GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
TAK1-dependent IKK and NF-kappa-B activation
  • AGER
  • APP
  • CAAF1
  • CHUK
  • HMG1
  • HMGB1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKBIA
  • NFKBIB
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • RELA
  • S100A12
  • S100B
  • bIkBa
Bos taurus (cattle)
Triglyceride biosynthesis
  • AGMO
  • DGAT1
  • GK
  • GK2
  • GPAM
  • GPAT2
  • LOC538702
  • LPIN1
  • LPIN2
  • LPIN3
  • MOGAT1
  • MOGAT3
Bos taurus (cattle)
Interleukin-12 signaling
  • IL12A
  • IL12B
  • IL12RB1
  • IL12RB2
  • JAK1
  • JAK2
  • P4HB
  • STAT4
  • TYK2
Bos taurus (cattle)
Gamma-carboxylation of protein precursors
  • BGLAP
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • GC
  • GGCX
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
Bos taurus (cattle)
p53-Dependent G1 DNA Damage Response
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCNE1
  • CCNE2
  • CDK2
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CDKN2
Bos taurus (cattle)
ADP signalling through P2Y purinoceptor 1
  • CPLA2
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • MAPK14
  • P2RY1
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • SRC
Bos taurus (cattle)
Interleukin-21 signaling
  • IL21
  • IL21R
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK3
  • MGF
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT4
  • STAT5A
  • STAT5B
Bos taurus (cattle)
APC/C:Cdh1 mediated degradation of Cdc20 and other APC/C:Cdh1 targeted proteins in late mitosis/early G1
  • AIK
  • AIRK1
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • ARK1
  • AURA
  • AURKA
  • AURKB
  • AYK1
  • BTAK
  • CDC16
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • FZR1
  • IAK1
  • PLK1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RB1
  • RPS27A
  • SKP2
  • STK15
  • STK6
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Bos taurus (cattle)
Interferon alpha/beta signaling
  • ABCE1
  • IF1AG1
  • IF1AG8
  • IFNAC
  • IFNAR
  • IFNAR1
  • IFNAR2
  • IRF9
  • ISGF3G
  • JAK1
  • KPNA1
  • KPNB1
  • LOC100335490
  • LOC523244
  • LOC618947
  • LOC783912
  • RNASEL
  • RPS27A
  • SOCS1
  • SOCS3
  • STAT1
  • STAT2
  • TYK2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Muscarinic acetylcholine receptors
  • CHRM1
  • CHRM2
  • CHRM3
  • CHRM5
Bos taurus (cattle)
G alpha (q) signalling events
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1D
  • ADRBK1
  • AGT
  • AGTR1
  • ANXA1
  • APP
  • ARHGEF25
  • AVP
  • AVPR1A
  • AVPR1B
  • BDKRB2
  • BRS3
  • BTK
  • CASR
  • CCK
  • CCKBR
  • CHRM1
  • CHRM3
  • CHRM5
  • CYSLTR1
  • CYSLTR2
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • FFAR2
  • FFAR3
  • FFAR4
  • GAS
  • GAST
  • GCG
  • GCGR
  • GHRL
  • GHSR
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNRH1
  • GNRH2
  • GNRHR
  • GPR120
  • GPR132
  • GPR143
  • GPR17
  • GPR39
  • GPR4
  • GPR41
  • GPR43
  • GPR65
  • GPR68
  • GPR73L1
  • GPR92
  • GPRC2A
  • GRK2
  • GRM1
  • GRM5
  • GRP
  • GRPR
  • HCRTR1
  • HCRTR2
  • HTR2A
  • HTR2B
  • KISS1
  • KISS1R
  • KNG1
  • LOC112445811
  • LOC508666
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR4
  • LPAR5
  • LPAR6
  • LTB4R
  • LTB4R2
