GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 301 - 325 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
Vitamin B2 (riboflavin) metabolism
  • ACP5
  • ENPP1
  • FLAD1
  • RFK
  • SLC52A1
  • SLC52A2
  • SLC52A3
Sus scrofa (pig)
Chemokine receptors bind chemokines
  • ACKR2
  • ACKR3
  • ACKR4
  • CCL1
  • CCL17
  • CCL2
  • CCL20
  • CCL21
  • CCL22
  • CCL25
  • CCL27
  • CCL3L1
  • CCL4
  • CCL5
  • CCR1
  • CCR10
  • CCR2
  • CCR3
  • CCR4
  • CCR5
  • CCR6
  • CCR7
  • CCR9
  • CCRL1
  • CCRL2
  • CCXCR1
  • CXCL10
  • CXCL12
  • CXCL13
  • CXCL16
  • CXCL2
  • CXCL7
  • CXCL8
  • CXCL9
  • CXCR2
  • CXCR3
  • CXCR4
  • CXCR5
  • CXCR6
  • IL8
  • LOC100525396
  • MIP1B
  • PPBP
  • SCY4A
  • SCYA2
  • SCYB7
  • XCL1
  • XCR1
Sus scrofa (pig)
Peptide ligand-binding receptors
  • ACKR1
  • AGT
  • AGTR1
  • APLN
  • C3
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • CCK
  • CCKAR
  • CXCL8
  • ECE1
  • ECE2
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • GALR2
  • GALR3
  • GPER1
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GRP
  • GRPR
  • IL8
  • KEL
  • MC1R
  • MC2R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • NLN
  • NMB
  • NMBR
  • NMU
  • NMUR1
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPBWR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NPW
  • NPY
  • NPY Y4
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • NPYR5
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • OPRD1
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • PDYN
  • PMCH
  • PNOC
  • POMC
  • PPL8
  • PPYR1
  • PRLH
  • PRLHR
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR1
  • PROKR2
  • PSAP
  • PYY
  • SST
  • SSTR2
  • SSTR3
  • SSTR5
  • TRH
  • TRHR
  • UTS2
  • UTS2R
  • XK
Sus scrofa (pig)
Apoptotic cleavage of cellular proteins
  • ACIN1
  • APC
  • BCAP31
  • BIRC2
  • BMX
  • CASP6
  • CASP7
  • CASP8
  • CLSPN
  • PRKCD
  • ROCK1
  • SATB1
  • STK24
Sus scrofa (pig)
Neurotransmitter clearance
  • ACHE
  • OCT2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
Sus scrofa (pig)
Sphingolipid catabolism
  • ACER1
  • ACER2
  • ACER3
  • ALDH3A2
  • ALDH3B1
  • ALDH3B2
  • LPP1
  • PLPP1
  • PLPP3
  • PPAP2A
  • SGPL1
  • SGPP1
  • SGPP2
Sus scrofa (pig)
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • ACE
  • ACE2
  • AGT
  • ATP6AP2
  • CES1
  • CTSD
  • CTSZ
  • ENPEP
  • LOC100154047
  • LOC100736962
  • MME
  • REN
Sus scrofa (pig)
Golgi Associated Vesicle Biogenesis
  • ACBD3
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S3
  • AP3B1
  • AP3S1
  • AP4B1
  • AP4E1
  • ARF1
  • ARRB1
  • BLOC1S3
  • BLOC1S6
  • CLTA
  • CLTC
  • CPD
  • DNM2
  • DTNBP1
  • GAK
  • GOLGB1
  • HIP1R
  • IGF2R
  • NAPA
  • NECAP1
  • OCRL
  • PICALM
  • PIK3C2A
  • PLDN
  • SNAPIN
  • SNX2
  • SNX5
  • SNX9
  • SORT1
  • TBC1D8B
  • TFRC
  • TPD52
  • TPD52L1
  • TXNDC5
  • VAMP2
  • VAMP8
  • YIPF6
Sus scrofa (pig)
Keratan sulfate degradation
  • ACAN
  • FMOD
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GNS
  • HEXA
  • HEXB
  • KERA
  • LUM
  • OGN
  • OMD
  • PRELP
Sus scrofa (pig)
Keratan sulfate biosynthesis
  • ACAN
  • B3GNT2
  • B3GNT4
  • B3GNT7
  • B4GALT1
  • B4GALT2
  • B4GALT3
  • B4GALT4
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • B4GAT1
  • CHST1
  • CHST2
  • FMOD
  • KERA
  • LOC100522551
  • LUM
  • OGN
  • OMD
  • PRELP
  • SLC35D2
  • ST3GAL-III
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
Sus scrofa (pig)
ECM proteoglycans
  • ACAN
  • AGRN
  • BCAN
  • BGN
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COMP
  • DCN
  • DMP1
  • HAPLN1
  • ITGA2
  • ITGA2B
  • ITGA7
  • ITGA8
  • ITGA9
