GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 252 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
FGFR3b ligand binding and activation
  • dob
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf20a
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr3
  • wu:fb05c08
Danio rerio (zebrafish)
Cellular hexose transport
  • fc29a02
  • glut1
  • glut10
  • glut12
  • glut1a
  • glut1b
  • glut2
  • mfsd4b
  • naglt1
  • rag1ap1
  • sb:cb753
  • sb:cb808
  • slc2a1
  • slc2a10
  • slc2a12
  • slc2a1a
  • slc2a2
  • slc2a3b
  • slc2a8
  • slc2a8l
  • slc45a3
  • slc50a1
  • slc5a1
  • slc5a2
  • slc5a9
  • wu:fb62h10
  • wu:fc29a02
  • zgc:56364
  • zgc:66074
  • zgc:85782
  • zgc:85792
Danio rerio (zebrafish)
Regulation of insulin secretion
  • fc29a02
  • glut1
  • glut1a
  • glut1b
  • glut2
  • slc2a1
  • slc2a1a
  • slc2a2
  • wu:fb62h10
  • wu:fc29a02
Danio rerio (zebrafish)
FRS-mediated FGFR1 signaling
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • kl
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
Downstream signaling of activated FGFR1
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • flrt1b
  • flrt2
  • id:ibd5158
  • kl
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkey-87k14.1
  • si:dkeyp-74c5.3
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • zgc:109774
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
SHC-mediated cascade:FGFR1
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • kl
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
PI-3K cascade:FGFR1
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • id:ibd5158
  • kl
  • pik3ca
  • pik3r1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb65b05
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
FGFR1c and Klotho ligand binding and activation
  • fgf23
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • kl
Danio rerio (zebrafish)
FGFR1b ligand binding and activation
  • GIPC
  • TIP-2
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf2
  • fgf22
  • fgf3
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • gipc1
  • rgs19ip1
  • si:ch73-18k18.1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • tgfbr3
  • wu:fd11d03
  • zgc:109774
Danio rerio (zebrafish)
FGFR2b ligand binding and activation
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf22
  • fgf3
  • fgf7
  • fgfr2
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • wu:fd11d03
  • zgc:109774
Danio rerio (zebrafish)
Keratan sulfate degradation
  • Lum
  • fmoda
  • gnsa
  • im:6910494
  • kera
  • lum
  • ogn
  • ogna
  • si:ch211-103f16.4
  • zgc:113456
  • zgc:113545
  • zgc:114066
  • zgc:86661
Danio rerio (zebrafish)
Antagonism of Activin by Follistatin
  • actbb
  • actbetaB
  • fst
  • fst1
  • fsta
  • fstl3
  • inhbab
  • inhbal
  • inhbb
  • si:dkey-28h18.3
  • zgc:114170
  • zgc:158348
Danio rerio (zebrafish)
GDP-fucose biosynthesis
  • fuom
  • gfus
  • gfus.1
  • si:dkey-235d18none
  • tsta3
  • zgc:101805
Danio rerio (zebrafish)
NGF processing
  • PCSK5
  • furin
  • furina
  • ngf
  • ngfb
  • pcsk5
  • pcsk5b
  • si:dkey-281a24.5
  • zgc:165659
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by PDGF
  • furin
  • furina
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • pdgfra
  • ptpn12
  • si:dkey-281a24.5
  • wu:fc32c12
  • zgc:153249
  • zgc:65856
  • zgc:77437
Danio rerio (zebrafish)
Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade
  • GRK1A
  • GUCA1D
  • METAP2
  • fk56b01
  • fk56e06
  • fnta
  • fntb
  • gcap1
  • gcap2
  • gcap3
  • gcap4
  • gcap5
  • gnat1
  • gng1
  • gngt1
  • grk1
  • grk1a
  • grk7-2
  • grk7b
  • guca1a
  • guca1aa
  • guca1ab.1
  • guca1b
  • guca1c
  • guca1d
  • guca1e
  • im:2601337
  • im:6909421
  • metap1
  • metap2
  • metap2b
  • nmt-1
  • nmt1
  • nmt1a
  • nmt2
  • rcv1a
  • rcvrna
  • rho
  • saga
  • si:rp71-1p14.1
  • wu:fb51d12
  • wu:fb98h06
  • wu:fb99h09
  • wu:fc15d01
  • wu:fc18a04
  • wu:fk53d06
  • wu:fk56b01
