GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 151 - 175 of 252 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Lactose synthesis
  • b4galt1l
  • fc29a02
  • glut1
  • glut1a
  • glut1b
  • lys-C
  • lyz
  • slc2a1
  • slc2a1a
  • wu:fc29a02
  • zgc:136734
  • zgc:154116
Danio rerio (zebrafish)
Interaction With Cumulus Cells And The Zona Pellucida
  • CHIA
  • ZP3
  • ZPC
  • b4galt1l
  • chia.1
  • chia.2
  • chia.3
  • chia.4
  • chia.5
  • chia.6
  • chioIIa
  • chioIa
  • chioIb
  • chit1
  • fa55e05
  • fe16c11
  • fi20d05
  • fj87h02
  • im:6902904
  • si:dkey-202n12.1
  • si:dkey-51e6none
  • spam1
  • wu:fa55e05
  • wu:fa55g10
  • wu:fb57c11
  • wu:fb61c11
  • wu:fb66f12
  • wu:fd61a02
  • wu:fe16c11
  • wu:fi13f01
  • wu:fi20d05
  • wu:fj87h02
  • zfZPC
  • zgc:114017
  • zgc:153827
  • zgc:154116
  • zgc:158668
  • zgc:162961
  • zgc:173556
  • zgc:55406
  • zgc:55941
  • zgc:56053
  • zgc:63792
  • zgc:77889
  • zgc:77912
  • zp2
  • zp2.2
  • zp2a
  • zp2l1
  • zp2l2
  • zp2v2
  • zp3
  • zp3.2
  • zp3.3
  • zp3a.2
  • zp3al
  • zp3b
  • zp3d.1
  • zp3e
  • zpb2b
  • zpb2c
  • zpc1-2
  • zpc2
  • zpc3
  • zpc4a-1
  • zpc6
Danio rerio (zebrafish)
Keratan sulfate biosynthesis
  • B3GNT1
  • CH1073-177A15.1
  • Lum
  • b3gnt1
  • b3gnt2b
  • b3gnt3
  • b3gnt3.4
  • b3gnt7
  • b4galt1l
  • b4galt2
  • b4galt4
  • b4galt5
  • b4galt6
  • b4gat1
  • cb543
  • chst1
  • fk70b01
  • fmoda
  • im:6910494
  • im:7151092
  • kera
  • lum
  • ogn
  • ogna
  • si:ch211-103f16.4
  • si:ch211-261p7.4
  • siat4
  • siat4c
  • ssp1
  • ssp5
  • st3gal1l
  • st3gal2l
  • st3gal4
  • st3gal8
  • wu:fa55h04
  • wu:fc39c01
  • wu:fk30b12
  • wu:fk70b01
  • zgc:101780
  • zgc:111788
  • zgc:113456
  • zgc:113545
  • zgc:113947
  • zgc:154116
  • zgc:158162
  • zgc:55730
  • zgc:86661
Danio rerio (zebrafish)
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
  • F-spondin1
  • b3galtla
  • b3glcta
  • etID309958.14
  • fc46a11
  • mindin2
  • pofut2
  • sema5a
  • sema5ba
  • si:dkey-1o1.2
  • spon1a
  • spon2b
  • thsd7a
  • thsd7aa
  • wu:fa95e03
  • wu:fc46a11
  • wu:fi41a04
  • zgc:100756
  • zgc:194822
Danio rerio (zebrafish)
O-linked glycosylation of mucins
  • B3GNT1
  • Galnt4
  • b3gnt2b
  • b3gnt3
  • b3gnt3.4
  • b3gnt5
  • b3gnt5a
  • b3gnt7
  • b3gntl1
  • b4galt5
  • b4galt6
  • cb543
  • fc23d02
  • fc56f12
  • galnt1
  • galnt11
  • galnt6
  • galnt7
  • galntl6
  • gcnt4
  • heg
  • im:7139488
  • poc1bl
  • qtgal
  • sb:cb921
  • si:ch211-15e22.3
  • ssp1
  • ssp5
  • wdr51bl
  • wu:fa55h04
  • wu:fc01a10
  • wu:fc23d02
  • wu:fc39c01
  • wu:fc56f12
  • wu:fk30b12
  • zgc:112011
  • zgc:113219
  • zgc:113947
  • zgc:153274
  • zgc:55730
