GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1 - 25 of 128 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Neutrophil degranulation
  • ADA2
  • Arc15
  • Arp1
  • CP2
  • CP3
  • CP4
  • CP5
  • CP6
  • CP7
  • CatD
  • DDB_G0267590
  • DDB_G0267742
  • DDB_G0267752
  • DDB_G0267952
  • DDB_G0267974
  • DDB_G0268034
  • DDB_G0269380
  • DDB_G0269774
  • DDB_G0270134
  • DDB_G0270454
  • DDB_G0271242
  • DDB_G0272220
  • DDB_G0272434
  • DDB_G0272742
  • DDB_G0273095
  • DDB_G0273153
  • DDB_G0273419
  • DDB_G0273473
  • DDB_G0274339
  • DDB_G0274461
  • DDB_G0274833
  • DDB_G0275535
  • DDB_G0275917
  • DDB_G0276227
  • DDB_G0276567
  • DDB_G0276661
  • DDB_G0276961
  • DDB_G0277093
  • DDB_G0277773
  • DDB_G0277967
  • DDB_G0278295
  • DDB_G0278401
  • DDB_G0278487
  • DDB_G0278563
  • DDB_G0278773
  • DDB_G0279493
  • DDB_G0279583
  • DDB_G0279675
  • DDB_G0280557
  • DDB_G0280565
  • DDB_G0280643
  • DDB_G0280855
  • DDB_G0281053
  • DDB_G0281055
  • DDB_G0281325
  • DDB_G0281401
  • DDB_G0281675
  • DDB_G0282107
  • DDB_G0282109
  • DDB_G0282177
  • DDB_G0282179
  • DDB_G0282517
  • DDB_G0282683
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  • DDB_G0282991
  • DDB_G0283893
  • DDB_G0284155
  • DDB_G0284307
  • DDB_G0284753
  • DDB_G0284755
  • DDB_G0284997
  • DDB_G0285063
  • DDB_G0285639
  • DDB_G0285709
  • DDB_G0285897
  • DDB_G0286315
  • DDB_G0286691
  • DDB_G0286891
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  • DDB_G0287559
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  • DDB_G0288717
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  • DDB_G0288847
  • DDB_G0289029
  • DDB_G0289063
  • DDB_G0289195
  • DDB_G0289231
  • DDB_G0289735
  • DDB_G0289749
  • DDB_G0290593
  • DDB_G0290995
  • DDB_G0291131
  • DDB_G0291332
  • DDB_G0291524
  • DDB_G0291984
  • DDB_G0292160
  • DDB_G0293674
  • DDB_G0293678
  • DDB_G0294569
  • DDB_G0294571
  • DDB_G0294577
  • DDB_G0295811
  • DDB_G0295845
  • DG1029
  • Rab1C
  • abcA2
  • abcA3
  • abcA4
  • abcA5
  • abcA6
  • abp1-1
  • abp1-2
  • abpA
  • abpD
  • abpE-1
  • abpE-2
  • acly
  • actnA
  • actnB
  • actr10
  • actr11
  • agl
  • akt
  • alad
  • alfA
  • amdA
  • ann7
  • ap2a1-1
  • ap2a1-2
  • apg7
  • apm1
  • arcE
  • arl8
  • arlE
  • armc8
  • arp10
  • arp11
  • arp2
  • arpA
  • arpB
  • arpH
  • atg7
  • atp6v1d
  • calA
  • calB
  • camA
  • cand1
  • cap
  • cat
  • catA
  • cct2
  • cct8
  • cda
  • cdc7
  • cdcD
  • cdk9-1
  • cdk9-2
  • cf60
  • cfaD
  • comG
  • commd3
  • copb
  • cpiA
  • cpiB
  • cpiC
  • cpl
  • cplA
  • cpnA
  • cpnB-1
  • cpnB-2
  • cpnC
  • cpnD
  • cpnE
  • cpnF
  • cprB
  • cprC
  • cprD
  • cprE
  • cprF
  • cprG
  • csnk2b
  • cspA
  • ctl2
  • ctnC
  • ctsB
  • ctsD
  • ctsZ
  • cyb5r1
  • dagA
  • ddi
  • ddiA
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  • ddx3
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  • dhcA
  • dlcA
  • dlcB
  • dnajc13
  • dnajc3
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  • docB
  • docC
  • docD
  • dst2
  • dstB
  • dync1li1
  • eef1a1
  • eef1a2
  • efaAI
  • efaAII
  • efaa1
  • efaa2
  • efbA
  • erk1
  • erkA
  • fba
  • fip-1
  • fip-2