  • MCHR1
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • NKA
  • NKNA
  • NKNB
  • NMBR
  • NMS
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPFF
  • NPFFR1
  • NPFFR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • OPN4
  • OXT
  • OXTR
  • P2RY1
  • P2RY10
  • P2RY11
  • P2RY2
  • P2RY5
  • P2RY6
  • PAFR
  • PCAR1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PKR2
  • PLCB1
  • PLCB4
  • PMCH
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR2
  • PTAFR
  • PTGER1
  • PTGFR
  • QRFP
  • QRFPR
  • RGS1
  • RGS13
  • RGS16
  • RGS17
  • RGS18
  • RGS19
  • RGS2
  • RGS21
  • RGS3
  • RGS4
  • RGS5
  • RGSL1
  • SERPINA8
  • TAC1
  • TAC2
  • TAC2R
  • TAC3
  • TACR1
  • TACR2
  • TACR3
  • TBXA2R
  • TRH
  • TRHR
  • TRIO
  • UTS2
  • UTS2B
  • XCL1
  • XCL2
  • XCR1
  • mln
Bos taurus (cattle)
Adrenoceptors
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1D
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
  • ADRB1
  • ADRB2
  • ADRB3
Bos taurus (cattle)
Neutrophil degranulation
  • A1BG
  • ABCA13
  • ABP1
  • ACAA1
  • ACLY
  • ACP3
  • ACPP
  • ACTR10
  • ACTR1B
  • ACTR2
  • ADA2
  • ADAM10
  • ADGRE3
  • ADGRE5
  • ADGRG3
  • AGA
  • AGL
  • AGP
  • AGPAT2
  • AHSG
  • ALAD
  • ALDH3B1
  • ALDOA
  • ALDOC
  • ALOX5
  • AMPD3
  • ANO6
  • ANX2
  • ANXA2
  • AOC1
  • AOP2
  • AP1M1
  • AP2A2
  • APAF1
  • APEH
  • APRT
  • ARG1
  • ARHA
  • ARHGAP45
  • ARHGAP9
  • ARL8A
  • ARMC8
  • ARP10
  • ARP2
  • ARPC5
  • ARSA
  • ARSB
  • ASAH1
  • ATAD3
  • ATG7
  • ATP11A
  • ATP11B
  • ATP6AP2
  • ATP6IP2
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0C
  • ATP8A1
  • ATP8B4
  • AZU1
  • B2M
  • B4GALT1
  • BIN2
  • BOLA
  • BOLA-NC1
  • BPI
  • BRI3
  • BST1
  • C3
  • C3AR1
  • C5AR1
  • C7H1orf35
  • CAAF1
  • CAAF2
  • CAB39
  • CALML5
  • CAND1
  • CANT1
  • CAP1
  • CAPN1
  • CAT
  • CATHL4
  • CCT2
  • CCT8
  • CD14
  • CD177
  • CD18
  • CD36
  • CD44
  • CD47
  • CD53
  • CD55
  • CD58
  • CD59
  • CD63
  • CD68
  • CD93
  • CDC2L
  • CDC2L5
  • CDK13
  • CEACAM1
  • CEP290
  • CFD
  • CFP
  • CHI3L1
  • CHRNB4
  • CK2N
  • CKAP4
  • CLEC4D
  • CLEC5A
  • CLEC6A
  • CMTM6
  • CNN2
  • COMMD3
  • COMMD9
  • COPB1
  • COTL1
  • CPNE1
  • CPNE3
  • CPPED1
  • CRACR2A
  • CREG1
  • CRISP2
  • CRISP3
  • CRISPLD2
  • CSNK2B
  • CST3
  • CSTB
  • CTL2
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSC
  • CTSD
  • CTSH
  • CTSS
  • CTSZ
  • CXCR1
  • CXCR2
  • CYB5R3
  • CYBA
  • CYBB
  • CYFIP1
  • CYSTM1
  • DDOST
  • DDX3X
  • DECTIN2
  • DEGS1
  • DERA
  • DES1
  • DGAT1
  • DIA1
  • DIAPH1
  • DNAJC13
  • DNAJC3
  • DNAJC5
  • DNASE1L1
  • DNCL1
  • DOCK2
  • DOK3
  • DPP7
  • DSC1
  • DSG1
  • DSN1
  • DSP
  • DYNC1H1
  • DYNC1LI1
  • DYNLL1
  • EEF1A
  • EEF1A1
  • EEF2
  • EF1A
  • ELANE
  • ENPP4
  • ERK2
  • ERP44
  • FABP5
  • FAF2
  • FCAR
  • FCER1G
  • FCGR2B
  • FCGR3
  • FCGR3A
  • FCGRIII
  • FCN2
  • FETUA
  • FGL2
  • FGR
  • FOLR2
  • FRK
  • FRMPD3
  • FTH
  • FTH1
  • FTL
  • FUCA1
  • FUCA2
  • GAA
  • GALNS
  • GALT
  • GCA
  • GDI2
  • GGH
  • GGTB2
  • GHDC
  • GLA
  • GLB1
  • GLIPR1
  • GLUT5
  • GM2A
  • GMFG
  • GNS
  • GOLGA7
  • GPI
  • GPR84
  • GPX
  • GRN
  • GSDMD
  • GSN
  • GSTP1
