GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 201 - 225 of 557 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
PI3K Cascade
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8A
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBGF-1
  • IRS1
  • IRS2
  • KL
  • KLB
  • PIK3C3
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R4
  • PTPN11
  • TLR9
Bos taurus (cattle)
PI-3K cascade:FGFR3
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6A
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR3
  • FRS2
  • Fgf4
  • GAB1
  • GRB2
  • HBGF-1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
Bos taurus (cattle)
PI-3K cascade:FGFR2
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR2
  • FRS2
  • Fgf4
  • GAB1
  • GRB2
  • HBGF-1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
Bos taurus (cattle)
PI-3K cascade:FGFR1
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF5
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FRS2
  • Fgf4
  • GAB1
  • GRB2
  • HBGF-1
  • KL
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
Bos taurus (cattle)
PI Metabolism
  • TNFAIP8
  • TNFAIP8L1
  • TNFAIP8L2
  • TNFAIP8L3
Bos taurus (cattle)
PD-1 signaling
  • BLA-DQB
  • BOLA-DQA1
  • BOLA-DQA2
  • BOLA-DQA5
  • BOLA-DRA
  • BOLA-DRB2
  • BOLA-DRB3
  • BOLA-DYA
  • BOLA-DYB
  • BoLA-DIB
  • BoLA-DRA
  • BoLA-DYB
  • CD247
  • CD274
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • DYB
  • HLA-DRA
  • LCK
  • LOC100848815
  • PD-L1
  • PDCD1LG2
  • PTPN11
  • PTPN6
  • TRAV29-1
Bos taurus (cattle)
PCP/CE pathway
  • ARHA
  • DAAM1
  • DVL1
  • DVL2
  • DVL3
  • FZD1
  • FZD3
  • FZD6
  • FZD7
  • PFN1
  • RAC2
  • RAC3
  • RHO12
  • RHOA
  • WNT1
  • WNT11
  • WNT4
  • WNT5A
Bos taurus (cattle)
P2Y receptors
  • GPR17
  • LPAR4
  • LPAR6
  • P2RY1
  • P2RY10
  • P2RY11
  • P2RY12
  • P2RY14
  • P2RY2
  • P2RY4
  • P2RY5
  • P2RY6
Bos taurus (cattle)
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha
  • AJUBA
  • CUL2
  • EGLN1
  • EGLN2
  • EGLN3
  • ELOC
  • EPAS1
  • HIF1A
  • HIF3A
  • JUB
  • LIMD1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SUG1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5B
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • WTIP
Bos taurus (cattle)
Ovarian tumor domain proteases
  • APC
  • ARHA
  • CARD15
  • CDC2
  • CDK1
  • CDKN1
  • ESR
  • ESR1
  • IKBKG
  • NEMO
  • NOD2
  • NR3A1
  • OTUB1
  • OTUB2
  • OTUD3
  • OTUD7A
  • OTUD7B
  • PTEN
  • RHO12
  • RHOA
  • RIPK1
  • RIPK2
  • RNF128
  • RPS27A
  • TNIP1
  • TNIP2
  • TNIP3
  • TP53
  • TRAF3
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBE2D1
  • VCP
  • VCPIP1
  • YOD1
  • ZRANB1
Bos taurus (cattle)
Other interleukin signaling
  • CSF1
  • CSF1R
  • CSF3
  • CSF3R
  • GCSF
  • IFNLR1
  • IL10RB
  • IL34
  • JAK1
  • PRTN3
  • PTPRZ1
  • SDC1
  • SNAP25
  • STX1A
  • STX3
  • STX4
  • STXBP2
  • SYB2
  • TXLNA
  • TYK2
  • VAMP2
Bos taurus (cattle)
Organic cation transport
  • OCT1
  • RUNX1
  • SLC22A1
  • SLC22A15
  • SLC22A16
  • SLC22A18
  • SLC22A2
  • SLC22A3
  • SLC22A4
  • SLC22A5
Bos taurus (cattle)
Organic anion transporters
  • GC1
  • SLC17A1
  • SLC17A5
  • SLC17A6
  • SLC17A7
  • SLC17A8
  • SLC20A4
  • SLC25A1
  • SLC25A10
  • SLC25A11
  • SLC25A22
  • SLC5A5
  • SLC5A8
  • SMCT1
  • VGLUT1
  • VGLUT2
Bos taurus (cattle)
