GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 326 - 350 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
RHOA GTPase cycle
  • ABCD3
  • ABR
  • ACBD5
  • ACTC1
  • AKAP13
  • ANLN
  • ARAP1
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP18
  • ARHGAP19
  • ARHGAP20
  • ARHGAP21
  • ARHGAP22
  • ARHGAP23
  • ARHGAP24
  • ARHGAP26
  • ARHGAP28
  • ARHGAP29
  • ARHGAP30
  • ARHGAP31
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP4
  • ARHGAP44
  • ARHGAP45
  • ARHGAP5
  • ARHGAP6
  • ARHGAP8
  • ARHGAP9
  • ARHGDIA
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF15
  • ARHGEF17
  • ARHGEF18
  • ARHGEF19
  • ARHGEF2
  • ARHGEF25
  • ARHGEF28
  • ARHGEF3
  • ARHGEF5
  • ARHGEF7
  • ATP6AP1
  • BCAP31
  • BCR
  • C1QBP
  • CAV1
  • CAVIN1
  • CCDC115
  • CIT
  • DAAM1
  • DDRGK1
  • DEF6
  • DEPDC1B
  • DIAPH1
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DOCK2
  • ECT2
  • FAF2
  • FAM13A
  • FARP1
  • FLOT1
  • FLOT2
  • FMNL3
  • GMIP
  • IQGAP3
  • JUP
  • Jup
  • KTN1
  • LBR
  • LMAN1
  • MACO1
  • MCAM
  • MCF2
  • MCF2L
  • MYO9A
  • MYO9B
  • NET1
  • NGEF
  • OPHN1
  • PCDH7
  • PGRMC2
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKN1
  • PKN2
  • PKN3
  • PLD1
  • PLEKHG3
  • PLEKHG5
  • PLEKHG6
  • PREX1
  • PREX2
  • RACGAP1
  • RASGRF2
  • RHOA
  • RHPN1
  • RHPN2
  • ROCK1
  • ROCK2
  • RTKN
  • SCFD1
  • SLK
  • SNAP23
  • SRGAP1
  • STARD8
  • STOM
  • TAGAP
  • TEX2
  • TFRC
  • TIAM1
  • TJP2
  • TMEM57
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAPB
  • VAV1
  • VAV2
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
Regulation of insulin secretion
  • ABCC8
  • CACNA1D
  • CACNA1E
  • CACNA2D2
  • CACNB2
  • CACNB3
  • GLUT1
  • GLUT2
  • RAPGEF3
  • RAPGEF4
  • SLC2A1
  • SLC2A2
Sus scrofa (pig)
Hyaluronan biosynthesis and export
  • ABCC5
  • CEMIP
  • HAS1
  • HAS3
  • SHAS2
  • shas3
Sus scrofa (pig)
Atorvastatin ADME
  • ABCC2
  • CYP3A22
  • CYP3A227
  • CYP3A29
  • LOC100522267
  • PON1
  • PON3
  • SLCO1B2
  • SLCO1B3
  • SLCO2B1
  • UGT1A6
Sus scrofa (pig)
Synthesis of Leukotrienes (LT) and Eoxins (EX)
  • ABCC1
  • ALOX15
  • ALOX5
  • CYP4A21
  • CYP4A23
  • CYP4A24
  • CYP4A90
  • CYP4B1
  • CYP4F22
  • CYP4F3
  • CYP4F52
  • DPEP1
  • DPEP2
  • DPEP3
  • GGT1
  • LOC110255311
  • LOC110259328
  • LOC110259329
  • LTA4H
  • LTC4S
  • MAPKAPK2
  • RDP
Sus scrofa (pig)
Sphingolipid de novo biosynthesis
  • ABCC1
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • BMDP
  • CERS1
  • CERS2
  • CERS4
  • CERS5
  • CYB5B
  • DEGS1
  • DEGS2
  • FA2H
  • GDF1
  • KDSR
  • LASS4
  • MFSD2B
  • ORMDL1
  • SAMD8
  • SGMS1
  • SGMS2
  • SPHK1
  • SPHK2
  • SPNS2
  • SPTLC1
  • SPTLC2
  • SPTLC3
  • SPTSSA
  • SPTSSB
Sus scrofa (pig)
Heme degradation
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ALB
  • BLVRA
  • BLVRB
  • BMDP
  • GSTA1
  • HMOX1
  • LOC100526118
  • SLCO1B2
  • SLCO1B3
  • SLCO2B1
  • UGT1A6
Sus scrofa (pig)
APAP ADME
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ABCC4
  • ABCC5
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ACY1
  • BMDP
  • CNDP2
  • CYP2E1
  • GGT1
  • GGT6
  • GGT7
  • GSTT1
  • LOC100153094
  • LOC100511540
  • LOC100515741
  • LOC100516628
  • LOC100623255
  • LOC100623504
  • LOC100739163
  • LOC110262115
  • SULT1A3
  • SULT1C4
  • SULT1E1
  • SULT2A1
  • UGT2B31
Sus scrofa (pig)
The canonical retinoid cycle in rods (twilight vision)
  • ABCA4
  • CYP4V2
  • LOC100626199
  • LRAT
  • RBP1
  • RBP3
  • RBP4
  • RDH10
  • RDH11
  • RDH12
  • RDH5
  • RHO
  • RHO1
  • SDR9C7
  • STRA6
  • TTR
Sus scrofa (pig)
Signaling by EGFR
  • AAMP
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • FAM83A
