GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 151 - 175 of 268 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Ion channel transport
  • ATP6AP1
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A2
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E1
  • ATP6V1A
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1D
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • TCIRG1
Canis familiaris (dog)
Insulin receptor recycling
  • ATP6AP1
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A2
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E1
  • ATP6V1A
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1D
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • CTSD
  • IDE
  • INS
  • INSR
  • PTPN1
  • PTPRF
  • TCIRG1
Canis familiaris (dog)
FCGR activation
  • CD247
  • CD3G
  • FCGR1A
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • FGR
  • FYN
  • HCK
  • LOC478984
  • LYN
  • SRC
  • SYK
  • YES1
Canis familiaris (dog)
Regulation of actin dynamics for phagocytic cup formation
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL1
  • ACTB
  • ACTG1
  • ACTR2
  • ACTR3
  • ARPC1A
  • ARPC1B
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC4
  • ARPC5
  • BAIAP2
  • BTK
  • CD247
  • CD3G
  • CDC42
  • CRK
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DOCK1
  • ELMO1
  • ELMO2
  • FCGR1A
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • GRB2
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • LIMK1
  • LOC478984
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MYH2
  • MYH9
  • MYO10
  • MYO1C
  • MYO5A
  • MYO9B
  • NCK1
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NCKIPSD
  • NF2
  • PAK1
  • PTK2
  • RAC1
  • SYK
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • WASF1
  • WASF2
  • WASF3
  • WASL
  • WIPF1
Canis familiaris (dog)
ABC-family proteins mediated transport
  • ABCA4
  • ABCA8
  • ABCB1
  • ABCB4
  • ABCB5
  • ABCB9
  • ABCC1
  • ABCC10
  • ABCC11
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ABCC4
  • ABCC5
  • ABCC6
  • ABCC7
  • ABCC9
  • ABCF1
  • Abcc4
  • CFTR
  • DERL1
  • DERL2
  • DERL3
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • ERLEC1
  • ERLIN1
  • ERLIN2
  • KCNJ11
  • LOC100686569
  • LOC100687259
  • LOC610717
  • MRP1
  • OS9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RNF5
  • RPS27A
  • SEL1L
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • VCP
Canis familiaris (dog)
Macroautophagy
  • AMBRA1
  • ATG10
  • ATG101
  • ATG12
  • ATG13
  • ATG14
  • ATG16L1
  • ATG3
  • ATG4A
  • ATG4B
  • ATG4C
  • ATG4D
  • ATG5
  • ATG7
  • ATG9A
  • ATG9B
  • BECN1
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP7
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • GABARAP
  • GABARAPL2
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • MAP1LC3C
  • MLST8
  • MTMR14
  • MTMR3
  • MTOR
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
  • RB1CC1
  • RHEB
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SLC38A9
  • TSC1
  • TSC2
  • ULK1
  • UVRAG
  • WDR45
  • WDR45B
  • WIPI1
  • WIPI2
Canis familiaris (dog)
Signaling by PDGF
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL4A5
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • FURIN
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFC
  • PDGFD