Danio rerio (zebrafish)
Apoptotic cleavage of cellular proteins
  • IAP1
  • bcap31
  • birc2
  • birc3
  • casp10
  • casp3
  • casp3a
  • casp6
  • casp6a
  • casp7
  • casp8l2
  • fb09d10
  • fnta
  • fv43b11
  • im:6909421
  • mst4
  • prkcd
  • prkcda
  • satb1a
  • sb:cb955
  • si:bz30i22.4
  • si:ch211-195k18.2
  • si:rp71-30i22.4
  • stk24a
  • stk26
  • wu:fb09d10
  • wu:fb51d12
  • wu:fv43b11
  • wu:fz92f09
  • zgc:100890
  • zgc:110595
  • zgc:112960
  • zgc:158397
  • zgc:163071
  • zgc:175288
  • zgc:56389
  • zgc:56558
Danio rerio (zebrafish)
RND3 GTPase cycle
  • CAV1
  • LOC100004299
  • arhe
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • bck
  • cav1
  • cb594
  • ckap4
  • ckb
  • ckbb
  • cpda
  • ddx4
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • epha2
  • epha2a
  • fam83b
  • fc39h07
  • flot2a
  • heg
  • id:ibd2712
  • id:ibd2919
  • id:ibd5152
  • kctd13
  • llk
  • pik3r1
  • pik3r2
  • rbm39a
  • rbm39b
  • rho8
  • rnd3
  • rnd3a
  • rnpc2
  • rnpc2l
  • rtk6
  • scrb1
  • scrib
  • stb2
  • stbm
  • tmod2
  • tnfaip1
  • tri
  • vangl1
  • vangl2
  • vas
  • vasa
  • vlg
  • wu:fa97g07
  • wu:fb09c08
  • wu:fb65b05
  • wu:fc07c04
  • wu:fc39h07
  • wu:fi06b02
  • wu:fi24g05
  • wu:fj36f10
  • wu:fj37d11
  • zgc:109812
  • zgc:112139
  • zgc:113117
  • zgc:158535
  • zgc:55302
  • zgc:55780
  • zgc:73080
  • zgc:86648
Danio rerio (zebrafish)
Disassembly of the destruction complex and recruitment of AXIN to the membrane
  • CAV1
  • LRP6
  • ZG06
  • Zfz8b
  • Zwnt[a]
  • axin
  • axin1
  • cav1
  • cb383
  • dvl2
  • fz10
  • fz2
  • fz3
  • fz5
  • fz6
  • fz8
  • fz8a
  • fz8b
  • fz8c
  • fzA
  • fzc
  • fzd1
  • fzd2
  • fzd5
  • fzd8a
  • fzd8b
  • fzd8c
  • ik:tdsubc_1e1
  • int-1
  • lrp5
  • lrp6
  • sb:eu471
  • wnt-1
  • wnt-8
  • wnt-8b
  • wnt1
  • wnt3
  • wnt3 l
  • wnt3a
  • wnt3l
  • wnt8
  • wnt8a
  • wnt8b
  • wnt[a]
  • wu:fb70g09
  • wu:fc05d12
  • wu:fc07c04
  • wu:fd02c05
  • wu:fo71e09
  • wu:fp54a02
  • xx:tdsubc_1e1
  • zfz2
  • zfzA
  • zg02
  • zg03
  • zg05
  • zg08
  • zg10
  • zgc:194774
  • zgc:55372
Danio rerio (zebrafish)
Asparagine N-linked glycosylation
  • asgr1a
  • cldc1
  • si:ch211-125e6.12
  • si:ch211-125e6.13
  • si:ch211-154o6.6
  • si:ch73-361h17.1
  • si:ch73-86n18.1
Danio rerio (zebrafish)
Dectin-2 family
  • asgr1a
  • cd247l
  • cldc1
  • fynb
  • heg
  • illr1
  • illr4
  • illrL
  • im:7156386
  • si:ch211-125e6.12
  • si:ch211-125e6.13
  • si:ch211-154o6.6
  • si:ch73-361h17.1
  • si:ch73-86n18.1
  • zgc:152681
  • zgc:174904
Danio rerio (zebrafish)
RAC2 GTPase cycle
  • CAV1
  • IQGAP1
  • LOC100004299
  • arhgap1
  • arhgap35a
  • arhgap42a
  • arhgdia