  • FAM83B
  • FAM83D
  • HBEGF
  • HEGFL
  • LRIG1
  • SRC
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis
  • AAK1
  • ADRB2
  • AGTR1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • AREG
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • BTC
  • CBL
  • CD3D
  • CD3G
  • CD4
  • CFTR
  • CHRM2
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • COPS2
  • COPS3
  • COPS4
  • COPS5
  • COPS6
  • COPS7A
  • COPS7B
  • DTR
  • DVL2
  • DYT1
  • EGF
  • EGFR
  • EPN1
  • EPN2
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • FCHO1
  • FCHO2
  • FZD4
  • GPS1
  • GRB2
  • GRK2
  • GRK3
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGS
  • IGF2R
  • IL7R
  • ITSN1
  • ITSN2
  • KIAA0319
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • M6PR
  • NECAP1
  • NECAP2
  • NEDD8
  • PICALM
  • REPS1
  • REPS2
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL1
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • SLC18A3
  • SLC2A8
  • SNAP91
  • STAM
  • STAM2
  • STON1
  • SYT1
  • SYT2
  • SYT8
  • SYT9
  • TACR1
  • TF
  • TFRC
  • TGFA
  • TOR1A
  • TOR1B
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBQLN1
  • UBQLN2
  • VAMP2
  • VAMP3
  • VAMP4
  • VAMP8
  • WNT5A
Sus scrofa (pig)
Clathrin-mediated endocytosis
  • AAK1
  • ACTR3
  • ADRB2
  • AGTR1
  • AMPH
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • AREG
  • ARF6
  • ARFGAP1
  • ARPC1A
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC5
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • BIN1
  • BTC
  • CBL
  • CD3D
  • CD3G
  • CD4
  • CFTR
  • CHRM2
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • DNAJC6
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DTR
  • DVL2
  • EGF
  • EGFR
  • EPN1
  • EPN2
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • FCHO1
  • FCHO2
  • FNBP1
  • FNBP1L
  • FZD4
  • GAK
  • GAPVD1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGS
  • HIP1
  • HIP1R
  • HSPA8
  • IGF2R
  • IL7R
  • ITSN1
  • ITSN2
  • KIAA0319
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • M6PR
  • NECAP1
  • NECAP2
  • OCRL
  • PACSIN1
  • PACSIN2
  • PACSIN3
  • PICALM
  • PIK3C2A
  • PIP5K1C
  • RAB5A
  • RAB5B
  • REPS1
  • REPS2
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL1
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • SLC18A3
  • SLC2A8
  • SNAP91
  • SNX18
  • SNX9
  • STAM
  • STAM2
  • STON1
  • SYNJ1
  • SYNJ2
  • SYT1
  • SYT2
  • SYT8
  • SYT9
  • TACR1
  • TF
  • TFRC
  • TGFA
  • TRIP10
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • VAMP2
  • VAMP3
  • VAMP4
  • VAMP8
  • WASL
  • WNT5A
Sus scrofa (pig)
Phase I - Functionalization of compounds
  • AADAC
  • ABP
  • AHR
  • AHRR
  • ALDH3A1
  • AOC1
  • AOC2
  • ARNT
  • ARNT2
  • BPHL
  • CBR3
  • CES1
  • CES3
  • CMBL
  • CYB5B
  • CYB5R3
  • CYP2B6B
  • CYP3A22
  • CYP3A227
  • CYP3A29
  • DAO
  • EPHX1
  • LOC100520329
  • LOC100736962
  • LOC110256000
  • MTARC1
  • MTARC2
  • NQO2
Sus scrofa (pig)
O-linked glycosylation of mucins
  • A4GNT
  • B3GNT2
  • B3GNT4
  • B3GNT5
  • B3GNT6
  • B3GNT7
  • B3GNT8
  • B3GNT9
  • B3GNTL1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • C1GALT1
  • C1GALT1C1
  • CHST4
  • GALNT1
  • GALNT10
  • GALNT11
  • GALNT12
  • GALNT14
  • GALNT15
  • GALNT16
  • GALNT17
  • GALNT18
  • GALNT2
  • GALNT4
  • GALNT5
  • GALNT6
  • GALNT7
  • GALNT8
  • GALNT9
  • GALNTL5
  • GCNT1
  • GCNT3
  • GCNT4
  • GCNT7
  • MUC1
  • MUC13
  • MUC15
  • MUC2
  • MUC20
  • MUC4
  • MUC5AC
  • MUC5B
  • MUC6
Sus scrofa (pig)
Glycosphingolipid biosynthesis
  • A4GALT
  • B3GALNT1
  • B3GALT3
  • B3GALT4
  • B3GNT5
  • B4GALNT1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • CERK
