GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 201 - 225 of 252 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • manba
  • zgc:55493
  • zgc:76896
Danio rerio (zebrafish)
RNA Polymerase I Promoter Opening
  • ERK1
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • MBD3
  • fi06b09
  • h2af1al
  • h2afvb
  • h2afvl
  • h2afx1
  • h2afza
  • h2av
  • h2ax1
  • h2az2a
  • h2az2b
  • h3-5
  • h3f3a
  • h3f3b.1
  • h3f3c
  • h3f3d
  • hist2h2l
  • im:6896397
  • mapk3
  • mbd1
  • mbd1b
  • mbd2
  • mbd3a
  • si:ch211-113a14.17
  • si:ch211-113a14.29
  • si:ch211-113a14.6
  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
  • si:dkey-108k21.18
  • si:dkey-108k21.28
  • si:dkey-23a13.7
  • si:dz180g5.3
  • ubtf
  • wu:fa97f06
  • wu:fa98f07
  • wu:fi06b09
  • wu:fi45g12
  • wu:fj38c10
  • zERK1
  • zK13A21.11
  • zK13A21.17
  • zgc:111862
  • zgc:112234
  • zgc:113984
  • zgc:173585
  • zgc:173587
  • zgc:194998
  • zgc:56685
Danio rerio (zebrafish)
The retinoid cycle in cones (daylight vision)
  • CRALBPb
  • dgat2
  • dhrs3b
  • ik:tdsubc_1f3
  • lws1
  • lws2
  • opn1lw1
  • opn1lw2
  • opn1sw1
  • opn1sw2
  • rdops
  • rlbp1
  • rlbp1b
  • sws1
  • tdsubc_1f3
  • uvops
  • xx:tdsubc_1f3
  • zgc:101705
  • zgc:77766
Danio rerio (zebrafish)
Energy dependent regulation of mTOR by LKB1-AMPK
  • RRAGB
  • cb116
  • frap1
  • gbl
  • im:7154392
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • mapksp1
  • mlst8
  • mtor
  • prkaa1
  • prkab1a
  • prkag1
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • sb:cb130
  • si:dkey-176g4.2
  • slc38a9
  • tor
  • wu:fa94c10
  • wu:fa94d09
  • wu:fc22h08
  • wu:fc68h09
  • wu:fd12h04
  • zgc:111971
  • zgc:56499
  • zgc:63896
  • zgc:73144
  • zgc:92228
Danio rerio (zebrafish)
Negative regulation of FGFR1 signaling
  • ERK1
  • anos1a
  • anos1b
  • anosmin-1a
  • anosmin-1b
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fi06b09
  • id:ibd5158
  • kal1.1
  • kal1.2
  • kal1a
  • kal1b
  • kl
  • mapk1
  • mapk3
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fi06b09
  • wu:fl91z45
  • zERK1
  • zERK2
  • zgc:109774
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
Gluconeogenesis
  • ENO1
  • PGI
  • PYCa
  • aldoa
  • aldoaa
  • aldob
  • aldoc
  • aldocb
  • cb598
  • cb79
  • cb856
  • cb883
  • cb924
  • eno1
  • eno1a
  • eno2
  • eno3
  • eno4
  • fb17g10
  • fb57b01
  • fbp1
  • fbp1b
  • fc09h05
  • fc25d06
  • fj24f12
  • fj93h11
  • g6pc3
  • gapdh
  • gapdh-2
  • gpi
  • gpib
  • id:ibd1091
  • id:ibd5157
  • pck
  • pck1
  • pck2
  • pcl
  • pcxa
  • pgam1
  • pgam1a
  • pgam2
  • pgi-2
  • pgk1
  • sb:cb79
  • slc37a1
  • slc37a2
  • slc37a4
  • slc37a4a
  • tpi1b
  • wu:fa28b10
  • wu:fb10b11
  • wu:fb17g10
  • wu:fb57b01
  • wu:fb81h05
  • wu:fc09h05
  • wu:fc25d06
