GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 261 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Activation of the phototransduction cascade
  • GNB1x
  • fb39f01
  • fk56e06
  • gnat1
  • gnb1b
  • gnb1l
  • gng1
  • gngt1
  • rho
  • wu:fb39f01
  • wu:fb98e06
  • wu:fj09d12
  • wu:fk53d06
  • wu:fk56e06
  • zfo2
  • zgc:55774
  • zgc:73318
Danio rerio (zebrafish)
RHO GTPases regulate CFTR trafficking
  • cftr
  • fe38f01
  • gopc
  • rhoq
  • wu:fe38f01
  • wu:fi15a09
  • zgc:55997
  • zgc:56254
  • zgc:65853
Danio rerio (zebrafish)
G alpha (12/13) signalling events
  • adra1bb
  • arhgef11
  • arhgef18
  • arhgef18a
  • arhgef37
  • arhgef39
  • fgd4
  • fgd4a
  • fj59e07
  • gna12
  • gna12a
  • gna12l
  • gna13
  • gna13a
  • rasgrf2
  • rhoac
  • rock2
  • rock2a
  • rok2
  • si:ch211-194i18.1
  • si:dkey-57m7.1
  • sos1
  • tbxa2r
  • trio
  • wu:fc21e04
  • wu:fe25e05
  • wu:fj05f11
  • wu:fj59e07
  • zgc:103517
  • zgc:103685
  • zgc:112436
  • zgc:158274
  • zgc:85686
Danio rerio (zebrafish)
Formation of the cornified envelope
  • cb80
  • dsc
  • dsc2
  • dsc2l
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • fb73g06
  • jup
  • jupa
  • lipf
  • pkp2
  • pkp3
  • pkp3a
  • wu:fa97f09
  • wu:fb73g06
  • wu:fk69a12
  • zgc:136656
  • zgc:56632
Danio rerio (zebrafish)
NFG and proNGF binds to p75NTR
  • ngf
  • ngfb
  • ngfrb
  • ngfrl
Danio rerio (zebrafish)
RHO GTPases Activate Rhotekin and Rhophilins
  • rhoac
  • rhpn2
Danio rerio (zebrafish)
Amino acid transport across the plasma membrane
  • fa11f11
  • fc26e12
  • fc51c07
  • id:ibd1327
  • sb:cb519
  • si:ch211-132b12.1
  • si:ch211-154h20.4
  • si:zc101n13.5
  • slc16a10
  • slc1a4
  • slc1a5
  • slc25a29
  • slc36a4
  • slc38a2
  • slc38a3
  • slc38a5b
  • slc3a2b
  • slc43a1b
  • slc6a11
  • slc6a11a
  • slc6a15
  • slc6a18
  • slc6a19
  • slc6a19b
  • slc6a6
  • slc6a6b
  • slc7a1
  • slc7a1a
  • slc7a2
  • slc7a6
  • slc7a7
  • snat2
  • tau
  • taut
  • wu:fa01a01
  • wu:fa11f11
  • wu:fc26e12
  • wu:fc31c02
  • wu:fc48a10
  • wu:fc51c07
  • wu:fd58f10
  • wu:fe14a07
  • wu:fq18d12
  • zgc:114094
  • zgc:123300
  • zgc:158383
  • zgc:158423
  • zgc:172267
  • zgc:55813
  • zgc:66050
  • zgc:92015
  • zgc:92817
Danio rerio (zebrafish)
Iron uptake and transport
  • Cul1
  • DMT1
  • LOC555483
  • aco1
  • cand1
  • cb141
  • cb193
  • cb426
  • cp
  • cul1a
  • cybrd1
  • fa07b10
  • fb06g09
  • fb78a05
  • fbxl5
  • fc27c04
  • fj01a11
  • fj24b11
  • fpn1
  • fth
  • fth1
  • fth1a
  • fth1b
  • fthl
  • fthl27
  • fthl28
  • fthl29
  • fthl31
  • hm:zeh0800
  • hm:zeh1145
  • hmox1
  • hmox1a
  • hmox2b
  • id:ibd5130
  • id:ibd5159
  • im:7160217
  • irp1
  • lcn15
  • nedd8l
  • pcft
  • ptgds