  • g6pi
  • gaa
  • gacJJ
  • gapA
  • gghB
  • gip17
  • glb1
  • glpD
  • glpV
  • gmfA
  • gmsA
  • gnrA
  • gnrB
  • gnrC
  • gpi
  • gpmA
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  • gsta2-1
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  • guk
  • hemB
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  • hspB
  • hspD
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  • hspE-2
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  • impdh
  • ku70
  • ku80
  • lipA
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  • lmpA
  • lmpB
  • lmpC
  • lvsC
  • manA
  • mapbpip
  • melA
  • mlcD
  • mvpA
  • nap1
  • napA
  • naprt
  • ncstn
  • ndkA
  • ndkB
  • ndkC-1
  • ndkC-2
  • ndkM
  • nhp6
  • nit2
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  • noxB
  • noxC
  • nramp
  • nramp1
  • nxnA
  • nxnB
  • orfR1062
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  • ost48
  • p2xA
  • p2xB
  • p2xC
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  • pgmB
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  • pirA
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  • pldA
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  • psmD2
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  • psmD7
  • ptp1
  • ptp2
  • ptp3
  • ptpA1-1
  • ptpA1-2
  • ptpB
  • ptpC
  • pyk
  • pykA
  • qpct
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  • rab18
  • rab24
  • rab32D
  • rab4
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  • rab6
  • rab7
  • rab7A
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  • rabL
  • rabM
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  • rabN2
  • rabR
  • rabT1
  • rabT2
  • rabV
  • rabX
  • rabZ
  • rac1A
  • rac1B
  • rac1C
  • racB
  • racC
  • racD
  • racE
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  • racI
  • racJ
  • racL
  • racM
  • racN
  • racO
  • racP
  • racQ
  • rap1
  • rapA
  • rapB
  • rapC
  • rasGAP1
  • rcdC
  • rgaA
  • sapA
  • sas1
  • sas2
  • sasA
  • sasB
  • sevA
  • sks1
  • slc11a1
  • slc44a2
  • spiA
  • srp14-1
  • srp14-2
  • sybA
  • sybB
  • symA
  • tctel1
  • trappc1-1
  • trappc1-2
  • tubB
  • vatM
  • vatP
  • veg125
  • vilA
  • vilB
  • vilD
  • ypel
Dictyostelium discoideum
Detoxification of Reactive Oxygen Species
  • DDB_G0273153
  • DDB_G0282517
  • DDB_G0284939
  • cat
  • catA
  • ccs
  • ccsA
  • cytC
  • gsr
  • gsta1
  • gsta2-1
  • gsta2-2
  • gsta3
  • gsta4
  • gsta5
  • noxA
  • noxB
  • noxC
  • prdx4
  • prdx5
  • sod2
  • sodB
  • sodC
  • sodD
  • sodE
  • sodF
  • trx3
  • trx4
  • trxC
  • trxD
Dictyostelium discoideum
Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol
  • DDB_G0275865
  • DDB_G0281737
  • DDB_G0285967
  • DDB_G0292920
  • Dd5P1
  • Dd5P3
  • Dd5P4
  • ITPK1
  • calA
  • calB
  • camA
  • cnrN
  • mlcD
  • pipA
  • plc
  • pld3
  • pldY
  • pldZ
  • pteN
  • ptenA
Dictyostelium discoideum
G alpha (q) signalling events
  • DDB_G0270858
  • DDB_G0273033
  • DDB_G0278897
  • DDB_G0282583
  • DDB_G0286173
  • DDB_G0286817
  • Ga3
  • gbqA
  • gpa10
  • gpa11
  • gpa12
  • gpaA
  • gpaB
  • gpaC
  • gpaD
  • gpaE
  • gpaF
  • gpaG
  • gpaH
