GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 201 - 225 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▲ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle
  • CPLX1
  • MAOA
  • OCT1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RIMS1
  • SLC18A2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SNAP25
  • STX1A
  • STXBP1
  • SYB2
  • SYT1
  • UNC13B
  • UNC18A
  • VAMP2
Bos taurus (cattle)
Serotonin Neurotransmitter Release Cycle
  • CPLX1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RIMS1
  • SLC18A2
  • SNAP25
  • STX1A
  • STXBP1
  • SYB2
  • SYN1
  • SYT1
  • UNC13B
  • UNC18A
  • VAMP2
Bos taurus (cattle)
Acetylcholine Neurotransmitter Release Cycle
  • CHAT
  • CPLX1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RIMS1
  • SLC18A3
  • SLC5A7
  • SNAP25
  • STX1A
  • STXBP1
  • SYB2
  • SYT1
  • UNC13B
  • UNC18A
  • VAMP2
Bos taurus (cattle)
Receptor-type tyrosine-protein phosphatases
  • LOC101901895
  • LRRC4B
  • NTRK3
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • PPFIBP1
  • PPFIBP2
  • PTPRD
  • PTPRF
  • PTPRS
  • SLITRK1
  • SLITRK2
  • SLITRK3
  • SLITRK4
  • SLITRK5
  • SLITRK6
Bos taurus (cattle)
Surfactant metabolism
  • ABCA3
  • ADA2
  • ADGRF5
  • ADORA2A
  • ADORA2B
  • ADRA2A
  • ADRA2C
  • CCDC59
  • CD163L1
  • CKAP4
  • CTSH
  • GATA6
  • LMCD1
  • LOC101907335
  • LOC751811
  • LOC786796
  • NAPSA
  • P2RY2
  • PGA5
  • SFTP3
  • SFTP4
  • SFTPA1
  • SFTPB
  • SFTPC
  • SFTPD
  • SLC34A1
  • TAP26
  • TTF1
  • WC-7
  • WC1
  • WC1-12
  • WC1.3
  • ZDHHC2
Bos taurus (cattle)
G alpha (z) signalling events
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY8
  • ADCY9
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
  • GNAZ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • RGS16
  • RGS17
  • RGS20
Bos taurus (cattle)
Adrenoceptors
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1D
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
  • ADRB1
  • ADRB2
  • ADRB3
Bos taurus (cattle)
Adrenaline,noradrenaline inhibits insulin secretion
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADRA2A
  • ADRA2C
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
Bos taurus (cattle)
Adrenaline signalling through Alpha-2 adrenergic receptor
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
Bos taurus (cattle)
Phase 4 - resting membrane potential
  • IRK1
  • KCNJ12
  • KCNJ14
  • KCNJ2
  • KCNJ4
  • KCNK1
  • KCNK10
  • KCNK12
  • KCNK13
  • KCNK15
  • KCNK16
  • KCNK17
  • KCNK18
  • KCNK2
  • KCNK3
  • KCNK4
  • KCNK5
  • KCNK7
  • KCNK9
Bos taurus (cattle)
Synaptic adhesion-like molecules
  • DLG1
  • DLG3
  • DLG4
  • FLOT1
  • FLOT2
  • GRIA1
  • GRIA3
  • LRFN1
  • LRFN2
  • LRFN3
  • LRFN4
  • PTPRD
  • PTPRF
  • PTPRS
  • SALM4
Bos taurus (cattle)
Lysosphingolipid and LPA receptors
  • EDG1
  • GPR92
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR5
  • PLPPR1
  • PLPPR2
  • PLPPR3
  • PLPPR4
  • PLPPR5
  • S1PR1
  • S1PR2
  • S1PR3
  • S1PR5
Bos taurus (cattle)
Synthesis of PA
  • ACP6
  • AGPAT1
  • AGPAT2
  • AGPAT3
  • AGPAT4
  • AGPAT5
  • AGPAT6
  • CPLA2
  • DDHD1
  • DDHD2
  • FAM73B
  • GNPAT
  • GPAM
  • GPAT2
  • GPAT3
  • GPAT4
  • GPD1
  • GPD1L
  • GPD2
  • LIPH
  • LOC516378
  • LOC613966
  • LPCAT1
  • LPCAT4
  • MIGA1
  • MIGA2
  • PLA2G12A
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D1
  • PLA2G2E
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4D
  • PLA2R1
  • PLD1
  • PLD2
  • PLD6
Bos taurus (cattle)
ABC-family proteins mediated transport
  • ABCA4
  • ABCB1
  • ABCB4
  • ABCB9
  • ABCC1
  • ABCC10
  • ABCC11
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ABCC5
  • ABCC9
  • ABCF1
  • ABCR
  • CFTR
  • DERL1
  • DERL2
  • DERL3
  • EIF2A
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • ERLEC1
  • ERLIN1
  • ERLIN2
  • KCNJ11
  • LOC515333
  • MRP1
  • OS9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RNF185
  • RNF5
  • RPS27A
  • SEL1L
  • SPFH2
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VCP
Bos taurus (cattle)
PI3K Cascade
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8A
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBGF-1
  • IRS1
  • IRS2
  • KL
  • KLB
  • PIK3C3
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R4
  • PTPN11
  • TLR9
Bos taurus (cattle)
RHO GTPases Activate NADPH Oxidases