  • cav1
  • cb422
  • cb810
  • cb893
  • cdc42
  • cdc42a
  • cdc42ep4
  • cdc42ep4a
  • cyba
  • cybb
  • def6
  • dlg3
  • dock1
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • epha2
  • epha2a
  • fb55a05
  • fc45f07
  • fj62g06
  • fk03b12
  • fk61c06
  • hmp
  • id:ibd5152
  • im:7152854
  • im:7156663
  • iqgap1
  • itgb1
  • itgb1b
  • itgb1b.1
  • itgb1b.2
  • kinase
  • mpp7
  • mtx1
  • mtx1b
  • ncf1
  • ncf2
  • nckap1
  • ogr
  • ogre
  • pak2
  • pak2a
  • pik3ca
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pik3r3a
  • rab-7
  • rab7
  • rab7a
  • rac2
  • racgap1
  • rtk6
  • samm50
  • samm50a
  • si:dkey-8l13.4
  • si:dz198m22.1
  • stb2
  • swap70b
  • swp70
  • tfr1a
  • trio
  • vamp3
  • vangl1
  • wu:cegs2891
  • wu:fa96g11
  • wu:fb07d08
  • wu:fb16a12
  • wu:fb55a05
  • wu:fb65b05
  • wu:fb71h01
  • wu:fb92c08
  • wu:fc07c04
  • wu:fc45f07
  • wu:fj62g06
  • wu:fk03b12
  • wu:fk56b03
  • wu:fk61c06
  • zgc:101675
  • zgc:110361
  • zgc:158405
  • zgc:55554
  • zgc:63918
  • zgc:64058
  • zgc:64144
  • zgc:66077
  • zgc:73230
  • zgc:77681
  • zgc:77839
  • zgc:85632
  • zgc:86686
  • zgc:86726
  • zgc:91798
  • zgc:91889
Danio rerio (zebrafish)
The NLRP3 inflammasome
  • TXN
  • asc
  • asc1
  • fb15h09
  • hsp90ab1
  • hsp90b
  • hspc3
  • nlrp1
  • p2rx7
  • p2xr7
  • panx1
  • panx1a
  • pstpip1b
  • pycard
  • sb:cb368
  • sgut1
  • sugt1
  • txn
  • txnip
  • txnipa
  • wu:fb15h09
  • wu:fd45a02
  • zgc:123255
  • zgc:194990
  • zgc:55631
  • zgc:92903
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by BMP
  • ActrIIB
  • BMP2b
  • BMPR-IA
  • BMPR-IB
  • BR1a
  • BR1b
  • LOC564395
  • actr2b
  • actrIIb
  • acvr2b
  • acvr2ba
  • alk3
  • alk3tr
  • alk6tr
  • amh
  • bmp-2
  • bmp2
  • bmp2-4
  • bmp2b
  • bmpr-IB
  • bmpr1a
  • bmpr1aa
  • bmpr1b
  • bmpr1ba
  • bmpr2b
  • cb670
  • cha
  • charon
  • dand5
  • fa95c03
  • fc25c04
  • fj60c10
  • fstl1b
  • madh1
  • madh5
  • madh7
  • nog3
  • sbn
  • si:dkey-288j18.1
  • sma8
  • smad1
  • smad5
  • smad6b
  • smad7
  • smad9
  • smurf1
  • smurf2
  • swr
  • wu:fa95c03
  • wu:fb30b12
  • wu:fc25c04
  • wu:fj60c10
  • wu:fj97d11
  • wwp1
  • zALK-6
  • zbmp-2
  • zbmp2
  • zfyve16
  • zgc:103407
  • zgc:136731
  • zgc:66401
  • zgc:92220
Danio rerio (zebrafish)
FGFR1c ligand binding and activation
  • GIPC
  • TIP-2
  • anos1a
  • anos1b
  • anosmin-1a
  • anosmin-1b
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • gipc1
  • id:ibd5158
  • kal1.1
  • kal1.2
  • kal1a
  • kal1b
  • rgs19ip1
  • si:ch73-18k18.1
  • tgfbr3
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fl91z45
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