  • gpaJ
  • gpaK
  • gpaL
  • pipA
  • plc
Dictyostelium discoideum
PLC beta mediated events
  • Ga3
  • gbqA
  • gpa10
  • gpa11
  • gpa12
  • gpaA
  • gpaB
  • gpaC
  • gpaD
  • gpaE
  • gpaF
  • gpaG
  • gpaH
  • gpaJ
  • gpaK
  • gpaL
  • pipA
  • plc
Dictyostelium discoideum
TP53 Regulates Metabolic Genes
  • DDB_G0274833
  • DDB_G0279427
  • DDB_G0280527
  • DDB_G0283567
  • DDB_G0288795
  • DDB_G0291948
  • DDB_G0292160
  • akt
  • ampka
  • dagA
  • fttB
  • g6pd-1
  • g6pd-2
  • g6pi
  • gpi
  • gsr
  • lst8
  • mapbpip
  • mrkB
  • pgi
  • pkbA
  • prdx4
  • prdx5
  • prkaa
  • prkab
  • prkag
  • ragA
  • ragC
  • raptor
  • rheb
  • snfA
  • tor
  • trx3
  • trx4
  • trxC
  • trxD
  • zwf
Dictyostelium discoideum
Regulation of HSF1-mediated heat shock response
  • DDB_G0278179
  • DDB_G0281165
  • DDB_G0281747
  • DDB_G0285709
  • DDB_G0293674
  • DDB_G0293678
  • bip2
  • erk1
  • erkA
  • fttB
  • gsk3
  • gskA
  • hsc70
  • hsp70
  • hspB
  • hspE-1
  • hspE-2
  • hspH
  • mhsp70
Dictyostelium discoideum
Peroxisomal protein import
  • DDB_G0268018
  • DDB_G0274339
  • DDB_G0275415
  • DDB_G0277335
  • DDB_G0277477
  • DDB_G0279049
  • DDB_G0280851
  • DDB_G0282495
  • DDB_G0287851
  • DDB_G0290089
  • DDB_G0290277
  • DDB_G0290547
  • acox1
  • agxt
  • cat
  • catA
  • ddo-1
  • ddo-2
  • ech1
  • hacl1
  • haox
  • hmgL
  • idhM
  • mfe2
  • mfeB
  • pex10
  • pex12
  • pex13
  • pex14
  • pex5
  • pex7
  • redB
  • ubcB
  • ubqB
  • ubqC
  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • veg116
Dictyostelium discoideum
Glyoxylate metabolism and glycine degradation
  • aatA
  • agxt
  • ddo-1
  • ddo-2
  • haox
  • prodh
Dictyostelium discoideum
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation
  • DDB_G0268504
  • DDB_G0269704
  • DDB_G0270000
  • DDB_G0271372
  • DDB_G0271726
  • DDB_G0271956
  • DDB_G0272202
  • DDB_G0272218
  • DDB_G0272951
  • DDB_G0273381
  • DDB_G0273419
  • DDB_G0273451
  • DDB_G0273573
  • DDB_G0274897
  • DDB_G0275145
  • DDB_G0277011
  • DDB_G0277047
  • DDB_G0277053
  • DDB_G0277075
  • DDB_G0277249
  • DDB_G0277429
  • DDB_G0278049
  • DDB_G0278075
  • DDB_G0278671
  • DDB_G0278981
  • DDB_G0279003
  • DDB_G0279093
  • DDB_G0279435
  • DDB_G0279463
  • DDB_G0280089
  • DDB_G0280091
  • DDB_G0280347
  • DDB_G0280581
  • DDB_G0280895
  • DDB_G0281369
  • DDB_G0281657
  • DDB_G0281679
  • DDB_G0281833
  • DDB_G0282391
  • DDB_G0282479
  • DDB_G0283667
  • DDB_G0283893
  • DDB_G0283983
  • DDB_G0284145
  • DDB_G0284325
  • DDB_G0285063
  • DDB_G0285261
  • DDB_G0285581
  • DDB_G0285797
  • DDB_G0286289
  • DDB_G0286387
  • DDB_G0286991
  • DDB_G0287221
  • DDB_G0288345
  • DDB_G0288683
  • DDB_G0289043
  • DDB_G0289099
  • DDB_G0290547
  • DDB_G0290641
  • DDB_G0291131
  • DDB_G0291612
  • DDB_G0291902
  • DDB_G0291984
  • DDB_G0292144
  • DDB_G0292302
  • DDB_G0292362
  • DDB_G0292586
  • DDB_G0293756
  • DDB_G0295713
  • M4
  • anapc1
  • anapc10
  • anapc11
  • anapc2
  • anapc3
  • anapc4
  • anapc5
  • anapc6
  • anapc7
  • anapc8
  • apc1
  • apc10
  • apc11
  • apc2
  • apc3
  • apc4
  • apc5
  • apc6
  • apc7
  • apc8
  • apg7
  • atg7
  • cblA-1
  • cblA-2
  • cdc16
  • cdc20