  • GUSB
  • GYG1
  • HBB
  • HEBP2
  • HEXB
  • HGSNAT
  • HK3
  • HMG1
  • HMGB1
  • HMOX2
  • HPSE
  • HSC70
  • HSP70-1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPA1A
  • HSPA6
  • HSPA8
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • HUWE1
  • HVCN1
  • IDH1
  • IGF2R
  • ILF2
  • IMPDH1
  • IMPDH2
  • IQGAP1
  • IQGAP2
  • IST1
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAV
  • ITGAX
  • ITGB2
  • JUP
  • KCMF1
  • KCNAB2
  • KPNB1
  • KRT1
  • KVB2
  • LAMP1
  • LAMP2
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LCN2
  • LGALS3
  • LILRA4
  • LOC100138951
  • LOC100336589
  • LOC100336941
  • LOC101904667
  • LOC107131803
  • LOC112441494
  • LOC112448555
  • LOC509956
  • LOC511695
  • LOC519132
  • LOC522479
  • LOC526163
  • LOC614923
  • LOC617406
  • LOC618268
  • LOC618463
  • LOC618737
  • LOC781990
  • LOC786350
  • LOC786410
  • LOC789748
  • LPCAT1
  • LRG1
  • LTA4H
  • LTF
  • LYZ1
  • LYZ2
  • LYZ3
  • MADM
  • MAGT1
  • MAN2B1
  • MANB
  • MANBA
  • MAPK1
  • MAPK14
  • MCEMP1
  • MGAM2
  • MGC140461
  • MGST1
  • MIF
  • MLEC
  • MME
  • MMP25
  • MMP8
  • MMP9
  • MOSPD2
  • MPO
  • MS4A3
  • MVP
  • NCKAP1L
  • NCSTN
  • NDUFC2
  • NEU1
  • NFAM1
  • NFASC
  • NFKB1
  • NHLRC3
  • NIT2
  • NME2
  • NPC2
  • NRAS
  • OLFM4
  • OLR1
  • ORM1
  • ORMDL3
  • OSCAR
  • OSTF1
  • P2RX1
  • PA2G4
  • PADI2
  • PAFAH1B2P68402
  • PAFAHB
  • PAFR
  • PAS4
  • PDAP1
  • PDXK
  • PECAM1
  • PFKL
  • PGAM1
  • PGLYRP
  • PGLYRP1
  • PGM2
  • PGRMC1
  • PGRP
  • PHGPX
  • PHT1
  • PI
  • PIGR
  • PKM
  • PKM2
  • PKP1
  • PLAC8
  • PLAU
  • PLAUR
  • PLD1
  • PLEKHO2
  • PNP
  • PPIA
  • PRCP
  • PRDX4
  • PRDX6
  • PRKCD
  • PRKM1
  • PRSS2
  • PRTN3
  • PSAP
  • PSEN1
  • PSMA2
  • PSMA5
  • PSMB1
  • PSMB7
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PTAFR
  • PTGES2
  • PTPN6
  • PTPRB
  • PTPRC
  • PTPRJ
  • PTPRN2
  • PTX3
  • PYCARD
  • PYGB
  • PYGL
  • QPCT
  • RAB10
  • RAB14
  • RAB18
  • RAB27A
  • RAB31
  • RAB37
  • RAB3A
  • RAB44
  • RAB4B
  • RAB5B
  • RAB6A
  • RAB9B
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RAP2B
  • RAP2C
  • RECS1
  • RETN
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOF
  • RHOG
  • RNASE2
  • RNASET2
  • ROCK1
  • RSTN
  • S100A12
  • S100A7
  • S100A8
  • S100A9
  • SCAMP1
  • SDCBP
  • SERPINA1
  • SERPINB1
  • SERPINB10
  • SERPINB12
  • SIRPA
  • SIRPB1
  • SLC11A1
  • SLC15A4
  • SLC27A2
  • SLC2A3
  • SLC2A5
  • SLC44A2
  • SLCO4C1
  • SLPI
  • SNAP23
  • SNAP25
  • SNAP29
  • SORBS2
  • SPTAN1
  • SRP14
  • STBD1
  • STING
  • STING1
  • STK11IP
  • STOM
  • SURF4
  • SVIP
  • SYNGR1
  • TCIRG1
  • TCN1
  • TICAM2
  • TIMP2
  • TLR2
  • TMBIM1
  • TMEM173
  • TMEM179B
  • TMEM30A
  • TNFAIP6
  • TNFRSF1B
  • TOLLIP
  • TOM1
  • TRAM
  • TRAP2
  • TRAPPC1
  • TTR
  • TUBB2C
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TXNDC4
  • TXNDC5
  • UBR4
  • UBXD8
  • UNC13D
  • VAMP8
  • VAPA
  • VAT1
  • VCL
  • VCP
  • VNN1
  • XRCC5
  • XRCC6
  • YPEL5
  • agp
  • tsg-6
Bos taurus (cattle)
Intestinal hexose absorption
  • GLUT2
  • GLUT5
  • SLC2A2
  • SLC2A5
  • SLC5A1
Bos taurus (cattle)
Fc epsilon receptor (FCERI) signaling
  • FCER1A
  • FCER1G
