GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 26 - 50 of 128 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Antimicrobial peptides
  • DDB_G0271242
  • DDB_G0278563
Dictyostelium discoideum
Neutrophil degranulation
  • ADA2
  • Arc15
  • Arp1
  • CP2
  • CP3
  • CP4
  • CP5
  • CP6
  • CP7
  • CatD
  • DDB_G0267590
  • DDB_G0267742
  • DDB_G0267752
  • DDB_G0267952
  • DDB_G0267974
  • DDB_G0268034
  • DDB_G0269380
  • DDB_G0269774
  • DDB_G0270134
  • DDB_G0270454
  • DDB_G0271242
  • DDB_G0272220
  • DDB_G0272434
  • DDB_G0272742
  • DDB_G0273095
  • DDB_G0273153
  • DDB_G0273419
  • DDB_G0273473
  • DDB_G0274339
  • DDB_G0274461
  • DDB_G0274833
  • DDB_G0275535
  • DDB_G0275917
  • DDB_G0276227
  • DDB_G0276567
  • DDB_G0276661
  • DDB_G0276961
  • DDB_G0277093
  • DDB_G0277773
  • DDB_G0277967
  • DDB_G0278295
  • DDB_G0278401
  • DDB_G0278487
  • DDB_G0278563
  • DDB_G0278773
  • DDB_G0279493
  • DDB_G0279583
  • DDB_G0279675
  • DDB_G0280557
  • DDB_G0280565
  • DDB_G0280643
  • DDB_G0280855
  • DDB_G0281053
  • DDB_G0281055
  • DDB_G0281325
  • DDB_G0281401
  • DDB_G0281675
  • DDB_G0282107
  • DDB_G0282109
  • DDB_G0282177
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  • DDB_G0282517
  • DDB_G0282683
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  • DDB_G0282991
  • DDB_G0283893
  • DDB_G0284155
  • DDB_G0284307
  • DDB_G0284753
  • DDB_G0284755
  • DDB_G0284997
  • DDB_G0285063
  • DDB_G0285639
  • DDB_G0285709
  • DDB_G0285897
  • DDB_G0286315
  • DDB_G0286691
  • DDB_G0286891
  • DDB_G0287185
  • DDB_G0287559
  • DDB_G0287731
  • DDB_G0288717
  • DDB_G0288795
  • DDB_G0288847
  • DDB_G0289029
  • DDB_G0289063
  • DDB_G0289195
  • DDB_G0289231
  • DDB_G0289735
  • DDB_G0289749
  • DDB_G0290593
  • DDB_G0290995
  • DDB_G0291131
  • DDB_G0291332
  • DDB_G0291524
  • DDB_G0291984
  • DDB_G0292160
  • DDB_G0293674
  • DDB_G0293678
  • DDB_G0294569
  • DDB_G0294571
  • DDB_G0294577
  • DDB_G0295811
  • DDB_G0295845
  • DG1029
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  • abcA2
  • abcA3
  • abcA4
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  • abcA6
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  • abp1-2
  • abpA
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  • abpE-1
  • abpE-2
  • acly
  • actnA
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  • agl
  • akt
  • alad
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  • ap2a1-2
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  • apm1
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  • arlE
  • armc8
  • arp10
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  • arp2
  • arpA
  • arpB
  • arpH
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  • calA
  • calB
  • camA
  • cand1
  • cap
  • cat
  • catA
  • cct2
  • cct8
  • cda
  • cdc7
  • cdcD
  • cdk9-1
  • cdk9-2
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  • cfaD
  • comG
  • commd3
  • copb
  • cpiA
  • cpiB
  • cpiC
  • cpl
  • cplA
  • cpnA
  • cpnB-1
  • cpnB-2
  • cpnC
  • cpnD
  • cpnE
  • cpnF
