GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 251 - 275 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Interleukin-12 signaling
  • IL12A
  • IL12B
  • IL12RB1
  • IL12RB2
  • JAK1
  • JAK2
  • LOC100736717
  • P4HB
  • STAT4
  • TYK2
  • stat4
Sus scrofa (pig)
Inactivation of CSF3 (G-CSF) signaling
  • CSF3
  • CSF3R
  • HCK
  • JAK1
  • JAK2
  • LYN
  • TYK2
Sus scrofa (pig)
IFNG signaling activates MAPKs
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • JAK1
  • JAK2
  • MAPK1
  • MAPK3
Sus scrofa (pig)
Signaling by CSF3 (G-CSF)
  • CSF3
  • CSF3R
  • GAB2
  • GRB2
  • HCK
  • JAK1
  • JAK2
  • KRAS
  • LYN
  • PTPN11
  • SHC1
  • TYK2
Sus scrofa (pig)
Interleukin receptor SHC signaling
  • CSF2
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • GAB2
  • GRB2
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL2RG
  • IL5
  • IL5RA
  • INPP5D
  • INPPL1
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
Interleukin-10 signaling
  • IL10
  • IL10RA
  • IL10RB
  • JAK1
  • STAT3
  • TYK2
Sus scrofa (pig)
Other interleukin signaling
  • CD4
  • CSF1
  • CSF1R
  • CSF3
  • CSF3R
  • IFNLR1
  • IL10RB
  • IL16
  • IL29
  • IL34
  • JAK1
  • PTPRZ1
  • SDC1
  • STX1A
  • STX3
  • STX4
  • STXBP2
  • TXLNA
  • TYK2
  • VAMP2
Sus scrofa (pig)
Regulation of IFNG signaling
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • JAK1
  • JAK2
  • PIAS1
  • PTPN2
  • SOCS1
  • SOCS3
  • STAT1
  • SUMO1
  • socs1
Sus scrofa (pig)
Interferon gamma signaling
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • JAK1
  • JAK2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKCD
  • SOCS1
  • SOCS3
  • STAT1
  • socs1
Sus scrofa (pig)
Interleukin-4 and Interleukin-13 signaling
  • HSP90B1
  • IL13
  • IL13RA1
  • IL13RA2
  • IL2RG
  • IL4
  • IL4R
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • SOCS1
  • SOCS5
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT6
  • TYK2
  • socs1
Sus scrofa (pig)
COPII-mediated vesicle transport
  • ANKRD28
  • AREG
  • CD59
  • CNIH1
  • CNIH3
  • COL7A1
  • CTSZ
  • F5
  • FOLR1
  • FOLR3
  • GOLGA2
  • GORASP1
  • GOSR2
  • GRIA1
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • MCFD2
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NSF
  • PPP6C
  • PPP6R1
  • PPP6R3
  • PREB
  • SAR1B
  • SCFD1
  • SEC13
  • SEC16A
  • SEC16B
  • SEC22C
  • SEC23A
  • SEC23IP
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SERPINA1
  • TFG
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
  • TRAPPC10
  • TRAPPC2
  • TRAPPC2L
  • TRAPPC3
  • TRAPPC4
  • TRAPPC5
  • TRAPPC6A
  • TRAPPC9
  • UABP-2
  • USO1
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
VEGFA-VEGFR2 Pathway
  • ABI1
  • ABI2
  • AXL
  • BAIAP2
  • BCAR1
  • BRK1
  • CDC42
  • CRK
  • CYBA
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DOCK1
  • ELMO2
  • FYN
  • GP91-PHOX
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPB1
  • HSPCA
  • ITGAV
  • ITGB3
  • KDR
  • MAPK11
  • MAPK12
  • MAPK13
  • MAPK14
  • MAPKAPK2
  • MAPKAPK3
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCK1
  • NCK2
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • PAK2
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTK2B
  • PXN
  • RAC1
  • RHOA
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SH2D2A
  • SHB
  • SHC2
  • SRC
  • VAV1
  • VAV2
  • VEGFA
  • WASF2
  • WASF3
Sus scrofa (pig)
MTOR signalling
  • AKT1S1
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • MLST8
  • MTOR
  • RHEB
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SLC38A9
  • YWHAB
Sus scrofa (pig)
ESR-mediated signaling
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FKBP4
  • FKBP5
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPCA
  • NR3A1
  • PPP5C
  • PTGES3
Sus scrofa (pig)
The NLRP3 inflammasome
  • HSP90AB1
  • NLRP3
  • P2RX7
  • PANX
  • PANX1
  • TXN
  • TXNIP
Sus scrofa (pig)
DDX58/IFIH1-mediated induction of interferon-alpha/beta
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPCA
  • IRF3
  • MAVS
  • TBK1
  • TOMM70
Sus scrofa (pig)
HSF1-dependent transactivation
  • AKT1S1
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CRYAB
  • HSBP1
  • HSF1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPA1B
  • HSPA1L
  • HSPA8
  • HSPB8
  • HSPCA
  • MLST8
  • MTOR
  • RPTOR
Sus scrofa (pig)
Generation of second messenger molecules
  • CD101
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • DRA
  • FYB1
  • GRAP2
  • HLA-DRA
  • LAT
  • LCK
  • LCP2
  • LOC100153139
  • NCK1
  • PAK1
  • PAK2
  • PLCG1
  • PLCG2
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
Sus scrofa (pig)
Translocation of ZAP-70 to Immunological synapse
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • DRA
  • HLA-DRA
  • LCK
  • LOC100153139
  • PTPN22
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
Sus scrofa (pig)
Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • DRA
  • HLA-DRA
  • LCK
  • LOC100153139
  • PAG1
  • PTPN22
  • PTPRC
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
Sus scrofa (pig)
PD-1 signaling
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • DRA
  • HLA-DRA
  • LCK
  • LOC100153139
  • PDCD1
  • PDCD1LG2
  • PTPN11
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
Sus scrofa (pig)
Downstream TCR signaling
  • BCL10
  • CARD11
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CHUK
  • DRA
  • HLA-DRA
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • INPP5D
  • LCK
  • LMP2
  • LOC100153139
  • MALT1
  • MAP3K7
  • NFKB1
  • NFKBIA
  • PDPK1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRORP
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB3
  • PSMB7
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC3
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • PTEN
  • RELA
  • RIPK2
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
  • TAB2
  • TAK1b
  • TRAF6
  • UBE2NL
Sus scrofa (pig)
Ion homeostasis
  • AHCYL1
  • ASPH
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • CALM3
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • DMPK
  • FKBP1B
  • FXYD1
  • FXYD6
  • ITPR1
  • ITPR3
  • NOS1
  • PLM
  • PLN
  • RYR2
  • RYR3
  • SLC8A2
  • SLC8A3
  • SRI
  • STIM1
  • TRDN
  • TRPC1
Sus scrofa (pig)
Platelet homeostasis
  • P2RX1
  • P2RX2
  • P2RX3
  • P2RX4
  • P2RX5
  • P2RX6
  • P2RX7
  • PAFAH2
Sus scrofa (pig)
Dissolution of Fibrin Clot
  • ANXA2
  • HRG
  • PAI1
  • PLANH1
  • PLAT
  • PLAU
  • PLG
  • S100A10
  • SERPINB2
  • SERPINB6
  • SERPINB8
  • SERPINE1
  • SERPINE2
  • SERPINF2
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


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Last updated: August 19, 2024