GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 151 - 175 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Signaling by Erythropoietin
  • EPOR
  • IRS2
  • JAK2
  • LYN
Bos taurus (cattle)
Apoptotic execution phase
  • BCAP31
  • CASP8
  • DNM1L
  • STK24
Bos taurus (cattle)
Regulation of PTEN stability and activity
  • CK2A1
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • FRK
  • MKRN1
  • NEDD4
  • OTUD3
  • PREX2
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • PTEN
  • RNF146B
  • RPS27A
  • STUB1
  • SUG1
  • TNKS
  • TNKS2
  • TRAP2
  • TRIM27
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP13
  • WWP2
  • XIAP
Bos taurus (cattle)
FRS-mediated FGFR3 signaling
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6A
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR3
  • FRS2
  • FRS3
  • Fgf4
  • GRB2
  • HBGF-1
  • KRAS
  • NRAS
  • PTPN11
  • SOS1
Bos taurus (cattle)
Signaling by Type 1 Insulin-like Growth Factor 1 Receptor (IGF1R)
  • IGF1
  • IGF1R
  • IGF2
Bos taurus (cattle)
VEGFA-VEGFR2 Pathway
  • ABI1
  • ABI2
  • ARHA
  • AXL
  • BAIAP2
  • BCAR1
  • BRK1
  • C22H3ORF10
  • CDC42
  • CRK
  • CYBA
  • CYBB
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DOCK1
  • ELMO2
  • FYN
  • HSP27
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPB1
  • HSPCA
  • ITGAV
  • ITGB3
  • KDR
  • MAPK11
  • MAPK13
  • MAPK14
  • MAPKAPK2
  • MAPKAPK3
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCK1
  • NCK2
  • NCKAP1L
  • PAK2
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PTK2
  • PTK2B
  • PXN
  • RHO12
  • RHOA
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SH2D2A
  • SHB
  • SHC2
  • SRC
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • VEGF
  • VEGFA
  • WASF1
  • WASF2
  • WASF3
Bos taurus (cattle)
Inactivation of CSF3 (G-CSF) signaling
  • CSF3
  • CSF3R
  • CUL5
  • ELOC
  • GCSF
  • JAK1
  • JAK2
  • LYN
  • RNF7
  • RPS27A
  • SOCS1
  • SOCS3
  • SRC
  • SYK
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TYK2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5B
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
Bos taurus (cattle)
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade
  • EEA1
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • TLR9
Bos taurus (cattle)
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade
  • BPI
  • CD14
  • CD18
  • CD180
  • DNM1
  • DNM3
  • ITGAM
  • ITGB2
  • LBP
  • LY86
  • LY96
  • MD-2
  • PLCG2
  • PTPN4
  • TICAM2
  • TLR4
  • TRAM
Bos taurus (cattle)
Sphingolipid catabolism
  • ACER1
  • ACER2
  • ACER3
  • ALDH3A2
  • ALDH3B1
  • PLPP1
  • PLPP2
  • PLPP3
  • PPAP2B
  • PPAP2C
  • SGPL1
  • SGPP1
Bos taurus (cattle)
TRAF6 mediated NF-kB activation
  • AGER
  • APP
  • CAAF1
  • CHUK
  • HMG1
  • HMGB1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKBIA
  • NFKBIB
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • RELA
  • S100A12
  • S100B
  • bIkBa
Bos taurus (cattle)
Extrinsic Pathway of Fibrin Clot Formation
  • F10
  • F3
  • F7
  • F9
  • TFPI
Bos taurus (cattle)
Peptide ligand-binding receptors
  • ACKR1
  • AGT
  • AGTR1
  • AGTR2
  • APLN
  • APLNR
  • BDKRB2
  • BRS3
  • C3
  • C3AR1
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C5L2
  • CCK
  • CCKBR
  • CORT
  • CXCL8
  • ECE1
  • ECE2
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • GAL
  • GALN
  • GALR1
  • GALR2
  • GALR3
  • GPR10
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GPR73L1
  • GPR77
  • GPR8
  • GRP
  • GRPR
  • IL8
  • KISS1
  • KISS1R
  • KNG1
  • LOC112445811
  • MC1R
  • MC2R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MCHR1
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • MSHR
  • NLN
  • NMBR
  • NMS
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPBWR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NPY
  • NPY1R
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • OPRD1
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • PDYN
  • PENK
  • PKR2
  • PMCH
  • PNOC
  • POMC
  • PPY
  • PPYR1
  • PRLHR
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR2
  • PSAP
  • PYY
  • SERPINA8
  • SST
  • SSTR1
  • SSTR2
  • SSTR5
