • PGRMC2
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLXNA1
  • PLXNB1
  • RACGAP1
  • RBM39
  • RHOD
  • SLC4A7
  • STBD1
  • STEAP3
  • SWS1
  • TOR1AIP1
  • VANGL1
  • VAPB
  • VRK2
Bos taurus (cattle)
Striated Muscle Contraction
  • ACTN2
  • ACTN3
  • DES
  • DMD
  • MYBPC1
  • MYBPC3
  • MYH3
  • MYH6
  • MYH8
  • MYL1
  • MYL2
  • MYL4
  • NEB
  • TCAP
  • TMOD1
  • TMOD2
  • TMOD3
  • TMOD4
  • TNNC
  • TNNC1
  • TNNC2
  • TNNI1
  • TNNI2
  • TNNT1
  • TNNT2
  • TNNT3
  • TPM1
  • TPM2
  • TPM3
  • VIM
Bos taurus (cattle)

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Acknowledgements

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Last updated: August 19, 2024