GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 226 - 250 of 252 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Regulation of PTEN gene transcription
  • RRAGB
  • frap1
  • gbl
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • maf1b
  • mapksp1
  • mlst8
  • mtor
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • si:ch73-174h16.3
  • si:dkey-176g4.2
  • slc38a9
  • tor
  • wu:fc22h08
  • wu:fc68h09
  • wu:fi23d09
  • zgc:111971
  • zgc:56499
  • zgc:73144
Danio rerio (zebrafish)
MTOR signalling
  • RRAGB
  • akt3b
  • frap1
  • gbl
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • mapksp1
  • mlst8
  • mtor
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • si:dkey-176g4.2
  • slc38a9
  • tor
  • wu:fc22h08
  • wu:fc68h09
  • ywhab
  • ywhab2
  • ywhabb
  • zgc:111971
  • zgc:56499
  • zgc:73144
Danio rerio (zebrafish)
Amino acids regulate mTORC1
  • RRAGB
  • atp6e
  • atp6v0cb
  • atp6v0d1
  • atp6v1ab
  • atp6v1ba
  • atp6v1c1
  • atp6v1c1a
  • atp6v1d
  • atp6v1e1
  • atp6v1e1b
  • atp6v1f
  • atp6v1g1
  • atp6v1h
  • atpv0e2
  • cb927
  • chunp6890
  • chunp6932
  • cto
  • fb52g11
  • fj35f08
  • frap1
  • gbl
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • mapksp1
  • mlst8
  • mtor
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • sh3bp4
  • sh3bp4a
  • si:dkey-176g4.2
  • slc38a9
  • tcirg1
  • tcirg1b
  • tor
  • vatB1
  • wu:fa12a02
  • wu:fb44e06
  • wu:fb52g11
  • wu:fc22h08
  • wu:fc68h09
  • wu:fc74d11
  • wu:fi46h07
  • wu:fj35f08
  • wu:fq38h02
  • zgc:109987
  • zgc:111904
  • zgc:111971
  • zgc:55524
  • zgc:56499
  • zgc:73144
  • zgc:73282
  • zgc:77708
  • zgc:92923
Danio rerio (zebrafish)
Energy dependent regulation of mTOR by LKB1-AMPK
  • RRAGB
  • cb116
  • frap1
  • gbl
  • im:7154392
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • mapksp1
  • mlst8
  • mtor
  • prkaa1
  • prkab1a
  • prkag1
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • sb:cb130
  • si:dkey-176g4.2
  • slc38a9
  • tor
  • wu:fa94c10
  • wu:fa94d09
  • wu:fc22h08
  • wu:fc68h09
  • wu:fd12h04
  • zgc:111971
  • zgc:56499
  • zgc:63896
  • zgc:73144
  • zgc:92228
Danio rerio (zebrafish)
Macroautophagy
  • Atg12
  • GABARAPL2
  • KM0005
  • MAP1-LC3A
  • MAP1-LC3B
  • MAP1-LC3C
  • Map1lc3
  • RRAGB
  • ambra1b
  • apg4b
  • apg4c
  • apg5l
  • atg10
  • atg101
  • atg12
  • atg13
  • atg4a
  • atg4b
  • atg4c
  • atg4cl
  • atg4da
  • atg5
  • bc2
  • cb116
  • cb741
  • chmp2a
  • chmp2ba
  • chmp3
  • chmp4b
  • chmp4c
  • chmp6
  • chmp6l
  • chmp7
  • dlc-1
  • dnl2
  • dnl2l
  • dynll2a
  • dynll2b
  • frap1
  • gabarap
  • gabarapa
  • gabarapl2
  • gbl
  • im:7153729
  • im:7154392
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • map1lc3a
  • map1lc3b
  • map1lc3c
  • mapksp1
  • mg:bb02b03
  • mlst8
  • mtor
  • prkaa1
  • prkab1a
  • prkag1
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • sb:cb130