  • wu:fc51c05
  • wu:fd59b07
  • wu:fi32b03
  • wu:fj24f12
  • wu:fj36g06
  • wu:fj93h11
  • wu:fk58e02
  • zgc:101659
  • zgc:123047
  • zgc:56252
  • zgc:63869
  • zgc:63876
  • zgc:64127
  • zgc:73152
  • zgc:77098
  • zgc:77867
  • zgc:77899
  • zgc:92418
Danio rerio (zebrafish)
MDK and PTN in ALK signaling
  • alk
  • cb518
  • fb79b05
  • fj33b02
  • fj48a12
  • mdk
  • mdk2
  • mdkb
  • plei2
  • ptn
  • wu:fb79b05
  • wu:fj33b02
  • wu:fj48a12
  • zHBNF
  • zgc:111787
Danio rerio (zebrafish)
Dermatan sulfate biosynthesis
  • DC
  • bcan
  • bgn
  • bgna
  • chst14
  • cspg2b
  • d4st1
  • dcan
  • dcn
  • decorin
  • dse
  • fb99b07
  • fi32a12
  • ncanb
  • si:dkey-121j17.2
  • vcanb
  • wu:fb99b07
  • wu:fi32a12
  • zgc:91989
Danio rerio (zebrafish)
RHOG GTPase cycle
  • ARFGAP3
  • ARHG
  • ARHGDIB
  • CAV1
  • LOC100004299
  • arfgap3
  • arhgap1
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • arhgdia
  • arhgdig
  • cav1
  • cb422
  • cb810
  • cdc42
  • cdc42a
  • cpn10
  • cyfip1
  • dlg3
  • dock1
  • dock5
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • epha2
  • epha2a
  • fj62g06
  • fk03b12
  • fk61c06
  • hmp
  • hspe1
  • id:ibd5152
  • itgb1
  • itgb1b
  • itgb1b.1
  • itgb1b.2
  • kinase
  • mpp7
  • ndufs3
  • pak2
  • pak2a
  • pik3r1
  • rab-7
  • rab7
  • rab7a
  • rhog
  • rhogb
  • rtk6
  • shmt2
  • si:dz198m22.1
  • stb2
  • tfr1a
  • trio
  • vamp3
  • vangl1
  • wu:cegs2891
  • wu:fa96g11
  • wu:fb07d08
  • wu:fb65b05
  • wu:fb71h01
  • wu:fc07c04
  • wu:fj62g06
  • wu:fk03b12
  • wu:fk30f01
  • wu:fk61c06
  • zgc:110361
  • zgc:112520
  • zgc:55554
  • zgc:55848
  • zgc:63918
  • zgc:64058
  • zgc:65966
  • zgc:77681
  • zgc:85632
  • zgc:85765
  • zgc:86726
  • zgc:86747
  • zgc:91798
Danio rerio (zebrafish)
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
  • F-spondin1
  • b3galtla
  • b3glcta
  • etID309958.14
  • fc46a11
  • mindin2
  • pofut2
  • sema5a
  • sema5ba
  • si:dkey-1o1.2
  • spon1a
  • spon2b
  • thsd7a
  • thsd7aa
  • wu:fa95e03
  • wu:fc46a11
  • wu:fi41a04
  • zgc:100756
  • zgc:194822
Danio rerio (zebrafish)
PI3K/AKT Signaling
  • ARHG
  • EGFR12
  • EGFR15
  • ER[b]2
  • ER[b]a
  • NRG2b
  • akt2
  • akt3b
  • btc
  • cb945
  • dob
  • egfr
  • egfra
  • epgn
  • erbb2
  • erbb3
  • erbb3b
  • erbb4
  • erbb4a
  • erbeta2
  • esr
  • esr1
  • esr2a
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hbegfa
  • id:ibd5158
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • kl
  • nr3a1
  • nrg2b
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • pdgfra
  • pdpk1b
  • pik3ap1
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3cd
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pik3r3a
  • rac1
  • rac1a
  • rac2
  • rhog
  • rhogb
  • sgk
  • sgk1