  • cprB
  • cprC
  • cprD
  • cprE
  • cprF
  • cprG
  • csnk2b
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  • dnajc3
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  • docB
  • docC
  • docD
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  • dstB
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  • erkA
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  • fip-2
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  • glpV
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  • napA
  • naprt
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  • nramp1
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  • ptp2
  • ptp3
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  • ptpA1-2
  • ptpB
  • ptpC
  • pyk
  • pykA
  • qpct
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  • racO
  • racP
  • racQ
  • rap1
  • rapA
  • rapB
  • rapC
  • rasGAP1
  • rcdC
  • rgaA
  • sapA
  • sas1
  • sas2
  • sasA
  • sasB
  • sevA
  • sks1
  • slc11a1
  • slc44a2
  • spiA
  • srp14-1
  • srp14-2
  • sybA
  • sybB
  • symA
  • tctel1
  • trappc1-1
  • trappc1-2
  • tubB
  • vatM
  • vatP
  • veg125
  • vilA
  • vilB
  • vilD
  • ypel
Dictyostelium discoideum
Degradation of the extracellular matrix
  • CP2
  • CP3
  • CP4
  • CP5
  • CP6
  • CP7
  • DDB_G0272742
  • DDB_G0278401
  • DDB_G0282991
  • cfaD
  • cprB
  • cprC
  • cprD
  • cprE
  • cprF
  • cprG
Dictyostelium discoideum
Lactose synthesis
  • DDB_G0277773
  • symA
Dictyostelium discoideum
FBXL7 down-regulates AURKA during mitotic entry and in early mitosis
  • AurB
  • Aurora
  • DDB_G0272951
  • M4
  • aurK
  • cul2
  • culB
  • dapA
  • dpr1
  • fp21A
  • fp21B
  • fpa1
  • fpa1A
  • fpa1B
  • fpa2
  • fpaA
  • fpaB-1
  • fpaB-2
  • prdD
  • prdE
  • prtC
  • prtD
  • psmA1
  • psmA2
  • psmA3
  • psmA4
  • psmA5
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  • psmB2
  • psmB3
  • psmB4-1
  • psmB4-2
  • psmB5
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  • psmB7
  • psmC1
  • psmC2
  • psmC3
  • psmC4
  • psmC6
  • psmD1
  • psmD10
  • psmD11
  • psmD12
  • psmD13
  • psmD14
  • psmD2
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  • psmD4
  • psmD6
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  • psmD8-1
  • psmD8-2
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  • psmE3
  • psmE4
  • psmF1
  • rbx1
  • skp1A
  • skp1B
  • sks1
  • tbp2
  • tbpB
  • ubqB
  • ubqC
  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • veg116
Dictyostelium discoideum
Synthesis of PC
  • D2
  • DDB_G0271730
  • DDB_G0276969
  • DDB_G0279717
  • DDB_G0282159
  • DDB_G0285555
  • DDB_G0288717
  • DDB_G0290229
  • DDB_G0291344
  • DG1056
  • abhd
  • captA
  • captB
  • captC
  • captD
  • cryS
  • ctl2
  • lipB
  • pemtA
  • slc44a2
Dictyostelium discoideum
Receptor Mediated Mitophagy
  • DDB_G0277699
  • DDB_G0286481
  • DDB_G0290491
  • apg1
  • apg12
  • apg5
  • apg8
  • atg1
  • atg12
  • atg5
  • atg8
  • casK
  • csnk2b
Dictyostelium discoideum
MHC class II antigen presentation
  • CP1
  • CP2