  • si:ch211-212h16.5
  • si:ch211-224m9.5
  • si:dkey-176g4.2
  • slc38a9
  • tor
  • vps24
  • wdr45
  • wdr45b
  • wdr45l
  • wipi1
  • wipi3
  • wipi4
  • wu:fa94c10
  • wu:fa94d09
  • wu:fb60g11
  • wu:fc22h08
  • wu:fc56g07
  • wu:fc68h09
  • wu:fd12h04
  • wu:fj43a09
  • zgc:100934
  • zgc:110812
  • zgc:111958
  • zgc:111971
  • zgc:123341
  • zgc:56434
  • zgc:56499
  • zgc:56565
  • zgc:63896
  • zgc:64205
  • zgc:66081
  • zgc:73144
  • zgc:77094
  • zgc:86888
  • zgc:92228
  • zgc:92319
Danio rerio (zebrafish)
TP53 Regulates Metabolic Genes
  • COX4I1
  • D244
  • PGI
  • RRAGB
  • TXN
  • cb116
  • cb58
  • coi
  • coii
  • coiii
  • cox1
  • cox11
  • cox16
  • cox19
  • cox2
  • cox20
  • cox3
  • cox4i1
  • cox5a
  • cox5aa
  • cox5ba
  • cox6a1
  • cox6b1
  • cox7a2l
  • cox7a3
  • cox7b
  • cox7c
  • coxi
  • coxii
  • coxiii
  • cyc
  • ddit4
  • fa92g05
  • fam36a
  • fb15h09
  • fb93e02
  • fe38c12
  • fk47c09
  • frap1
  • gbl
  • glsl
  • gpi
  • gpib
  • hm:zeh0438
  • hm:zehl0637
  • hm:zehn0976
  • im:6898613
  • im:6904550
  • im:7154392
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • mapksp1
  • mg:bb02d03
  • mlst8
  • mt-co1
  • mt-co2
  • mt-co3
  • mtco1
  • mtco2
  • mtco3
  • mtor
  • ndufa4
  • ndufa4a
  • ndufa4l
  • ns:zf-e250
  • pgi-2
  • prdx1
  • prdx2
  • prdx5
  • prkaa1
  • prkab1a
  • prkag1
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • sb:cb130
  • sco2
  • sesn2
  • si:dkey-161j23.2
  • si:dkey-176g4.2
  • si:dkey-222f2.8
  • slc38a9
  • surf1
  • tigara
  • tor
  • txn
  • wu:fa91b01
  • wu:fa92g05
  • wu:fa94c10
  • wu:fa94d09
  • wu:fb02e12
  • wu:fb15h09
  • wu:fb33b01
  • wu:fb36f06
  • wu:fb48f06
  • wu:fb51h04
  • wu:fb93e02
  • wu:fc22h08
  • wu:fc68h09
  • wu:fd12h04
  • wu:fe38c12
  • wu:fi22e10
  • wu:fj32b09
  • wu:fj35d07
  • wu:fj49c05
  • wu:fj56d06
  • wu:fk47c09
  • wu:fk86h02
  • wu:fp89f04
  • wu:fq19b09
  • ywhab
  • ywhab2
  • ywhabb
  • ywhabl
  • ywhae
  • ywhae1
  • ywhag
  • ywhag2
  • ywhah
  • ywhaq
  • ywhaq1
  • ywhaq2
  • ywhaqa
  • ywhaqb
  • ywhaz
  • zeh0438
  • zgc:103782
  • zgc:109989
  • zgc:110058
  • zgc:110300
  • zgc:110343
  • zgc:111971
  • zgc:112318
  • zgc:114165
  • zgc:158646
  • zgc:162286
  • zgc:55377
  • zgc:55499
  • zgc:56499
  • zgc:56564
  • zgc:63883
  • zgc:63896
  • zgc:66312
  • zgc:73065
  • zgc:73144
  • zgc:73316
  • zgc:77062
  • zgc:77351
  • zgc:92228
  • zgc:92631
  • zgc:92891
  • zgc:92903
Danio rerio (zebrafish)
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell
  • SCN2B
  • cb810
  • cd226
  • cd40
  • cd40lg
  • cxadr
  • dl3
  • itga4
  • itgb1
  • itgb1b
  • itgb1b.1
  • itgb1b.2
  • mag
  • nectin1b
  • pvrl1b
  • sb:cb1043
  • sc:d147
  • scn2b
  • si:ch211-231h20.3
  • si:ch211-264f5.2
  • si:ch73-208g10.1
  • siglec-4
  • tnfsf10
  • tnfsf10l2
  • tnfsf10l4
  • zgc:113297
  • zgc:158817
  • zgc:85632
  • zgc:92320
Danio rerio (zebrafish)
