GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1 - 25 of 252 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
Galactose catabolism
  • gale
  • galk1
  • im:7147391
  • pgm1
  • wu:fb05f01
  • zgc:101541
  • zgc:136578
  • zgc:63718
Danio rerio (zebrafish)
Lewis blood group biosynthesis
  • LOC565422
  • LOC796410
  • LOC798349
  • b3galt10.1
  • b3galt11
  • b3galt2
  • fe05b03
  • fut10
  • fut11
  • fut7
  • fut9a
  • im:7151092
  • siat4c
  • st3gal4
  • wu:fe05b03
  • zgc:152705
  • zgc:158162
  • zgc:194168
  • zgc:194170
  • zgc:194313
  • zgc:194330
  • zgc:76904
Danio rerio (zebrafish)
GDP-fucose biosynthesis
  • fuom
  • gfus
  • gfus.1
  • si:dkey-235d18none
  • tsta3
  • zgc:101805
Danio rerio (zebrafish)
Reactions specific to the complex N-glycan synthesis pathway
  • CH73-301C19.1
  • chst10
  • fuca1.2
  • fut8a
  • mgat2
  • wu:fb02a09
  • zgc:162268
Danio rerio (zebrafish)
N-Glycan antennae elongation
  • CH1073-177A15.1
  • b4galt1l
  • b4galt2
  • b4galt4
  • b4galt5
  • b4galt6
  • cb394
  • fk70b01
  • id:ibd5161
  • im:7151092
  • mgat4bQ9UQ53
  • mgat5
  • mgat5a
  • si:ch211-261p7.4
  • si:dkeyp-4h4.2
  • siat 8C
  • siat4c
  • siat8
  • st3gal4
  • st8sia2
  • st8sia3
  • wu:fk70b01
  • zgc:101780
  • zgc:136939
  • zgc:154116
  • zgc:158162
  • zgc:55730
Danio rerio (zebrafish)
Digestion of dietary carbohydrate
  • amy2a
  • amy3
  • chia.2
  • chia.3
  • chioIa
  • chioIb
  • wu:fb61c11
  • wu:fb64c06
  • wu:fd61a02
  • wu:fi13f01
  • zgc:55406
  • zgc:55941
  • zgc:66270
  • zgc:77877
  • zgc:77889
  • zgc:77912
Danio rerio (zebrafish)
Progressive trimming of alpha-1,2-linked mannose residues from Man9/8/7GlcNAc2 to produce Man5GlcNAc2
  • fj20e02
  • man1a2
  • si:dkey-174k18.8
  • wu:fj20e02
Danio rerio (zebrafish)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • manba
  • zgc:55493
  • zgc:76896
Danio rerio (zebrafish)
Class C/3 (Metabotropic glutamate/pheromone receptors)
  • T2R2
  • TAS1R1
  • TAS1R2a
  • TAS1R3
  • TAS2R1a
  • TAS2R1b
  • Tas1R2b
  • gb:kf234084
  • gprc6a
  • grm1
  • grm1b
  • grm2b
  • grm3
  • grm5a
  • grm5b
  • grm6a
  • grm7
  • grm8a
  • si:ch211-233h19.1
  • si:ch211-278p9.5
  • si:dkey-52h10.3
  • t1rc1
  • tas1r1
  • tas1r2.1
  • tas1r2.2
  • tas1r2a
  • tas1r2b
  • tas1r3
  • tas2r1a
  • tas2r200.1
  • tas2r200.2
  • tas2r2l
Danio rerio (zebrafish)
Fructose biosynthesis
  • akr1b1.2
  • si:dkey-180p18.9
  • zgc:153855
Danio rerio (zebrafish)
Regulation of insulin secretion
  • fc29a02
  • glut1
  • glut1a
  • glut1b
  • glut2
  • slc2a1
  • slc2a1a
  • slc2a2
  • wu:fb62h10
  • wu:fc29a02
Danio rerio (zebrafish)
G alpha (i) signalling events
  • ACTH
  • CB1R
  • DOR2
  • Drd4c
  • GNB1x
  • GNG5
  • LOC100005461
  • LOC561647
  • LOC794924
  • Lpar3
  • MSH
  • NPYRYC
  • Npy1r
  • Opn5m
  • PPSS1
  • PPSS3
  • RFLA1