  • CP3
  • CP4
  • CP5
  • CP6
  • CP7
  • CatD
  • DDB_G0272742
  • DDB_G0274385
  • DDB_G0278401
  • DDB_G0282991
  • DDB_G0286055
  • DDB_G0291191
  • cfaD
  • cprA
  • cprB
  • cprC
  • cprD
  • cprE
  • cprF
  • cprG
  • ctsB
  • ctsD
  • gmsA
Dictyostelium discoideum
Reactions specific to the complex N-glycan synthesis pathway
  • DDB_G0276661
  • alfA
  • fut1
  • fut10
  • fut11
  • fut2
  • fut3
  • fut4
  • fut5
  • fut6
  • fut7
  • fut9
Dictyostelium discoideum
Digestion
  • DDB_G0291472
Dictyostelium discoideum
Hydrolysis of LPC
  • plbD
Dictyostelium discoideum
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation
  • DDB_G0268504
  • DDB_G0269704
  • DDB_G0270000
  • DDB_G0271372
  • DDB_G0271726
  • DDB_G0271956
  • DDB_G0272202
  • DDB_G0272218
  • DDB_G0272951
  • DDB_G0273381
  • DDB_G0273419
  • DDB_G0273451
  • DDB_G0273573
  • DDB_G0274897
  • DDB_G0275145
  • DDB_G0277011
  • DDB_G0277047
  • DDB_G0277053
  • DDB_G0277075
  • DDB_G0277249
  • DDB_G0277429
  • DDB_G0278049
  • DDB_G0278075
  • DDB_G0278671
  • DDB_G0278981
  • DDB_G0279003
  • DDB_G0279093
  • DDB_G0279435
  • DDB_G0279463
  • DDB_G0280089
  • DDB_G0280091
  • DDB_G0280347
  • DDB_G0280581
  • DDB_G0280895
  • DDB_G0281369
  • DDB_G0281657
  • DDB_G0281679
  • DDB_G0281833
  • DDB_G0282391
  • DDB_G0282479
  • DDB_G0283667
  • DDB_G0283893
  • DDB_G0283983
  • DDB_G0284145
  • DDB_G0284325
  • DDB_G0285063
  • DDB_G0285261
  • DDB_G0285581
  • DDB_G0285797
  • DDB_G0286289
  • DDB_G0286387
  • DDB_G0286991
  • DDB_G0287221
  • DDB_G0288345
  • DDB_G0288683
  • DDB_G0289043
  • DDB_G0289099
  • DDB_G0290547
  • DDB_G0290641
  • DDB_G0291131
  • DDB_G0291612
  • DDB_G0291902
  • DDB_G0291984
  • DDB_G0292144
  • DDB_G0292302
  • DDB_G0292362
  • DDB_G0292586
  • DDB_G0293756
  • DDB_G0295713
  • M4
  • anapc1
  • anapc10
  • anapc11
  • anapc2
  • anapc3
  • anapc4
  • anapc5
  • anapc6
  • anapc7
  • anapc8
  • apc1
  • apc10
  • apc11
  • apc2
  • apc3
  • apc4
  • apc5
  • apc6
  • apc7
  • apc8
  • apg7
  • atg7
  • cblA-1
  • cblA-2
  • cdc16
  • cdc20
  • cdc23
  • cdc26
  • cdc27
  • cdh1
  • cnrM
  • cul1
  • cul2
  • cul3
  • cul5
  • culA
  • culB
  • culC
  • culE
  • dapA
  • dpr1
  • fp21A
  • fp21B
  • fpa1
  • fpa1A
  • fpa1B
  • fpa2
  • fpaA
  • fpaB-1
  • fpaB-2
  • gacGG
  • hbx1
  • mip1-1
  • mip1-2
  • mtpn
  • nosA
  • prdD
  • prdE
  • prtC
  • prtD
  • psaA
  • psaB
  • psmA1
  • psmA2
  • psmA3
  • psmA4
  • psmA5
  • psmA6
  • psmA7
  • psmB2
  • psmB3
  • psmB4-1
  • psmB4-2
  • psmB5
  • psmB6
  • psmB7
  • psmC1
  • psmC2
  • psmC3
  • psmC4
  • psmC6
  • psmD1
  • psmD10
  • psmD11
  • psmD12
  • psmD13
  • psmD14
  • psmD2
  • psmD3
  • psmD4
  • psmD6
  • psmD7
  • psmD8-1
  • psmD8-2
  • psmD9
  • psmE3
  • psmE4
  • psmF1
  • rbrA
  • rbx1
  • rnf160
  • skp1A
  • skp1B
  • sks1
  • tbp2
  • tbpB
  • tceb1
  • tirA
  • triA
  • uae1
  • uba1
  • uba3
  • uba5
  • ubc2
  • ubcB
  • ubcC
  • ubch10
  • ube1c
  • ube2c
  • ube2j2
  • ube2m
  • ube2n
  • ube2s
  • ube2v
  • ube2w
  • ube3a
