GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 101 - 125 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
The retinoid cycle in cones (daylight vision)
  • BCP
  • CRALBP
  • DHRS3
  • OPN1LW
  • OPN1SW
  • RBP3
  • RCP
  • RLBP1
Bos taurus (cattle)
Amino acid transport across the plasma membrane
  • ASCT2
  • B0AT2
  • LAT4
  • NTT73
  • ORNT3
  • SATT
  • SLC16A10
  • SLC1A4
  • SLC1A5
  • SLC25A29
  • SLC36A1
  • SLC36A2
  • SLC36A4
  • SLC38A1
  • SLC38A2
  • SLC38A3
  • SLC38A4
  • SLC38A5
  • SLC3A1
  • SLC3A2
  • SLC43A1
  • SLC43A2
  • SLC6A15
  • SLC6A18
  • SLC6A19
  • SLC6A20
  • SLC6A6
  • SLC7A1
  • SLC7A10
  • SLC7A11
  • SLC7A3
  • SLC7A5
  • SLC7A6
  • SLC7A7
  • SLC7A8
  • SLC7A9
  • SNAT2
  • SNAT5
Bos taurus (cattle)
FGFR1c and Klotho ligand binding and activation
  • FGF23
  • FGFR1
  • KL
Bos taurus (cattle)
Signaling by BMP
  • ACTRII
  • ACVR2
  • ACVR2A
  • ACVR2B
  • ACVRL1
  • AMH
  • AMHR2
  • BMP10
  • BMP2
  • BMPR1A
  • BMPR1B
  • BMPR2
  • CER1
  • CHRDL1
  • FSTL1
  • GDF2
  • INHA
  • INHBA
  • NOG
  • SF3A2
  • SKI
  • SMAD1
  • SMAD4
  • SMAD5
  • SMAD6
  • SMAD7
  • SMAD9
  • SMURF1
  • SMURF2
  • TGFBR3
  • UBE2D1
  • UBE2D3
  • ZFYVE16
Bos taurus (cattle)
PI-3K cascade:FGFR1
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF5
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FRS2
  • Fgf4
  • GAB1
  • GRB2
  • HBGF-1
  • KL
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
Bos taurus (cattle)
Cell surface interactions at the vascular wall
  • AMICA1
  • APOB
  • CAR
  • CD177
  • CD18
  • CD2
  • CD44
  • CD47
  • CD48
  • CD58
  • CD74
  • CD84
  • CEACAM1
  • CXADR
  • EPCAM
  • EPCR
  • ESAM
  • F11R
  • F2
  • FCAMR
  • FCER1G
  • FN1
  • FYN
  • GAS6
  • GLG1
  • GPC1
  • IGJ
  • ITGA4
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAX
  • ITGB1
  • ITGB2
  • JAM1
  • JAM2
  • JAML
  • JCHAIN
  • LOC100336941
  • LYN
  • MERTK
  • MIF
  • OLR1
  • PECAM1
  • PPBP
  • PROC
  • PROCR
  • PROS
  • PROS1
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC4
  • SELE
  • SELP
  • SIRPA
  • SIRPB1
  • SPN
  • TGFB1
  • THBD
  • TREM1
Bos taurus (cattle)
Vitamin C (ascorbate) metabolism
  • CYB5
  • CYB5A
  • CYB5R3
  • DIA1
  • GLUT1
  • GSTO2
  • SLC23A1
  • SLC23A2
  • SLC2A1
  • SLC2A3
Bos taurus (cattle)
PKA activation
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY8
  • ADCY9
  • CALM
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2A
Bos taurus (cattle)
Degradation of GLI1 by the proteasome
  • CUL1
  • GLI1
  • ITCH
  • NUMB
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUFU
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Regulation of RUNX2 expression and activity
  • CUL1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSMF1
  • RPS27A
  • RUNX2
  • SKP1
  • SKP1A
  • SKP2
  • STUB1
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins
  • AQP1
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AVP
  • AVPR2
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • MYO5B
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2A
  • RAB11A
  • RAB11FIP2
Bos taurus (cattle)
HSF1-dependent transactivation
  • AKT1S1
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CRYA2
  • CRYAB
  • DNAJB1
  • GBL
  • HSBP1
  • HSC70
  • HSF1
  • HSP70-1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPA1A
  • HSPA1L
  • HSPA8
  • HSPB8
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • LST8
  • MLST8
  • MTOR
  • RPTOR
Bos taurus (cattle)