  • si:ch211-227n20.1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sparse
  • src
  • strn
  • wu:fb05c08
  • wu:fb16a12
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb65b05
  • wu:fc32c12
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fd16e02
  • wu:fk30f01
  • wu:fk56b03
  • wu:fv70f10
  • zfER-beta2
  • zfER[b]2
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:153249
  • zgc:194535
  • zgc:55823
  • zgc:55848
  • zgc:55917
  • zgc:63473
  • zgc:63601
  • zgc:73077
  • zgc:73230
  • zgc:77318
  • zgc:86686
  • zgc:86934
Danio rerio (zebrafish)
Regulation of PTEN gene transcription
  • RRAGB
  • frap1
  • gbl
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • maf1b
  • mapksp1
  • mlst8
  • mtor
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • si:ch73-174h16.3
  • si:dkey-176g4.2
  • slc38a9
  • tor
  • wu:fc22h08
  • wu:fc68h09
  • wu:fi23d09
  • zgc:111971
  • zgc:56499
  • zgc:73144
Danio rerio (zebrafish)
Platelet Adhesion to exposed collagen
  • LOC100004428
  • VWF
  • gp1bb
  • lrcc54
  • nyx
  • si:ch1073-474e24.1
  • si:dkey-285c2.8
  • tsk
  • tsku
  • vasn
  • vasnb
  • vwf
Danio rerio (zebrafish)
Assembly of collagen fibrils and other multimeric structures
  • COL11A1b
  • COL5A3a
  • alpha2(I)
  • alpha3(I)
  • col11a1
  • col11a1b
  • col1a1b
  • col1a2
  • col1a3
  • col27a1
  • col27a1b
  • col2a1
  • col2a1a
  • col5a3
  • col5a3a
  • coll2a1
  • fb38c06
  • fc10c01
  • fj59a10
  • hm:zeh0348
  • hm:zehn2357
  • si:dkey-87l9.2
  • wu:fa95h05
  • wu:fa98d05
  • wu:fa99g10
  • wu:fb04c08
  • wu:fb11d06
  • wu:fb38c06
  • wu:fb54e07
  • wu:fc10c01
  • wu:fd02a10
  • wu:fj59a10
  • zehn2357
Danio rerio (zebrafish)
RND3 GTPase cycle
  • CAV1
  • LOC100004299
  • arhe
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • bck
  • cav1
  • cb594
  • ckap4
  • ckb
  • ckbb
  • cpda
  • ddx4
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • epha2
  • epha2a
  • fam83b
  • fc39h07
  • flot2a
  • heg
  • id:ibd2712
  • id:ibd2919
  • id:ibd5152
  • kctd13
  • llk
  • pik3r1
  • pik3r2
  • rbm39a
  • rbm39b
  • rho8
  • rnd3
  • rnd3a
  • rnpc2
  • rnpc2l
  • rtk6
  • scrb1
  • scrib
  • stb2
  • stbm
  • tmod2
  • tnfaip1
  • tri
  • vangl1
  • vangl2
  • vas
  • vasa
  • vlg
  • wu:fa97g07
  • wu:fb09c08
  • wu:fb65b05
  • wu:fc07c04
  • wu:fc39h07
  • wu:fi06b02
  • wu:fi24g05
  • wu:fj36f10
  • wu:fj37d11
  • zgc:109812
  • zgc:112139
  • zgc:113117
  • zgc:158535
  • zgc:55302
  • zgc:55780
  • zgc:73080
  • zgc:86648
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis of PA
  • Gpd1
  • acp6
  • agpat2
  • agpat3
  • agpat4
  • agpat6
  • agpat8
  • agpat9
  • alp3
  • alpi
  • alpi.1
  • alpi.2
  • aytl2
  • cpla2
  • fam73a
  • fam73b
  • fb68b10
  • fc21c07
  • fd13g09
  • fj78c06
  • gpat2
  • gpat3
  • gpat4
  • gpd1b
  • gpd1h