Cell surface interactions at the vascular wall
  • ESAM
  • Iclp-1
  • JAM
  • MIF
  • SCN2B
  • cb810
  • cd74a
  • ceacam1
  • cxadr
  • epcam
  • esam
  • esama
  • f11r
  • f11r.1
  • hm:zeh0068
  • iclp1
  • itga4
  • itgb1
  • itgb1b
  • itgb1b.1
  • itgb1b.2
  • jam2a
  • jam3b
  • jamb
  • jamc
  • mif
  • sb:cb6
  • sc:d0175
  • sc:d0254
  • scn2b
  • selp
  • selplg
  • si:ch211-260g14.4
  • si:ch211-264f5.6
  • tacstd
  • wu:fb11f09
  • wu:fb12a01
  • wu:fb13d06
  • wu:fc07c05
  • wu:fj17g02
  • wu:fk94e07
  • zeh0068
  • zgc:103642
  • zgc:110304
  • zgc:77119
  • zgc:85632
Danio rerio (zebrafish)
Atorvastatin ADME
  • CYP3A
  • abcc2
  • cyp3a65
  • cyp3c1
  • cyp3c4
  • fk84f07
  • im:7158298
  • pon1
  • pon2
  • si:dkey-217k21.8
  • slco1c1
  • slco1e1
  • slco2b1
  • wu:fa96d12
  • wu:fc26b04
  • wu:fi40d02
  • wu:fk84f07
  • zgc:123110
  • zgc:123236
  • zgc:153269
  • zgc:56626
  • zgc:66072
  • zgc:77556
  • zgc:91887
Danio rerio (zebrafish)
N-Glycan antennae elongation
  • CH1073-177A15.1
  • b4galt1l
  • b4galt2
  • b4galt4
  • b4galt5
  • b4galt6
  • cb394
  • fk70b01
  • id:ibd5161
  • im:7151092
  • mgat4bQ9UQ53
  • mgat5
  • mgat5a
  • si:ch211-261p7.4
  • si:dkeyp-4h4.2
  • siat 8C
  • siat4c
  • siat8
  • st3gal4
  • st8sia2
  • st8sia3
  • wu:fk70b01
  • zgc:101780
  • zgc:136939
  • zgc:154116
  • zgc:158162
  • zgc:55730
Danio rerio (zebrafish)
Keratan sulfate biosynthesis
  • B3GNT1
  • CH1073-177A15.1
  • Lum
  • b3gnt1
  • b3gnt2b
  • b3gnt3
  • b3gnt3.4
  • b3gnt7
  • b4galt1l
  • b4galt2
  • b4galt4
  • b4galt5
  • b4galt6
  • b4gat1
  • cb543
  • chst1
  • fk70b01
  • fmoda
  • im:6910494
  • im:7151092
  • kera
  • lum
  • ogn
  • ogna
  • si:ch211-103f16.4
  • si:ch211-261p7.4
  • siat4
  • siat4c
  • ssp1
  • ssp5
  • st3gal1l
  • st3gal2l
  • st3gal4
  • st3gal8
  • wu:fa55h04
  • wu:fc39c01
  • wu:fk30b12
  • wu:fk70b01
  • zgc:101780
  • zgc:111788
  • zgc:113456
  • zgc:113545
  • zgc:113947
  • zgc:154116
  • zgc:158162
  • zgc:55730
  • zgc:86661
Danio rerio (zebrafish)
Myogenesis
  • Ctnna2
  • MEF2B
  • R-cadherin
  • boc
  • cb507
  • cb553
  • cb641
  • cdh2
  • cdh4
  • cdon
  • ctnna1
  • ctnnb1
  • etID309781.16
  • fa16d03
  • fk53b11
  • mapk11
  • mapk12b
  • mapk14
  • mapk14b
  • mef2D
  • mef2b
  • mef2d
  • mrf4
  • myf-5
  • myf5
  • myf6
  • myod
  • myod1
  • myog
  • pac
  • rcad
  • si:ch211-125m10.1
  • si:dkey-14d8.5
  • tcf12
  • tcf3a
  • tcf3b
  • wu:fa10c03
  • wu:fa16d03
  • wu:fb94b11
  • wu:fc50h03
  • wu:fk53b11
  • zgc:100763
  • zgc:109833
  • zgc:110509
  • zgc:136316
  • zgc:158240
  • zgc:86905
Danio rerio (zebrafish)
FGFR1b ligand binding and activation
  • GIPC
  • TIP-2
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf2
  • fgf22
  • fgf3
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • gipc1
  • rgs19ip1
  • si:ch73-18k18.1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • tgfbr3