  • TRH
  • TRHR
  • mln
Bos taurus (cattle)
ATF6B (ATF6-beta) activates chaperones
  • ATF6B
  • MBTPS1
  • MBTPS2
Bos taurus (cattle)
TAK1-dependent IKK and NF-kappa-B activation
  • AGER
  • APP
  • CAAF1
  • CHUK
  • HMG1
  • HMGB1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKBIA
  • NFKBIB
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • RELA
  • S100A12
  • S100B
  • bIkBa
Bos taurus (cattle)
Triglyceride biosynthesis
  • AGMO
  • DGAT1
  • GK
  • GK2
  • GPAM
  • GPAT2
  • LOC538702
  • LPIN1
  • LPIN2
  • LPIN3
  • MOGAT1
  • MOGAT3
Bos taurus (cattle)
Interleukin-12 signaling
  • IL12A
  • IL12B
  • IL12RB1
  • IL12RB2
  • JAK1
  • JAK2
  • P4HB
  • STAT4
  • TYK2
Bos taurus (cattle)
Gamma-carboxylation of protein precursors
  • BGLAP
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • GC
  • GGCX
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
Bos taurus (cattle)
p53-Dependent G1 DNA Damage Response
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCNE1
  • CCNE2
  • CDK2
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CDKN2
Bos taurus (cattle)
ADP signalling through P2Y purinoceptor 1
  • CPLA2
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • MAPK14
  • P2RY1
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • SRC
Bos taurus (cattle)
Interleukin-21 signaling
  • IL21
  • IL21R
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK3
  • MGF
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT4
  • STAT5A
  • STAT5B
Bos taurus (cattle)
APC/C:Cdh1 mediated degradation of Cdc20 and other APC/C:Cdh1 targeted proteins in late mitosis/early G1
  • AIK
  • AIRK1
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • ARK1
  • AURA
  • AURKA
  • AURKB
  • AYK1
  • BTAK
  • CDC16
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • FZR1
  • IAK1
  • PLK1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RB1
  • RPS27A
  • SKP2
  • STK15
  • STK6
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Bos taurus (cattle)
Interferon alpha/beta signaling
  • ABCE1
  • IF1AG1
  • IF1AG8
  • IFNAC
  • IFNAR
  • IFNAR1
  • IFNAR2
  • IRF9
  • ISGF3G
  • JAK1
  • KPNA1
  • KPNB1
  • LOC100335490
  • LOC523244
  • LOC618947
  • LOC783912
  • RNASEL
  • RPS27A
  • SOCS1
  • SOCS3
  • STAT1
  • STAT2
  • TYK2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Muscarinic acetylcholine receptors
  • CHRM1
  • CHRM2
  • CHRM3
  • CHRM5
Bos taurus (cattle)
G alpha (q) signalling events
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1D
  • ADRBK1
  • AGT
  • AGTR1
  • ANXA1
  • APP
  • ARHGEF25
  • AVP
  • AVPR1A
  • AVPR1B
  • BDKRB2
  • BRS3
  • BTK
  • CASR
  • CCK
  • CCKBR
  • CHRM1
  • CHRM3
  • CHRM5
  • CYSLTR1
  • CYSLTR2
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • FFAR2
  • FFAR3
  • FFAR4
  • GAS
  • GAST
  • GCG
  • GCGR
  • GHRL
  • GHSR
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNRH1
  • GNRH2
  • GNRHR
  • GPR120
  • GPR132
  • GPR143
  • GPR17
  • GPR39
  • GPR4
  • GPR41
  • GPR43
  • GPR65
  • GPR68
  • GPR73L1
  • GPR92
  • GPRC2A
  • GRK2
  • GRM1
  • GRM5
  • GRP
  • GRPR
  • HCRTR1
  • HCRTR2
  • HTR2A
  • HTR2B
  • KISS1
  • KISS1R
  • KNG1
  • LOC112445811
  • LOC508666
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR4
  • LPAR5
  • LPAR6
  • LTB4R
  • LTB4R2
  • MCHR1
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • NKA
  • NKNA
  • NKNB
  • NMBR
  • NMS
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPFF
  • NPFFR1
  • NPFFR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • OPN4
  • OXT
  • OXTR
  • P2RY1
  • P2RY10
  • P2RY11
  • P2RY2
  • P2RY5
  • P2RY6
  • PAFR
  • PCAR1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PKR2
  • PLCB1
  • PLCB4
  • PMCH
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR2
  • PTAFR
  • PTGER1
  • PTGFR
  • QRFP
  • QRFPR
  • RGS1
  • RGS13
  • RGS16
  • RGS17
  • RGS18
  • RGS19
  • RGS2
  • RGS21
  • RGS3
  • RGS4
  • RGS5
  • RGSL1
  • SERPINA8
  • TAC1
  • TAC2
  • TAC2R
  • TAC3
  • TACR1
  • TACR2
  • TACR3
  • TBXA2R
  • TRH
  • TRHR
  • TRIO
  • UTS2
  • UTS2B
  • XCL1
  • XCL2
  • XCR1
  • mln
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024