  • gpd1l
  • im:7147584
  • im:7149526
  • im:7149588
  • lclat1
  • liph
  • lpcat1
  • lycat
  • miga1
  • miga2
  • pla2g10
  • pla2g12a
  • pla2g4
  • pla2g4a
  • pld6
  • si:ch211-262h13.1
  • si:ch211-262h13.2
  • wu:fa16h03
  • wu:fa95f04
  • wu:fb68b10
  • wu:fc21c07
  • wu:fc25a07
  • wu:fc58b05
  • wu:fd13g09
  • wu:fi89e03
  • wu:fj78c06
  • wu:fq33b10
  • zgc:110409
  • zgc:110794
  • zgc:136875
  • zgc:153984
  • zgc:162119
  • zgc:162485
  • zgc:56524
  • zgc:63605
  • zgc:66051
  • zgc:85742
Danio rerio (zebrafish)
Phase 4 - resting membrane potential
  • KCNK18
  • TREK-2A
  • im:7150627
  • kcnj12b
  • kcnj14
  • kcnj2
  • kcnj2a
  • kcnk1
  • kcnk10a
  • kcnk13a
  • kcnk18
  • kcnk1a
  • kcnk2b
  • kcnk5a
  • si:ch211-120k19.4
  • si:dkey-121j17.4
  • si:dkey-63b1.2
  • trek-1
  • zgc:123268
  • zgc:123271
Danio rerio (zebrafish)
Arachidonic acid metabolism
  • cpla2
  • dgat2
  • faah2a
  • pla2g4
  • pla2g4a
Danio rerio (zebrafish)
Acyl chain remodelling of PS
  • cpla2
  • pla1a
  • pla2g10
  • pla2g12a
  • pla2g4
  • pla2g4a
  • rarres3l
  • zgc:162119
Danio rerio (zebrafish)
Adrenaline signalling through Alpha-2 adrenergic receptor
  • adra2a
  • adra2b
  • adra2c
Danio rerio (zebrafish)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR2
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf7
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr2
  • fj46f04
  • id:ibd5158
  • plcg1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj46f04
  • wu:fj57a05
  • zgc:109774
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis, secretion, and deacylation of Ghrelin
  • IGF-1
  • IGF-1L
  • IGF-1a
  • IGF-I
  • fa97f07
  • gh1
  • ghl
  • ghr
  • ghre
  • ghrl
  • goat
  • igf1
  • ins
  • lepb
  • mboat4
  • ob-b
  • pcsk1
  • sec11
  • sec11a
  • sec11l1
  • si:dkey-21o22.1
  • spcs1
  • spcs2
  • spcs3
  • wu:fa97f07
  • zgc:110014
  • zgc:85675
  • zgc:92805
Danio rerio (zebrafish)
WNT ligand biogenesis and trafficking
  • Zwnt[a]
  • cgi100
  • cgi1000
  • int-1
  • tmed5
  • wnt-1
  • wnt-10a
  • wnt-2
  • wnt-4
  • wnt-5
  • wnt-8
  • wnt-8b
  • wnt1
  • wnt10a
  • wnt10b
  • wnt2
  • wnt2bb
  • wnt3
  • wnt3 l
  • wnt3a
  • wnt3l
  • wnt4
  • wnt4a
  • wnt5
  • wnt5a
  • wnt5b
  • wnt7a
  • wnt7aa
  • wnt8
  • wnt8a
  • wnt8b
  • wnt9a
  • wnt9b
  • wnt[a]
  • zgc:153617
  • zgc:63936
Danio rerio (zebrafish)
RND1 GTPase cycle
  • Aldh-III
  • CAV1
  • LOC100004299
  • aldh3a2
  • aldh3a2a
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • arms
  • cav1
  • cpda
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Danio rerio (zebrafish)
Neurophilin interactions with VEGF and VEGFR
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  • kdrb
  • np-1
  • nrp1
  • nrp1a
Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024