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PLAT
  • PLG
  • PTPN12
  • SPP1
  • THBS1
  • THBS2
  • THBS3
  • THBS4
Canis familiaris (dog)
Formation of the cornified envelope
  • CAPN1
  • CAPNS1
  • CASP14
  • CSTA
  • DSC1
  • DSC3
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • EVPL
  • FLG
  • FURIN
  • JUP
  • KAZN
  • KLK12
  • KLK13
  • KLK14
  • LIPJ
  • LIPK
  • LIPM
  • LIPN
  • LOC119876865
  • PCSK6
  • PERP
  • PI3
  • PKP1
  • PKP2
  • PKP3
  • PKP4
  • PPL
  • PRSS8
  • RPTN
  • SPINK6
  • TCHH
  • TGM1
  • cystatin A
Canis familiaris (dog)
TRP channels
  • MCOLN1
  • MCOLN2
  • MCOLN3
  • TRPA1
  • TRPC1
  • TRPC3
  • TRPC4
  • TRPC4AP
  • TRPC5
  • TRPC6
  • TRPC7
  • TRPM1
  • TRPM2
  • TRPM3
  • TRPM4
  • TRPM5
  • TRPM6
  • TRPM7
  • TRPM8
  • TRPV1
  • TRPV2
  • TRPV3
  • TRPV4
  • TRPV5
  • TRPV6
Canis familiaris (dog)
APAP ADME
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ABCC4
  • ABCC5
  • ABCG2
  • ABHD14A
  • Abcc4
  • Abcg2
  • CNDP2
  • CYP2E1
  • GGT1
  • GGT6
  • GGT7
  • GSTP1
  • LOC119874463
  • LOC119876946
  • MRP1
  • SULT1A1
  • SULT1C4
  • SULT1E1
  • UGT1A6
Canis familiaris (dog)
Voltage gated Potassium channels
  • CERG
  • ERG
  • KCNA1
  • KCNA10
  • KCNA2
  • KCNA3
  • KCNA4
  • KCNA5
  • KCNA6
  • KCNA7
  • KCNAB1
  • KCNAB2
  • KCNAB3
  • KCNB1
  • KCNB2
  • KCNC1
  • KCNC2
  • KCNC3
  • KCNC4
  • KCND1
  • KCND2
  • KCND3
  • KCNF1
  • KCNG1
  • KCNG3
  • KCNG4
  • KCNH1
  • KCNH2
  • KCNH3
  • KCNH4
  • KCNH5
  • KCNH6
  • KCNH7
  • KCNH8
  • KCNQ4
  • KCNQ5
  • KCNS1
  • KCNS2
  • KCNS3
  • KCNV1
  • KCNV2
Canis familiaris (dog)
Translocation of ZAP-70 to Immunological synapse
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • DLA-DQA1
  • DLA-DRA
  • HLA-DQB2
  • LCK
  • PTPN22
  • TRAV29DV5
  • ZAP70
Canis familiaris (dog)
Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • DLA-DQA1
  • DLA-DRA
  • HLA-DQB2
  • LCK
  • PAG1
  • PTPN22
  • PTPRC
  • PTPRJ
  • TRAV29DV5
Canis familiaris (dog)
PD-1 signaling
  • CD247
  • CD274
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • DLA-DQA1
  • DLA-DRA
  • HLA-DQB2
  • LCK
  • PD-L1
  • PDCD1
  • PDCD1LG2
  • PDL1
  • PTPN11
  • PTPN6
  • TRAV29DV5
Canis familiaris (dog)
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell
  • B2M
  • C3
  • CD160
  • CD19
  • CD1A8
  • CD1B
  • CD1D
  • CD200
  • CD226
  • CD247
  • CD300E
  • CD300LF
  • CD300LG
  • CD34
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD40
  • CD40L
  • CD40LG
  • CD81
  • CD8A
  • CD8B
  • CD96
  • CD99
  • CLEC2B
  • CLEC2D
  • CLEC4G
  • CRTAM
  • CXADR
  • DLA-12
  • DLA-79
  • DLA88
  • FCGR1A
  • HCST
  • ICAM1
  • ICAM2
  • ICAM3
  • ICAM4
  • ICAM5
  • ITGA4
  • ITGAL
  • ITGB1
  • ITGB2
  • ITGB7
  • JAML
  • KLRB1
  • KLRF1
  • KLRK1
  • LAIR1
  • LOC100683099
  • LOC100686511
  • LOC102152131
  • LOC119863908
  • LOC119864110
  • LOC119864112
  • LOC119864113
  • LOC119864114
  • LOC119868795
  • LOC119873404
  • LOC119876868
  • LOC119881386
  • LOC475935
  • LOC476396
  • LOC483396
  • LOC484343
  • LOC606890
  • LOC609800
  • MADCAM1
  • MAG
  • NCR3
  • NCR3LG1
  • NECTIN2
  • NPDC1
  • OSCAR
  • PIANP
  • PILRA
  • PVR
  • SELL
  • SIGLEC1
  • SIGLEC11
  • SLAMF7
  • TNFSF5
  • TRAV29DV5
  • TREM1
  • TREML2
  • VCAM1
Canis familiaris (dog)
Generation of second messenger molecules
