GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 76 - 100 of 252 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Cellular hexose transport
  • fc29a02
  • glut1
  • glut10
  • glut12
  • glut1a
  • glut1b
  • glut2
  • mfsd4b
  • naglt1
  • rag1ap1
  • sb:cb753
  • sb:cb808
  • slc2a1
  • slc2a10
  • slc2a12
  • slc2a1a
  • slc2a2
  • slc2a3b
  • slc2a8
  • slc2a8l
  • slc45a3
  • slc50a1
  • slc5a1
  • slc5a2
  • slc5a9
  • wu:fb62h10
  • wu:fc29a02
  • zgc:56364
  • zgc:66074
  • zgc:85782
  • zgc:85792
Danio rerio (zebrafish)
FGFR3b ligand binding and activation
  • dob
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf20a
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr3
  • wu:fb05c08
Danio rerio (zebrafish)
FGFR4 ligand binding and activation
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr4
  • id:ibd5158
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
FRS-mediated FGFR4 signaling
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr4
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
FGFR3c ligand binding and activation
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr3
  • id:ibd5158
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
Danio rerio (zebrafish)
SHC-mediated cascade:FGFR3
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr3
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
FRS-mediated FGFR3 signaling
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr3
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
FGFR2c ligand binding and activation
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr2
  • id:ibd5158
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
SHC-mediated cascade:FGFR2
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf7
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr2
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
FRS-mediated FGFR2 signaling
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf7
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr2
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
FGFRL1 modulation of FGFR1 signaling
  • fb14c08
  • fc89b01
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfrl1
  • fgfrl1a
  • fj51c03
  • id:ibd5158
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • spred1
  • spred2
  • wu:fb14c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj51c03
  • zgc:109774
  • zgc:64084
  • zgc:85707
Danio rerio (zebrafish)
ESR-mediated signaling
  • ER[b]2
  • ER[b]a
  • Tebp
  • cPGES-1
  • cb820
  • erbeta2
  • esr
  • esr1
  • esr2a
  • hsp90a.2
  • hsp90a2
  • hsp90aa1.2
  • hsp90ab1
  • hsp90b
  • hspc3
  • nr3a1
  • ptges3
  • ptges3a
  • wu:fb98d06
  • zfER-beta2
  • zfER[b]2
  • zgc:65804
  • zgc:77131
Danio rerio (zebrafish)
EPH-Ephrin signaling
  • D160
  • EphA3
  • RTK2
  • al1
  • efna1
  • efna1b
  • efna2
  • efna3
  • efna3b
  • efna5
  • efna5b
  • efnb1
  • efnb2b
  • efnb3
  • efnb3b
  • ek1
  • ek2
