GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 426 - 450 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
RAC3 GTPase cycle
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL2
  • ABR
  • AMIGO2
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP15
  • ARHGAP17
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP42
  • ARHGAP5
  • ARHGAP6
  • ASCT2
  • BAIAP2
  • BAIAP2L1
  • BCR
  • BORG5
  • BRK1
  • C22H3ORF10
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42EP1
  • CYBA
  • CYBB
  • CYFIP1
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DOCK10
  • DSG2
  • EMD
  • EPHA2
  • ERP27
  • ESYT1
  • FAM62A
  • FERMT2
  • GARRE1
  • GIT1
  • GIT2
  • HSPC321
  • ITGB1
  • JAG1
  • LAMTOR1
  • LBR
  • LMAN1
  • MCAM
  • MPP7
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCKAP1L
  • NHS
  • NOX1
  • NOX3
  • NOXO1
  • OCRL
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK4
  • PGRMC2
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PREX1
  • RAC3
  • RACGAP1
  • RAPGEF1
  • RBM39
  • SLC1A5
  • SLITRK3
  • SLITRK5
  • SNAP23
  • SRGAP2
  • STBD1
  • SWAP70
  • SYDE1
  • TAOK3
  • TFRC
  • TRIO
  • VANGL1
  • VAV2
  • VRK2
  • WASF1
  • WASF2
  • YKT6
Bos taurus (cattle)
Extracellular matrix organization
  • FN1
Bos taurus (cattle)
AUF1 (hnRNP D0) binds and destabilizes mRNA
  • EIF4G1
  • HNRNPD
  • HSC70
  • HSP27
  • HSP70-1
  • HSPA1A
  • HSPA8
  • HSPB1
  • PABP1
  • PABPC1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Signaling by Activin
  • ACTRII
  • ACVR1B
  • ACVR1C
  • ACVR2
  • ACVR2A
  • ACVR2B
  • ERK2
  • INHA
  • INHBA
  • INHBB
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • TGFBR3
Bos taurus (cattle)
O-linked glycosylation of mucins
  • B3GNT2
  • B3GNT4
  • B3GNT5
  • B3GNT6
  • B3GNT8
  • B3GNT9
  • B3GNTL1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • C1GALT1
  • C1GALT1C1
  • CHST4
  • GALNT1
  • GALNT10
  • GALNT11
  • GALNT12
  • GALNT13
  • GALNT14
  • GALNT15
  • GALNT16
  • GALNT17
  • GALNT18
  • GALNT2
  • GALNT3
  • GALNT5
  • GALNT6
  • GALNT7
  • GALNT8
  • GALNTL1
  • GALNTL5
  • GCNT1
  • GCNT3
  • GCNT4
  • LOC789503
  • MUC1
  • MUC15
  • MUC2
  • MUC20
Bos taurus (cattle)
Removal of aminoterminal propeptides from gamma-carboxylated proteins
  • BGLAP
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • FURIN
  • GAS6
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
Bos taurus (cattle)
RHOQ GTPase cycle
  • ARHGAP1
  • ARHGAP17
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP33
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARHGEF7
  • ARHGEF9
  • ARL13B
  • ASCT2
  • BORG1
  • BORG5
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPB
  • CDC42EP1
  • CDC42EP2
  • CDC42EP3
  • CDC42EP4
  • CEP2
  • CFTR
  • CPNE8
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DLC1
  • FNBP1
  • GIT1
  • GIT2
  • GJA1
  • GOPC
  • IQGAP1
  • IQGAP3
  • ITSN1
  • JUP
  • LAMTOR1
  • MPP7
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK4
  • PLEKHG3
  • PREX1
  • RHOQ
  • SCRIB
  • SLC1A5
  • SLC4A7
  • SNAP23
  • SRGAP2
  • STEAP3
  • STOM
  • SYDE1
  • TFRC
  • TRIP10
  • VANGL1
  • WASL
  • WWP2
Bos taurus (cattle)
CD209 (DC-SIGN) signaling
  • CREBBP
  • EP300
  • NFKB1
  • PRKACA
  • PRKACB
  • RELA
  • RELB
  • RPS6KA5
Bos taurus (cattle)
APC/C:Cdc20 mediated degradation of mitotic proteins
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • BUB1B
  • BUB3
  • CDC16
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • MAD2L1
  • UBCH10
