GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 201 - 225 of 268 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
EPHB-mediated forward signaling
  • ACTB
  • ACTG1
  • ACTR2
  • ACTR3
  • ARHGEF28
  • ARPC1A
  • ARPC1B
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC4
  • ARPC5
  • CDC42
  • FYN
  • GRIN1
  • GRIN2B
  • HRAS
  • KALRN
  • LOC119867035
  • LYN
  • NMDAR1
  • PAK1
  • PTK2
  • RAC1
  • RASA1
  • RHOA
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SRC
  • TIAM1
  • WASL
  • YES1
Canis familiaris (dog)
Stimuli-sensing channels
  • ANO1
  • ANO2
  • ANO3
  • ANO4
  • ANO5
  • ANO6
  • ANO7
  • ANO8
  • ANO9
  • ASIC1
  • ASIC2
  • ASIC3
  • ASIC4
  • ASIC5
  • ASPH
  • BEST1
  • BEST2
  • BEST3
  • BEST4
  • BSND
  • CALM2
  • CLCA1
  • CLCA2
  • CLCA4
  • CLCN1
  • CLCN2
  • CLCN4
  • CLCN5
  • CLCN6
  • CLCN7
  • CLCNK
  • CLCNKA
  • CLIC2
  • LOC119880472
  • NALCN
  • NEDD4L
  • OSTM1
  • RAF1
  • RPS27A
  • RYR1
  • RYR2
  • RYR3
  • SCNN1A
  • SCNN1B
  • SCNN1D
  • SCNN1G
  • SGK1
  • SGK3
  • SLC17A2
  • SLC9B1
  • SLC9B2
  • SLC9C2
  • SRI
  • STOM
  • STOML3
  • TPCN1
  • TPCN2
  • TRDN
  • TTYH1
  • TTYH2
  • TTYH3
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • UNC79
  • UNC80
  • WWP1
Canis familiaris (dog)
Glycosphingolipid catabolism
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSF
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSJ
  • ARSK
  • ARSL
  • ASAH1
  • ASAH2
  • CTSA
  • ENPP7
  • GALC
  • GBA1
  • GBA2
  • GBA3
  • GLA
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GM2A
  • HEXA
  • HEXB
  • M6PR
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • PSAP
  • SMPD1
  • SMPD2
  • SMPD3
  • SMPD4
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
  • arsb
Canis familiaris (dog)
Regulation of actin dynamics for phagocytic cup formation
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL1
  • ACTB
  • ACTG1
  • ACTR2
  • ACTR3
  • ARPC1A
  • ARPC1B
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC4
  • ARPC5
  • BAIAP2
  • BTK
  • CD247
  • CD3G
  • CDC42
  • CRK
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DOCK1
  • ELMO1
  • ELMO2
  • FCGR1A
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • GRB2
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • LIMK1
  • LOC478984
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MYH2
  • MYH9
  • MYO10
  • MYO1C
  • MYO5A
  • MYO9B
  • NCK1
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NCKIPSD
  • NF2
  • PAK1
  • PTK2
  • RAC1
  • SYK
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • WASF1
  • WASF2
  • WASF3
  • WASL
  • WIPF1
Canis familiaris (dog)
Ion transport by P-type ATPases
  • ATP10A
  • ATP10B
  • ATP10D
  • ATP11A
  • ATP11B
  • ATP11C
  • ATP12A
  • ATP13A1
  • ATP13A2
  • ATP13A4
  • ATP13A5
  • ATP1A1
  • ATP1A3
  • ATP1A4
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • ATP2C1
  • ATP2C2
  • ATP4A
  • ATP4B
  • ATP7A
  • ATP7B
  • ATP8A1
  • ATP8A2
  • ATP8B1
  • ATP8B2
  • ATP8B4
  • ATP9A
  • ATP9B
  • CALM2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2G
  • FXYD1
  • FXYD2
  • FXYD3
  • FXYD4
  • FXYD6
  • FXYD7
  • PDZD11
  • PLN
  • SRI
Canis familiaris (dog)
Ion channel transport
  • ATP6AP1
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A2
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E1
