GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1 - 25 of 252 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
HS-GAG biosynthesis
  • 2-OST
  • 2OST
  • 3-OST-6
  • 3OST6
  • Gpc2
  • Gpc5a
  • Gpc6a
  • HS2st
  • HS2st1
  • HS3st2
  • HS3st3X
  • HS3st3Z
  • HS3st6
  • SDC4
  • cb440
  • chunp6920
  • ext1b
  • ext2
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  • fc47a08
  • fe05f10
  • fj47c03
  • gal3st4
  • gpc1
  • gpc2
  • gpc3
  • gpc4
  • gpc4/6
  • gpc5
  • gpc5a
  • gpc6
  • gpc6a
  • gpc6l
  • hs2st1
  • hs2st1a
  • hs3st2
  • hs3st3b1a
  • hs3st3b1b
  • hs3st3l
  • hs6st
  • hs6st1
  • hs6st1a
  • hs6st2
  • hs6st3b
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  • im:7147474
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  • knypek
  • ndst1
  • ndst1b
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Danio rerio (zebrafish)
G alpha (q) signalling events
  • 5-ht2cr
  • 5ht2b
  • EDN3
  • EDN3a
  • Ednra2
  • FP
  • GNB1x
  • GNG5
  • GnRH-II
  • IT-NP
  • LOC794123
  • LOC798233
  • LTB4R
  • Lpar3
  • NPFF
  • RGS4
  • VT-NP
  • [g]3
  • adra1bb
  • agt
  • agtr1b
  • avp
  • avpl
  • avpr1a
  • avpr1aa
  • avpr1ab
  • avpr1b
  • cGnRH-II
  • cb436
  • chrm5
  • chrm5a
  • cysltr1
  • edg2
  • edn1
  • edn3
  • edn3b
  • ednr-a
  • ednra
  • ednraa
  • ednrb1
  • ednrb1a
  • ednrba
  • et-1
  • fb14d01
  • fb39f01
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  • fj33a01
  • fp
  • gna11b
  • gna15.1
  • gnb1b
  • gnb1l
  • gnb3a
  • gnb3l
  • gnb5a
  • gng1
  • gng12b
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  • gng3
  • gng5
  • gng7
  • gng8
  • gngt1
  • gngt2
  • gngt2a
  • gnrh2
  • gnrhr2
  • gnrhr4
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  • gprc6a
  • grm1
  • grm1b
  • grm5a
  • grm5b
  • hcrt
  • hcrtr
  • hcrtr2
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  • htr2cl1
  • id:ibd1139
  • ik:tdsubc_2c12
  • im:7160079
  • itnp
  • kiss1
  • kiss1rb
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  • lpar6a
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  • oxtl
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  • oxtra
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  • p2ry10
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  • tac1
  • tac2a
  • tac3a
  • tacr1a
  • tacr2
  • tacr3b
  • tacr3l
  • tbxa2r
  • trio
  • vsnp
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  • zgc:66034
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  • zgc:73318
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Danio rerio (zebrafish)
G alpha (i) signalling events
  • ACTH
  • CB1R
  • DOR2
  • Drd4c
  • GNB1x
  • GNG5
  • LOC100005461
  • LOC561647
  • LOC794924
  • Lpar3
  • MSH
  • NPYRYC
  • Npy1r
  • Opn5m
  • PPSS1
  • PPSS3
  • RFLA1
  • RFLC2
  • RGS12TS
  • RGS12TS-I
  • RGS12TS-L
  • RGS12TS-S
  • RGS4
  • SDF-1
  • SI:bZ36D5.1
  • SI:bZ36D5.4
  • SS1
  • SS2
  • T2R2
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  • TAS2R1a
  • TAS2R1b
  • Tas1R2b
  • [g]3
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  • adra2b
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  • agtr2
  • agtrl1
  • agtrl1a
  • agtrl1b
  • apln
  • aplnr2
  • aplnr3
  • aplnra
  • aplnrb
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  • cb2a
  • cb2b
  • cb436
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  • cb958
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  • ccl-c5a
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  • cxcl20
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  • cxcl8b.3
  • cxcr3.1
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  • drd4c
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  • galn
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  • gnat2