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • MATN1
  • MATN3
  • MATN4
  • NCAN
  • PAI1
  • PLANH1
  • SERPINE1
  • SPARC
  • TNC
  • TNN
  • TNXB
  • VCAN
  • VTN
Sus scrofa (pig)
CDC42 GTPase cycle
  • ABR
  • ARAP1
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARFGAP2
  • ARFGAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP17
  • ARHGAP20
  • ARHGAP21
  • ARHGAP22
  • ARHGAP24
  • ARHGAP26
  • ARHGAP27
  • ARHGAP29
  • ARHGAP30
  • ARHGAP31
  • ARHGAP33
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP4
  • ARHGAP44
  • ARHGAP45
  • ARHGAP5
  • ARHGAP9
  • ARHGDIA
  • ARHGDIG
  • ARHGEF10
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF15
  • ARHGEF16
  • ARHGEF19
  • ARHGEF25
  • ARHGEF26
  • ARHGEF5
  • ARHGEF6
  • ARHGEF7
  • ARHGEF9
  • BAIAP2
  • BCR
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPA
  • CDC42BPB
  • CDC42EP1
  • CDC42EP2
  • CDC42EP3
  • CDC42EP4
  • CDC42EP5
  • CDC42SE2
  • CHN1
  • CPNE8
  • DAAM1
  • DEF6
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DNMBP
  • DOCK10
  • DOCK11
  • DOCK6
  • DOCK7
  • DOCK8
  • DOCK9
  • ECT2
  • FAM13B
  • FARP1
  • FGD1
  • FGD2
  • FGD3
  • FGD4
  • FMNL1
  • FMNL2
  • FMNL3
  • FNBP1
  • FNBP1L
  • GIT1
  • GIT2
  • GMIP
  • GNA13
  • GOLGA2
  • IQGAP2
  • IQGAP3
  • ITSN1
  • JUP
  • Jup
  • KCTD3
  • KTN1
  • LAMTOR1
  • LBR
  • MAP3K11
  • MCF2
  • MCF2L
  • MYO9B
  • NGEF
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK5
  • PAK6
  • PARD6A
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLD1
  • PLEKHG1
  • PLEKHG2
  • PLEKHG3
  • PREX1
  • PREX2
  • RAB7A
  • RACGAP1
  • RASGRF2
  • SCRIB
  • SH3PXD2A
  • SHKBP1
  • SNAP23
  • SRGAP1
  • SRGAP2
  • SRGAP3
  • STARD8
  • STEAP3
  • STOM
  • SYDE1
  • TAGAP
  • TFRC
  • TIAM1
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAV2
  • WASL
  • WDR81
  • WDR91
  • WIPF1
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
G alpha (12/13) signalling events
  • ABR
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1D
  • AKAP13
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF15
  • ARHGEF16
  • ARHGEF17
  • ARHGEF18
  • ARHGEF19
  • ARHGEF2
  • ARHGEF25
  • ARHGEF26
  • ARHGEF3
  • ARHGEF33
  • ARHGEF37
  • ARHGEF38
  • ARHGEF39
  • ARHGEF5
  • ARHGEF6
  • ARHGEF7
  • ARHGEF9
  • BTK
  • ECT2
  • FGD1
  • FGD2
  • FGD3
  • FGD4
  • GNA12
  • GNA13
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • ITSN1
  • LOC100621431
  • LOC110255211
  • MCF2
  • MCF2L
  • NET1
  • NGEF
  • PLEKHG2
  • PLEKHG5
  • PLXNB1
  • PREX1
  • RASGRF2
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SOS1
  • SOS2
  • TBXA2R
  • TIAM1
  • TIAM2
  • TRIO
  • VAV1
  • VAV2
  • alpha-1A
Sus scrofa (pig)
RHOB GTPase cycle
  • ABR
  • ACTC1
  • AKAP13
  • ANLN
  • ARHGAP1
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • ARHGDIG
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF17
  • ARHGEF2
  • ARHGEF25
  • ARHGEF28
  • ARHGEF3
  • ARHGEF5
  • BCR
  • CAV1
  • CAVIN1
  • CIT
  • DAAM1
  • DEPDC1B
  • DIAPH1
  • DIAPH3
  • DLC1
  • ECT2
  • FLOT1
  • FLOT2
  • IQGAP3
  • JUP
  • Jup
  • MCAM
  • MCF2
  • MCF2L
  • MYO9A
  • MYO9B
  • NET1
  • OPHN1
  • PCDH7
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKN1
  • PKN2
  • PKN3
  • PREX1
  • RACGAP1
  • RHOB
  • RHPN2
  • ROCK1
  • ROCK2
  • RTKN
  • SLK
  • SNAP23
  • STARD8
  • STOM
  • TFRC
  • TJP2
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAV2
Sus scrofa (pig)
VEGFA-VEGFR2 Pathway
  • ABI1
  • ABI2
  • AXL
  • BAIAP2
  • BCAR1
  • BRK1
  • CDC42
  • CRK
  • CYBA
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DOCK1
  • ELMO2
  • FYN
  • GP91-PHOX