  • ATP6V1A
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1D
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • TCIRG1
Canis familiaris (dog)
Insulin receptor recycling
  • ATP6AP1
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A2
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E1
  • ATP6V1A
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1D
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • CTSD
  • IDE
  • INS
  • INSR
  • PTPN1
  • PTPRF
  • TCIRG1
Canis familiaris (dog)
Uptake of dietary cobalamins into enterocytes
  • CBLIF
  • CTRB
  • CTRB1
  • GIF
  • LMBRD1
  • LOC119869278
  • PRSS2
  • TCN1
Canis familiaris (dog)
Transport of RCbl within the body
  • ABCC1
  • CD320
  • LDLRAP1
  • LMBRD1
  • LOC119869278
  • LRP2
  • MRP1
  • TCN1
  • TCN2
Canis familiaris (dog)
Ion homeostasis
  • ABCC9
  • AHCYL1
  • ASPH
  • ATP1A1
  • ATP1A3
  • ATP1A4
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • CALM2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2G
  • CLIC2
  • FXYD1
  • FXYD2
  • FXYD3
  • FXYD4
  • FXYD6
  • FXYD7
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KCNJ11
  • LOC119880472
  • NCX1
  • NOS1
  • PLN
  • PRKACA
  • RYR1
  • RYR2
  • RYR3
  • SLC8A1
  • SLC8A2
  • SLC8A3
  • SRI
  • STIM1
  • TNNI3
  • TRDN
  • TRPC1
Canis familiaris (dog)
Regulation of insulin secretion
  • ABCC8
  • CACNA1A
  • CACNA1C
  • CACNA1D
  • CACNA1E
  • CACNA2D2
  • CACNB2
  • CACNB3
  • KCNJ11
  • PRKACA
  • PRKACB
  • RAPGEF3
  • RAPGEF4
  • SLC2A1
  • SLC2A2
Canis familiaris (dog)
Hyaluronan biosynthesis and export
  • ABCC5
  • CEMIP
  • HAS1
  • HAS2
  • HAS3
Canis familiaris (dog)
Platelet degranulation
  • A1BG
  • A2M
  • ABCC4
  • ACTG1
  • ACTN1
  • ACTN2
  • AHSG
  • ALB
  • ALDOA
  • ANXA5
  • APLP2
  • APOA1
  • APOH
  • APOOL
  • APP
  • Abcc4
  • B9D2
  • BRPF3
  • CALM2
  • CANT1
  • CD109
  • CD36
  • CD63
  • CD9
  • CDC37L1
  • CFD
  • CHID1
  • CLU
  • CTSW
  • CYB5R1
  • CYRIB
  • ECM1
  • EGF
  • ENDOD1
  • F13A1
  • F5
  • F8VWF
  • FAM3C
  • FERMT3
  • FLNA
  • FN1
  • GAS6
  • GTPBP2
  • HABP4
  • HGF
  • HRG
  • IGF1
  • IGF2
  • IGFIA
  • ISLR
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • ITIH3
  • ITIH4
  • KNG1
  • LAMP2
  • LEFTY1
  • LGALS7B
  • LHFPL2
  • LOC100685620
  • LOC102152706
  • LOC119866770
  • LOC490387
  • LY6G6F
  • MAGED2
  • MANF
  • NHLRC2
  • OLA1
  • PCDH7
  • PCYOX1L
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PECAM1
  • PHACTR2
  • PLEK
  • PLG
  • PPBP
  • PROS1
  • PSAP
  • QSOX1
  • RARRES2
  • SCCPDH
  • SCG3
  • SELENOP
  • SELP
  • SERPINA1
  • SERPINA3
  • SERPINA4
  • SERPINE1
  • SERPINF2
  • SERPING1
  • SOD1
  • SPARC
  • SPP2
  • SRGN
  • STXBP2
  • SYTL4
  • TAGLN2
  • TEX264
  • TGFB2
  • TGFB3
  • THBS1
  • TIMP1
  • TIMP3
  • TLN1
  • TMX3
  • TUBA4A
  • VCL
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VWF
  • WDR1
Canis familiaris (dog)
The canonical retinoid cycle in rods (twilight vision)
  • ABCA4
  • CYP4V2
  • DHRS9
  • HSD17B6
  • LRAT
  • MYO7A
  • RBP1
  • RBP3
  • RBP4
  • RDH10
  • RDH12
  • RDH16
  • RDH5
  • RHO
  • RLBP1
  • RPE65
  • SDR9C7
  • STRA6
  • TTR
Canis familiaris (dog)
Surfactant metabolism
  • ABCA3
  • ADGRF5
  • ADORA2A
  • ADRA2A
  • ADRA2C
  • CCDC59
  • CKAP4
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • CTSH