  • LAT
  • LYN
  • MS4A2
  • SYK
Bos taurus (cattle)
Cargo concentration in the ER
  • AREG
  • CD59
  • CNIH
  • CNIH1
  • CTSC
  • CTSZ
  • F5
  • F8
  • FOLR3
  • GOSR2
  • GRIA1
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • MCFD2
  • MIA2
  • PI
  • PREB
  • RAB1B
  • SAR1B
  • SEC22B
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SERPINA1
  • STX5
  • TGFA
  • TMED10
  • TMP21
  • VIPL
Bos taurus (cattle)
Aryl hydrocarbon receptor signalling
  • AHR
  • AIP
  • ARNT
  • ARNT2
  • HSP90AB1
  • HSPC3
  • HSPCB
  • PTGES3
Bos taurus (cattle)
Signaling by SCF-KIT
  • FER
  • FES
  • FYN
  • GAB2
  • GRAP
  • GRAP2
  • GRB10
  • GRB2
  • GRB7
  • JAK2
  • KIT
  • KITLG
  • KRAS
  • LCK
  • LOC100139881
  • LOC540321
  • LYN
  • MGF
  • MMP9
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PTPN11
  • PTPRU
  • SCF
  • SOS1
  • SRC
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TEC
  • VAV1
  • YES1
Bos taurus (cattle)
Malate-aspartate shuttle
  • GC1
  • GOT1
  • GOT2
  • MDH1
  • MDH2
  • SLC20A4
  • SLC25A11
  • SLC25A12
  • SLC25A22
Bos taurus (cattle)
Sialic acid metabolism
  • CMAS
  • CTSA
  • GLB1
  • GNE
  • NANP
  • NANS
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • NPL
  • SIAT10
  • SLC17A5
  • SLC35A1
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL5
  • ST3GAL6
  • ST6GAL2
  • ST6GALNAC1
  • ST6GALNAC2
  • ST6GALNAC4
  • ST6GALNAC5
  • ST6GALNAC6
  • ST8SIA1
  • ST8SIA2
  • ST8SIA3
  • ST8SIA4
  • ST8SIA5
  • siat4B
Bos taurus (cattle)
MET activates PTK2 signaling
  • HGF
  • ITGA2
  • ITGA3
  • ITGB1
  • LAMA4
  • MEGF6
  • MET
  • PTK2
  • SRC
Bos taurus (cattle)
Post-translational protein phosphorylation
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMELX
  • AMTN
  • ANO8
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APOL3
  • APP
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • C4A
  • CALU
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHGC
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • CP
  • CSF1
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  • DNAJC3
  • ENAM
  • F5
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  • P4HB
  • PDIA6
  • PENK
  • PI
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
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  • SCG2
  • SCG3
  • SCOTIN
  • SDC2
  • SERPINA1
  • SERPINA10
  • SERPIND1
  • SHISA5
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • SPP24
  • STC2
  • TF
  • TMEM132A
  • TNC
  • TRA1
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
Bos taurus (cattle)
Hydrolysis of LPC
  • CPLA2
  • LYPLA3
  • PLA2G15
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4D
  • PLA2G4E
  • PLA2G4F
  • PLBD1
Bos taurus (cattle)
SHC-mediated cascade:FGFR1
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF5
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • Fgf4
  • GRB2
  • HBGF-1
  • KL
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
Bos taurus (cattle)
Condensation of Prometaphase Chromosomes
  • CK2A1
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • NCAPD2
  • NCAPG
  • NCAPH
  • SMC2
  • SMC4
Bos taurus (cattle)

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Last updated: August 19, 2024