  • FUT1
  • FUT2
  • GAL3ST1
  • ST3GAL-III
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL5
  • ST6GALNAC5
  • ST6GALNAC6
  • ST8SIA5
  • UGCG
  • UGT8
Sus scrofa (pig)
Lysosome Vesicle Biogenesis
  • A4
  • AD1
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1G2
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S3
  • AP4B1
  • AP4E1
  • AP4M1
  • APP
  • ARF1
  • ARRB1
  • CHMP2A
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLVS1
  • CTSZ
  • DNASE2
  • DNASE2A
  • DNL2
  • DNM2
  • GNS
  • HGS
  • M6PR
  • TXNDC5
  • VAMP2
  • VAMP8
Sus scrofa (pig)
Insertion of tail-anchored proteins into the endoplasmic reticulum membrane
  • A4
  • AD1
  • ALDH3A2
  • APP
  • CYB5
  • CYB5A
  • EMD
  • HMOX1
  • PRNP
  • PRP
  • SEC61B
  • SEC61G
  • SERP1
  • SGTA
  • STX1A
  • UBE2J2
  • VAMP2
  • VAPA
Sus scrofa (pig)
TRAF6 mediated NF-kB activation
  • A4
  • AD1
  • AGER
  • APP
  • CHUK
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB2_tv2
  • NFKBIA
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • RELA
  • S100A12
  • S100B
Sus scrofa (pig)
Advanced glycosylation endproduct receptor signaling
  • A4
  • AD1
  • AGER
  • APP
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • S100A12
  • S100B
Sus scrofa (pig)
TAK1-dependent IKK and NF-kappa-B activation
  • A4
  • AD1
  • AGER
  • ALPK1
  • APP
  • CHUK
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IRAK1
  • IRAK2
  • MAP3K7
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB2_tv2
  • NFKBIA
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • RELA
  • RPS27A
  • S100A12
  • S100B
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1b
  • TIFA
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBE2NL
  • USP18
Sus scrofa (pig)
G alpha (q) signalling events
  • A4
  • AD1
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1D
  • AGT
  • AGTR1
  • ANXA1
  • APP
  • ARHGEF25
  • AVP
  • AVPR1A
  • AVPR1B
  • BTK
  • CASR
  • CCK
  • CCKAR
  • CCXCR1
  • CHRM1
  • CHRM3
  • CHRM5
  • CYSLTR1
  • EDG7
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • FFAR1
  • FFAR2
  • FFAR4
  • GCG
  • GCGR
  • GHRL
  • GHSR
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNRH
  • GNRH1
  • GNRH2
  • GNRHR
  • GNRHR2
  • GPR120
  • GPR132
  • GPR143
  • GPR17
  • GPR39
  • GPR54
  • GPR68
  • GPRC6A
  • GRK2
  • GRM1
  • GRM5
  • GRP
  • GRPR
  • HCRT
  • HCRTR1
  • HCRTR2
  • HRH1
  • HTR2A
  • HTR2B
  • HTR2C
  • KISS1R
  • KNG1
  • LOC100621431
  • LOC110255211
  • LPA3
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR4
  • LPAR5
  • LPAR6
  • LTB4R
  • LTB4R2
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • NKNB
  • NMB
  • NMBR
  • NMU
  • NMUR1
  • NPFFR1
  • NPFFR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • O3FAR1
  • OPN4
  • ORX
  • OX
  • OXT
  • OXTR
  • P2RY1
  • P2RY10
  • P2RY11
  • P2RY2
  • P2RY6
  • PCAR1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
  • PLCB4
  • PMCH
  • PPOX
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR1
  • PROKR2
  • PTAFR
  • PTGER1
  • PTGFR
  • QRFPR
  • RGS1
  • RGS13
  • RGS16
  • RGS17
  • RGS18
  • RGS19
  • RGS2
  • RGS4
  • RGS5
  • RGSL1
  • TAC3
  • TACR1
  • TACR2
  • TACR3
  • TBXA2R
  • TRH
  • TRHR
  • TRIO
  • UTS2
  • UTS2R
  • XCL1
  • XCR1
  • alpha-1A
  • fp
Sus scrofa (pig)
Post-translational protein phosphorylation
  • A4
  • AD1
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMEL
  • ANO8
  • APLP2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APP
  • ATGL
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • C4A
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • CSF1
  • CST3
  • DMP1
  • DNAJC3