Negative regulation of FGFR1 signaling
  • ERK1
  • anos1a
  • anos1b
  • anosmin-1a
  • anosmin-1b
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fi06b09
  • id:ibd5158
  • kal1.1
  • kal1.2
  • kal1a
  • kal1b
  • kl
  • mapk1
  • mapk3
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fi06b09
  • wu:fl91z45
  • zERK1
  • zERK2
  • zgc:109774
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
RAF/MAP kinase cascade
  • EGFR12
  • EGFR15
  • ERK1
  • NRG2b
  • ang1
  • angpt1
  • btc
  • c-met
  • cmet
  • dob
  • egfr
  • egfra
  • epgn
  • erbb2
  • erbb3
  • erbb3b
  • erbb4
  • erbb4a
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf7
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fgfr2
  • fgfr3
  • fgfr4
  • fi06b09
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hbegfa
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • kl
  • mapk1
  • mapk3
  • met
  • nras
  • nrg2b
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • pdgfra
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3r1
  • pik3r2
  • ranbp9
  • rasgrf2
  • rasgrp3
  • rgl1
  • si:ch211-227n20.1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • sparse
  • tek
  • tie-2
  • tie2
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb65b05
  • wu:fc32c12
  • wu:fc76g06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fi06b09
  • wu:fj59e07
  • wu:fv70f10
  • zERK1
  • zERK2
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:153249
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:63601
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
Tie2 Signaling
  • ang1
  • ang2-1
  • angpt1
  • angpt2a
  • fb18e12
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • nras
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3r1
  • pik3r2
  • sos1
  • tek
  • tie-2
  • tie2
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb65b05
  • wu:fc76g06
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
Activated PKN1 stimulates transcription of AR (androgen receptor) regulated genes KLK2 and KLK3
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • NR3C4
  • ar
  • grip1
  • h2af1al
  • h2afvb
  • h2afvl
  • h2afx1
  • h2afza
  • h2av
  • h2ax1
  • h2az2a
  • h2az2b
  • h3-5
  • h3f3a
  • h3f3b.1
  • h3f3c
  • h3f3d
  • hist2h2l
  • im:6896397
  • jmjd2c
  • kdm4c
  • ncoa2
  • pkn1b
  • si:ch211-113a14.17
  • si:ch211-113a14.29
  • si:ch211-113a14.6
  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
  • si:dkey-108k21.18
  • si:dkey-108k21.28
  • si:dkey-23a13.7
  • src2
  • tif2
  • wu:fd55d07
  • zgc:112234
  • zgc:113984
  • zgc:173585
  • zgc:173587
  • zgc:194998
  • zgc:56685
Danio rerio (zebrafish)
Rhesus glycoproteins mediate ammonium transport.
