GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 201 - 225 of 360 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Keratinization
  • DSC1
  • DSC2
  • DSC3
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • JUP
  • Jup
  • KRT1
  • KRT10
  • KRT12
  • KRT15
  • KRT17
  • KRT18
  • KRT19
  • KRT2
  • KRT20
  • KRT23
  • KRT24
  • KRT25
  • KRT26
  • KRT27
  • KRT28
  • KRT3
  • KRT31
  • KRT32
  • KRT33A
  • KRT34
  • KRT35
  • KRT36
  • KRT39
  • KRT4
  • KRT40
  • KRT5
  • KRT6A
  • KRT7
  • KRT71
  • KRT72
  • KRT73
  • KRT74
  • KRT75
  • KRT77
  • KRT78
  • KRT79
  • KRT80
  • KRT82
  • KRT84
  • KRT85
  • KRTAP11-1
  • KRTAP24-1
  • KRTAP8-1
  • LOC100515166
  • LOC100516036
  • LOC100517674
  • LOC100518807
  • LOC100523123
  • LOC100523275
  • LOC100523670
  • LOC100621639
  • LOC100621844
  • LOC100622826
  • LOC100623393
  • LOC100625168
  • LOC100625858
  • LOC100737483
  • LOC102160031
  • LOC102164863
  • LOC106504189
  • LOC106507258
  • LOC106508044
  • LOC110255272
  • LOC110255312
  • LOC110256008
  • LOC110256282
  • LOC110260665
  • PKP1
  • PKP2
  • PKP3
  • PKP4
Sus scrofa (pig)
Keratan sulfate degradation
  • ACAN
  • FMOD
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GNS
  • HEXA
  • HEXB
  • KERA
  • LUM
  • OGN
  • OMD
  • PRELP
Sus scrofa (pig)
Keratan sulfate biosynthesis
  • ACAN
  • B3GNT2
  • B3GNT4
  • B3GNT7
  • B4GALT1
  • B4GALT2
  • B4GALT3
  • B4GALT4
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • B4GAT1
  • CHST1
  • CHST2
  • FMOD
  • KERA
  • LOC100522551
  • LUM
  • OGN
  • OMD
  • PRELP
  • SLC35D2
  • ST3GAL-III
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
Sus scrofa (pig)
Iron uptake and transport
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ACO1
  • BMDP
  • CAND1
  • CUL1
  • CYBRD1
  • FBXL5
  • FLVCR1
  • FTH1
  • FTL
  • HEPH
  • HMOX1
  • IREB2
  • LCN2
  • NEDD8
  • RPS27A
  • SKP1
  • SLC11A2
  • SLC22A17
  • SLC46A1
  • TF
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
Ion transport by P-type ATPases
  • ATP10A
  • ATP10B
  • ATP10D
  • ATP11A
  • ATP11B
  • ATP11C
  • ATP12A
  • ATP13A1
  • ATP13A2
  • ATP13A4
  • ATP13A5
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • ATP2C1
  • ATP2C2
  • ATP4A
  • ATP4B
  • ATP7A
  • ATP8A1
  • ATP8A2
  • ATP8B1
  • ATP8B2
  • ATP8B3
  • ATP8B4
  • ATP9A
  • ATP9B
  • CALM3
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • FXYD1
  • FXYD6
  • PDZD11
  • PDZK11
  • PLM
  • PLN
  • SRI
Sus scrofa (pig)
Ion homeostasis
  • AHCYL1
  • ASPH
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • CALM3
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • DMPK
  • FKBP1B
  • FXYD1
  • FXYD6
  • ITPR1
  • ITPR3
  • NOS1
  • PLM
  • PLN
  • RYR2
  • RYR3
  • SLC8A2
  • SLC8A3
  • SRI
  • STIM1
  • TRDN
  • TRPC1
Sus scrofa (pig)
Ion channel transport
  • ATP6AP1
  • ATP6G2
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1H
  • TCIRG1
Sus scrofa (pig)
Intestinal hexose absorption
  • GLUT2
  • SLC2A2
  • SLC2A5
  • SLC5A1
Sus scrofa (pig)
Interleukin-7 signaling
  • BRWD1
  • CRLF2
  • H3C12
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C4
  • H3C6
  • HIST1H3E
  • IL2RG
  • IL7
  • IL7R
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK3
  • LOC110257900
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • SMARCA4
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
  • stat5B
Sus scrofa (pig)
Interleukin-4 and Interleukin-13 signaling
  • HSP90B1
  • IL13
  • IL13RA1
  • IL13RA2
  • IL2RG
  • IL4
  • IL4R
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • SOCS1
  • SOCS5
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT6
  • TYK2
  • socs1
Sus scrofa (pig)
Interleukin-3, Interleukin-5 and GM-CSF signaling
  • CSF2
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • IL5
  • IL5RA
  • JAK2
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTPN11
