GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 351 - 375 of 557 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
PCP/CE pathway
  • ARHA
  • DAAM1
  • DVL1
  • DVL2
  • DVL3
  • FZD1
  • FZD3
  • FZD6
  • FZD7
  • PFN1
  • RAC2
  • RAC3
  • RHO12
  • RHOA
  • WNT1
  • WNT11
  • WNT4
  • WNT5A
Bos taurus (cattle)
PD-1 signaling
  • BLA-DQB
  • BOLA-DQA1
  • BOLA-DQA2
  • BOLA-DQA5
  • BOLA-DRA
  • BOLA-DRB2
  • BOLA-DRB3
  • BOLA-DYA
  • BOLA-DYB
  • BoLA-DIB
  • BoLA-DRA
  • BoLA-DYB
  • CD247
  • CD274
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • DYB
  • HLA-DRA
  • LCK
  • LOC100848815
  • PD-L1
  • PDCD1LG2
  • PTPN11
  • PTPN6
  • TRAV29-1
Bos taurus (cattle)
PI Metabolism
  • TNFAIP8
  • TNFAIP8L1
  • TNFAIP8L2
  • TNFAIP8L3
Bos taurus (cattle)
PI-3K cascade:FGFR1
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF5
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FRS2
  • Fgf4
  • GAB1
  • GRB2
  • HBGF-1
  • KL
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
Bos taurus (cattle)
PI-3K cascade:FGFR2
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR2
  • FRS2
  • Fgf4
  • GAB1
  • GRB2
  • HBGF-1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
Bos taurus (cattle)
PI-3K cascade:FGFR3
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6A
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR3
  • FRS2
  • Fgf4
  • GAB1
  • GRB2
  • HBGF-1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
Bos taurus (cattle)
PI3K Cascade
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8A
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBGF-1
  • IRS1
  • IRS2
  • KL
  • KLB
  • PIK3C3
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R4
  • PTPN11
  • TLR9
Bos taurus (cattle)
PI3K/AKT Signaling
  • AFGF
  • AREG
  • BTC
  • CD19
  • CD28
  • CD80
  • CD86
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8A
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • FYN
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBEGF
  • HBGF-1
  • HGF
  • ICOS
  • IL1RL1
  • IL33
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • LCK
  • MET
  • MYD88
  • NR3A1
  • NR3A2
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDPK1
  • PIK3AP1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PTPN11
  • RAC2
  • RHOG
  • SCF
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • TRAF6
  • TRAT1
  • VAV1
Bos taurus (cattle)
PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
  • AFGF
  • AREG
  • BTC
  • CD19
  • CD28
  • CD80
  • CD86
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ERK2
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8A
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • FYN
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBEGF
  • HBGF-1
  • HGF
  • ICOS
  • IER3
  • IL1RL1
  • IL33
  • INS
  • INSR
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • LCK
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • MYD88
  • NR3A1
  • NR3A2
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PIK3AP1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PIP4K2A
  • PIP4K2B
  • PIP4K2C
  • PIP5K1A
  • PIP5K1B
  • PIP5K1C
  • PIP5K2C
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PRKM1
  • PTPN11
  • RAC2
  • RHOG
  • SCF
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • TRAF6
  • TRAT1
  • VAV1
Bos taurus (cattle)
PKA activation
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY8
  • ADCY9
  • CALM
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2A
Bos taurus (cattle)
PKMTs methylate histone lysines
  • AEBP2
  • ASH1L
  • ASH2L
  • ATF7IP
  • DOT1L
  • EED
  • EHMT1
  • EZH2
  • KMT2A
  • KMT2B
  • KMT2C
  • KMT5A
  • KMT5B
  • KMT5C
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NSD1
  • NSD2
  • NSD3
  • PRDM16
  • PRDM7
  • RBBP4
  • RBBP5
  • RBBP7
  • RELA
  • SETD1A
  • SETD1B
  • SETD3
  • SETD6
  • SETD7
  • SETD8
  • SETDB1
  • SETDB2
  • SMYD2
  • SMYD3
  • SUV39H1
  • SUV39H2
  • SUZ12
  • WDR5
Bos taurus (cattle)