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  • gnb3l
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  • gpr183a
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  • opn1sw1
  • opn1sw2
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  • zya
  • zyb
Danio rerio (zebrafish)
Peptide ligand-binding receptors
  • ACTH
  • DOR2
  • EDN3
  • EDN3a
  • Ednra2
  • MSH
  • NPYRYC
  • Npy1r
  • PPSS1
  • PPSS3
  • SI:bZ36D5.1
  • SI:bZ36D5.4
  • SS1
  • SS2
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  • agtr1b
  • agtr2
  • agtrl1
  • agtrl1a
  • agtrl1b
  • apln
  • aplnr2
  • aplnr3
  • aplnra
  • aplnrb
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  • ece1
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  • edn3b
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  • ednra
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  • ednrba
  • et-1
  • fb12g05
  • fb14d01
  • fd11b07
  • fd57e04
  • gal
  • galn
  • galr2a
  • gper1
  • grn
  • im:7160079
  • kiss1
  • kiss1rb
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  • mc2r
  • mc3r
  • mc4r
  • mc5br
  • mc5ra
  • mc5rb
  • npy
  • npy1r
  • npy4r
  • npy8ar
  • npy8br
  • npyrya
  • npyryb
  • npyryc
  • nts
  • ntsr1
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  • or4
  • penk
  • penkb
  • pomc
  • pomca
  • ppg
  • prok1
  • prok2
  • prokr1a
  • prokr1b
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  • pyya
  • sb:eu249
  • si:bz36d5.2
  • si:ch211-157p22.8
  • si:ch211-202p1.5
  • si:ch211-44l19.2
  • si:dkey-211h10.1
  • si:dkey-253i9.3
  • sst1
  • sst1.1
  • sst3
  • sst7
  • sstr1b
  • sstr5
  • wu:fb12g05
  • wu:fb14d01
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  • wu:fd11b07
  • wu:fd57e04
  • wu:fj87b02
  • zMC5b
  • zgc:111892
  • zgc:113016
  • zgc:153708
  • zgc:154079
  • zgc:194217
  • zgc:194235
  • zgc:194624
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  • zgc:194694
  • zgc:194705
  • zgc:195074
  • zgc:195090
  • zgc:92779
  • zya
  • zyb
Danio rerio (zebrafish)
Methylation
  • AHCY
  • CYP1A
  • D150
  • MAT2AA
  • ahcy
  • as3mt
  • cb1079
  • comta
  • cyp1A1
  • cyp1a
  • cyp1a1
  • ducttrip
  • fd12a12
  • fd58h04
  • gsto1
  • hm:zeh1173
  • hm:zeh1364
  • mat1a
  • mat2a
  • mat2aa
  • mat2b
  • n6amt1
  • si:ch73-340n8.1
  • si:ch73-345a19.3
  • tpmt
  • tpmt.2
  • trmt112
  • wu:fb63b04
  • wu:fb95e01
  • wu:fd12a12
  • wu:fd58h04
  • wu:fi35e01
  • wu:fj67b02
  • zfCYP1A
  • zgc:109747
  • zgc:110652
  • zgc:136933
  • zgc:55442
  • zgc:64002
  • zgc:92254
  • zgc:92834
Danio rerio (zebrafish)
Synaptic adhesion-like molecules
  • AMPA
  • GRIN3A
  • SI:zC231H1.1
  • ZfGluR1a
  • dlg1l
  • dlg4
  • flot1
  • flot1a
  • flot2a
  • glur1a
  • glur3b
  • glur4a
  • gria1.1
  • gria1a
  • gria3
  • gria3.2
  • gria3b
  • gria4
  • gria4a
  • iGluR4
  • lrfn1
  • lrfn2b
  • reggie2
  • si:bz1o18.1
  • si:cabz01090165.1
  • si:dz44o19.1
  • si:zc140k5.3
  • wu:fj45g11
  • zfGRIA1[a]
  • zfGRIA3[b]
  • zmp:0000001073
Danio rerio (zebrafish)
TRP channels
  • ANKTM1
  • TRPM4a
  • TRPV1
  • bZ1P14.9
  • cb495
  • ecac
  • mcoln1.2
  • mcoln1b
  • mcoln2
  • si:dkey-9e15.2
  • si:rp71-1p14.9
  • tap1A
  • tap1a
  • tct
  • trpa1
  • trpa1a
  • trpa1b
  • trpa1l
  • trpa2
  • trpc1
  • trpc4a
  • trpc4apa
  • trpc4b
  • trpc6
  • trpc6a
  • trpc7b
  • trpm2
  • trpm4
  • trpm4a
  • trpm6
  • trpm7
  • trpv1
  • trpv5-6
  • trpv6
  • wu:fb15d09
  • zgc:109818
  • zgc:55310
Danio rerio (zebrafish)
Platelet degranulation
  • ANX V
  • CYB5R1
  • IGF-1
  • IGF-1L
  • IGF-1a
  • IGF-I
  • LOC792613
  • MRP
  • PAI
  • PAI-1
  • PAI1
  • PLANH1
  • TAGLN
  • Tbeta11
  • VWF
  • abcc4
  • actbb
  • actn2
  • actn2b
  • ahsg
  • ahsg1
  • ai39657
  • aldoa
  • aldoaa
  • antivin
  • anx
  • anx5
  • anxa5
  • anxa5b
  • apoa