Orexin and neuropeptides FF and QRFP bind to their respective receptors
  • HCRTR1
  • HCRTR2
  • NPFF
  • NPFFR1
  • NPFFR2
  • QRFP
  • QRFPR
Bos taurus (cattle)
Orc1 removal from chromatin
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CDC6
  • CDK2
  • CDKN2
  • CDT1
  • CUL1
  • MCM2
  • MCM3
  • MCM4
  • MCM5
  • MCM6
  • MCM7
  • MCM8
  • ORC1
  • ORC2
  • ORC3
  • ORC4
  • ORC4L
  • ORC5
  • ORC5L
  • ORC6
  • ORC6L
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SKP2
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Opsins
  • BCP
  • OPN1LW
  • OPN1SW
  • OPN4
  • OPN5
  • RCP
  • RGR
  • RHO
  • RRH
Bos taurus (cattle)
Opioid Signalling
  • OPRM1
  • PDYN
  • POMC
Bos taurus (cattle)
O-linked glycosylation of mucins
  • B3GNT2
  • B3GNT4
  • B3GNT5
  • B3GNT6
  • B3GNT8
  • B3GNT9
  • B3GNTL1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • C1GALT1
  • C1GALT1C1
  • CHST4
  • GALNT1
  • GALNT10
  • GALNT11
  • GALNT12
  • GALNT13
  • GALNT14
  • GALNT15
  • GALNT16
  • GALNT17
  • GALNT18
  • GALNT2
  • GALNT3
  • GALNT5
  • GALNT6
  • GALNT7
  • GALNT8
  • GALNTL1
  • GALNTL5
  • GCNT1
  • GCNT3
  • GCNT4
  • LOC789503
  • MUC1
  • MUC15
  • MUC2
  • MUC20
Bos taurus (cattle)
O-linked glycosylation
  • AGO61
  • B3GALNT2
  • B3GNT1
  • B3GNT6
  • B4GAT1
  • DAG1
  • GTDC2
  • LARGE1
  • LARGE2
  • POMGNT1
  • POMGNT2
  • POMK
  • POMT1
  • POMT2
Bos taurus (cattle)
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
  • ADAMTS1
  • ADAMTS10
  • ADAMTS12
  • ADAMTS13
  • ADAMTS14
  • ADAMTS15
  • ADAMTS16
  • ADAMTS17
  • ADAMTS18
  • ADAMTS19
  • ADAMTS2
  • ADAMTS20
  • ADAMTS3
  • ADAMTS4
  • ADAMTS5
  • ADAMTS6
  • ADAMTS8
  • ADAMTS9
  • ADAMTSL1
  • ADAMTSL3
  • ADAMTSL4
  • ADAMTSL5
  • B3GLCT
  • CFP
  • NPI
  • POFUT2
  • RPESP
  • SBSPON
  • SEMA5A
  • SEMA5B
  • SPON1
  • SSPO
  • THBS1
  • THBS2
  • THSD1
  • THSD7A
  • THSD7B
  • VSGP
Bos taurus (cattle)
Nuclear signaling by ERBB4
  • APH1A
  • APH1B
  • ERBB4
  • ESR
  • ESR1
  • MGF
  • NCSTN
  • NR3A1
  • PEN2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • SRC
  • STAT5A
  • WWOX
  • YAP1
Bos taurus (cattle)
Nuclear events mediated by NFE2L2
  • CREBBP
  • EP300
  • NFE2L2
  • PRKAA2
Bos taurus (cattle)
Nuclear Receptor transcription pathway
  • AD4BP
  • AR
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESRRA
  • ESRRB
  • ESRRG
  • FTZF1
  • HNF4A
  • HNF4G
  • LXRA
  • LXRB
  • MED1
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NR0B1
  • NR0B2
  • NR1C3
  • NR1D1
  • NR1D2
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR1H4
  • NR1I2
  • NR1I3
  • NR2B3
  • NR2C1
  • NR2C2
  • NR2E1
  • NR2E3
  • NR2F1
  • NR2F6
  • NR3A1
  • NR3A2
  • NR3C1
  • NR3C2
  • NR4A1
  • NR4A2
  • NR4A3
  • NR5A1
  • NR5A2
  • NR6A1
  • NRBF2
  • PGR
  • PPARA
  • PPARD
  • PPARG
  • RARA
  • RARB
  • RARG
  • RORC
  • RXRA
  • RXRB
  • RXRG
  • TFCOUP1
  • THRA
  • THRB
  • VDR
Bos taurus (cattle)
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle
  • CPLX1
  • MAOA
  • OCT1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RIMS1
  • SLC18A2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SNAP25
  • STX1A
  • STXBP1
  • SYB2
  • SYT1
  • UNC13B
  • UNC18A
  • VAMP2
Bos taurus (cattle)
Non-integrin membrane-ECM interactions
  • DDR1
  • DDR2
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024