  • GATA6
  • LMCD1
  • LOC610540
  • NAPSA
  • P2RY2
  • PGA
  • PGNA
  • RDC8
  • SFTPB
  • SFTPC
  • SFTPD
  • SLC34A1
  • SLC34A2
  • TTF1
  • ZDHHC2
Canis familiaris (dog)
Apoptotic cleavage of cellular proteins
  • ACIN1
  • APC
  • BCAP31
  • BIRC2
  • BMX
  • CASP3
  • CASP6
  • CASP7
  • CASP8
  • CLSPN
  • PRKCD
  • PRKCQ
  • PTK2
  • ROCK1
  • SATB1
  • STK24
  • STK26
Canis familiaris (dog)
Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis
  • AAK1
  • ABCC7
  • ADRB2
  • AGFG1
  • AGTR1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • AREG
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • BTC
  • CBL
  • CD3D
  • CD3G
  • CD4
  • CFTR
  • CHRM2
  • CI-MPR/IGF2R
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL1
  • COPS2
  • COPS3
  • COPS5
  • COPS6
  • COPS7A
  • COPS7B
  • COPS8
  • DAB2
  • DVL2
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • EPN1
  • EPN2
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • FCHO1
  • FCHO2
  • FZD4
  • GPS1
  • GRB2
  • GRK2
  • GRK3
  • HBEGF
  • HGS
  • IGF2R
  • IL7R
  • ITSN2
  • KIAA0319
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LOC102156511
  • LOC119867035
  • LRP2
  • M6PR
  • NECAP1
  • NECAP2
  • NEDD8
  • PICALM
  • REPS2
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3KBP1
  • SLC18A3
  • SLC2A8
  • SNAP91
  • STAM
  • STAM2
  • STON1
  • STON2
  • SYT1
  • SYT11
  • SYT2
  • SYT8
  • TACR1
  • TGFA
  • TGOLN2
  • TOR1A
  • TOR1B
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • VAMP2
  • VAMP3
  • VAMP4
  • VAMP7
  • VAMP8
  • WNT5A
Canis familiaris (dog)
Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein
  • ALG1
  • ALG12
  • ALG14
  • ALG2
  • ALG3
  • ALG6
  • ALG8
  • ALG9
  • DPAGT1
  • MPDU1
Canis familiaris (dog)
VxPx cargo-targeting to cilium
  • ARF4
  • ASAP1
  • CNGA2
  • CNGA4
  • CNGB1
  • EXOC1
  • EXOC2
  • EXOC3
  • EXOC4
  • EXOC5
  • EXOC6
  • EXOC7
  • EXOC8
  • GBF1
  • MEL
  • PKD2
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11FIP3
  • RAB3IP
  • RAB8
  • RAB8A
  • RHO
Canis familiaris (dog)
MHC class II antigen presentation
  • ACTR10
  • ACTR1A
  • ACTR1B
  • AP1B1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARF1
  • CANX
  • CAPZA2
  • CAPZA3
  • CAPZB
  • CD74
  • CENPE
  • CLTA
  • CLTC
  • CTRN1
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSC
  • CTSD
  • CTSE
  • CTSF
  • CTSH
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSO
  • CTSS
  • DCTN1
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN6
  • DLA-DMA
  • DLA-DMB
  • DLA-DOA
  • DLA-DQA1
  • DLA-DRA
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • HLA-DQB2
  • IFI30
  • KIF11
  • KIF18A
  • KIF20A
  • KIF22
  • KIF23
  • KIF26A
  • KIF2B
  • KIF2C
  • KIF3A
  • KIF3C
  • KIF4A
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KIFAP3
  • KLC1
  • KLC3
  • KLC4
  • LAG3
  • LGMN
  • LOC100856399
  • LOC119868747
  • LOC119876190
  • LOC612266
  • OSBPL1A
  • PHLPP2
  • QTRT1
  • RAB7
  • RAB7A
  • RACGAP1
  • RILP
  • SEC13
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SH3GL2
  • SPTBN2
Canis familiaris (dog)
MET receptor recycling
  • ARF6
  • CRK
  • CRKL
  • GAB1
  • GGA3
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • RAB4A
  • RAB4B
Canis familiaris (dog)
Post-translational modification: synthesis of GPI-anchored proteins