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPB1
  • HSPCA
  • ITGAV
  • ITGB3
  • KDR
  • MAPK11
  • MAPK12
  • MAPK13
  • MAPK14
  • MAPKAPK2
  • MAPKAPK3
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCK1
  • NCK2
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • PAK2
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTK2B
  • PXN
  • RAC1
  • RHOA
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SH2D2A
  • SHB
  • SHC2
  • SRC
  • VAV1
  • VAV2
  • VEGFA
  • WASF2
  • WASF3
Sus scrofa (pig)
RAC2 GTPase cycle
  • ABI1
  • ABI2
  • ABR
  • ANKLE2
  • ARHGAP1
  • ARHGAP17
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGDIA
  • ARMCX3
  • BAIAP2L1
  • BCR
  • BRK1
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42EP1
  • CDC42EP4
  • CYBA
  • CYFIP1
  • DEF6
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DOCK1
  • DOCK10
  • DOCK2
  • DOCK3
  • DOCK4
  • DSG2
  • EMD
  • EPHA2
  • ESYT1
  • GARRE1
  • GIT1
  • GIT2
  • GP91-PHOX
  • ITGB1
  • KIAA0355
  • LAMTOR1
  • LBR
  • LMAN1
  • MCAM
  • MCF2
  • MPP7
  • MTX1
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NHS
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PGRMC2
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLD2
  • PREX1
  • RAB7A
  • RAC2
  • RACGAP1
  • RBM39
  • SAMM50
  • SLITRK5
  • SWAP70
  • SYDE1
  • TFRC
  • TIAM1
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAPB
  • VAV1
  • VAV2
  • WASF2
Sus scrofa (pig)
RAC3 GTPase cycle
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL2
  • ABR
  • AMIGO2
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP15
  • ARHGAP17
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • ARHGAP6
  • BAIAP2
  • BAIAP2L1
  • BCR
  • BRK1
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42EP1
  • CYBA
  • CYFIP1
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DOCK10
  • DSG2
  • EMD
  • EPHA2
  • ESYT1
  • FERMT2
  • GARRE1
  • GIT1
  • GIT2
  • GP91-PHOX
  • ITGB1
  • JAG1
  • KIAA0355
  • LAMTOR1
  • LBR
  • LMAN1
  • MCAM
  • MCF2
  • MPP7
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NHS
  • NOX1
  • NOX3
  • NOXA1
  • NOXO1
  • OCRL
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PGRMC2
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PREX1
  • RAB7A
  • RAC3
  • RACGAP1
  • RAPGEF1
  • RBM39
  • SLC1A5
  • SLITRK3
  • SLITRK5
  • SNAP23
  • SRGAP2
  • SWAP70
  • SYDE1
  • TFRC
  • TIAM1
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAV2
  • WASF2
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
RAC1 GTPase cycle
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL2
  • ABR
  • ALS2
  • AMIGO2
  • ARAP1
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP12
  • ARHGAP15
  • ARHGAP17
  • ARHGAP20
  • ARHGAP21
  • ARHGAP22
  • ARHGAP23
  • ARHGAP24
  • ARHGAP25
  • ARHGAP26
  • ARHGAP27
  • ARHGAP29
  • ARHGAP30
  • ARHGAP31
  • ARHGAP33
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP4
  • ARHGAP44
  • ARHGAP45
  • ARHGAP5
  • ARHGAP9
  • ARHGDIA
  • ARHGEF10
  • ARHGEF11
  • ARHGEF15
  • ARHGEF18
  • ARHGEF19
  • ARHGEF25
  • ARHGEF39
  • ARHGEF5
  • ARHGEF6
  • ARHGEF7
  • BAIAP2
  • BAIAP2L1
  • BCR
  • BRK1
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPA
  • CDC42EP1
  • CDC42EP4
  • CHN1
  • CHN2
  • CIT
  • CYBA
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DEF6
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DOCK1
  • DOCK10
  • DOCK11
  • DOCK2
  • DOCK3
  • DOCK4
  • DOCK5
  • DOCK6
  • DOCK7
  • DOCK8
  • DOCK9
  • ECT2
  • EMD
  • EPHA2
  • ESYT1
  • FAM13A
  • FAM13B
  • FARP1
  • FARP2
  • FERMT2
  • FGD5
  • FMNL1
  • GARRE1
  • GIT1
  • GIT2
  • GMIP