  • ptgdsa
  • ptgdsb
  • ptgdsb.1
  • ptgdsb.2
  • ptgdsl
  • sb:cb141
  • si:ch211-14a17.5
  • si:zc14a17.5
  • skp1
  • skp1a
  • slc11a2
  • slc39a1
  • slc40a1
  • slc46a1
  • wu:fa07b10
  • wu:fb06g09
  • wu:fb10b10
  • wu:fb11h03
  • wu:fb15e12
  • wu:fb78a05
  • wu:fc13a10
  • wu:fc27c04
  • wu:fi23f10
  • wu:fj01a11
  • wu:fj24b11
  • wu:fj24c01
  • wu:fo75b03
  • wu:fq18c10
  • zeh1145
  • zgc:136699
  • zgc:153704
  • zgc:153919
  • zgc:158768
  • zgc:194505
  • zgc:194526
  • zgc:198419
  • zgc:55729
  • zgc:55747
  • zgc:65984
  • zgc:73186
  • zgc:77500
  • zgc:92245
  • zgc:92768
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis of Dolichyl-phosphate
  • dhdds
  • dolk
  • dolpp1
  • mvd
  • mvda
  • ngbr
  • nus1
  • srd5a3
  • wu:fd56c06
  • zgc:101585
  • zgc:77088
Danio rerio (zebrafish)
Zinc influx into cells by the SLC39 gene family
  • liv1
  • slc39a1
  • slc39a14
  • slc39a6
  • zip1
  • zip14
  • zip6
Danio rerio (zebrafish)
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors
  • LOC555747
  • LOC556619
  • chrna1
  • chrna2
  • chrna2a
  • chrna4
  • chrna4b
  • chrna5
  • chrna6
  • chrna7
  • chrna7a
  • chrnb3a
  • dZ70B1.1
  • nic1
  • si:dkey-234d14.1
  • zgc:110642
  • zgc:136717
Danio rerio (zebrafish)
VEGF binds to VEGFR leading to receptor dimerization
  • figf
  • flk1b
  • flt-4
  • flt4
  • kdr
  • kdrb
  • vegf
  • vegf-d
  • vegfa
  • vegfaa
  • vegfc
  • vegfd
  • vegfr3
Danio rerio (zebrafish)
Collagen biosynthesis and modifying enzymes
  • COL11A1b
  • COL5A3a
  • LOC100003546x
  • LOC794872
  • alpha2(I)
  • alpha3(I)
  • bmp1a
  • cb216
  • cb479
  • cb816
  • col11a1
  • col11a1b
  • col1a1b
  • col1a2
  • col1a3
  • col27a1
  • col27a1b
  • col28a1
  • col28a1a
  • col28a1b
  • col28a1c
  • col28a1d
  • col2a1
  • col2a1a
  • col5a3
  • col5a3a
  • col8a1b
  • colgalt1
  • colgalt2
  • colgalt2b
  • coll2a1
  • diwanka
  • fb38c06
  • fb72h05
  • fc10c01
  • fc56b02
  • fj59a10
  • glt25d1
  • glt25d2
  • hm:zeh0348
  • hm:zehn2357
  • hsp
  • hsp47
  • id:ibd5060
  • im:6912725
  • lh2
  • mfn
  • p4ha1
  • p4ha1b
  • p4hb
  • pcolce2b
  • pcolceb
  • plod2
  • plod3
  • psmb3
  • serpinh1b
  • si:ch211-174d12.1
  • si:ch211-174d12.4
  • si:dkey-87l9.2
  • slc35c2
  • tld
  • tll1
  • tolloid
  • wu:fa95h05
  • wu:fa98d05
  • wu:fa99g10
  • wu:fb04c08
  • wu:fb11d06
  • wu:fb38c06
  • wu:fb54e07
  • wu:fb72f10
  • wu:fb72h05
  • wu:fb99e07
  • wu:fc10c01
  • wu:fc49g11
  • wu:fc56b02
  • wu:fc69d06
  • wu:fd02a10
  • wu:fi09e02
  • wu:fi27h11
  • wu:fj59a10
  • zehn2357
  • zgc:101868
  • zgc:194993
  • zgc:195010
  • zgc:55285
  • zgc:56058
  • zgc:63590
  • zgc:77328
  • zgc:92596
Danio rerio (zebrafish)
Keratinization