  • wu:fd11d03
  • zgc:109774
Danio rerio (zebrafish)
FGFR1c ligand binding and activation
  • GIPC
  • TIP-2
  • anos1a
  • anos1b
  • anosmin-1a
  • anosmin-1b
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • gipc1
  • id:ibd5158
  • kal1.1
  • kal1.2
  • kal1a
  • kal1b
  • rgs19ip1
  • si:ch73-18k18.1
  • tgfbr3
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fl91z45
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
Metabolism of folate and pterines
  • aldh1l1
  • cb595
  • dhfr
  • fa92h12
  • fk48e08
  • fk51d09
  • folr
  • fpgs
  • im:7144504
  • mthfd1a
  • mthfd1l
  • mthfd2
  • mthfr
  • mthfs
  • pcft
  • shmt1
  • shmt2
  • si:dkey-25e12.5
  • si:dkey-25e12.6
  • si:dkeyp-100a1.4
  • slc19a1
  • slc25a32b
  • slc46a1
  • wu:fa92h12
  • wu:fb38b11
  • wu:fe12e11
  • wu:fk48e08
  • wu:fk49h03
  • wu:fk51d09
  • zgc:110786
  • zgc:63807
  • zgc:66171
  • zgc:77524
  • zgc:86637
  • zgc:91891
Danio rerio (zebrafish)
Cation-coupled Chloride cotransporters
  • nkcc1
  • slc12a2
Danio rerio (zebrafish)
Zinc influx into cells by the SLC39 gene family
  • liv1
  • slc39a1
  • slc39a14
  • slc39a6
  • zip1
  • zip14
  • zip6
Danio rerio (zebrafish)
RAC2 GTPase cycle
  • CAV1
  • IQGAP1
  • LOC100004299
  • arhgap1
  • arhgap35a
  • arhgap42a
  • arhgdia
  • cav1
  • cb422
  • cb810
  • cb893
  • cdc42
  • cdc42a
  • cdc42ep4
  • cdc42ep4a
  • cyba
  • cybb
  • def6
  • dlg3
  • dock1
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • epha2
  • epha2a
  • fb55a05
  • fc45f07
  • fj62g06
  • fk03b12
  • fk61c06
  • hmp
  • id:ibd5152
  • im:7152854
  • im:7156663
  • iqgap1
  • itgb1
  • itgb1b
  • itgb1b.1
  • itgb1b.2
  • kinase
  • mpp7
  • mtx1
  • mtx1b
  • ncf1
  • ncf2
  • nckap1
  • ogr
  • ogre
  • pak2
  • pak2a
  • pik3ca
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pik3r3a
  • rab-7
  • rab7
  • rab7a
  • rac2
  • racgap1
  • rtk6
  • samm50
  • samm50a
  • si:dkey-8l13.4
  • si:dz198m22.1
  • stb2
  • swap70b
  • swp70
  • tfr1a
  • trio
  • vamp3
  • vangl1
  • wu:cegs2891
  • wu:fa96g11
  • wu:fb07d08
  • wu:fb16a12
  • wu:fb55a05
  • wu:fb65b05
  • wu:fb71h01
  • wu:fb92c08
  • wu:fc07c04
  • wu:fc45f07
  • wu:fj62g06
  • wu:fk03b12
  • wu:fk56b03
  • wu:fk61c06
  • zgc:101675
  • zgc:110361
  • zgc:158405
  • zgc:55554
  • zgc:63918
  • zgc:64058
  • zgc:64144
  • zgc:66077
  • zgc:73230
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Danio rerio (zebrafish)
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Danio rerio (zebrafish)
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Danio rerio (zebrafish)
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Danio rerio (zebrafish)
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Danio rerio (zebrafish)
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
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Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024