  • ALPI
  • ALPL
  • ART3
  • ART4
  • BST1
  • CD109
  • CD52
  • CDW52
  • CE5
  • CEACAM1
  • CEACAM20
  • CNTN5
  • CPM
  • FCGR3A
  • GLIPR2
  • GP2
  • GPIHBP1
  • GPLD1
  • HMCN2
  • IZUMO1R
  • LOC100683099
  • LOC119875695
  • LOC476816
  • LOC478984
  • LSAMP
  • LY6D
  • LY6E
  • LY6G6C
  • LY6G6D
  • LY6H
  • LYPD1
  • LYPD3
  • LYPD4
  • LYPD5
  • LYPD6B
  • LYPD8
  • MELTF
  • NEGR1
  • NRN1
  • NRN1L
  • NTM
  • OPCML
  • OTOA
  • PLET1
  • PRND
  • PSCA
  • RTN4RL1
  • RTN4RL2
  • SPACA4
  • SPRN
  • TECTA
  • TECTB
  • TEX101
  • THY1
  • VNN1
  • XPNPEP2
Canis familiaris (dog)
Aggrephagy
  • ABCC7
  • ARL13B
  • CETN1
  • CFTR
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • HDAC6
  • IFT88
  • LOC119881719
  • PARK7
  • PCNT
  • PRKN
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • UBE2N
Canis familiaris (dog)
RHOQ GTPase cycle
  • ABCC7
  • ARHGAP1
  • ARHGAP17
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP33
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARHGEF7
  • ARL13B
  • CAV
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPA
  • CDC42BPB
  • CDC42EP1
  • CDC42EP2
  • CDC42EP3
  • CFTR
  • CPNE8
  • CXNK1
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DLC1
  • FNBP1
  • GFOD1
  • GIT1
  • GIT2
  • GJA1
  • GOPC
  • GRLF1
  • IQGAP3
  • JUP
  • LAMTOR1
  • LOC119867035
  • MPP7
  • OPHN1
  • P190A
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK4
  • PLEKHG3
  • PREX1
  • RAB7
  • RAB7A
  • RHOQ
  • SCRIB
  • SLC1A5
  • SLC4A7
  • SNAP23
  • SRGAP2
  • STEAP3
  • STOM
  • SYDE1
  • TFRC
  • TRIP10
  • VAMP3
  • VANGL1
  • WASL
  • WWP2
  • p190ARHOGAP
Canis familiaris (dog)
Clathrin-mediated endocytosis
  • AAK1
  • ABCC7
  • ACTR2
  • ACTR3
  • ADRB2
  • AGFG1
  • AGTR1
  • AMPH
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • AREG
  • ARF6
  • ARFGAP1
  • ARPC1A
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC4
  • ARPC5
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • BIN1
  • BTC
  • CBL
  • CD3D
  • CD3G
  • CD4
  • CFTR
  • CHRM2
  • CI-MPR/IGF2R
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL1
  • DAB2
  • DNAJC6
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DVL2
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • EPN1
  • EPN2
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • FCHO1
  • FCHO2
  • FNBP1
  • FNBP1L
  • FZD4
  • GAK
  • GAPVD1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HGS
  • HIP1
  • HIP1R
  • IGF2R
  • IL7R
  • ITSN2
  • KIAA0319
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LOC102156511
  • LOC119867035
  • LOC607182
  • LRP2
  • M6PR
  • NECAP1
  • NECAP2
  • OCRL
  • PACSIN1
  • PACSIN2
  • PACSIN3
  • PICALM
  • PIK3C2A
  • PIP5K1C
  • QTRT1
  • RAB5A
  • RAB5B
  • RAB5C
  • REPS2
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3KBP1
  • SLC18A3
  • SLC2A8
  • SNAP91
  • SNX18
  • SNX9
  • STAM
  • STAM2
  • STON1
  • STON2
  • SYNJ1
  • SYNJ2
  • SYT1
  • SYT11
  • SYT2
  • SYT8
  • TACR1
  • TGFA
  • TGOLN2
  • TRIP10
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • VAMP2
  • VAMP3
  • VAMP4
  • VAMP7
  • VAMP8
  • WASL
  • WNT5A
Canis familiaris (dog)

About Release Notes Help Feedback

Click here to visit the beta site.


International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024