  • cb112
  • cb80
  • ckii
  • dsc
  • dsc2
  • dsc2l
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • jup
  • jupa
  • krt18b
  • krt2-8
  • krt5
  • krt8
  • krt93
  • krt94
  • krt95
  • krt97
  • krtt1c6
  • pkp2
  • pkp3
  • pkp3a
  • sb:cb112
  • sb:cb481
  • wu:fa91c11
  • wu:fa91g11
  • wu:fa96h10
  • wu:fa97f09
  • wu:fb02h09
  • wu:fb58f07
  • wu:fj02d02
  • wu:fk69a12
  • wu:fk78b12
  • zfCKII
  • zgc:136656
  • zgc:66015
Danio rerio (zebrafish)
Aggrephagy
  • arl13b
  • arl2l1
  • cb741
  • cftr
  • dj1
  • dlc-1
  • dncli2
  • dnl2
  • dnl2l
  • dync1i2a
  • dync1li1
  • dynll2a
  • dynll2b
  • fc73a07
  • hdac6
  • hm:zeh0386
  • ik:tdsubc_1f2
  • im:7136154
  • park2
  • park7
  • prkn
  • rps27a
  • si:ch211-123f21.1
  • si:dkey-63j1.8
  • tdsubc_1f2
  • uba52
  • ube2n
  • ube2na
  • ube2v1
  • wu:fa91f08
  • wu:fb11b03
  • wu:fc08b06
  • wu:fc73a07
  • xx:tdsubc_1f2
  • zgc:110812
  • zgc:112390
  • zgc:123326
  • zgc:123344
  • zgc:55726
  • zgc:66081
  • zgc:66168
Danio rerio (zebrafish)
RHO GTPases activate IQGAPs
  • E-cad
  • IQGAP1
  • IQGAP3
  • cdc42
  • cdc42a
  • cdh1
  • ctnna1
  • ctnnb1
  • fj62g06
  • im:7152854
  • im:7156663
  • iqgap1
  • iqgap3
  • men1
  • rac1
  • rac1a
  • wu:fb07d08
  • wu:fc44c03
  • wu:fd16e02
  • wu:fj62g06
  • zgc:110510
  • zgc:55823
  • zgc:55917
  • zgc:63918
  • zgc:86934
Danio rerio (zebrafish)
TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of cell cycle factors
  • fb48g05
  • fb49c04
  • jarid1b
  • jarid1bb
  • kdm5bb
  • mycb
  • tfap2c
  • wu:fb48g05
  • wu:fb49c04
  • zgc:92088
Danio rerio (zebrafish)
Release of Hh-Np from the secreting cell
  • Gpc5a
  • disp2
  • gpc5
  • gpc5a
  • hha
  • ihh
  • ihha
  • notum1a
  • scube2
  • shh
  • shha
  • shhb
  • twhh
  • vhh1
  • you
Danio rerio (zebrafish)
Condensation of Prophase Chromosomes
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • SMC2L1
  • cb267
  • cb525
  • cb636
  • ccnb
  • ccnb1
  • cdc2
  • cdk1
  • cycb
  • cycb1
  • fb92e05
  • h2af1al
  • h2afvb
  • h2afvl
  • h2afx1
  • h2afza
  • h2av
  • h2ax1
  • h2az2a
  • h2az2b
  • hist1h4l
  • hist2h2l
  • id:ibd2253
  • ik:tdsubc_2d1
  • im:6896397
  • kmt5aa
  • ncapd3
  • ncapg2
  • ncaph2
  • phf8
  • plk
  • plk1
  • rb1
  • set8a
  • setd8
  • setd8a
  • si:ch211-113a14.17
  • si:ch211-113a14.22
  • si:ch211-113a14.29
  • si:ch211-113a14.6
  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
  • si:dkey-108k21.18
  • si:dkey-108k21.28
  • si:dkey-23a13.7
  • smc2
  • wu:fa19g04
  • wu:fb16d01
  • wu:fb16e07
  • wu:fb37g11
  • wu:fb76g03
  • wu:fb92e05
  • wu:fc30e01
  • wu:fi21c01
  • xx:tdsubc_2d1
  • zeh1628
  • zgc:112234
  • zgc:154147
  • zgc:165555
  • zgc:173585
  • zgc:173587