  • apoa1
  • apoa1a
  • apool
  • app
  • appa
  • atv
  • atv2
  • bactin2
  • cb1019
  • cb223
  • cb420
  • cb720
  • cb73
  • cb79
  • cb989
  • cd163
  • cd36
  • cd63
  • cdc37l1
  • cfd
  • cfdl
  • chid1
  • clu
  • ctsf
  • cuzn
  • cxcl-c13d
  • cxcl8b.1
  • cxcl8b.3
  • cyb5r1
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Danio rerio (zebrafish)
Signaling by BMP
  • ActrIIB
  • BMP2b
  • BMPR-IA
  • BMPR-IB
  • BR1a
  • BR1b
  • LOC564395
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  • actrIIb
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  • bmp2
  • bmp2-4
  • bmp2b
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  • bmpr2b
  • cb670
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  • zgc:103407
  • zgc:136731
  • zgc:66401
  • zgc:92220
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by Activin
  • ActrIIB
  • actbb
  • actbetaB
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  • actrIIb
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  • acvr2ba
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  • smad3
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  • wu:fa99e03
  • wu:fj97d11
  • zgc:158348
Danio rerio (zebrafish)
RND2 GTPase cycle
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  • CAV1
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  • Rho
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Danio rerio (zebrafish)
RND1 GTPase cycle
  • Aldh-III
  • CAV1
  • LOC100004299
  • aldh3a2
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  • arms
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  • zgc:55780
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  • zgc:92133
Danio rerio (zebrafish)
MHC class II antigen presentation
  • Ap1m1
  • CTSB
  • GILT
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  • ap1m2
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  • zgc:92089
  • zmp:0000001138
Danio rerio (zebrafish)
Macroautophagy
  • Atg12
  • GABARAPL2
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  • zgc:92319
Danio rerio (zebrafish)
Keratan sulfate biosynthesis
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Danio rerio (zebrafish)
O-linked glycosylation of mucins
  • B3GNT1
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  • zgc:112011
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  • zgc:113947
  • zgc:153274
  • zgc:55730
Danio rerio (zebrafish)
Glycosphingolipid biosynthesis
  • B4GALNT1
  • b3gnt5
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  • b4galt6
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  • gal3st1a
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  • ugcg
  • ugt8
  • wu:fc08a12
  • zgc:112506
  • zgc:158609
  • zgc:55730
Danio rerio (zebrafish)
RHOQ GTPase cycle
  • CAV1
  • IQGAP1
  • IQGAP3
  • LOC100004299
  • arhgap1
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • arl13b
  • arl2l1
  • cav1
  • cb422
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  • cdc42
  • cdc42a
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  • cftr
  • cip4
  • cx43
  • dlg3
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  • fj62g06
  • fk03b12
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  • hmp
  • im:7152854
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  • jupa
  • kinase
  • llk
  • mpp7
  • pak2
  • pak2a
  • rab-7
  • rab7
  • rab7a
  • rhoq
  • scrb1
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  • shf
  • si:dz198m22.1
  • slc1a5
  • sof
  • srgap2
  • stb2
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  • stoml3a
  • stoml3b
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  • trip10
  • vamp3
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  • zgc:91798
  • zgc:91889
  • zgc:92806
Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024