  • RFLC2
  • RGS12TS
  • RGS12TS-I
  • RGS12TS-L
  • RGS12TS-S
  • RGS4
  • SDF-1
  • SI:bZ36D5.1
  • SI:bZ36D5.4
  • SS1
  • SS2
  • T2R2
  • TAS1R1
  • TAS1R2a
  • TAS1R3
  • TAS2R1a
  • TAS2R1b
  • Tas1R2b
  • [g]3
  • ackr3b
  • adra2a
  • adra2b
  • adra2c
  • agt
  • agtr2
  • agtrl1
  • agtrl1a
  • agtrl1b
  • apln
  • aplnr2
  • aplnr3
  • aplnra
  • aplnrb
  • cb1
  • cb2a
  • cb2b
  • cb436
  • cb824
  • cb958
  • ccl-c11b
  • ccl-c5a
  • ccl19a.1
  • ccl27b
  • ccl44
  • ccr10
  • ccr7
  • chrm2
  • chrm2a
  • cnr1
  • cnr2
  • cort
  • cxcl-c13d
  • cxcl-c1c
  • cxcl-c5c
  • cxcl11.1
  • cxcl11.6
  • cxcl11aa
  • cxcl11af
  • cxcl12
  • cxcl12a
  • cxcl18b
  • cxcl20
  • cxcl8b.1
  • cxcl8b.3
  • cxcr3.1
  • cxcr4a
  • cxcr7b
  • drd4b
  • drd4c
  • edg2
  • edg5
  • fb12g05
  • fb39f01
  • fd16a06
  • fd57e04
  • fi21e06
  • fj30h05
  • fk56e06
  • gal
  • galn
  • galr2a
  • gb:kf234084
  • gnai1
  • gnai2
  • gnai2b
  • gnai3
  • gnat1
  • gnat2
  • gnb1b
  • gnb1l
  • gnb3a
  • gnb3l
  • gnb5a
  • gng1
  • gng12b
  • gng13b
  • gng3
  • gng5
  • gng7
  • gng8
  • gngt1
  • gngt2
  • gngt2a
  • gper1
  • gpr183
  • gpr183a
  • gpr35.1
  • gpsm1
  • gpsm1b
  • grm2b
  • grm3
  • grm6a
  • grm7
  • grm8a
  • grn
  • hcar1-4
  • hm:zeh0300
  • htr1b
  • htr1bd
  • htr1d
  • htr5a
  • htr5aa
  • id:ibd1139
  • ik:tdsubc_2c12
  • il8l1
  • insl5
  • insl5a
  • lpar1
  • lpar2a
  • lpar3
  • lpar5a
  • lpar6
  • lpar6l
  • lws1
  • lws2
  • mel1ar
  • mel1br
  • mtnr1aa
  • mtnr1ar
  • mtnr1bb
  • mtnr1br
  • mtnr1br-2
  • npy
  • npy1r
  • npy4r
  • npy8ar
  • npy8br
  • npyrya
  • npyryb
  • npyryc
  • opn1lw1
  • opn1lw2
  • opn1sw1
  • opn1sw2
  • opn3
  • opn5
  • oprd1b
  • or4
  • oxgr1a.1
  • p2ry12
  • p2ry13
  • p2ry5
  • penk
  • penkb
  • pomc
  • pomca
  • ppg
  • pyy
  • pyya
  • rdops
  • rgr
  • rgr1
  • rgra
  • rgs12
  • rgs12b
  • rgs13
  • rgs4
  • rgs5
  • rgs5a
  • rgs6
  • rgs8
  • rho
  • rln3
  • rln3a
  • rlx 3a
  • rlx3a
  • rlx3b
  • rrh
  • rxfp3
  • rxfp3-2b
  • rxfp3.2b
  • s1pr2
  • s1pr5b
  • sb:cb436
  • sb:cb900
  • sb:eu249
  • sb:eu378
  • sdf-1a
  • sdf1a
  • si:bz36d5.2
  • si:ch211-105n9.2
  • si:ch211-152p11.4
  • si:ch211-233h19.1
  • si:ch211-268e23.2
  • si:ch211-89f7.4
  • si:ch73-6k14.1
  • si:dkey-110c1.1
  • si:dkey-253i9.3
  • si:dkey-265a7.5
  • si:dkey-44g17.6
  • si:dkey-52h10.3
  • si:dkey-96h14.2
  • si:dz22b13.1
  • si:dz46m7.1
  • src
  • sst1
  • sst1.1
  • sst3
  • sst7
  • sstr1b
  • sstr5
  • sws1
  • t1rc1
  • tas1r1
  • tas1r2.1
  • tas1r2.2
  • tas1r2a
  • tas1r2b
  • tas1r3
  • tas2r1a
  • tas2r200.1
  • tas2r200.2
  • tas2r2l
  • uvops
  • wu:fa55e10
  • wu:fb12g05
  • wu:fb39f01
  • wu:fb62d01
  • wu:fb62f06
  • wu:fb98e06
  • wu:fc06d08
  • wu:fc16h12
  • wu:fd16a06
  • wu:fd57e04
  • wu:fi21e06
  • wu:fj09d12