  • zgc:194998
  • zgc:55326
  • zgc:55549
  • zgc:56685
  • zgc:92032
Danio rerio (zebrafish)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR3
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr3
  • fj46f04
  • id:ibd5158
  • plcg1
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fj46f04
  • wu:fj57a05
Danio rerio (zebrafish)
GP1b-IX-V activation signalling
  • LOC100004428
  • VWF
  • gp1bb
  • hm:zehn0976
  • lrcc54
  • nyx
  • pik3r1
  • si:ch1073-474e24.1
  • si:dkey-285c2.8
  • src
  • tsk
  • tsku
  • vasn
  • vasnb
  • vwf
  • wu:fb33b01
  • wu:fb65b05
  • ywhabl
  • zgc:73065
  • zgc:77351
Danio rerio (zebrafish)
EPH-ephrin mediated repulsion of cells
  • ZFMMP-9
  • aph1b
  • efnb1
  • efnb2b
  • efnb3
  • efnb3b
  • ephb4a
  • fc10d03
  • fj05a08
  • fynb
  • hm:zeh0344
  • id:ibd5049
  • mmp2
  • mmp9
  • pen2
  • psen1
  • psen2
  • psenen
  • psfl
  • rac1
  • rac1a
  • rtk5
  • src
  • wu:fa99h12
  • wu:fb02g06
  • wu:fb07b05
  • wu:fc10d03
  • wu:fd16e02
  • wu:fi98c09
  • wu:fj05a08
  • wu:fk89d01
  • yes
  • yes1
  • zeh0344
  • zgc:111938
  • zgc:114200
  • zgc:55823
  • zgc:55917
  • zgc:64165
  • zgc:86934
Danio rerio (zebrafish)
Amino acids regulate mTORC1
  • RRAGB
  • atp6e
  • atp6v0cb
  • atp6v0d1
  • atp6v1ab
  • atp6v1ba
  • atp6v1c1
  • atp6v1c1a
  • atp6v1d
  • atp6v1e1
  • atp6v1e1b
  • atp6v1f
  • atp6v1g1
  • atp6v1h
  • atpv0e2
  • cb927
  • chunp6890
  • chunp6932
  • cto
  • fb52g11
  • fj35f08
  • frap1
  • gbl
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • mapksp1
  • mlst8
  • mtor
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • sh3bp4
  • sh3bp4a
  • si:dkey-176g4.2
  • slc38a9
  • tcirg1
  • tcirg1b
  • tor
  • vatB1
  • wu:fa12a02
  • wu:fb44e06
  • wu:fb52g11
  • wu:fc22h08
  • wu:fc68h09
  • wu:fc74d11
  • wu:fi46h07
  • wu:fj35f08
  • wu:fq38h02
  • zgc:109987
  • zgc:111904
  • zgc:111971
  • zgc:55524
  • zgc:56499
  • zgc:73144
  • zgc:73282
  • zgc:77708
  • zgc:92923
Danio rerio (zebrafish)
Lysosphingolipid and LPA receptors
  • Lpar3
  • edg1
  • edg2
  • edg5
  • lpar1
  • lpar2a
  • lpar3
  • lpar5a
  • lpar6
  • lpar6l
  • p2ry5
  • s1pr1
  • s1pr2
  • s1pr5b
  • si:dz22b13.1
  • si:dz46m7.1
  • wu:fb62d01
  • zgc:101053
  • zgc:158362
  • zgc:66034
  • zgc:92157
Danio rerio (zebrafish)
FGFRL1 modulation of FGFR1 signaling
  • fb14c08
  • fc89b01
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfrl1
  • fgfrl1a
  • fj51c03
  • id:ibd5158
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • spred1
  • spred2
  • wu:fb14c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj51c03
  • zgc:109774
  • zgc:64084
  • zgc:85707
Danio rerio (zebrafish)

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