DEx/H-box helicases activate type I IFN and inflammatory cytokines production
  • DDX9
  • DHX36
  • DHX9
  • MYD88
  • NDH2
  • NFKB1
  • NFKB2
  • RELA
Bos taurus (cattle)
Peptide hormone biosynthesis
  • PCSK1
  • POMC
Bos taurus (cattle)
Interleukin-1 signaling
  • CHUK
  • CUL1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IL1A
  • IL1B
  • IL1R1
  • IL1R2
  • IL1RN
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK3
  • IRAK4
  • MAP2K6
  • MAP3K3
  • MAP3K7
  • MYD88
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKBIA
  • PELI1
  • PELI2
  • PELI3
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RELA
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SQSTM1
  • SUG1
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TOLLIP
  • TRAF6
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBE2N
  • bIkBa
Bos taurus (cattle)
Signaling by ROBO receptors
  • CXCL12
  • CXCR4
  • GPC1
  • ROBO1
  • SLIT2
  • SLIT3
Bos taurus (cattle)
Thromboxane signalling through TP receptor
  • AAMP
  • GNA11
  • GNA13
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • TBXA2R
Bos taurus (cattle)
Autodegradation of Cdh1 by Cdh1:APC/C
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • CDC16
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • FZR1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Bos taurus (cattle)
RAF/MAP kinase cascade
  • ACTN2
  • AFGF
  • ANG1
  • ANGPT1
  • AREG
  • ARTN
  • BTC
  • CALM
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CSF2
  • CSF2RB
  • DLG1
  • DLG3
  • DLG4
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ERK2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8A
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • FRS3
  • FYN
  • Fgf4
  • GDNF
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA3
  • GFRA4
  • GRB2
  • HBEGF
  • HBGF-1
  • HGF
  • IL-2
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RG
  • IL3
  • IL3RA
  • IL5
  • IL5RA
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • KRAS
  • LAT
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • NEFL
  • NRAPGEP
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRTN
  • ODAD3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDZGEF1
  • PEA15
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRKM1
  • PTK2
  • PTPRA
  • RALGDS
  • RANBP9
  • RAPGEF2
  • RASGEF1A
  • RASGRF1
  • RASGRF2
  • RASGRP1
  • RASGRP3
  • RASGRP4
  • RET
  • RGL1
  • RGL2
  • RGL3
  • SCF
  • SHC1
  • SHC2
  • SHC3
  • SOS1
  • SPTA1
  • SPTAN1
  • SPTB
  • SPTBN2
  • SPTBN4
  • TEK
  • TGFA
  • TIE-2
  • TIE2
Bos taurus (cattle)
Creatine metabolism
  • CKB
  • CKM
  • CKMT1
  • CKMT2
  • GAMT
  • GATM
  • SLC6A11
  • SLC6A7
  • SLC6A8
Bos taurus (cattle)
Asymmetric localization of PCP proteins
  • DVL2
  • FZD1
  • FZD2
  • FZD3
  • FZD5
  • FZD7
  • FZD8
  • PARD6A
  • PRICKLE1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SMURF1
  • SMURF2
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WNT5A
Bos taurus (cattle)
TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of cell cycle factors
  • KDM5B
  • MYC
  • TFAP2C
Bos taurus (cattle)
Leukotriene receptors
  • CYSLTR1
  • CYSLTR2
  • GPR17
  • LTB4R
  • LTB4R2
Bos taurus (cattle)
Neurotransmitter release cycle
  • NAAA
Bos taurus (cattle)
Chylomicron clearance
  • APOB
  • APOE
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LIPC
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

Click here to visit the beta site.


International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024