  • wu:fj30h05
  • wu:fj56b02
  • wu:fj84c02
  • wu:fj87b02
  • wu:fk53d05
  • wu:fk53d06
  • wu:fk56e06
  • xx:tdsubc_2c12
  • zfo2
  • zgc:100880
  • zgc:101053
  • zgc:103757
  • zgc:110316
  • zgc:110660
  • zgc:111892
  • zgc:113016
  • zgc:136854
  • zgc:153708
  • zgc:158362
  • zgc:163081
  • zgc:194211
  • zgc:194624
  • zgc:194648
  • zgc:194666
  • zgc:194690
  • zgc:194694
  • zgc:194705
  • zgc:194824
  • zgc:194855
  • zgc:195074
  • zgc:195090
  • zgc:55774
  • zgc:56690
  • zgc:63957
  • zgc:66034
  • zgc:73318
  • zgc:91924
  • zgc:92157
  • zgc:92641
  • zgc:92704
  • zgc:92709
  • zgc:92779
  • zgc:92852
  • zya
  • zyb
Danio rerio (zebrafish)
Sensory perception of sweet, bitter, and umami (glutamate) taste
  • GNB1x
  • T2R2
  • TAS1R1
  • TAS1R2a
  • TAS1R3
  • TAS2R1a
  • TAS2R1b
  • Tas1R2b
  • fb39f01
  • gnat2
  • gnb1b
  • gnb1l
  • gnb3a
  • gnb3l
  • gng13b
  • t1rc1
  • tas1r1
  • tas1r2.1
  • tas1r2.2
  • tas1r2a
  • tas1r2b
  • tas1r3
  • tas2r1a
  • tas2r200.1
  • tas2r200.2
  • tas2r2l
  • wu:fb39f01
  • wu:fb98e06
  • wu:fj09d12
  • zgc:55774
  • zgc:92641
  • zgc:92704
Danio rerio (zebrafish)
Glycosphingolipid catabolism
  • NSMase
  • asah2
  • gba2
  • gba3
  • im:6912336
  • im:6912508
  • nSMase2
  • neu3.2
  • neu3.3
  • neu3.5
  • neu4
  • neuc.1
  • sb:eu489
  • si:ch73-316n6.2
  • si:dkey-11j5.6
  • smpd2
  • smpd2a
  • smpd3
  • smpd4
  • zgc:100806
  • zgc:109998
  • zgc:153998
Danio rerio (zebrafish)
N-glycan trimming and elongation in the cis-Golgi
  • fi29h09
  • manea
  • mgat1b
  • si:ch211-152p11.3
  • wu:fi29h09
  • zgc:153912
  • zgc:92825
Danio rerio (zebrafish)
Glycolysis
  • ENO1
  • PGI
  • adpgk
  • aldoa
  • aldoaa
  • aldob
  • aldoc
  • aldocb
  • bpgm
  • cb1029
  • cb79
  • cb883
  • eno1
  • eno1a
  • eno2
  • eno3
  • eno4
  • fc09h05
  • fi09d05
  • fi17h06
  • fj24f12
  • fj33f03
  • gapdh
  • gapdh-2
  • gnpda1
  • gpi
  • gpib
  • hk1
  • hk2
  • im:7140576
  • im:7148527
  • pfkm
  • pfkma
  • pgam1
  • pgam1a
  • pgam2
  • pgi-2
  • pgk1
  • pgm2l1
  • pklr
  • pkm2
  • pkm2a
  • pkma
  • sb:cb79
  • tpi1b
  • wu:fa28b10
  • wu:fb10b11
  • wu:fb81h05
  • wu:fc09d08
  • wu:fc09h05
  • wu:fc16e02
  • wu:fc21e02
  • wu:fd15e01
  • wu:fd59b07
  • wu:fi09d05
  • wu:fi17h06
  • wu:fi31b04
  • wu:fi32b03
  • wu:fi37e08
  • wu:fj24f12
  • wu:fj33f03
  • wu:fj36g06
  • wu:fk58e02
  • wu:fq14b11
  • zgc:110691
  • zgc:153956
  • zgc:198285
  • zgc:55790
  • zgc:55926
  • zgc:56252
  • zgc:63876
  • zgc:73152
  • zgc:77618
  • zgc:77899
  • zgc:92230
  • zgc:92344
  • zgc:92418
Danio rerio (zebrafish)
Gluconeogenesis
  • ENO1
  • PGI
  • PYCa
  • aldoa
  • aldoaa
  • aldob
  • aldoc
  • aldocb
  • cb598
  • cb79
  • cb856
  • cb883
  • cb924
  • eno1
  • eno1a
  • eno2
  • eno3
  • eno4
  • fb17g10
  • fb57b01
  • fbp1
  • fbp1b
  • fc09h05