  • ubqB
  • ubqC
  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • veg116
  • warA
  • wri
Dictyostelium discoideum
Switching of origins to a post-replicative state
  • MCM7
  • mcm2
  • mcm3
  • mcm4
  • mcm5
  • mcm6
  • mcm7
Dictyostelium discoideum
Synthesis of very long-chain fatty acyl-CoAs
  • DDB_G0270106
  • DDB_G0270312
  • DDB_G0271066
  • DDB_G0272012
  • DDB_G0274669
  • DDB_G0275049
  • DDB_G0277569
  • DDB_G0278113
  • DDB_G0278683
  • DDB_G0288001
  • DDB_G0289539
  • eloA
  • fcsA
  • fcsB
  • gpsn2
  • sre1
Dictyostelium discoideum
DARPP-32 events
  • Pde4
  • pde2
  • pde3
  • regA
Dictyostelium discoideum
Glycogen breakdown (glycogenolysis)
  • agl
  • gaa
  • glpD
  • glpV
  • gtr3
  • pgmA
Dictyostelium discoideum
Negative regulation of MAPK pathway
  • DDB_G0267566
  • DDB_G0267686
  • DDB_G0268876
  • DDB_G0270200
  • DDB_G0271350
  • DDB_G0271860
  • DDB_G0272092
  • DDB_G0273199
  • DDB_G0282963
  • DDB_G0290471
  • DDB_G0291516
  • DDB_G0291664
  • DDB_G0292880
  • RacGEF
  • erk1
  • erkA
  • kxcB
  • mpl1
  • mpl2
  • mpl3
  • mrkC
  • phg2
  • ptp1
  • ptp2
  • ptp3
  • ptpA1-1
  • ptpA1-2
  • ptpB
  • ptpC
  • spkA-1
  • spkA-2
Dictyostelium discoideum
Fibronectin matrix formation
  • sadA
Dictyostelium discoideum
IRE1alpha activates chaperones
  • ireA
Dictyostelium discoideum
Events associated with phagocytolytic activity of PMN cells
  • poxA
Dictyostelium discoideum
Metal ion SLC transporters
  • DDB_G0282067
  • DDB_G0285545
  • nramp
  • nramp1
  • slc11a1
Dictyostelium discoideum
Regulation of TP53 Activity through Phosphorylation
  • DDB_G0286481
  • atr1
  • casK
  • csnk2b
  • dyrk2
  • spt16
  • ssrp
  • ssrp1
Dictyostelium discoideum
COPII-mediated vesicle transport
  • DDB_G0268044
  • DDB_G0268452
  • DDB_G0269584
  • DDB_G0269942
  • DDB_G0270566
  • DDB_G0271968
  • DDB_G0274803
  • DDB_G0275331
  • DDB_G0276935
  • DDB_G0281693
  • DDB_G0282433
  • DDB_G0283055
  • DDB_G0286167
  • DDB_G0291694
  • DDB_G0293712
  • cak1-1
  • cak1-2
  • cnrM
  • ctsZ
  • gmsA
  • grpA
  • nsfA
  • ppp6c
  • pppD
  • rab1A
  • rab1B
  • rab1D
  • rab1E
  • rabA
  • rabF1-1
  • rabF1-2
  • rabS
  • rabU
  • rabW
  • rabY
  • rsmM
  • sarA
  • scfd1
  • sec13
  • sec23
  • sec24
  • sec24l
  • sec31
  • snpA
  • snpC
  • syn5
  • syn7
  • syn7A
  • tmem1-1
  • tmem1-2
  • trapcc10-1
  • trapcc10-2
  • trappc1-1
  • trappc1-2
  • trappc2
  • trappc2l
  • trappc3
  • trappc4
  • trappc5
  • wimA
Dictyostelium discoideum
Cyclin D associated events in G1
  • DDB_G0279813
  • E2F
  • PP2A
  • PP2Ac
  • Rb
  • cks1
  • cul2
  • culB
  • fp21A
  • fp21B
  • fpa1
  • fpa1A
  • fpa1B
  • fpa2
  • fpaA
  • fpaB-1
  • fpaB-2
  • pho2a
  • phr2aB
  • pppA
  • pppD
  • rblA
  • rcdB
  • skp1A
  • skp1B
  • tfdp2
  • ubqB
  • ubqC
  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • veg116
  • veg124
Dictyostelium discoideum
Regulation of insulin secretion
  • DDB_G0277773
  • symA
Dictyostelium discoideum

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Last updated: August 19, 2024