PLC beta mediated events
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • PLCB1
  • PLCB4
Bos taurus (cattle)
Passive transport by Aquaporins
  • AQP1
  • AQP10
  • AQP11
  • AQP12
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AQP5
  • AQP6
  • AQP7
  • AQP8
  • AQP9
  • MIP
Bos taurus (cattle)
Pentose phosphate pathway
  • DERA
  • G6PD
  • PGD
  • PGLS
  • PGM2
  • RBKS
  • RPE
  • RPIA
  • SHPK
  • TALDO1
  • TKT
Bos taurus (cattle)
Peptide hormone biosynthesis
  • PCSK1
  • POMC
Bos taurus (cattle)
Peptide ligand-binding receptors
  • ACKR1
  • AGT
  • AGTR1
  • AGTR2
  • APLN
  • APLNR
  • BDKRB2
  • BRS3
  • C3
  • C3AR1
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C5L2
  • CCK
  • CCKBR
  • CORT
  • CXCL8
  • ECE1
  • ECE2
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • GAL
  • GALN
  • GALR1
  • GALR2
  • GALR3
  • GPR10
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GPR73L1
  • GPR77
  • GPR8
  • GRP
  • GRPR
  • IL8
  • KISS1
  • KISS1R
  • KNG1
  • LOC112445811
  • MC1R
  • MC2R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MCHR1
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • MSHR
  • NLN
  • NMBR
  • NMS
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPBWR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NPY
  • NPY1R
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • OPRD1
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • PDYN
  • PENK
  • PKR2
  • PMCH
  • PNOC
  • POMC
  • PPY
  • PPYR1
  • PRLHR
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR2
  • PSAP
  • PYY
  • SERPINA8
  • SST
  • SSTR1
  • SSTR2
  • SSTR5
  • TRH
  • TRHR
  • mln
Bos taurus (cattle)
Phase 0 - rapid depolarisation
  • CACNA1C
  • CACNA2D2
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG7
  • CACNG8
  • CALM
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • FGF12
  • FGF13
  • FGF14
  • RANGRF
  • SCN11A
  • SCN1A
  • SCN1B
  • SCN2B
  • SCN3A
  • SCN3B
  • SCN4B
  • SCN5A
  • SCN8A
  • SCN9A
Bos taurus (cattle)
Phase 1 - inactivation of fast Na+ channels
  • KCND1
  • KCND2
  • KCND3
  • KCNIP1
  • KCNIP2
  • KCNIP3
  • KCNIP4
Bos taurus (cattle)
Phase 2 - plateau phase
  • CACNA1C
  • CACNA2D2
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG7
  • CACNG8
  • KCNE1
  • KCNE1L
  • KCNE2
  • KCNE3
  • KCNE4
  • KCNE5
  • KCNQ1
Bos taurus (cattle)
Phase 4 - resting membrane potential
  • IRK1
  • KCNJ12
  • KCNJ14
  • KCNJ2
  • KCNJ4
  • KCNK1
  • KCNK10
  • KCNK12
  • KCNK13
  • KCNK15
  • KCNK16
  • KCNK17
  • KCNK18
  • KCNK2
  • KCNK3
  • KCNK4
  • KCNK5
  • KCNK7
  • KCNK9
Bos taurus (cattle)
Phase I - Functionalization of compounds
  • AADAC
  • ABP1
  • AHR
  • ALDH3A1
  • AOC1
  • AOC2
  • AOC3
  • ARNT
  • ARNT2
  • BPHL
  • CBR3
  • CES1
  • CES2
  • CES3
  • CMBL
  • CYB5B
  • CYB5R3
  • CYP2B6
  • CYP3A28
  • CYP3A4
  • CYP3A5
  • CYP3A74
  • CYP3A76
  • DIA1
  • EPHX1
  • LOC100138645
  • MARC2
  • MOSC2
  • MTARC1
  • MTARC2
  • NQO2
Bos taurus (cattle)
Phospholipase C-mediated cascade: FGFR1
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF5
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • Fgf4
  • HBGF-1
  • KL
  • PLCG1
Bos taurus (cattle)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR2
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR2
  • Fgf4
  • HBGF-1
  • PLCG1
Bos taurus (cattle)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR3
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6A
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR3
  • Fgf4
  • HBGF-1
  • PLCG1
Bos taurus (cattle)
Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains
  • BLA-DQB
  • BOLA-DQA1
  • BOLA-DQA2
  • BOLA-DQA5
  • BOLA-DRA
  • BOLA-DRB2
  • BOLA-DRB3
  • BOLA-DYA
  • BOLA-DYB
  • BoLA-DIB
  • BoLA-DRA
  • BoLA-DYB
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • DYB
  • HLA-DRA
  • LCK
  • LOC100848815
  • PAG1
  • PTPN22
  • PTPRC
  • PTPRJ
  • TRAV29-1
Bos taurus (cattle)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024