  • cdc23
  • cdc26
  • cdc27
  • cdh1
  • cnrM
  • cul1
  • cul2
  • cul3
  • cul5
  • culA
  • culB
  • culC
  • culE
  • dapA
  • dpr1
  • fp21A
  • fp21B
  • fpa1
  • fpa1A
  • fpa1B
  • fpa2
  • fpaA
  • fpaB-1
  • fpaB-2
  • gacGG
  • hbx1
  • mip1-1
  • mip1-2
  • mtpn
  • nosA
  • prdD
  • prdE
  • prtC
  • prtD
  • psaA
  • psaB
  • psmA1
  • psmA2
  • psmA3
  • psmA4
  • psmA5
  • psmA6
  • psmA7
  • psmB2
  • psmB3
  • psmB4-1
  • psmB4-2
  • psmB5
  • psmB6
  • psmB7
  • psmC1
  • psmC2
  • psmC3
  • psmC4
  • psmC6
  • psmD1
  • psmD10
  • psmD11
  • psmD12
  • psmD13
  • psmD14
  • psmD2
  • psmD3
  • psmD4
  • psmD6
  • psmD7
  • psmD8-1
  • psmD8-2
  • psmD9
  • psmE3
  • psmE4
  • psmF1
  • rbrA
  • rbx1
  • rnf160
  • skp1A
  • skp1B
  • sks1
  • tbp2
  • tbpB
  • tceb1
  • tirA
  • triA
  • uae1
  • uba1
  • uba3
  • uba5
  • ubc2
  • ubcB
  • ubcC
  • ubch10
  • ube1c
  • ube2c
  • ube2j2
  • ube2m
  • ube2n
  • ube2s
  • ube2v
  • ube2w
  • ube3a
  • ubqB
  • ubqC
  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • veg116
  • warA
  • wri
Dictyostelium discoideum
ABC-family proteins mediated transport
  • DDB_G0272951
  • M4
  • abcA2
  • abcA3
  • abcA4
  • abcA5
  • abcA6
  • abcB2
  • abcB3
  • abcB6
  • abcB7
  • abcC1
  • abcC10
  • abcC12
  • abcC13
  • abcC14
  • abcC15
  • abcC2
  • abcC3
  • abcC5
  • abcC6
  • abcC7
  • abcC8
  • abcC9
  • abcF4
  • dapA
  • dpr1
  • eif2G
  • eif2a
  • eif2b
  • eif2s1
  • eif2s2
  • eif2s3
  • prdD
  • prdE
  • prtC
  • prtD
  • psmA1
  • psmA2
  • psmA3
  • psmA4
  • psmA5
  • psmA6
  • psmA7
  • psmB2
  • psmB3
  • psmB4-1
  • psmB4-2
  • psmB5
  • psmB6
  • psmB7
  • psmC1
  • psmC2
  • psmC3
  • psmC4
  • psmC6
  • psmD1
  • psmD10
  • psmD11
  • psmD12
  • psmD13
  • psmD14
  • psmD2
  • psmD3
  • psmD4
  • psmD6
  • psmD7
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Dictyostelium discoideum
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Dictyostelium discoideum
FBXL7 down-regulates AURKA during mitotic entry and in early mitosis
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Dictyostelium discoideum
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Dictyostelium discoideum
Orc1 removal from chromatin
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Dictyostelium discoideum
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Dictyostelium discoideum
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Dictyostelium discoideum
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Dictyostelium discoideum
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Dictyostelium discoideum
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Dictyostelium discoideum
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Dictyostelium discoideum
Fatty acyl-CoA biosynthesis
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Dictyostelium discoideum
Macroautophagy
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Dictyostelium discoideum
Pentose phosphate pathway
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  • rpiA
  • tal
  • zwf
Dictyostelium discoideum

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Last updated: August 19, 2024