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FGA
  • FGF23
  • FGG
  • FN1
  • FSTL1
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • HRC
  • HSP90B1
  • IGFBP1
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP7
  • IL-6
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC100156062
  • LOC100738836
  • LOC106510284
  • LTBP1
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MGAT4A
  • MIA3
  • MXRA8
  • NOTUM
  • NUCB1
  • OPN
  • P4HB
  • PCSK9
  • PDIA6
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • QSOX1
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SDC2
  • SERPINA1
  • SERPINC1
  • SERPIND1
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • STC2
  • TF
  • TIMP1
  • TMEM132A
  • TNC
  • TNN
  • UABP-2
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
  • bmp4
Sus scrofa (pig)
Regulation of IGF Activity by IGFBP
  • A4
  • AD1
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMEL
  • ANO8
  • APLP2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APP
  • ATGL
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • C4A
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • CSF1
  • CST3
  • DMP1
  • DNAJC3
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FGA
  • FGF23
  • FGG
  • FN1
  • FSTL1
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • HRC
  • HSP90B1
  • IGF1
  • IGF2
  • IGFBP1
  • IGFBP2
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP6
  • IGFBP7
  • IL-6
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC100156062
  • LOC100738836
  • LOC106510284
  • LTBP1
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MGAT4A
  • MIA3
  • MXRA8
  • NOTUM
  • NUCB1
  • OPN
  • P4HB
  • PAPPA
  • PAPPA2
  • PCSK9
  • PDIA6
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • QSOX1
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SDC2
  • SERPINA1
  • SERPINC1
  • SERPIND1
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • STC2
  • TF
  • TIMP1
  • TMEM132A
  • TNC
  • TNN
  • UABP-2
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
  • bmp4
Sus scrofa (pig)
Mitochondrial protein degradation
  • A4
  • ACAD8
  • ACADSB
  • ACAT1
  • ACO2
  • AD1
  • AFG3L2
  • ALAS1
  • ALDH18A1
  • ALDH1B1
  • ALDH2
  • APP
  • ARG2
  • ATP5A1
  • ATP5A2
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5O
  • ATP5PO
  • ATP6
  • ATPASE6
  • BDH1
  • CLPP
  • CLPX
  • COI
  • COX5A
  • COX5B
  • COXI
  • CS
  • DBT
  • DLD
  • ECH1
  • ECI1
  • FECH
  • FH
  • GLUD
  • GLUD1
  • HAD
  • HADH
  • HADHSC
  • HMGCS2
  • HSD17B10
  • HSPA9
  • HSPD1
  • HTRA2
  • IARS2
  • IDH2
  • IDH3A
  • LDHD
  • LOC100524613
  • LOC106507363
  • LOC110255331
  • LONP1
  • MDH2
  • ME2
  • MRPL32
  • MRPS10
  • MRPS2
  • MT-ATP6
  • MT-CO1
  • MTATP6
  • MTCO1
  • NADK2
  • NDUFS1
  • NDUFS3
  • OGDH
  • OXCT
  • OXCT1
  • OXSM
  • PCCB
  • PDHA1
  • PDHB
  • PDK1
  • PMPCA
  • SCHAD
  • SCOT
  • SHMT2
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • SMDT1
  • SPG7
  • SSBP1
  • STAR
  • SUCLG2
  • TFAM
  • TWNK
  • UQCRC2
Sus scrofa (pig)
Degradation of the extracellular matrix
  • A2M
  • ACAN
  • ADAM10
  • ADAM15
  • ADAM8
  • ADAMTS4
  • ADAMTS5
  • BCAN
  • BSG
  • CAPN1
  • CAPN10
  • CAPN11
  • CAPN12
  • CAPN13
  • CAPN14
  • CAPN15
  • CAPN2
  • CAPN4
  • CAPN5
  • CAPN6
  • CAPN7
  • CAPN8
  • CAPN9
  • CAPNS1
  • CAST
  • CD44
  • CDH1
  • DCN
  • HTRA1
  • KLK7
  • LOC100154047
  • MMP1
  • MMP11
  • MMP12
  • MMP13
  • MMP19
  • MMP20
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP8
  • MMP9
  • NID1
  • OPN
  • OPTC
  • SCUBE1
  • SCUBE3
  • SPP1
  • TMPRSS6
Sus scrofa (pig)

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Last updated: August 19, 2024