  • epha2
  • epha2a
  • epha3
  • epha4
  • epha4a
  • epha4b
  • epha7
  • ephb4a
  • ephrin-A3
  • eplg6
  • eplg7
  • fc10d03
  • fc51g03
  • hm:zeh0344
  • id:ibd2782
  • id:ibd5049
  • id:ibd5152
  • lerk6
  • lerk7
  • rtk2
  • rtk5
  • rtk6
  • si:dkey-23k6.1
  • wu:fc10d03
  • wu:fc51g03
  • zeh0344
  • zek1
  • zek2
  • zgc:100772
  • zgc:111938
Danio rerio (zebrafish)
Opsins
  • Opn5m
  • lws1
  • lws2
  • opn1lw1
  • opn1lw2
  • opn1sw1
  • opn1sw2
  • opn3
  • opn4
  • opn4a
  • opn4d
  • opn4m1
  • opn5
  • rdops
  • rgr
  • rgr1
  • rgra
  • rho
  • rrh
  • si:ch211-105n9.2
  • sws1
  • uvops
  • zfo2
  • zgc:103757
  • zgc:110660
Danio rerio (zebrafish)
Heme signaling
  • HBA2r
  • HBAA1
  • LOC100334599
  • MGC173646
  • OTTDARP00000001843
  • OTTDARP00000001844
  • OTTDARP00000001846
  • OTTDARP00000002003
  • SI:dZ118J2.10
  • SI:dZ118J2.7
  • SI:dZ118J2.8
  • SI:dZ118J2.9
  • bE1
  • ba1
  • ba1l
  • be1c
  • dZ118J2.6
  • hba2
  • hbae1
  • hbae1.1
  • hbae1.2
  • hbae1.3
  • hbba2
  • hbbe1
  • hbbe1.1
  • hbbe1.2
  • hbbe1.3
  • hbbe1c
  • hbbe2
  • hbbe3
  • pcft
  • pgrmc2
  • si:busm1-118j2.5
  • si:by119c3.1
  • si:by119c3.2
  • si:by119c3.3
  • si:ch211-5k11.12
  • si:xx-119c3.3
  • slc46a1
  • wu:fa12a11
  • wu:fb25g12
  • wu:fb74f06
  • wu:fd12f11
  • zgc:110736
  • zgc:56692
  • zgc:86936
Danio rerio (zebrafish)
Vitamin B2 (riboflavin) metabolism
  • TRAP
  • acp5
  • acp5a
  • enpp1
  • flad1
  • rft2a
  • sb:cb576
  • si:ch211-142e24.2
  • slc52a3a
  • wu:fb19f01
  • wu:fb30b03
  • wu:fi14e01
  • wu:fj66f03
  • zgc:136238
  • zgc:63825
Danio rerio (zebrafish)
Regulation of FZD by ubiquitination
  • NgR
  • ZG06
  • Zfz8b
  • Zwnt[a]
  • fz2
  • fz5
  • fz6
  • fz8a
  • fz8b
  • fz8c
  • fzA
  • fzc
  • fzd5
  • fzd6
  • fzd8a
  • fzd8b
  • fzd8c
  • hm:zeh0386
  • ik:tdsubc_1e1
  • ik:tdsubc_1f2
  • lrp6
  • ngr
  • rps27a
  • rspo1
  • rspo2
  • rspo3
  • rspo4
  • rtn4r
  • si:ch211-149p10.1
  • si:dkey-107i16.4
  • tdsubc_1f2
  • uba52
  • wnt3
  • wnt3 l
  • wnt3a
  • wnt3l
  • wnt[a]
  • wu:fa91f08
  • wu:fd02c05
  • xx:tdsubc_1e1
  • xx:tdsubc_1f2
  • zfzA
  • zg02
  • zg05
  • zgc:123344
  • zgc:65879
  • zgc:66168
  • zgc:77440
  • znrf3
Danio rerio (zebrafish)
Regulation of KIT signaling
  • cbl
  • fb18e12
  • fj59e07
  • fynb
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • lck
  • sos1
  • sparse
  • src
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fd16a12
  • wu:fj59e07
  • yes
  • yes1
  • zgc:103549
  • zgc:136695
  • zgc:158274
  • zgc:73077
  • zgc:92560
Danio rerio (zebrafish)
MAP2K and MAPK activation
  • ARAF
  • ERK1
  • araf
  • cb208
  • fa56c06
  • fi06b09
  • il17rd
  • lamtor2
  • lamtor3
  • map2k1
  • map2k2
  • map2k2a
  • mapk1
  • mapk3
  • mapksp1
  • mek1
  • mek2
  • morg1
  • sb:eu994
  • sef
  • si:ch211-242m18.2
  • wdr83
  • wu:fa56c06
  • wu:fi06b09
  • wu:fj56a12
  • wu:fj61b01
  • wu:fk45h07
  • zERK1