  • fc25d06
  • fj24f12
  • fj93h11
  • g6pc3
  • gapdh
  • gapdh-2
  • gpi
  • gpib
  • id:ibd1091
  • id:ibd5157
  • pck
  • pck1
  • pck2
  • pcl
  • pcxa
  • pgam1
  • pgam1a
  • pgam2
  • pgi-2
  • pgk1
  • sb:cb79
  • slc37a1
  • slc37a2
  • slc37a4
  • slc37a4a
  • tpi1b
  • wu:fa28b10
  • wu:fb10b11
  • wu:fb17g10
  • wu:fb57b01
  • wu:fb81h05
  • wu:fc09h05
  • wu:fc25d06
  • wu:fc51c05
  • wu:fd59b07
  • wu:fi32b03
  • wu:fj24f12
  • wu:fj36g06
  • wu:fj93h11
  • wu:fk58e02
  • zgc:101659
  • zgc:123047
  • zgc:56252
  • zgc:63869
  • zgc:63876
  • zgc:64127
  • zgc:73152
  • zgc:77098
  • zgc:77867
  • zgc:77899
  • zgc:92418
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis, secretion, and deacylation of Ghrelin
  • IGF-1
  • IGF-1L
  • IGF-1a
  • IGF-I
  • fa97f07
  • gh1
  • ghl
  • ghr
  • ghre
  • ghrl
  • goat
  • igf1
  • ins
  • lepb
  • mboat4
  • ob-b
  • pcsk1
  • sec11
  • sec11a
  • sec11l1
  • si:dkey-21o22.1
  • spcs1
  • spcs2
  • spcs3
  • wu:fa97f07
  • zgc:110014
  • zgc:85675
  • zgc:92805
Danio rerio (zebrafish)
Intestinal hexose absorption
  • glut2
  • slc2a2
  • slc5a1
  • wu:fb62h10
  • zgc:66074
  • zgc:85782
Danio rerio (zebrafish)
Lactose synthesis
  • b4galt1l
  • fc29a02
  • glut1
  • glut1a
  • glut1b
  • lys-C
  • lyz
  • slc2a1
  • slc2a1a
  • wu:fc29a02
  • zgc:136734
  • zgc:154116
Danio rerio (zebrafish)
Cellular hexose transport
  • fc29a02
  • glut1
  • glut10
  • glut12
  • glut1a
  • glut1b
  • glut2
  • mfsd4b
  • naglt1
  • rag1ap1
  • sb:cb753
  • sb:cb808
  • slc2a1
  • slc2a10
  • slc2a12
  • slc2a1a
  • slc2a2
  • slc2a3b
  • slc2a8
  • slc2a8l
  • slc45a3
  • slc50a1
  • slc5a1
  • slc5a2
  • slc5a9
  • wu:fb62h10
  • wu:fc29a02
  • zgc:56364
  • zgc:66074
  • zgc:85782
  • zgc:85792
Danio rerio (zebrafish)
Antimicrobial peptides
  • INTL1
  • INTL2
  • INTL3
  • LOC793075
  • PGRP-SC1a
  • im:7150573
  • intl2
  • intl3
  • itln1
  • itln2
  • itln3
  • leap2
  • lys-C
  • lyz
  • nkl.4
  • nkld
  • pglyrp2
  • pglyrp5
  • pgrp-l
  • rnasel2
  • rnasel3
  • rnasel4
  • si:ch211-139g14.6
  • si:ch211-194p6.4
  • si:ch211-202c21.3
  • si:dkey-113g17.4
  • si:rp71-40n14.1
  • wu:fj22b05
  • zgc:136734
  • zgc:153267
  • zgc:194626
  • zgc:194647
Danio rerio (zebrafish)
Hyaluronan uptake and degradation
  • hyal1
Danio rerio (zebrafish)
Hyaluronan biosynthesis and export
  • abcc5
  • fj51h02
  • si:ch1073-183g13.2
  • wu:fj51h02
Danio rerio (zebrafish)
Pentose phosphate pathway
  • RBKS
  • Tal
  • dera
  • fi03d03
  • ik:tdsubc_2c8
  • pgd
  • pgm2
  • rbks
  • rpe
  • rpia
  • taldo1
  • wu:fa07h08
  • wu:fb93d11
  • wu:fc20b11
  • wu:fc32g02
  • wu:fi03d03
  • xx:tdsubc_2c8
  • zgc:101610
  • zgc:103524
  • zgc:111848
  • zgc:55585
  • zgc:66054
  • zgc:77113
  • zgc:86813
Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024