  • CYBA
  • CYBB
  • ERK2
  • MAPK1
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPK3
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NOX1
  • NOX3
  • NOXO1
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PIN1
  • PRKCB
  • PRKCB1
  • PRKCD
  • PRKCZ
  • PRKM1
  • RAC2
  • S100A8
  • S100A9
Bos taurus (cattle)
Macroautophagy
  • AMBRA1
  • APG4B
  • ATG10
  • ATG101
  • ATG12
  • ATG13
  • ATG14
  • ATG16L1
  • ATG3
  • ATG4A
  • ATG4B
  • ATG4C
  • ATG4D
  • ATG5
  • ATG7
  • ATG9
  • ATG9A
  • ATG9B
  • AUT2B
  • BECN1
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • DNCL1
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • GABARAP
  • GABARAPL1
  • GABARAPL2
  • GBL
  • GEF2
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • LST8
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3
  • MAP1LC3A
  • MAP1LC3B
  • MAP1LC3C
  • MGC138057
  • MLST8
  • MTMR14
  • MTOR
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PRKAA1
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
  • RB1CC1
  • RHEB
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SLC38A9
  • TSC1
  • ULK1
  • UVRAG
  • VPS24
  • WDR45
  • WDR45B
  • WIPI1
  • WIPI2
Bos taurus (cattle)
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade
  • EEA1
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • TLR9
Bos taurus (cattle)
Class B/2 (Secretin family receptors)
  • ADGRE3
  • ADGRE5
  • CD55
  • CRH
  • CRHBP
  • CRHR2
  • LOC112447333
  • LOC508459
  • PTH
  • PTH1R
  • PTH2
  • PTH2R
  • PTHLH
  • SPC
  • UCN2
  • UCN3
Bos taurus (cattle)
Estrogen-dependent gene expression
  • CBFB
  • CCNT1
  • CDK9
  • CITED1
  • CREBBP
  • EP300
  • ERBB4
  • ESR
  • ESR1
  • FKBP4
  • FOXA1
  • GATA3
  • GREB1
  • GTF2A1
  • GTF2A2
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • H2AC12
  • H2AC18
  • H2AC21
  • H2AC6
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AZ2
  • H2B
  • H2BC26
  • H2BC5
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3F3A
  • H3F3B
  • HDAC1
  • HIST1H2BI
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • KAT2B
  • KAT5
  • KDM1A
  • KDM4B
  • LOC528006
  • MED1
  • MSG1
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA3
  • NR3A1
  • NR5A2
  • NRIP1
  • PGR
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2K
  • POLR2L
  • PRMT1
  • PTGES3
  • RUNX1
  • SP1
  • TBP
  • TLE3
  • USF1
  • USF2
  • YY1
  • ZNF217
Bos taurus (cattle)
Sensory perception of sweet, bitter, and umami (glutamate) taste
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB3
  • GNG13
  • ITPR3
  • LOC782957
  • T2R10C
  • TAS1R1
  • TAS1R2
  • TAS1R3
  • TAS2R1
  • TAS2R16
  • TAS2R3
  • TAS2R39
  • TAS2R4
  • TAS2R40
  • TAS2R46
  • TAS2R7
  • TAS2R8
Bos taurus (cattle)
KEAP1-NFE2L2 pathway
  • CUL3
  • KEAP1
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3
  • MAP1LC3B
  • MUL1
  • NFE2L2
  • NPLOC4
  • PRKCI
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SESN1
  • SESN2
  • SQSTM1
  • SUG1
  • TRAP2
  • TRIM21
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBXN7
  • UFD1
  • VCP
Bos taurus (cattle)
GSK3B and BTRC:CUL1-mediated-degradation of NFE2L2
  • CUL1
  • GSK3B
  • NFE2L2
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Nuclear events mediated by NFE2L2
  • CREBBP
  • EP300
  • NFE2L2
  • PRKAA2
Bos taurus (cattle)
PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
  • AFGF
  • AREG
  • BTC
  • CD19
  • CD28
  • CD80
  • CD86
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ERK2
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8A
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • FYN
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBEGF
  • HBGF-1
  • HGF
  • ICOS
  • IER3
  • IL1RL1
  • IL33
  • INS
  • INSR
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • LCK
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • MYD88
  • NR3A1
  • NR3A2
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PIK3AP1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PIP4K2A
  • PIP4K2B
  • PIP4K2C
  • PIP5K1A
  • PIP5K1B
  • PIP5K1C
  • PIP5K2C
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PRKM1
  • PTPN11
  • RAC2
  • RHOG
  • SCF
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • TRAF6
  • TRAT1
  • VAV1
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024