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Bos taurus (cattle)
DAG and IP3 signaling
  • PRKCD
Bos taurus (cattle)
G2/M Checkpoints
  • GTSE1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SUG1
  • TP53
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Acrosome Reaction and Sperm:Oocyte Membrane Binding
  • ACR
  • CD9
  • IZUMO1
  • IZUMO2
  • IZUMO3
  • IZUMO4
Bos taurus (cattle)
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation
  • ECSIT
  • MAP3K1
  • TRAF6
Bos taurus (cattle)
Signaling by CSF3 (G-CSF)
  • CSF3
  • CSF3R
  • GAB2
  • GCSF
  • GRB2
  • JAK1
  • JAK2
  • KRAS
  • LYN
  • PTPN11
  • SHC1
  • SRC
  • SYK
  • TYK2
Bos taurus (cattle)
HDL clearance
  • AMN
  • APOA1
  • CUBN
  • HDLBP
  • SCARB1
Bos taurus (cattle)
Degradation of AXIN
  • AXIN1
  • AXIN2
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RNF146B
  • RPS27A
  • SMURF2
  • SUG1
  • TNKS
  • TNKS2
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of keratinocytes
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • SERPINB13
Bos taurus (cattle)
Negative regulation of the PI3K/AKT network
  • PTEN
Bos taurus (cattle)
Assembly of the pre-replicative complex
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • CDC16
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDT1
  • FZR1
  • GMNN
  • MCM2
  • MCM3
  • MCM4
  • MCM5
  • MCM6
  • MCM7
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Bos taurus (cattle)
FGFR2c ligand binding and activation
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR2
  • Fgf4
  • HBGF-1
Bos taurus (cattle)
Attachment of GPI anchor to uPAR
  • GPAA1
  • PGAP1
  • PIGK
  • PIGS
  • PIGT
  • PIGU
  • PLAUR
Bos taurus (cattle)
Dectin-1 mediated noncanonical NF-kB signaling
  • CHUK
  • CUL1
  • FBXW11
  • IKKA
  • MAP3K14
  • NFKB2
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RELB
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC12
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBE2M
Bos taurus (cattle)
Downstream TCR signaling
  • BCL10
  • BLA-DQB
  • BOLA-DQA1
  • BOLA-DQA2
  • BOLA-DQA5
  • BOLA-DRA
  • BOLA-DRB2
  • BOLA-DRB3
  • BOLA-DYA
  • BOLA-DYB
  • BoLA-DIB
  • BoLA-DRA
  • BoLA-DYB
  • CARD11
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CDC34
  • CHUK
  • CUL1
  • DYB
  • FBXW11
  • HLA-DRA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • INPP5D
  • LCK
  • LOC100848815
  • MALT1
  • MAP3K7
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKBIA
  • PDPK1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRKCQ
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • PTEN
  • RELA
  • RIPK2
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • TAB2
  • TRAF6
  • TRAP2
  • TRAT1
  • TRAV29-1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5B
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • bIkBa
Bos taurus (cattle)
IFNG signaling activates MAPKs
  • ERK2
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • JAK1
  • JAK2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
Bos taurus (cattle)
Generation of second messenger molecules
  • BLA-DQB
  • BOLA-DQA1
  • BOLA-DQA2
  • BOLA-DQA5
  • BOLA-DRA
  • BOLA-DRB2
  • BOLA-DRB3
  • BOLA-DYA
  • BOLA-DYB
  • BoLA-DIB
  • BoLA-DRA
  • BoLA-DYB
  • CD101
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • DYB
  • FYB
  • FYB1
  • GRAP2
  • HLA-DRA
  • ITK
  • LAT
  • LCK
  • LCP2
  • LOC100848815
  • NCK1
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PLCG1
  • PLCG2
  • TRAV29-1
  • ZAP70
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024