  • GNA13
  • GP91-PHOX
  • IQGAP2
  • IQGAP3
  • ITGB1
  • JAG1
  • KIAA0355
  • KTN1
  • LAMTOR1
  • LBR
  • MCAM
  • MCF2
  • MCF2L
  • MPP7
  • MYO9B
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NGEF
  • NHS
  • NISCH
  • NOX1
  • NOX3
  • NOXA1
  • NOXO1
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK5
  • PAK6
  • PARD6A
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKN1
  • PKN2
  • PLD1
  • PLD2
  • PLEKHG1
  • PLEKHG2
  • PLEKHG3
  • PLEKHG6
  • PREX1
  • PREX2
  • RAB7A
  • RAC1
  • RACGAP1
  • RASGRF2
  • RBM39
  • SH3BP1
  • SLC1A5
  • SNAP23
  • SOS1
  • SOS2
  • SRGAP1
  • SRGAP2
  • SRGAP3
  • SWAP70
  • SYDE2
  • TAGAP
  • TFRC
  • TIAM1
  • TIAM2
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAV1
  • VAV2
  • WASF2
  • WASF3
  • WASL
  • WIPF1
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
Regulation of actin dynamics for phagocytic cup formation
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL1
  • ACTB
  • ACTG1
  • ACTR3
  • ARPC1A
  • ARPC1B
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC5
  • BAIAP2
  • BRK1
  • CD247
  • CD3G
  • CDC42
  • CRK
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DOCK1
  • ELMO2
  • FCGR1A
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • GRB2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPCA
  • IGKV5-2
  • LIMK1
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MYH9
  • MYO10
  • MYO1C
  • MYO9B
  • NCK1
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NCKIPSD
  • NF2
  • PAK1
  • RAC1
  • VAV1
  • VAV2
  • WASF2
  • WASF3
  • WASL
  • WIPF1
Sus scrofa (pig)
Synthesis of PC
  • ABHD3
  • ACHE
  • CEPT1
  • CHAT
  • CHKA
  • CHKB
  • CHPT1
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • CTL2
  • CTL4
  • LPCAT1
  • LPIN1
  • LPIN2
  • LPIN3
  • MFSD2A
  • PCTP
  • PCYT1A
  • PCYT1B
  • PEMT
  • PHOSPHO1
  • SLC44A1
  • SLC44A2
  • SLC44A3
  • SLC44A4
  • STARD10
  • STARD7
  • TPPT1
Sus scrofa (pig)
Cytosolic sulfonation of small molecules
  • ABHD14B
  • BPNT1
  • BPNT2
  • IMPA3
  • IMPAD1
  • PODXL2
  • SULT1A3
  • SULT1B1
  • SULT1C4
  • SULT1E1
  • SULT2A1
  • SULT2B1
  • SULT4A1
  • SULT6B1
  • TPST2
Sus scrofa (pig)
Ciprofloxacin ADME
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ALB
  • BMDP
  • SLC22A1
  • SLCO1A2
Sus scrofa (pig)
Heme biosynthesis
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ALAD
  • ALAS1
  • ALAS2
  • ALB
  • BMDP
  • COX10
  • COX15
  • CPOX
  • FECH
  • FLVCR1
  • HMBS
  • PPOX
  • UROD
  • UROS
Sus scrofa (pig)
Iron uptake and transport
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ACO1
  • BMDP
  • CAND1
  • CUL1
  • CYBRD1
  • FBXL5
  • FLVCR1
  • FTH1
  • FTL
  • HEPH
  • HMOX1
  • IREB2
  • LCN2
  • NEDD8
  • RPS27A
  • SKP1
  • SLC11A2
  • SLC22A17
  • SLC46A1
  • TF
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
RHOC GTPase cycle
  • ABCD3
  • ABR
  • ACBD5
  • AKAP13
  • ANLN
  • ARHGAP1
  • ARHGAP18
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • ARHGDIA
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF17
  • ARHGEF25
  • ARHGEF28
  • ARHGEF5
  • BCR
  • C1QBP
  • CAV1
  • CAVIN1
  • CIT
  • DAAM1
  • DEPDC1B
  • DIAPH1
  • DIAPH3
  • DLC1
  • FLOT1
  • FLOT2
  • FMNL2
  • FMNL3
  • IQGAP3
  • JUP
  • Jup
  • LBR
  • LMAN1
  • MACO1
  • MCAM
  • MCF2
  • MCF2L
  • MYO9B
  • OPHN1
  • PIK3R1
  • PKN1
  • PKN2
  • PKN3
  • PREX1
  • RACGAP1
  • RHOA
  • RHOC
  • ROCK1
  • ROCK2
  • RTKN
  • SLK
  • STOM
  • TFRC
  • TJP2
  • TMEM57
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAPB
  • VAV2
Sus scrofa (pig)

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Last updated: August 19, 2024