  • SHC1
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TEC
  • VAV1
  • YWHAZ
  • stat5B
Sus scrofa (pig)
Interleukin-23 signaling
  • IL12B
  • IL12RB1
  • IL23A
  • IL23R
  • JAK2
  • LOC100736717
  • P4HB
  • SGRF
  • STAT3
  • STAT4
  • TYK2
  • stat4
Sus scrofa (pig)
Interleukin-2 signaling
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK3
  • LCK
  • PTK2B
  • SHC1
  • STAT5A
  • STAT5B
  • stat5B
Sus scrofa (pig)
Interleukin-12 signaling
  • IL12A
  • IL12B
  • IL12RB1
  • IL12RB2
  • JAK1
  • JAK2
  • LOC100736717
  • P4HB
  • STAT4
  • TYK2
  • stat4
Sus scrofa (pig)
Interleukin-10 signaling
  • IL10
  • IL10RA
  • IL10RB
  • JAK1
  • STAT3
  • TYK2
Sus scrofa (pig)
Interleukin-1 signaling
  • CHUK
  • CUL1
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IL1A
  • IL1B
  • IL1B2
  • IL1R1
  • IL1R2
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK3
  • IRAK4
  • LMP2
  • LOC110255300
  • LOC110258125
  • LOC110258578
  • LOC110259156
  • MAP2K6
  • MAP3K3
  • MAP3K7
  • MYD88
  • NFKB1
  • NFKBIA
  • PELI2
  • PELI3
  • PRORP
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB3
  • PSMB7
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC3
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RBX1
  • RELA
  • RPS27A
  • SKP1
  • SQSTM1
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1b
  • TOLLIP
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBE2NL
Sus scrofa (pig)
Interleukin-1 processing
  • CASP1
  • GSDMD
  • IGIF
  • IL18
  • IL1A
  • IL1B
  • IL1B2
  • LOC100154047
  • LOC110255300
  • LOC110258125
  • LOC110258578
  • LOC110259156
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB2_tv2
  • RELA
Sus scrofa (pig)
Interleukin receptor SHC signaling
  • CSF2
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • GAB2
  • GRB2
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL2RG
  • IL5
  • IL5RA
  • INPP5D
  • INPPL1
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
Interferon gamma signaling
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • JAK1
  • JAK2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKCD
  • SOCS1
  • SOCS3
  • STAT1
  • socs1
Sus scrofa (pig)
Interaction With Cumulus Cells And The Zona Pellucida
  • ADAM2
  • ADAM20
  • ADAM21
  • B4GALT1
  • FTNB
  • OVGP1
  • SPAM-1
  • SPAM1
  • ZP2
  • ZP3
  • ZP3A
  • ZP4
  • ZPA
  • ZPB
Sus scrofa (pig)
Integrin cell surface interactions
  • BSG
  • CD44
  • CD47
  • CDH1
  • COL13A1
  • COL16A1
  • COL18A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COMP
  • F11R
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN1
  • IBSP
  • ICAM1
  • ICAM2
  • ICAM4
  • ICAM5
  • ITGA1
  • ITGA10
  • ITGA11
  • ITGA2
  • ITGA2B
  • ITGA3
  • ITGA4
  • ITGA5
  • ITGA6
  • ITGA8
  • ITGA9
  • ITGAD
  • ITGAE
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB2
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB7
  • ITGB8
  • JAM2
  • JAM3
  • LUM
  • MADCAM1
  • OPN
  • PECAM1
  • SPP1
  • THBS1
  • TNC
  • TNN
  • VCAM1
  • VTN
Sus scrofa (pig)
Insulin receptor signalling cascade
  • GRB2
  • Grb10
  • INS
  • INSR
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
Insulin receptor recycling
  • ATP6AP1
  • ATP6G2
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1H
  • CTSD
  • IDE
  • INS
  • INSR
  • PTPN1
  • PTPRF
  • TCIRG1
Sus scrofa (pig)
Insertion of tail-anchored proteins into the endoplasmic reticulum membrane
  • A4
  • AD1
  • ALDH3A2
  • APP
  • CYB5
  • CYB5A
  • EMD
  • HMOX1
  • PRNP
  • PRP
  • SEC61B
  • SEC61G
  • SERP1
  • SGTA
  • STX1A
  • UBE2J2
  • VAMP2
  • VAPA
Sus scrofa (pig)
Initial triggering of complement
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C4A
  • COLEC10
  • COLEC11
  • FCN1
  • FCN2
  • IGKV5-2
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • MASP1
  • MASP2
  • MBL2
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024