  • CD101
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • DLA-DQA1
  • DLA-DRA
  • FYB1
  • GRAP2
  • HLA-DQB2
  • ITK
  • LAT
  • LCK
  • LCP2
  • NCK1
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PLCG1
  • PLCG2
  • TRAV29DV5
  • ZAP70
Canis familiaris (dog)
EPHB-mediated forward signaling
  • ACTB
  • ACTG1
  • ACTR2
  • ACTR3
  • ARHGEF28
  • ARPC1A
  • ARPC1B
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC4
  • ARPC5
  • CDC42
  • FYN
  • GRIN1
  • GRIN2B
  • HRAS
  • KALRN
  • LOC119867035
  • LYN
  • NMDAR1
  • PAK1
  • PTK2
  • RAC1
  • RASA1
  • RHOA
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SRC
  • TIAM1
  • WASL
  • YES1
Canis familiaris (dog)
Iron uptake and transport
  • ABCG2
  • ACO1
  • Abcg2
  • CAND1
  • CP
  • CUL1
  • CYBRD1
  • FBXL5
  • FLVCR1
  • FTH
  • FTH1
  • FTL
  • HEPH
  • HMOX1
  • HMOX2
  • IREB2
  • LCN2
  • LOC119865338
  • LOC119878918
  • LOC608550
  • NEDD8
  • RPS27A
  • SKP1
  • SLC11A2
  • SLC22A17
  • SLC40A1
  • SLC46A1
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
Canis familiaris (dog)
GABA synthesis, release, reuptake and degradation
  • CPLX1
  • DNAJC5
  • GAD1
  • GAD2
  • GAD65
  • GAD67
  • LOC607182
  • RAB3A
  • RIMS1
  • SLC32A1
  • SNAP25
  • STX1A
  • STXBP1
  • SYT1
  • VAMP2
Canis familiaris (dog)
Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins
  • AQP1
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AVP
  • AVPR2
  • GNAS
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG11
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT2
  • LOC119863873
  • MYO5B
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11FIP2
Canis familiaris (dog)
TNFR1-induced proapoptotic signaling
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BIRC4
  • CYLD
  • IKBKE
  • IRF9
  • MIB2
  • RBCK1
  • RIPK1
  • SPATA2
  • TBK1
  • TNF
  • TNFA
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF2
  • XIAP
Canis familiaris (dog)
TNF receptor superfamily (TNFSF) members mediating non-canonical NF-kB pathway
  • BIRC2
  • BIRC3
  • CD40
  • CD40L
  • CD40LG
  • LTA
  • LTB
  • LTBR
  • MAP3K14
  • TNFB
  • TNFRSF11A
  • TNFRSF12A
  • TNFRSF13C
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF12
  • TNFSF13B
  • TNFSF14
  • TNFSF5
  • TNLG1C
  • TNLG1D
  • TNLG7A
  • TRAF2
  • TRAF3
Canis familiaris (dog)
Apoptotic cleavage of cellular proteins
  • ACIN1
  • APC
  • BCAP31
  • BIRC2
  • BMX
  • CASP3
  • CASP6
  • CASP7
  • CASP8
  • CLSPN
  • PRKCD
  • PRKCQ
  • PTK2
  • ROCK1
  • SATB1
  • STK24
  • STK26
Canis familiaris (dog)
TNFR2 non-canonical NF-kB pathway
  • BIRC2
  • BIRC3
  • CD40
  • CD40L
  • CD40LG
  • LOC100686569
  • LOC100687259
  • LOC610717
  • LTA
  • LTB
  • LTBR
  • MAP3K14
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • TNF
  • TNFA
  • TNFB
  • TNFRSF11A
  • TNFRSF12A
  • TNFRSF13C
  • TNFRSF1B
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF12
  • TNFSF13B
  • TNFSF14
  • TNFSF2
  • TNFSF5
  • TNLG1C
  • TNLG1D
  • TNLG7A
  • TRAF2
  • TRAF3
Canis familiaris (dog)
DAP12 interactions
  • B2M
  • CD300E
  • CD94
  • CLEC5A
  • KLRD1
  • LOC119863908
  • LOC119866326
  • LOC119873404
  • LOC476396
  • LOC484343
  • SIGLEC15
  • SIRPA
  • TREM1
  • TYROBP
Canis familiaris (dog)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024