  • zERK2
  • zgc:123171
  • zgc:56557
  • zgc:92074
Danio rerio (zebrafish)
Crosslinking of collagen fibrils
  • bmp1a
  • lox
  • loxa
  • loxl1
  • loxl2b
  • loxl3b
  • mfn
  • si:ch211-238c15.1
  • tld
  • tll1
  • tolloid
  • zgc:77447
Danio rerio (zebrafish)
PCP/CE pathway
  • daam1b
  • daam1l
  • dvl2
  • fa91a03
  • fc83b10
  • frizzled3b
  • fz10
  • fz3
  • fz7
  • fzd1
  • fzd3b
  • fzd3l
  • fzd6
  • fzd7a
  • hm:zeh0341
  • id:ibd2735
  • int-1
  • pfn1
  • pfn2
  • pfn2a
  • pfn2b
  • pfn2l
  • rac1
  • rac1a
  • rac2
  • rac3
  • rac3a
  • rac3b
  • rhoac
  • sb:cb813
  • sb:eu471
  • si:ch211-87i20.1
  • wnt-1
  • wnt-4
  • wnt-5
  • wnt1
  • wnt4
  • wnt4a
  • wnt5
  • wnt5a
  • wnt5b
  • wu:fa91a03
  • wu:fb01g08
  • wu:fb02e10
  • wu:fb54f09
  • wu:fb95b01
  • wu:fc05d12
  • wu:fc17e10
  • wu:fc83b10
  • wu:fd16e02
  • wu:fd58f06
  • wu:fi35b08
  • wu:fo71e09
  • wu:fp54a02
  • zg03
  • zg07
  • zg10
  • zgc:100831
  • zgc:194774
  • zgc:55372
  • zgc:55823
  • zgc:55917
  • zgc:65879
  • zgc:77440
  • zgc:86686
  • zgc:86790
  • zgc:86934
Danio rerio (zebrafish)
Formation of the cornified envelope
  • cb80
  • dsc
  • dsc2
  • dsc2l
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • fb73g06
  • jup
  • jupa
  • lipf
  • pkp2
  • pkp3
  • pkp3a
  • wu:fa97f09
  • wu:fb73g06
  • wu:fk69a12
  • zgc:136656
  • zgc:56632
Danio rerio (zebrafish)
Keratinization
  • cb112
  • cb80
  • ckii
  • dsc
  • dsc2
  • dsc2l
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • jup
  • jupa
  • krt18b
  • krt2-8
  • krt5
  • krt8
  • krt93
  • krt94
  • krt95
  • krt97
  • krtt1c6
  • pkp2
  • pkp3
  • pkp3a
  • sb:cb112
  • sb:cb481
  • wu:fa91c11
  • wu:fa91g11
  • wu:fa96h10
  • wu:fa97f09
  • wu:fb02h09
  • wu:fb58f07
  • wu:fj02d02
  • wu:fk69a12
  • wu:fk78b12
  • zfCKII
  • zgc:136656
  • zgc:66015
Danio rerio (zebrafish)
PRC2 methylates histones and DNA
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • aebp2
  • cb633
  • dnmt3b
  • dnmt3bb.1
  • dnmt4
  • eed
  • ezh2
  • h2af1al
  • h2afvb
  • h2afvl
  • h2afx1
  • h2afza
  • h2av
  • h2ax1
  • h2az2a
  • h2az2b
  • h3-5
  • h3f3a
  • h3f3b.1
  • h3f3c
  • h3f3d
  • hist2h2l
  • im:6896397
  • jarid2b
  • jmj
  • mtf2
  • rbb4
  • rbb4l
  • rbbp4
  • rbbp7
  • si:ch211-113a14.17
  • si:ch211-113a14.29
  • si:ch211-113a14.6
  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
  • si:dkey-108k21.18
  • si:dkey-108k21.28
  • si:dkey-23a13.7
  • suz12
  • suz12b
  • wu:cegs2813
  • zgc:112234
  • zgc:113984
  • zgc:136399
  • zgc:152758
  • zgc:173585
  • zgc:173587
  • zgc:194998
  • zgc:56685
Danio rerio (zebrafish)
Acyl chain remodelling of PS
  • cpla2
  • pla1a
  • pla2g10
  • pla2g12a
  • pla2g4
  • pla2g4a
  • rarres3l
  • zgc:162119
Danio rerio (zebrafish)

About Release Notes Help Feedback

Click here to visit the beta site.


International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024