  • rhag
  • rhbg
  • rhcg2a
  • rhcgl1
  • wu:fj61d12
  • zgc:171954
Danio rerio (zebrafish)
Amino acid transport across the plasma membrane
  • fa11f11
  • fc26e12
  • fc51c07
  • id:ibd1327
  • sb:cb519
  • si:ch211-132b12.1
  • si:ch211-154h20.4
  • si:zc101n13.5
  • slc16a10
  • slc1a4
  • slc1a5
  • slc25a29
  • slc36a4
  • slc38a2
  • slc38a3
  • slc38a5b
  • slc3a2b
  • slc43a1b
  • slc6a11
  • slc6a11a
  • slc6a15
  • slc6a18
  • slc6a19
  • slc6a19b
  • slc6a6
  • slc6a6b
  • slc7a1
  • slc7a1a
  • slc7a2
  • slc7a6
  • slc7a7
  • snat2
  • tau
  • taut
  • wu:fa01a01
  • wu:fa11f11
  • wu:fc26e12
  • wu:fc31c02
  • wu:fc48a10
  • wu:fc51c07
  • wu:fd58f10
  • wu:fe14a07
  • wu:fq18d12
  • zgc:114094
  • zgc:123300
  • zgc:158383
  • zgc:158423
  • zgc:172267
  • zgc:55813
  • zgc:66050
  • zgc:92015
  • zgc:92817
Danio rerio (zebrafish)
Glutamate Neurotransmitter Release Cycle
  • EAAT3
  • EAAT5A
  • MGC163045
  • SLC1A2a
  • SLC1A7
  • addicsin
  • arl6ip5b
  • fj55a04
  • glsl
  • rab3a
  • rab3ab
  • si:ch211-255d18.4
  • si:ch211-284b7.1
  • si:ch73-116b16.2
  • si:dkey-21n12.2
  • slc17a7
  • slc17a7a
  • slc1a1
  • slc1a2a
  • slc1a3b
  • slc1a7
  • slc1a7a
  • slc1a7b
  • slc38a2
  • snat2
  • syt1
  • syt1a
  • vamp2
  • vglut1
  • wu:fj41c01
  • wu:fj55a04
  • wu:fj61c06
  • wu:fk56d05
  • zgc:112516
  • zgc:73302
  • zgc:91959
  • zgc:92811
  • zgc:92899
  • zp22
Danio rerio (zebrafish)
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides
  • EAAT3
  • EAAT5A
  • SLC1A2a
  • SLC1A7
  • ctns
  • samc
  • si:ch211-284b7.1
  • si:ch73-116b16.2
  • si:dkey-21n12.2
  • slc1a1
  • slc1a2a
  • slc1a3b
  • slc1a7
  • slc1a7a
  • slc1a7b
  • slc25a26
  • slc32a1
  • zgc:110194
  • zgc:158324
  • zgc:91959
Danio rerio (zebrafish)
Other interleukin signaling
  • IL-34
  • STX4A
  • csf1-2
  • csf1b
  • csf1r
  • fc21b12
  • fms
  • il34
  • im:7039434
  • si:ch211-239j19.3
  • si:dkey-220f10.3
  • stx4
  • txlna
  • wu:fc08c10
  • wu:fc21b12
  • zgc:158436
  • zgc:56272
Danio rerio (zebrafish)
Digestion of dietary carbohydrate
  • amy2a
  • amy3
  • chia.2
  • chia.3
  • chioIa
  • chioIb
  • wu:fb61c11
  • wu:fb64c06
  • wu:fd61a02
  • wu:fi13f01
  • zgc:55406
  • zgc:55941
  • zgc:66270
  • zgc:77877
  • zgc:77889
  • zgc:77912
Danio rerio (zebrafish)
Adrenaline,noradrenaline inhibits insulin secretion
  • GNB1x
  • GNG5
  • [g]3
  • adcy5
  • adra2a
  • adra2c
  • fb39f01
  • fi21e06
  • gnai1
  • gnai2
  • gnai2b
  • gnb1b
  • gnb1l
  • gnb3a
  • gnb3l
  • gnb5a
  • gng1
  • gng12b
  • gng13b
  • gng3
  • gng5
  • gng7
  • gng8
  • gngt1
  • gngt2
  • gngt2a
  • id:ibd1139
  • ik:tdsubc_2c12
  • si:dkey-178j17.2
  • si:dkey-44g17.6
  • si:dkeyp-60a7.2
  • wu:fb39f01
  • wu:fb98e06
  • wu:fi21e06
  • wu:fj09d12
  • wu:fj56b02
  • wu:fk53d05
  • wu:fk53d06
  • xx:tdsubc_2c12
  • zgc:100880
  • zgc:110316
  • zgc:55774
  • zgc:56690
  • zgc:63957
  • zgc:73318
  • zgc:92641
  • zgc:92704
  • zgc:92709
  • zgc:92852
Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024