  • wu:fk56e06
  • wu:fz92f09
  • zfo2
  • zgc:110714
  • zgc:114180
  • zgc:158397
  • zgc:66109
  • zgc:66243
  • zgc:66250
  • zgc:73318
  • zgc:85885
  • zgc:86774
Danio rerio (zebrafish)
Class C/3 (Metabotropic glutamate/pheromone receptors)
  • T2R2
  • TAS1R1
  • TAS1R2a
  • TAS1R3
  • TAS2R1a
  • TAS2R1b
  • Tas1R2b
  • gb:kf234084
  • gprc6a
  • grm1
  • grm1b
  • grm2b
  • grm3
  • grm5a
  • grm5b
  • grm6a
  • grm7
  • grm8a
  • si:ch211-233h19.1
  • si:ch211-278p9.5
  • si:dkey-52h10.3
  • t1rc1
  • tas1r1
  • tas1r2.1
  • tas1r2.2
  • tas1r2a
  • tas1r2b
  • tas1r3
  • tas2r1a
  • tas2r200.1
  • tas2r200.2
  • tas2r2l
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis of glycosylphosphatidylinositol (GPI)
  • pigb
  • pign
  • zgc:172324
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by SCF-KIT
  • JAK2bCA
  • Stat5
  • ZFMMP-9
  • fb18e12
  • fj05a08
  • fj21h04
  • fj59e07
  • fynb
  • grap
  • grap2a
  • grapa
  • grb10
  • grb10a
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • jak2
  • jak2b
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • lck
  • mmp9
  • nras
  • pik3ca
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pik3r3a
  • ptpru
  • rptppsi
  • sb:eu508
  • sb:eu615
  • sos1
  • sparse
  • src
  • stat1
  • stat1a
  • stat5
  • stat5.1
  • stat5.2
  • stat5a
  • stat5b
  • stat6
  • stat7
  • tec
  • wu:fb02g06
  • wu:fb07b05
  • wu:fb16a12
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb65b05
  • wu:fi98c09
  • wu:fj05a08
  • wu:fj21h04
  • wu:fj59e07
  • wu:fj66g07
  • wu:fk56b03
  • yes
  • yes1
  • zgc:103549
  • zgc:110202
  • zgc:110734
  • zgc:112091
  • zgc:136695
  • zgc:158274
  • zgc:64165
  • zgc:73077
  • zgc:73230
  • zgc:91987
Danio rerio (zebrafish)
Amino acids regulate mTORC1
  • RRAGB
  • atp6e
  • atp6v0cb
  • atp6v0d1
  • atp6v1ab
  • atp6v1ba
  • atp6v1c1
  • atp6v1c1a
  • atp6v1d
  • atp6v1e1
  • atp6v1e1b
  • atp6v1f
  • atp6v1g1
  • atp6v1h
  • atpv0e2
  • cb927
  • chunp6890
  • chunp6932
  • cto
  • fb52g11
  • fj35f08
  • frap1
  • gbl
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • mapksp1
  • mlst8
  • mtor
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • sh3bp4
  • sh3bp4a
  • si:dkey-176g4.2
  • slc38a9
  • tcirg1
  • tcirg1b
  • tor
  • vatB1
  • wu:fa12a02
  • wu:fb44e06
  • wu:fb52g11
  • wu:fc22h08
  • wu:fc68h09
  • wu:fc74d11
  • wu:fi46h07
  • wu:fj35f08
  • wu:fq38h02
  • zgc:109987
  • zgc:111904
  • zgc:111971
  • zgc:55524
  • zgc:56499
  • zgc:73144
  • zgc:73282
  • zgc:77708
  • zgc:92923
Danio rerio (zebrafish)
Regulation of PTEN gene transcription
  • RRAGB
  • frap1
  • gbl
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • maf1b
  • mapksp1
  • mlst8
  • mtor
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • si:ch73-174h16.3
  • si:dkey-176g4.2
  • slc38a9
  • tor
  • wu:fc22h08
  • wu:fc68h09
  • wu:fi23d09
  • zgc:111971
  • zgc:56499
  • zgc:73144
Danio rerio (zebrafish)
Electric Transmission Across Gap Junctions
  • PANX
  • connexin35
  • cx35
  • cx35b
  • cx52.7
  • gja10a
  • gja9
  • gjd2b
  • panx1
  • panx1a
  • panx2
  • si:ch211-192n14.2
  • zgc:194445
  • zgc:194451
  • zgc:55631
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis, secretion, and deacylation of Ghrelin
  • IGF-1
  • IGF-1L
  • IGF-1a
  • IGF-I
  • fa97f07
  • gh1
  • ghl
  • ghr
  • ghre
  • ghrl
  • goat
  • igf1
  • ins
  • lepb
  • mboat4
  • ob-b
  • pcsk1
  • sec11
  • sec11a
  • sec11l1
  • si:dkey-21o22.1
  • spcs1
  • spcs2
  • spcs3
  • wu:fa97f07
  • zgc:110014
  • zgc:85675
  • zgc:92805
Danio rerio (zebrafish)
Intestinal hexose absorption
  • glut2
  • slc2a2
  • slc5a1
  • wu:fb62h10
  • zgc:66074
  • zgc:85782
Danio rerio (zebrafish)
Glycerophospholipid catabolism
  • enpp6
  • gde1
  • zgc:56068
  • zgc:77135
Danio rerio (zebrafish)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


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Last updated: August 19, 2024